MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_014012	TATC	2	8	1300813	1300820	25 %	50 %	0 %	25 %	294139876
23002	NC_014012	TGGCCT	2	12	1300866	1300877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139876
23003	NC_014012	GGC	2	6	1300900	1300905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139876
23004	NC_014012	TGC	2	6	1301039	1301044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139877
23005	NC_014012	TTC	2	6	1301047	1301052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139877
23006	NC_014012	TGG	2	6	1301066	1301071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139877
23007	NC_014012	CGG	2	6	1301126	1301131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139877
23008	NC_014012	GGT	2	6	1301139	1301144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139877
23009	NC_014012	GTT	2	6	1301175	1301180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139877
23010	NC_014012	CGA	2	6	1301193	1301198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139877
23011	NC_014012	TTA	2	6	1301247	1301252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139877
23012	NC_014012	CTTA	2	8	1301326	1301333	25 %	50 %	0 %	25 %	294139877
23013	NC_014012	TTAT	2	8	1301347	1301354	25 %	75 %	0 %	0 %	294139877
23014	NC_014012	TGG	2	6	1301405	1301410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139877
23015	NC_014012	CAG	2	6	1301444	1301449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139878
23016	NC_014012	GGC	2	6	1301491	1301496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139878
23017	NC_014012	CTG	2	6	1301531	1301536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139878
23018	NC_014012	AGC	2	6	1301601	1301606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139878
23019	NC_014012	GAT	2	6	1301648	1301653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139878
23020	NC_014012	CAG	2	6	1301689	1301694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139878
23021	NC_014012	AGC	2	6	1301727	1301732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139878
23022	NC_014012	GA	3	6	1301745	1301750	50 %	0 %	50 %	0 %	294139878
23023	NC_014012	GC	3	6	1301869	1301874	0 %	0 %	50 %	50 %	294139878
23024	NC_014012	GT	3	6	1301894	1301899	0 %	50 %	50 %	0 %	294139878
23025	NC_014012	ATT	2	6	1301964	1301969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139878
23026	NC_014012	CTT	2	6	1301979	1301984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139878
23027	NC_014012	TC	3	6	1302159	1302164	0 %	50 %	0 %	50 %	294139879
23028	NC_014012	ATT	2	6	1302217	1302222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139879
23029	NC_014012	ATG	2	6	1302321	1302326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139879
23030	NC_014012	GCT	2	6	1302329	1302334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139879
23031	NC_014012	CTC	2	6	1302365	1302370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139879
23032	NC_014012	AT	3	6	1302442	1302447	50 %	50 %	0 %	0 %	294139879
23033	NC_014012	TTA	2	6	1302484	1302489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139879
23034	NC_014012	GCA	2	6	1302515	1302520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139879
23035	NC_014012	TC	3	6	1302550	1302555	0 %	50 %	0 %	50 %	294139879
23036	NC_014012	GCCA	2	8	1302729	1302736	25 %	0 %	25 %	50 %	294139879
23037	NC_014012	GCA	2	6	1302751	1302756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139879
23038	NC_014012	TCC	2	6	1302840	1302845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139879
23039	NC_014012	TTG	2	6	1302876	1302881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139879
23040	NC_014012	C	6	6	1302908	1302913	0 %	0 %	0 %	100 %	294139879
23041	NC_014012	GTT	2	6	1302947	1302952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139879
23042	NC_014012	GAT	2	6	1302984	1302989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139879
23043	NC_014012	CAT	2	6	1303029	1303034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139879
23044	NC_014012	GCA	2	6	1303079	1303084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139879
23045	NC_014012	CTT	2	6	1303151	1303156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139879
23046	NC_014012	CAGA	2	8	1303170	1303177	50 %	0 %	25 %	25 %	294139879
23047	NC_014012	GAG	2	6	1303203	1303208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139879
23048	NC_014012	AAT	2	6	1303268	1303273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23049	NC_014012	A	6	6	1303300	1303305	100 %	0 %	0 %	0 %	294139880
23050	NC_014012	CAG	2	6	1303363	1303368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139880
