MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_014012	TTA	2	6	1327789	1327794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139904
23502	NC_014012	ATCA	2	8	1327890	1327897	50 %	25 %	0 %	25 %	294139904
23503	NC_014012	AGA	2	6	1328014	1328019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139904
23504	NC_014012	GACTCA	2	12	1328102	1328113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294139904
23505	NC_014012	ATG	2	6	1328313	1328318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139904
23506	NC_014012	GCGCC	2	10	1328384	1328393	0 %	0 %	40 %	60 %	294139904
23507	NC_014012	CAT	2	6	1328433	1328438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139904
23508	NC_014012	AAG	2	6	1328442	1328447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139904
23509	NC_014012	ATG	2	6	1328478	1328483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139904
23510	NC_014012	GTTG	2	8	1328524	1328531	0 %	50 %	50 %	0 %	294139904
23511	NC_014012	AAGC	2	8	1328559	1328566	50 %	0 %	25 %	25 %	294139904
23512	NC_014012	TAAT	2	8	1328589	1328596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23513	NC_014012	TAC	2	6	1328670	1328675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139905
23514	NC_014012	TGCT	2	8	1328692	1328699	0 %	50 %	25 %	25 %	294139905
23515	NC_014012	TTTG	2	8	1328857	1328864	0 %	75 %	25 %	0 %	294139905
23516	NC_014012	AT	3	6	1328866	1328871	50 %	50 %	0 %	0 %	294139905
23517	NC_014012	CAA	2	6	1329045	1329050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139905
23518	NC_014012	TAG	2	6	1329091	1329096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139905
23519	NC_014012	ATT	2	6	1329103	1329108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139905
23520	NC_014012	G	6	6	1329163	1329168	0 %	0 %	100 %	0 %	294139905
23521	NC_014012	GGC	2	6	1329305	1329310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139905
23522	NC_014012	T	6	6	1329442	1329447	0 %	100 %	0 %	0 %	294139906
23523	NC_014012	GAA	2	6	1329500	1329505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139906
23524	NC_014012	ACC	2	6	1329515	1329520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139906
23525	NC_014012	TCA	3	9	1329558	1329566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139906
23526	NC_014012	TCGC	2	8	1329575	1329582	0 %	25 %	25 %	50 %	294139906
23527	NC_014012	TGC	2	6	1329672	1329677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139906
23528	NC_014012	CAT	2	6	1329698	1329703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139906
23529	NC_014012	CAA	2	6	1329713	1329718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139906
23530	NC_014012	GCT	2	6	1329767	1329772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139906
23531	NC_014012	CTT	2	6	1329922	1329927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139906
23532	NC_014012	ATG	2	6	1329989	1329994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139906
23533	NC_014012	TGA	2	6	1330071	1330076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23534	NC_014012	TTAACT	2	12	1330079	1330090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23535	NC_014012	TTCA	2	8	1330114	1330121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23536	NC_014012	GATG	2	8	1330160	1330167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23537	NC_014012	TCT	2	6	1330213	1330218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139907
23538	NC_014012	CAC	2	6	1330400	1330405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139907
23539	NC_014012	GT	3	6	1330504	1330509	0 %	50 %	50 %	0 %	294139907
23540	NC_014012	GGA	2	6	1330550	1330555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139907
23541	NC_014012	TGA	2	6	1330580	1330585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139907
23542	NC_014012	ATC	2	6	1330637	1330642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23543	NC_014012	TAGCT	2	10	1330693	1330702	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23544	NC_014012	A	6	6	1330795	1330800	100 %	0 %	0 %	0 %	294139908
23545	NC_014012	TCA	2	6	1330829	1330834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139908
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23547	NC_014012	CAT	2	6	1330956	1330961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139908
23548	NC_014012	TAA	2	6	1331011	1331016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23549	NC_014012	TTTTA	2	10	1331049	1331058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23550	NC_014012	AGC	2	6	1331089	1331094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23551	NC_014012	A	6	6	1331098	1331103	100 %	0 %	0 %	0 %	294139909
23552	NC_014012	GGT	2	6	1331119	1331124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139909
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23554	NC_014012	GTT	2	6	1331293	1331298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139909
23555	NC_014012	TAA	2	6	1331349	1331354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139909
23556	NC_014012	TAA	2	6	1331409	1331414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139909
23557	NC_014012	TAA	2	6	1331424	1331429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139909
23558	NC_014012	GGA	2	6	1331488	1331493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139909
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23560	NC_014012	CGG	2	6	1331522	1331527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139909
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23562	NC_014012	TGC	2	6	1331760	1331765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139909
23563	NC_014012	TGG	2	6	1331829	1331834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139909
23564	NC_014012	TGC	2	6	1331926	1331931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139910
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23566	NC_014012	CT	3	6	1331985	1331990	0 %	50 %	0 %	50 %	294139910
23567	NC_014012	TTG	2	6	1332094	1332099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139910
23568	NC_014012	GAG	2	6	1332135	1332140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139910
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23570	NC_014012	GT	4	8	1332169	1332176	0 %	50 %	50 %	0 %	294139910
23571	NC_014012	GTC	2	6	1332189	1332194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139910
23572	NC_014012	TAGC	2	8	1332367	1332374	25 %	25 %	25 %	25 %	294139910
