MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_014012	AGT	2	6	1214231	1214236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139812
21502	NC_014012	CCTG	2	8	1214336	1214343	0 %	25 %	25 %	50 %	294139812
21503	NC_014012	TAA	2	6	1214368	1214373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139812
21504	NC_014012	GCG	2	6	1214393	1214398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139812
21505	NC_014012	ACG	2	6	1214494	1214499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139812
21506	NC_014012	GT	3	6	1214518	1214523	0 %	50 %	50 %	0 %	294139812
21507	NC_014012	AAT	2	6	1214590	1214595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139812
21508	NC_014012	ATC	2	6	1214600	1214605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139812
21509	NC_014012	CA	3	6	1214761	1214766	50 %	0 %	0 %	50 %	294139813
21510	NC_014012	ATC	2	6	1214767	1214772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139813
21511	NC_014012	GCG	2	6	1214816	1214821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139813
21512	NC_014012	GCGCC	2	10	1214907	1214916	0 %	0 %	40 %	60 %	294139813
21513	NC_014012	A	6	6	1215005	1215010	100 %	0 %	0 %	0 %	294139813
21514	NC_014012	CGC	3	9	1215081	1215089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139813
21515	NC_014012	GAT	2	6	1215125	1215130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139813
21516	NC_014012	AAT	2	6	1215222	1215227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139813
21517	NC_014012	GCT	2	6	1215254	1215259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139813
21518	NC_014012	TGA	3	9	1215264	1215272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139813
21519	NC_014012	T	6	6	1215274	1215279	0 %	100 %	0 %	0 %	294139813
21520	NC_014012	GTT	2	6	1215472	1215477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139813
21521	NC_014012	TGC	2	6	1215495	1215500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139813
21522	NC_014012	T	8	8	1215532	1215539	0 %	100 %	0 %	0 %	294139813
21523	NC_014012	GTT	2	6	1215628	1215633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21524	NC_014012	GGA	2	6	1215904	1215909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139814
21525	NC_014012	TCC	2	6	1215954	1215959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139814
21526	NC_014012	GTG	2	6	1216018	1216023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139814
21527	NC_014012	TGGC	2	8	1216098	1216105	0 %	25 %	50 %	25 %	294139814
21528	NC_014012	GAT	2	6	1216106	1216111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139814
21529	NC_014012	GCA	2	6	1216163	1216168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139814
21530	NC_014012	GGC	2	6	1216244	1216249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139814
21531	NC_014012	TACT	2	8	1216276	1216283	25 %	50 %	0 %	25 %	294139814
21532	NC_014012	GAA	2	6	1216314	1216319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139814
21533	NC_014012	TTCGA	2	10	1216334	1216343	20 %	40 %	20 %	20 %	294139814
21534	NC_014012	GTCT	2	8	1216360	1216367	0 %	50 %	25 %	25 %	294139814
21535	NC_014012	TTG	2	6	1216372	1216377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139814
21536	NC_014012	ATG	2	6	1216380	1216385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139814
21537	NC_014012	T	6	6	1216390	1216395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21538	NC_014012	ATC	2	6	1216545	1216550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139815
21539	NC_014012	CAT	2	6	1216576	1216581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139815
21540	NC_014012	AGC	2	6	1216590	1216595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139815
21541	NC_014012	AGAT	2	8	1216620	1216627	50 %	25 %	25 %	0 %	294139815
21542	NC_014012	GAG	2	6	1216686	1216691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139815
21543	NC_014012	CGG	2	6	1216695	1216700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139815
21544	NC_014012	AGC	2	6	1216737	1216742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139815
21545	NC_014012	GGC	2	6	1216837	1216842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139815
21546	NC_014012	GTC	2	6	1216866	1216871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139815
21547	NC_014012	GC	3	6	1216989	1216994	0 %	0 %	50 %	50 %	294139815
21548	NC_014012	TGG	2	6	1217019	1217024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139815
21549	NC_014012	CAG	2	6	1217064	1217069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139815
21550	NC_014012	AC	3	6	1217101	1217106	50 %	0 %	0 %	50 %	294139815
21551	NC_014012	A	6	6	1217225	1217230	100 %	0 %	0 %	0 %	294139815
21552	NC_014012	GAG	2	6	1217235	1217240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139815