23051	NC_014012	GCT	2	6	1303374	1303379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139880
23052	NC_014012	CAG	2	6	1303393	1303398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139880
23053	NC_014012	T	7	7	1303437	1303443	0 %	100 %	0 %	0 %	294139880
23054	NC_014012	GTG	2	6	1303449	1303454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139880
23055	NC_014012	TG	3	6	1303453	1303458	0 %	50 %	50 %	0 %	294139880
23056	NC_014012	GAA	2	6	1303468	1303473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139880
23057	NC_014012	GAG	2	6	1303514	1303519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139880
23058	NC_014012	GTCGAT	2	12	1303534	1303545	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139880
23059	NC_014012	GAA	2	6	1303546	1303551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139880
23060	NC_014012	GCA	2	6	1303614	1303619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139880
23061	NC_014012	GCCC	2	8	1303653	1303660	0 %	0 %	25 %	75 %	294139880
23062	NC_014012	CAAGG	2	10	1303675	1303684	40 %	0 %	40 %	20 %	294139880
23063	NC_014012	ATC	2	6	1303821	1303826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23064	NC_014012	ATC	2	6	1303913	1303918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23065	NC_014012	ATC	2	6	1304005	1304010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23066	NC_014012	CT	3	6	1304116	1304121	0 %	50 %	0 %	50 %	294139881
23067	NC_014012	AG	3	6	1304270	1304275	50 %	0 %	50 %	0 %	294139881
23068	NC_014012	CAG	2	6	1304306	1304311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139881
23069	NC_014012	CCAG	2	8	1304332	1304339	25 %	0 %	25 %	50 %	294139881
23070	NC_014012	AGT	3	9	1304417	1304425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139881
23071	NC_014012	AGC	2	6	1304453	1304458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139881
23072	NC_014012	CAGT	2	8	1304505	1304512	25 %	25 %	25 %	25 %	294139881
23073	NC_014012	TCT	2	6	1304526	1304531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139881
23074	NC_014012	CT	3	6	1304533	1304538	0 %	50 %	0 %	50 %	294139881
23075	NC_014012	GAT	2	6	1304580	1304585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139881
23076	NC_014012	TGT	2	6	1304593	1304598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139881
23077	NC_014012	GATC	2	8	1304621	1304628	25 %	25 %	25 %	25 %	294139881
23078	NC_014012	GTG	2	6	1304685	1304690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139881
23079	NC_014012	CAAG	2	8	1304729	1304736	50 %	0 %	25 %	25 %	294139881
23080	NC_014012	GGC	3	9	1304763	1304771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139881
23081	NC_014012	A	6	6	1304825	1304830	100 %	0 %	0 %	0 %	294139882
23082	NC_014012	GCG	2	6	1304850	1304855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139882
23083	NC_014012	AGC	2	6	1304857	1304862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139882
23084	NC_014012	TCCC	2	8	1304882	1304889	0 %	25 %	0 %	75 %	294139882
23085	NC_014012	GGC	2	6	1304902	1304907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139882
23086	NC_014012	TCA	2	6	1304923	1304928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139882
23087	NC_014012	GAG	2	6	1304939	1304944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139882
23088	NC_014012	CCG	2	6	1305018	1305023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139882
23089	NC_014012	CCTG	2	8	1305056	1305063	0 %	25 %	25 %	50 %	294139882
23090	NC_014012	AGC	2	6	1305227	1305232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139882
23091	NC_014012	AAG	2	6	1305254	1305259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139882
23092	NC_014012	TGA	2	6	1305262	1305267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139882
23093	NC_014012	AGG	2	6	1305376	1305381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139882
23094	NC_014012	TC	3	6	1305483	1305488	0 %	50 %	0 %	50 %	294139882
23095	NC_014012	T	6	6	1305525	1305530	0 %	100 %	0 %	0 %	294139882
23096	NC_014012	ATT	2	6	1305561	1305566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139882
23097	NC_014012	ATA	2	6	1305594	1305599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139882
23098	NC_014012	CGG	2	6	1305664	1305669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139882
23099	NC_014012	GAT	2	6	1305740	1305745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139882
23100	NC_014012	CTT	2	6	1305850	1305855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139882
23101	NC_014012	CTA	2	6	1306003	1306008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139882
23102	NC_014012	AAT	2	6	1306016	1306021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139882