23573	NC_014012	TTA	2	6	1332499	1332504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23574	NC_014012	TTA	2	6	1332516	1332521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23575	NC_014012	TTA	2	6	1332533	1332538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23576	NC_014012	TGTT	2	8	1332568	1332575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23577	NC_014012	ATTG	2	8	1332616	1332623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23578	NC_014012	CGG	2	6	1332709	1332714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139911
23579	NC_014012	AGT	2	6	1332725	1332730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139911
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23581	NC_014012	TGAAGC	2	12	1332836	1332847	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294139911
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23583	NC_014012	GTT	2	6	1333108	1333113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139912
23584	NC_014012	CAT	2	6	1333163	1333168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139912
23585	NC_014012	GCT	2	6	1333211	1333216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139912
23586	NC_014012	ATG	2	6	1333240	1333245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139912
23587	NC_014012	TTG	2	6	1333264	1333269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139912
23588	NC_014012	GCCT	2	8	1333273	1333280	0 %	25 %	25 %	50 %	294139912
23589	NC_014012	GCA	2	6	1333351	1333356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139912
23590	NC_014012	ATA	2	6	1333417	1333422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23591	NC_014012	ACT	2	6	1333561	1333566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23592	NC_014012	CTT	2	6	1333674	1333679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139913
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23594	NC_014012	AG	3	6	1333726	1333731	50 %	0 %	50 %	0 %	294139913
23595	NC_014012	TAA	2	6	1333743	1333748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139913
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23601	NC_014012	TGG	2	6	1333976	1333981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139913
23602	NC_014012	TCG	2	6	1334011	1334016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139913
23603	NC_014012	GCA	2	6	1334026	1334031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139913
23604	NC_014012	T	6	6	1334118	1334123	0 %	100 %	0 %	0 %	294139913
23605	NC_014012	GCT	2	6	1334138	1334143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139913
23606	NC_014012	TGG	2	6	1334194	1334199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139913
23607	NC_014012	TTA	2	6	1334212	1334217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139913
23608	NC_014012	AAT	2	6	1334307	1334312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139913
23609	NC_014012	A	6	6	1334314	1334319	100 %	0 %	0 %	0 %	294139913
23610	NC_014012	TGT	2	6	1334329	1334334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23611	NC_014012	GCTT	2	8	1334388	1334395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23612	NC_014012	TATC	2	8	1334436	1334443	25 %	50 %	0 %	25 %	294139914
23613	NC_014012	TGT	2	6	1334486	1334491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139914
23614	NC_014012	CAG	2	6	1334506	1334511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139914
23615	NC_014012	CAT	2	6	1334518	1334523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139914
23616	NC_014012	TCA	2	6	1334685	1334690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139914
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23856	NC_014012	GTT	2	6	1348450	1348455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139924
23857	NC_014012	TCT	2	6	1348527	1348532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139924
23858	NC_014012	TCA	2	6	1348673	1348678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139924
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23867	NC_014012	CT	3	6	1348983	1348988	0 %	50 %	0 %	50 %	294139924
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23879	NC_014012	CAA	2	6	1349570	1349575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23881	NC_014012	T	6	6	1349712	1349717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23976	NC_014012	TGA	2	6	1355514	1355519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139933
23977	NC_014012	ATGA	2	8	1355525	1355532	50 %	25 %	25 %	0 %	294139933
23978	NC_014012	CGG	2	6	1355679	1355684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139933
23979	NC_014012	CTG	2	6	1355732	1355737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139933
23980	NC_014012	ACC	2	6	1355776	1355781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139933
23981	NC_014012	TGG	2	6	1355794	1355799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139933
23982	NC_014012	TTA	2	6	1355823	1355828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139933
23983	NC_014012	TCG	2	6	1355976	1355981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139933
23984	NC_014012	GCA	2	6	1356217	1356222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139933
23985	NC_014012	GCT	2	6	1356316	1356321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139933
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23987	NC_014012	GCT	2	6	1356395	1356400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139933
23988	NC_014012	CA	3	6	1356421	1356426	50 %	0 %	0 %	50 %	294139933
23989	NC_014012	TCA	2	6	1356460	1356465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139933
23990	NC_014012	CTT	2	6	1356475	1356480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139933
23991	NC_014012	AGC	2	6	1356510	1356515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139933
23992	NC_014012	TGAG	2	8	1356627	1356634	25 %	25 %	50 %	0 %	294139933
23993	NC_014012	AT	3	6	1356722	1356727	50 %	50 %	0 %	0 %	294139933
23994	NC_014012	ATC	2	6	1356747	1356752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139933
23995	NC_014012	TTTG	2	8	1356783	1356790	0 %	75 %	25 %	0 %	294139933
23996	NC_014012	AGTG	2	8	1356792	1356799	25 %	25 %	50 %	0 %	294139933
23997	NC_014012	A	8	8	1356809	1356816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23998	NC_014012	AGG	2	6	1356827	1356832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23999	NC_014012	CTTAC	2	10	1356894	1356903	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24000	NC_014012	TGA	2	6	1356937	1356942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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