MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21003	NC_014012	GAC	2	6	1186005	1186010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139789
21004	NC_014012	A	6	6	1186018	1186023	100 %	0 %	0 %	0 %	294139789
21005	NC_014012	AGA	2	6	1186109	1186114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139789
21006	NC_014012	GGCCAA	2	12	1186191	1186202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139789
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21008	NC_014012	TTA	2	6	1186245	1186250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139789
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21012	NC_014012	TTG	2	6	1186378	1186383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139789
21013	NC_014012	GGT	2	6	1186386	1186391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139789
21014	NC_014012	GGT	2	6	1186395	1186400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139789
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21043	NC_014012	TAA	2	6	1188574	1188579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21045	NC_014012	TTA	2	6	1188617	1188622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21054	NC_014012	A	7	7	1188845	1188851	100 %	0 %	0 %	0 %	294139790
21055	NC_014012	TGGA	2	8	1188935	1188942	25 %	25 %	50 %	0 %	294139790
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21102	NC_014012	TA	3	6	1191287	1191292	50 %	50 %	0 %	0 %	294139792
21103	NC_014012	ACC	2	6	1191407	1191412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139792
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21106	NC_014012	A	7	7	1191596	1191602	100 %	0 %	0 %	0 %	294139792
21107	NC_014012	TCA	2	6	1191709	1191714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139792
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21112	NC_014012	ATA	2	6	1191839	1191844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21113	NC_014012	AAT	2	6	1191935	1191940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21114	NC_014012	TAAC	2	8	1192070	1192077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21115	NC_014012	TG	3	6	1192173	1192178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21116	NC_014012	TC	3	6	1192289	1192294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21118	NC_014012	T	8	8	1192353	1192360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21119	NC_014012	A	6	6	1192404	1192409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21120	NC_014012	CCT	2	6	1192460	1192465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21121	NC_014012	GA	3	6	1192575	1192580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21122	NC_014012	TAG	2	6	1192592	1192597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21219	NC_014012	TGA	2	6	1198974	1198979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21221	NC_014012	CTG	3	9	1199052	1199060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21222	NC_014012	A	6	6	1199156	1199161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21223	NC_014012	A	6	6	1199277	1199282	100 %	0 %	0 %	0 %	294139797
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21229	NC_014012	GCT	2	6	1199961	1199966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21234	NC_014012	GGT	2	6	1200046	1200051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21237	NC_014012	A	6	6	1200173	1200178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21238	NC_014012	TCG	2	6	1200198	1200203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21239	NC_014012	GTAA	2	8	1200239	1200246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21240	NC_014012	A	6	6	1200412	1200417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21276	NC_014012	GT	3	6	1202392	1202397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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21331	NC_014012	TAAA	2	8	1204851	1204858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21332	NC_014012	GTC	2	6	1204885	1204890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139803
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21352	NC_014012	TAT	2	6	1206137	1206142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21353	NC_014012	ACT	2	6	1206190	1206195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21354	NC_014012	AT	3	6	1206237	1206242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21355	NC_014012	TTG	2	6	1206271	1206276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21356	NC_014012	TGA	2	6	1206387	1206392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139805
21357	NC_014012	AAG	2	6	1206576	1206581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139805
21358	NC_014012	ATG	2	6	1206714	1206719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139805
21359	NC_014012	GCG	2	6	1206740	1206745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139805
21360	NC_014012	GCA	2	6	1206776	1206781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139805
21361	NC_014012	TGA	2	6	1206793	1206798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139805
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21365	NC_014012	TCTA	2	8	1206858	1206865	25 %	50 %	0 %	25 %	294139805
21366	NC_014012	TCT	2	6	1206878	1206883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139805
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21373	NC_014012	TCAA	2	8	1207368	1207375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21374	NC_014012	A	6	6	1207446	1207451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21375	NC_014012	TAA	2	6	1207452	1207457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21377	NC_014012	ACTCT	2	10	1207496	1207505	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21378	NC_014012	A	6	6	1207557	1207562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21379	NC_014012	GCA	2	6	1207691	1207696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139806
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21402	NC_014012	TAC	2	6	1209025	1209030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21475	NC_014012	ATTGA	2	10	1212955	1212964	40 %	40 %	20 %	0 %	294139809
21476	NC_014012	GAAC	2	8	1213044	1213051	50 %	0 %	25 %	25 %	294139809
21477	NC_014012	TTG	2	6	1213080	1213085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21478	NC_014012	AGG	3	9	1213106	1213114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21479	NC_014012	GCT	2	6	1213170	1213175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21480	NC_014012	ATC	2	6	1213297	1213302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139810
21481	NC_014012	ATA	2	6	1213324	1213329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139810
21482	NC_014012	GCCTT	2	10	1213334	1213343	0 %	40 %	20 %	40 %	294139810
21483	NC_014012	TC	3	6	1213350	1213355	0 %	50 %	0 %	50 %	294139810
21484	NC_014012	TTG	2	6	1213388	1213393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139810
21485	NC_014012	TGG	2	6	1213420	1213425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139810
21486	NC_014012	CTT	2	6	1213431	1213436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139810
21487	NC_014012	TA	3	6	1213471	1213476	50 %	50 %	0 %	0 %	294139810
21488	NC_014012	TTTCTG	2	12	1213567	1213578	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294139810
21489	NC_014012	CTG	2	6	1213581	1213586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139810
21490	NC_014012	GCT	2	6	1213648	1213653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21491	NC_014012	AT	3	6	1213699	1213704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21492	NC_014012	AAT	2	6	1213894	1213899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139811
21493	NC_014012	GA	3	6	1213931	1213936	50 %	0 %	50 %	0 %	294139811
21494	NC_014012	GGC	2	6	1213973	1213978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139811
21495	NC_014012	AGC	2	6	1214060	1214065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139811
21496	NC_014012	CTG	2	6	1214074	1214079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139811
21497	NC_014012	GCA	2	6	1214091	1214096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139811
21498	NC_014012	ATC	3	9	1214165	1214173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139812
21499	NC_014012	AG	3	6	1214182	1214187	50 %	0 %	50 %	0 %	294139812
21500	NC_014012	GCG	2	6	1214215	1214220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139812

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