23103	NC_014012	TGG	2	6	1306037	1306042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139882
23104	NC_014012	ATC	2	6	1306116	1306121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139883
23105	NC_014012	GAT	2	6	1306131	1306136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139883
23106	NC_014012	TCG	2	6	1306238	1306243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139883
23107	NC_014012	TGG	2	6	1306571	1306576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139883
23108	NC_014012	TGT	2	6	1306619	1306624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139883
23109	NC_014012	AAT	2	6	1306677	1306682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139883
23110	NC_014012	CAC	2	6	1306691	1306696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139883
23111	NC_014012	AT	3	6	1306747	1306752	50 %	50 %	0 %	0 %	294139883
23112	NC_014012	CGA	2	6	1306892	1306897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139883
23113	NC_014012	TCA	2	6	1306910	1306915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139883
23114	NC_014012	TTAT	2	8	1306946	1306953	25 %	75 %	0 %	0 %	294139884
23115	NC_014012	GCA	2	6	1307017	1307022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139884
23116	NC_014012	TAT	2	6	1307090	1307095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139884
23117	NC_014012	GCA	2	6	1307173	1307178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139884
23118	NC_014012	CGA	2	6	1307287	1307292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139884
23119	NC_014012	T	6	6	1307389	1307394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23120	NC_014012	TGGCAG	2	12	1307445	1307456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294139885
23121	NC_014012	CTG	2	6	1307599	1307604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139885
23122	NC_014012	GTG	2	6	1307636	1307641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139885
23123	NC_014012	AAT	2	6	1307769	1307774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139885
23124	NC_014012	CT	3	6	1307808	1307813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23125	NC_014012	TGA	2	6	1307855	1307860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23126	NC_014012	TTTA	2	8	1307888	1307895	25 %	75 %	0 %	0 %	294139886
23127	NC_014012	GAT	2	6	1307947	1307952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139886
23128	NC_014012	ATA	2	6	1308034	1308039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139886
23129	NC_014012	ATC	2	6	1308091	1308096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139886
23130	NC_014012	AGT	2	6	1308214	1308219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139886
23131	NC_014012	GGT	2	6	1308262	1308267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139886
23132	NC_014012	AG	3	6	1308407	1308412	50 %	0 %	50 %	0 %	294139886
23133	NC_014012	TTG	2	6	1308521	1308526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139886
23134	NC_014012	TGG	2	6	1308528	1308533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139886
23135	NC_014012	TTG	2	6	1308535	1308540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139886
23136	NC_014012	AT	3	6	1308551	1308556	50 %	50 %	0 %	0 %	294139886
23137	NC_014012	GCC	3	9	1308583	1308591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139886
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23142	NC_014012	GTTT	2	8	1308827	1308834	0 %	75 %	25 %	0 %	294139886
23143	NC_014012	TCG	2	6	1308884	1308889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139886
23144	NC_014012	ATCT	2	8	1308913	1308920	25 %	50 %	0 %	25 %	294139886
23145	NC_014012	GCC	2	6	1309010	1309015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139886
23146	NC_014012	TG	3	6	1309139	1309144	0 %	50 %	50 %	0 %	294139886
23147	NC_014012	AGGT	2	8	1309217	1309224	25 %	25 %	50 %	0 %	294139886
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23149	NC_014012	GATT	2	8	1309274	1309281	25 %	50 %	25 %	0 %	294139886
23150	NC_014012	TGTACC	3	18	1309348	1309365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294139886
23151	NC_014012	TAC	2	6	1309407	1309412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139886
23152	NC_014012	CAC	2	6	1309413	1309418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139886
23153	NC_014012	ATAA	2	8	1309490	1309497	75 %	25 %	0 %	0 %	294139886
