MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

< Previous12...3435363738394041424344...175176Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19003	NC_014012	GGT	2	6	1075112	1075117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139694
19004	NC_014012	AGC	2	6	1075131	1075136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139694
19005	NC_014012	AAG	3	9	1075239	1075247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139694
19006	NC_014012	AGT	2	6	1075255	1075260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139694
19007	NC_014012	AT	3	6	1075315	1075320	50 %	50 %	0 %	0 %	294139694
19008	NC_014012	AGG	2	6	1075323	1075328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139694
19009	NC_014012	GAGC	2	8	1075421	1075428	25 %	0 %	50 %	25 %	294139694
19010	NC_014012	AAG	2	6	1075527	1075532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139694
19011	NC_014012	TAG	2	6	1075572	1075577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139694
19012	NC_014012	AGGG	2	8	1075593	1075600	25 %	0 %	75 %	0 %	294139694
19013	NC_014012	TGC	2	6	1075612	1075617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139694
19014	NC_014012	CAT	2	6	1075648	1075653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139694
19015	NC_014012	CAG	2	6	1075674	1075679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139694
19016	NC_014012	AAG	2	6	1075688	1075693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139694
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19018	NC_014012	GGTT	2	8	1075918	1075925	0 %	50 %	50 %	0 %	294139694
19019	NC_014012	GCA	2	6	1075954	1075959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139694
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19023	NC_014012	AT	3	6	1076419	1076424	50 %	50 %	0 %	0 %	294139694
19024	NC_014012	TAGA	2	8	1076433	1076440	50 %	25 %	25 %	0 %	294139694
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19033	NC_014012	TAC	2	6	1076820	1076825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19035	NC_014012	AAT	3	9	1076895	1076903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19039	NC_014012	CT	3	6	1077075	1077080	0 %	50 %	0 %	50 %	294139695
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19096	NC_014012	ATCTC	2	10	1080009	1080018	20 %	40 %	0 %	40 %	294139697
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19352	NC_014012	TAA	2	6	1096509	1096514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139714
19353	NC_014012	A	6	6	1096634	1096639	100 %	0 %	0 %	0 %	294139714
19354	NC_014012	TGA	2	6	1096712	1096717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139714
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19373	NC_014012	GTTT	2	8	1097700	1097707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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19375	NC_014012	AATT	2	8	1097744	1097751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19376	NC_014012	ATT	2	6	1097763	1097768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19383	NC_014012	TGG	2	6	1097872	1097877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19449	NC_014012	ATA	2	6	1101724	1101729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139717
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19460	NC_014012	ATC	2	6	1102527	1102532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139717
19461	NC_014012	ATG	2	6	1102540	1102545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
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19464	NC_014012	GATT	2	8	1102625	1102632	25 %	50 %	25 %	0 %	294139717
19465	NC_014012	ATA	2	6	1102654	1102659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139717
19466	NC_014012	TGC	2	6	1102697	1102702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139717
19467	NC_014012	ATG	2	6	1102747	1102752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
19468	NC_014012	ATG	2	6	1102861	1102866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
19469	NC_014012	TCAA	2	8	1102876	1102883	50 %	25 %	0 %	25 %	294139717
19470	NC_014012	GAA	2	6	1103013	1103018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139717
19471	NC_014012	TCG	2	6	1103029	1103034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139717
19472	NC_014012	AGC	2	6	1103072	1103077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139717
19473	NC_014012	CAA	2	6	1103125	1103130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139717
19474	NC_014012	GATA	2	8	1103153	1103160	50 %	25 %	25 %	0 %	294139717
19475	NC_014012	ATT	2	6	1103413	1103418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139717
19476	NC_014012	AAC	2	6	1103445	1103450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139717
19477	NC_014012	TATGA	2	10	1103754	1103763	40 %	40 %	20 %	0 %	294139717
19478	NC_014012	AGCTG	2	10	1103774	1103783	20 %	20 %	40 %	20 %	294139717
19479	NC_014012	AT	3	6	1103855	1103860	50 %	50 %	0 %	0 %	294139717
19480	NC_014012	CT	3	6	1103925	1103930	0 %	50 %	0 %	50 %	294139717
19481	NC_014012	T	6	6	1103952	1103957	0 %	100 %	0 %	0 %	294139717
19482	NC_014012	GAA	2	6	1103973	1103978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139717
19483	NC_014012	TAA	2	6	1104014	1104019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139717
19484	NC_014012	GCT	2	6	1104024	1104029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139717
19485	NC_014012	GTGATG	2	12	1104037	1104048	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294139717
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19487	NC_014012	TAA	2	6	1104098	1104103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139717
19488	NC_014012	GAT	2	6	1104135	1104140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
19489	NC_014012	TA	3	6	1104141	1104146	50 %	50 %	0 %	0 %	294139717
19490	NC_014012	TGG	2	6	1104149	1104154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139717
19491	NC_014012	TGA	2	6	1104161	1104166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
19492	NC_014012	GTA	2	6	1104178	1104183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
19493	NC_014012	GAT	2	6	1104243	1104248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
19494	NC_014012	GGT	2	6	1104258	1104263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139717
19495	NC_014012	ATG	2	6	1104271	1104276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
19496	NC_014012	TGG	2	6	1104284	1104289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139717
19497	NC_014012	TTG	2	6	1104439	1104444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139717
19498	NC_014012	TAT	2	6	1104476	1104481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139717
19499	NC_014012	AGT	2	6	1104495	1104500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
19500	NC_014012	TGA	2	6	1104680	1104685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717

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