MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_014012	ATG	2	6	1048088	1048093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139669
18502	NC_014012	ATG	2	6	1048106	1048111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139669
18503	NC_014012	AGCTT	2	10	1048148	1048157	20 %	40 %	20 %	20 %	294139669
18504	NC_014012	T	6	6	1048214	1048219	0 %	100 %	0 %	0 %	294139669
18505	NC_014012	ATT	2	6	1048282	1048287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18506	NC_014012	GTT	2	6	1048310	1048315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18507	NC_014012	ATC	2	6	1048331	1048336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139670
18508	NC_014012	CGAA	2	8	1048362	1048369	50 %	0 %	25 %	25 %	294139670
18509	NC_014012	TACT	2	8	1048390	1048397	25 %	50 %	0 %	25 %	294139670
18510	NC_014012	GCT	2	6	1048398	1048403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139670
18511	NC_014012	ATTG	2	8	1048407	1048414	25 %	50 %	25 %	0 %	294139670
18512	NC_014012	GGGA	2	8	1048425	1048432	25 %	0 %	75 %	0 %	294139670
18513	NC_014012	AGC	2	6	1048508	1048513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139670
18514	NC_014012	AGC	2	6	1048536	1048541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139670
18515	NC_014012	AGC	2	6	1048604	1048609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139670
18516	NC_014012	ATA	2	6	1048862	1048867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139670
18517	NC_014012	CAG	2	6	1048910	1048915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139670
18518	NC_014012	A	6	6	1049058	1049063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18519	NC_014012	GAA	2	6	1049267	1049272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139671
18520	NC_014012	ATG	2	6	1049274	1049279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139671
18521	NC_014012	GTC	2	6	1049399	1049404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139671
18522	NC_014012	TGGT	2	8	1049427	1049434	0 %	50 %	50 %	0 %	294139671
18523	NC_014012	GAA	2	6	1049482	1049487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139671
18524	NC_014012	ACA	2	6	1049498	1049503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139671
18525	NC_014012	AGCT	2	8	1049518	1049525	25 %	25 %	25 %	25 %	294139671
18526	NC_014012	A	7	7	1049568	1049574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18527	NC_014012	TTGCA	2	10	1049580	1049589	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18528	NC_014012	T	8	8	1049596	1049603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18529	NC_014012	ATG	2	6	1049713	1049718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139672
18530	NC_014012	CGA	2	6	1049783	1049788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139672
18531	NC_014012	GCA	2	6	1049819	1049824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139672
18532	NC_014012	TTGCT	2	10	1049940	1049949	0 %	60 %	20 %	20 %	294139672
18533	NC_014012	AAAG	2	8	1049976	1049983	75 %	0 %	25 %	0 %	294139672
18534	NC_014012	CAGC	2	8	1049993	1050000	25 %	0 %	25 %	50 %	294139672
18535	NC_014012	TGCT	2	8	1050068	1050075	0 %	50 %	25 %	25 %	294139672
18536	NC_014012	TGC	2	6	1050192	1050197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139673
18537	NC_014012	GCT	2	6	1050211	1050216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139673
18538	NC_014012	AGGG	2	8	1050226	1050233	25 %	0 %	75 %	0 %	294139673
18539	NC_014012	CAA	2	6	1050271	1050276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139673
18540	NC_014012	ATC	3	9	1050281	1050289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139673
18541	NC_014012	ATC	2	6	1050359	1050364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139673
18542	NC_014012	CTT	2	6	1050385	1050390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139673
18543	NC_014012	TCTTCC	2	12	1050414	1050425	0 %	50 %	0 %	50 %	294139673
18544	NC_014012	CAT	3	9	1050445	1050453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139673
18545	NC_014012	CAA	2	6	1050493	1050498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139673
18546	NC_014012	AGT	2	6	1050499	1050504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139673
18547	NC_014012	TC	3	6	1050561	1050566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18548	NC_014012	ATCAT	2	10	1050611	1050620	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18549	NC_014012	GGA	2	6	1050628	1050633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_014012	GGA	2	6	1050654	1050659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_014012	TTAG	2	8	1050725	1050732	25 %	50 %	25 %	0 %	294139674
18552	NC_014012	CTTT	2	8	1050733	1050740	0 %	75 %	0 %	25 %	294139674
18553	NC_014012	AAC	2	6	1050802	1050807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139674
18554	NC_014012	CAA	2	6	1050833	1050838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139674
18555	NC_014012	TAC	2	6	1050854	1050859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139674
18556	NC_014012	GAG	2	6	1050950	1050955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139674
18557	NC_014012	GAA	2	6	1050990	1050995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139674