21553	NC_014012	GGC	2	6	1217248	1217253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139815
21554	NC_014012	ATG	2	6	1217264	1217269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139815
21555	NC_014012	TAT	2	6	1217475	1217480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139816
21556	NC_014012	TATT	2	8	1217531	1217538	25 %	75 %	0 %	0 %	294139816
21557	NC_014012	C	6	6	1217550	1217555	0 %	0 %	0 %	100 %	294139816
21558	NC_014012	TC	3	6	1217603	1217608	0 %	50 %	0 %	50 %	294139816
21559	NC_014012	TGA	2	6	1217639	1217644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139816
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21562	NC_014012	TTGCC	2	10	1217696	1217705	0 %	40 %	20 %	40 %	294139816
21563	NC_014012	AG	3	6	1217741	1217746	50 %	0 %	50 %	0 %	294139816
21564	NC_014012	CGT	2	6	1217767	1217772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139816
21565	NC_014012	GAT	2	6	1217797	1217802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139816
21566	NC_014012	TGA	2	6	1217834	1217839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139816
21567	NC_014012	TCA	3	9	1217852	1217860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139816
21568	NC_014012	TGG	2	6	1217906	1217911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139816
21569	NC_014012	TATG	2	8	1218146	1218153	25 %	50 %	25 %	0 %	294139816
21570	NC_014012	CAG	2	6	1218226	1218231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139816
21571	NC_014012	CTA	2	6	1218232	1218237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139816
21572	NC_014012	TAG	2	6	1218348	1218353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139816
21573	NC_014012	TTG	2	6	1218439	1218444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139816
21574	NC_014012	TA	3	6	1218449	1218454	50 %	50 %	0 %	0 %	294139816
21575	NC_014012	CAT	2	6	1218487	1218492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139816
21576	NC_014012	TGA	2	6	1218518	1218523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139816
21577	NC_014012	ATC	2	6	1218598	1218603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21578	NC_014012	AGG	2	6	1218650	1218655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21579	NC_014012	T	6	6	1218678	1218683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21580	NC_014012	TAG	2	6	1218787	1218792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139817
21581	NC_014012	GAT	2	6	1218954	1218959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139817
21582	NC_014012	TCAT	2	8	1219006	1219013	25 %	50 %	0 %	25 %	294139817
21583	NC_014012	GCTT	2	8	1219084	1219091	0 %	50 %	25 %	25 %	294139817
21584	NC_014012	CATT	2	8	1219104	1219111	25 %	50 %	0 %	25 %	294139817
21585	NC_014012	TAT	2	6	1219128	1219133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139817
21586	NC_014012	ATG	2	6	1219219	1219224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139817
21587	NC_014012	CGAG	2	8	1219322	1219329	25 %	0 %	50 %	25 %	294139817
21588	NC_014012	ACG	2	6	1219335	1219340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139817
21589	NC_014012	CTT	2	6	1219366	1219371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139817
21590	NC_014012	ATT	2	6	1219390	1219395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139817
21591	NC_014012	CA	3	6	1219398	1219403	50 %	0 %	0 %	50 %	294139817
21592	NC_014012	TAT	2	6	1219503	1219508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139817
21593	NC_014012	TC	3	6	1219603	1219608	0 %	50 %	0 %	50 %	294139817
21594	NC_014012	GATTC	2	10	1219698	1219707	20 %	40 %	20 %	20 %	294139817
21595	NC_014012	TGGAT	2	10	1219756	1219765	20 %	40 %	40 %	0 %	294139817
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21597	NC_014012	CAT	2	6	1219893	1219898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21598	NC_014012	A	6	6	1220010	1220015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21599	NC_014012	TTATT	2	10	1220047	1220056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21600	NC_014012	TTATT	2	10	1220137	1220146	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21601	NC_014012	CGG	2	6	1220385	1220390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139818
21602	NC_014012	CTT	2	6	1220455	1220460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139818
21603	NC_014012	CT	3	6	1220463	1220468	0 %	50 %	0 %	50 %	294139818
21604	NC_014012	CCAT	2	8	1220489	1220496	25 %	25 %	0 %	50 %	294139818
21605	NC_014012	ACG	2	6	1220513	1220518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139818
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21607	NC_014012	TTAT	2	8	1220702	1220709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21608	NC_014012	AAT	2	6	1220716	1220721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21609	NC_014012	TGAT	2	8	1220750	1220757	25 %	50 %	25 %	0 %	294139819
