MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_014012	TAG	2	6	1272366	1272371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139858
22503	NC_014012	TGCC	2	8	1272394	1272401	0 %	25 %	25 %	50 %	294139858
22504	NC_014012	GCA	2	6	1272445	1272450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139858
22505	NC_014012	ATG	2	6	1272459	1272464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139858
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22509	NC_014012	CGG	2	6	1272766	1272771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139858
22510	NC_014012	TCA	2	6	1272816	1272821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139858
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22588	NC_014012	GATT	2	8	1277167	1277174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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22598	NC_014012	TAA	2	6	1277718	1277723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22600	NC_014012	TG	3	6	1277812	1277817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22601	NC_014012	ATA	2	6	1277865	1277870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22602	NC_014012	TGGC	2	8	1277888	1277895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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22608	NC_014012	CTAT	2	8	1278216	1278223	25 %	50 %	0 %	25 %	294139863
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22620	NC_014012	TTA	2	6	1278777	1278782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139863
22621	NC_014012	GTG	2	6	1278820	1278825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139863
22622	NC_014012	AGA	2	6	1278830	1278835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139863
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22722	NC_014012	T	7	7	1285059	1285065	0 %	100 %	0 %	0 %	294139865
22723	NC_014012	A	6	6	1285122	1285127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22724	NC_014012	TGAA	2	8	1285210	1285217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22725	NC_014012	TAAT	2	8	1285405	1285412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22726	NC_014012	AGGA	2	8	1285500	1285507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22727	NC_014012	TGC	2	6	1285552	1285557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22731	NC_014012	GTG	2	6	1285673	1285678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139866
22732	NC_014012	TTGG	2	8	1285682	1285689	0 %	50 %	50 %	0 %	294139866
22733	NC_014012	ATT	2	6	1285795	1285800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139866
22734	NC_014012	AG	3	6	1285806	1285811	50 %	0 %	50 %	0 %	294139866
22735	NC_014012	CAA	2	6	1285860	1285865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139866
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22971	NC_014012	GAT	2	6	1299454	1299459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139875
22972	NC_014012	TTG	2	6	1299469	1299474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139875
22973	NC_014012	ATTCT	2	10	1299486	1299495	20 %	60 %	0 %	20 %	294139875
22974	NC_014012	TGC	2	6	1299501	1299506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139875
22975	NC_014012	TGG	2	6	1299518	1299523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139875
22976	NC_014012	TGG	2	6	1299533	1299538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139875
22977	NC_014012	CGG	2	6	1299627	1299632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139875
22978	NC_014012	TCT	2	6	1299676	1299681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139875
22979	NC_014012	TGG	2	6	1299719	1299724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139875
22980	NC_014012	TG	3	6	1299725	1299730	0 %	50 %	50 %	0 %	294139875
22981	NC_014012	TC	3	6	1299791	1299796	0 %	50 %	0 %	50 %	294139875
22982	NC_014012	A	6	6	1299867	1299872	100 %	0 %	0 %	0 %	294139875
22983	NC_014012	CAT	2	6	1299891	1299896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139875
22984	NC_014012	GCC	2	6	1299986	1299991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139875
22985	NC_014012	GAA	2	6	1300012	1300017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139875
22986	NC_014012	GTC	2	6	1300081	1300086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139875
22987	NC_014012	TCA	2	6	1300176	1300181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22988	NC_014012	AGC	2	6	1300314	1300319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139876
22989	NC_014012	CTG	2	6	1300337	1300342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139876
22990	NC_014012	GGCC	2	8	1300364	1300371	0 %	0 %	50 %	50 %	294139876
22991	NC_014012	CTC	2	6	1300413	1300418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139876
22992	NC_014012	GCT	2	6	1300429	1300434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139876
22993	NC_014012	CTG	2	6	1300439	1300444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139876
22994	NC_014012	GGCT	2	8	1300522	1300529	0 %	25 %	50 %	25 %	294139876
22995	NC_014012	GA	3	6	1300542	1300547	50 %	0 %	50 %	0 %	294139876
22996	NC_014012	GA	3	6	1300554	1300559	50 %	0 %	50 %	0 %	294139876
22997	NC_014012	GT	4	8	1300665	1300672	0 %	50 %	50 %	0 %	294139876
22998	NC_014012	GGC	2	6	1300717	1300722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139876
22999	NC_014012	CAG	2	6	1300738	1300743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139876
23000	NC_014012	CCTGG	2	10	1300768	1300777	0 %	20 %	40 %	40 %	294139876

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