18558	NC_014012	TGT	2	6	1051034	1051039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139674
18559	NC_014012	CCA	2	6	1051042	1051047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139674
18560	NC_014012	ACC	2	6	1051146	1051151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139674
18561	NC_014012	AT	3	6	1051250	1051255	50 %	50 %	0 %	0 %	294139674
18562	NC_014012	GAAA	2	8	1051299	1051306	75 %	0 %	25 %	0 %	294139674
18563	NC_014012	ACC	2	6	1051365	1051370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139674
18564	NC_014012	GCC	2	6	1051402	1051407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139674
18565	NC_014012	T	6	6	1051409	1051414	0 %	100 %	0 %	0 %	294139674
18566	NC_014012	ATGA	2	8	1051549	1051556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18567	NC_014012	T	6	6	1051566	1051571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18568	NC_014012	AGAT	2	8	1051623	1051630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18569	NC_014012	GCA	2	6	1051646	1051651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18570	NC_014012	TTAA	2	8	1051715	1051722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18571	NC_014012	AGA	2	6	1051732	1051737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18572	NC_014012	AG	3	6	1051761	1051766	50 %	0 %	50 %	0 %	294139675
18573	NC_014012	GGT	2	6	1051825	1051830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139675
18574	NC_014012	GTA	2	6	1051896	1051901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139675
18575	NC_014012	CAT	2	6	1051940	1051945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139675
18576	NC_014012	CCG	2	6	1051965	1051970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139675
18577	NC_014012	GCTAT	2	10	1052016	1052025	20 %	40 %	20 %	20 %	294139675
18578	NC_014012	TGT	2	6	1052091	1052096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139675
18579	NC_014012	TTGA	2	8	1052108	1052115	25 %	50 %	25 %	0 %	294139675
18580	NC_014012	GA	3	6	1052149	1052154	50 %	0 %	50 %	0 %	294139675
18581	NC_014012	TGAG	2	8	1052159	1052166	25 %	25 %	50 %	0 %	294139675
18582	NC_014012	GAT	2	6	1052173	1052178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139675
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18584	NC_014012	TTG	2	6	1052237	1052242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139675
18585	NC_014012	ATC	2	6	1052312	1052317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139675
18586	NC_014012	GCC	2	6	1052357	1052362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139675
18587	NC_014012	TGA	2	6	1052409	1052414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139675
18588	NC_014012	AAT	2	6	1052649	1052654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139675
18589	NC_014012	CAG	2	6	1052681	1052686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139675
18590	NC_014012	ATTT	2	8	1052687	1052694	25 %	75 %	0 %	0 %	294139675
18591	NC_014012	GTT	2	6	1052782	1052787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139675
18592	NC_014012	CCAT	2	8	1052817	1052824	25 %	25 %	0 %	50 %	294139675
18593	NC_014012	TAG	2	6	1052850	1052855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139675
18594	NC_014012	TATC	2	8	1052881	1052888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18595	NC_014012	TAG	2	6	1052938	1052943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18596	NC_014012	CTTA	2	8	1053010	1053017	25 %	50 %	0 %	25 %	294139676
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18598	NC_014012	TC	3	6	1053186	1053191	0 %	50 %	0 %	50 %	294139676
18599	NC_014012	CCTTA	2	10	1053196	1053205	20 %	40 %	0 %	40 %	294139676
18600	NC_014012	TAA	2	6	1053252	1053257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139676
18601	NC_014012	CGG	2	6	1053336	1053341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139676
18602	NC_014012	TAC	2	6	1053462	1053467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139676
18603	NC_014012	TCC	2	6	1053473	1053478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139676
18604	NC_014012	GAT	2	6	1053598	1053603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139676
18605	NC_014012	TGG	2	6	1053660	1053665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139676
18606	NC_014012	TTA	2	6	1053749	1053754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139676
18607	NC_014012	GTGAT	2	10	1053833	1053842	20 %	40 %	40 %	0 %	294139676
18608	NC_014012	A	6	6	1053854	1053859	100 %	0 %	0 %	0 %	294139676
18609	NC_014012	ATC	2	6	1053868	1053873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139676
18610	NC_014012	ATG	2	6	1053881	1053886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139676
18611	NC_014012	TTC	2	6	1053920	1053925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139676
18612	NC_014012	GGC	2	6	1053988	1053993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139676
18613	NC_014012	CTTTA	2	10	1054009	1054018	20 %	60 %	0 %	20 %	294139676
18614	NC_014012	GT	3	6	1054030	1054035	0 %	50 %	50 %	0 %	294139676
18615	NC_014012	TTG	2	6	1054045	1054050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139676