23154	NC_014012	TAT	2	6	1309503	1309508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23155	NC_014012	CGAAAC	2	12	1309574	1309585	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23156	NC_014012	TTA	2	6	1309593	1309598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23157	NC_014012	AGA	2	6	1309617	1309622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23158	NC_014012	ATA	2	6	1309640	1309645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23159	NC_014012	CTAGG	2	10	1309678	1309687	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23160	NC_014012	TCT	2	6	1309724	1309729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139887
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23162	NC_014012	TC	3	6	1309864	1309869	0 %	50 %	0 %	50 %	294139887
23163	NC_014012	ACT	2	6	1309895	1309900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139887
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23170	NC_014012	TTAT	2	8	1310304	1310311	25 %	75 %	0 %	0 %	294139887
23171	NC_014012	GAA	2	6	1310406	1310411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139887
23172	NC_014012	TA	3	6	1310566	1310571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23173	NC_014012	GCA	2	6	1310577	1310582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23175	NC_014012	TATT	2	8	1310676	1310683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23176	NC_014012	AAT	2	6	1310690	1310695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139888
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23187	NC_014012	ATCGC	2	10	1311382	1311391	20 %	20 %	20 %	40 %	294139888
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23191	NC_014012	AAC	2	6	1311625	1311630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23192	NC_014012	AGAACA	2	12	1311739	1311750	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294139889
23193	NC_014012	GTA	2	6	1311761	1311766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139889
23194	NC_014012	TGA	2	6	1311808	1311813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139889
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23201	NC_014012	A	6	6	1312447	1312452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23202	NC_014012	T	6	6	1312469	1312474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23203	NC_014012	ATCA	2	8	1312486	1312493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23204	NC_014012	TAA	2	6	1312583	1312588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139890
23205	NC_014012	TTC	2	6	1312644	1312649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139890
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23221	NC_014012	AT	3	6	1313366	1313371	50 %	50 %	0 %	0 %	294139890
23222	NC_014012	TTC	2	6	1313628	1313633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139890
23223	NC_014012	AAC	2	6	1313649	1313654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139890
23224	NC_014012	TGA	2	6	1313696	1313701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139890
23225	NC_014012	CTT	2	6	1313721	1313726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139890
23226	NC_014012	GTG	2	6	1313743	1313748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139890
23227	NC_014012	ATT	2	6	1313781	1313786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139890
23228	NC_014012	TCGTTA	2	12	1313818	1313829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294139890
23229	NC_014012	TGC	2	6	1313973	1313978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139890
23230	NC_014012	ACTC	2	8	1314020	1314027	25 %	25 %	0 %	50 %	294139890
23231	NC_014012	CCT	2	6	1314055	1314060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139890
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23233	NC_014012	TGG	2	6	1314121	1314126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139890
23234	NC_014012	TAT	2	6	1314158	1314163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139890
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23249	NC_014012	GCAG	2	8	1315544	1315551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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23357	NC_014012	TTCA	2	8	1320614	1320621	25 %	50 %	0 %	25 %	294139898
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23456	NC_014012	ATT	2	6	1325523	1325528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23460	NC_014012	GAC	2	6	1325668	1325673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23461	NC_014012	A	7	7	1325693	1325699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23463	NC_014012	A	7	7	1325706	1325712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23464	NC_014012	ACG	2	6	1325799	1325804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23470	NC_014012	A	6	6	1326105	1326110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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