21610	NC_014012	AT	3	6	1220770	1220775	50 %	50 %	0 %	0 %	294139819
21611	NC_014012	CTC	2	6	1220810	1220815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139819
21612	NC_014012	CGA	2	6	1220923	1220928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139819
21613	NC_014012	TCA	2	6	1220997	1221002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139819
21614	NC_014012	GT	3	6	1221037	1221042	0 %	50 %	50 %	0 %	294139819
21615	NC_014012	CTCG	2	8	1221055	1221062	0 %	25 %	25 %	50 %	294139819
21616	NC_014012	CCG	2	6	1221075	1221080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139819
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21618	NC_014012	GAG	2	6	1221102	1221107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139819
21619	NC_014012	TCA	2	6	1221120	1221125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139819
21620	NC_014012	GCA	2	6	1221142	1221147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139819
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21634	NC_014012	GCTA	2	8	1221832	1221839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21635	NC_014012	AT	3	6	1221850	1221855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21636	NC_014012	GGGA	2	8	1221860	1221867	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21637	NC_014012	CTAG	2	8	1221888	1221895	25 %	25 %	25 %	25 %	294139821
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21650	NC_014012	GCG	2	6	1222599	1222604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139822
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21659	NC_014012	T	7	7	1223062	1223068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21660	NC_014012	GGT	2	6	1223133	1223138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21743	NC_014012	TGA	2	6	1228076	1228081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139828
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21746	NC_014012	T	6	6	1228350	1228355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21826	NC_014012	TTGC	2	8	1232631	1232638	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21827	NC_014012	TGT	2	6	1232639	1232644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21837	NC_014012	TGT	2	6	1233096	1233101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139832
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21851	NC_014012	ACCA	2	8	1234076	1234083	50 %	0 %	0 %	50 %	294139832
21852	NC_014012	GGC	2	6	1234113	1234118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139832
21853	NC_014012	TGT	2	6	1234148	1234153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139832
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21974	NC_014012	ATC	2	6	1241628	1241633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139838
21975	NC_014012	T	7	7	1241678	1241684	0 %	100 %	0 %	0 %	294139838
21976	NC_014012	TC	3	6	1241744	1241749	0 %	50 %	0 %	50 %	294139838
21977	NC_014012	TTG	2	6	1241758	1241763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139838
21978	NC_014012	ATG	2	6	1241966	1241971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139838
21979	NC_014012	T	6	6	1242188	1242193	0 %	100 %	0 %	0 %	294139838
21980	NC_014012	TCTG	2	8	1242195	1242202	0 %	50 %	25 %	25 %	294139838
21981	NC_014012	GTG	2	6	1242226	1242231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139838
21982	NC_014012	TC	3	6	1242281	1242286	0 %	50 %	0 %	50 %	294139838
21983	NC_014012	TAG	2	6	1242359	1242364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139838
21984	NC_014012	GTG	2	6	1242421	1242426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139838
21985	NC_014012	TCG	2	6	1242464	1242469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139838
21986	NC_014012	AATC	2	8	1242518	1242525	50 %	25 %	0 %	25 %	294139838
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21988	NC_014012	TGGAC	2	10	1242702	1242711	20 %	20 %	40 %	20 %	294139838
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21992	NC_014012	GGT	2	6	1242831	1242836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139838
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21995	NC_014012	CGC	2	6	1243025	1243030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139838
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21998	NC_014012	GTCT	2	8	1243214	1243221	0 %	50 %	25 %	25 %	294139838
21999	NC_014012	TGG	2	6	1243322	1243327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139838
22000	NC_014012	GAA	2	6	1243377	1243382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139838

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