18616	NC_014012	TCG	2	6	1054061	1054066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139676
18617	NC_014012	CTCAGG	2	12	1054075	1054086	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294139676
18618	NC_014012	TGA	2	6	1054121	1054126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139676
18619	NC_014012	CGT	2	6	1054212	1054217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139676
18620	NC_014012	TGC	2	6	1054233	1054238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139676
18621	NC_014012	CACTAA	2	12	1054309	1054320	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294139676
18622	NC_014012	AC	3	6	1054322	1054327	50 %	0 %	0 %	50 %	294139676
18623	NC_014012	GCA	2	6	1054350	1054355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139676
18624	NC_014012	T	7	7	1054414	1054420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18625	NC_014012	AC	3	6	1054444	1054449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18626	NC_014012	AGT	2	6	1054507	1054512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18627	NC_014012	CTG	2	6	1054589	1054594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139677
18628	NC_014012	CA	3	6	1054670	1054675	50 %	0 %	0 %	50 %	294139677
18629	NC_014012	TCC	2	6	1054786	1054791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139677
18630	NC_014012	CTGG	2	8	1054891	1054898	0 %	25 %	50 %	25 %	294139677
18631	NC_014012	TGC	2	6	1054909	1054914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139677
18632	NC_014012	ATG	2	6	1054955	1054960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139677
18633	NC_014012	GAC	2	6	1054967	1054972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139677
18634	NC_014012	AAG	2	6	1054976	1054981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139677
18635	NC_014012	ATG	2	6	1055159	1055164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139677
18636	NC_014012	GAA	2	6	1055191	1055196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139677
18637	NC_014012	CA	3	6	1055211	1055216	50 %	0 %	0 %	50 %	294139677
18638	NC_014012	GCT	2	6	1055302	1055307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139677
18639	NC_014012	GA	3	6	1055325	1055330	50 %	0 %	50 %	0 %	294139677
18640	NC_014012	ATC	2	6	1055402	1055407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139677
18641	NC_014012	ATG	2	6	1055418	1055423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139677
18642	NC_014012	GCT	2	6	1055438	1055443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139677
18643	NC_014012	TCA	2	6	1055454	1055459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139677
18644	NC_014012	GAT	2	6	1055486	1055491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139677
18645	NC_014012	TGAAC	2	10	1055503	1055512	40 %	20 %	20 %	20 %	294139677
18646	NC_014012	TATCGC	2	12	1055524	1055535	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294139677
18647	NC_014012	AGAT	2	8	1055610	1055617	50 %	25 %	25 %	0 %	294139677
18648	NC_014012	CAC	2	6	1055659	1055664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139677
18649	NC_014012	CCTG	2	8	1055772	1055779	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18650	NC_014012	ACGC	2	8	1055847	1055854	25 %	0 %	25 %	50 %	294139678
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18652	NC_014012	GA	3	6	1055879	1055884	50 %	0 %	50 %	0 %	294139678
18653	NC_014012	TGA	2	6	1055885	1055890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139678
18654	NC_014012	CAC	2	6	1056078	1056083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139678
18655	NC_014012	GACC	2	8	1056116	1056123	25 %	0 %	25 %	50 %	294139678
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18684	NC_014012	ACTGC	2	10	1057738	1057747	20 %	20 %	20 %	40 %	294139679
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18687	NC_014012	ACC	2	6	1057917	1057922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139679
18688	NC_014012	AG	3	6	1057923	1057928	50 %	0 %	50 %	0 %	294139679
18689	NC_014012	TGA	2	6	1057999	1058004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139679
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18714	NC_014012	A	8	8	1059143	1059150	100 %	0 %	0 %	0 %	294139681
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18730	NC_014012	GCG	2	6	1060030	1060035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139682
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18732	NC_014012	AAT	2	6	1060078	1060083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139682
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18734	NC_014012	T	7	7	1060143	1060149	0 %	100 %	0 %	0 %	294139682
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18975	NC_014012	TTG	2	6	1073675	1073680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18976	NC_014012	GGT	2	6	1073713	1073718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18977	NC_014012	TA	3	6	1073770	1073775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18978	NC_014012	T	6	6	1073860	1073865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18979	NC_014012	TGAT	2	8	1073956	1073963	25 %	50 %	25 %	0 %	294139693
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