MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_014012	TGC	2	6	1022574	1022579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139647
18002	NC_014012	TC	3	6	1022605	1022610	0 %	50 %	0 %	50 %	294139647
18003	NC_014012	ATAG	2	8	1022615	1022622	50 %	25 %	25 %	0 %	294139647
18004	NC_014012	TTG	2	6	1022654	1022659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139647
18005	NC_014012	GAG	2	6	1022689	1022694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139647
18006	NC_014012	TGG	2	6	1022752	1022757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139647
18007	NC_014012	CAT	2	6	1022797	1022802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139647
18008	NC_014012	AGTTC	2	10	1022814	1022823	20 %	40 %	20 %	20 %	294139647
18009	NC_014012	TGC	2	6	1022836	1022841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139647
18010	NC_014012	TGG	2	6	1022892	1022897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139647
18011	NC_014012	ATAA	2	8	1022941	1022948	75 %	25 %	0 %	0 %	294139647
18012	NC_014012	GAAT	2	8	1023143	1023150	50 %	25 %	25 %	0 %	294139647
18013	NC_014012	GC	3	6	1023292	1023297	0 %	0 %	50 %	50 %	294139647
18014	NC_014012	TTA	2	6	1023300	1023305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139647
18015	NC_014012	AGC	2	6	1023347	1023352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139647
18016	NC_014012	TTG	2	6	1023354	1023359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139647
18017	NC_014012	TC	3	6	1023397	1023402	0 %	50 %	0 %	50 %	294139647
18018	NC_014012	GATTA	2	10	1023410	1023419	40 %	40 %	20 %	0 %	294139647
18019	NC_014012	TGA	2	6	1023479	1023484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139647
18020	NC_014012	GCCA	2	8	1023520	1023527	25 %	0 %	25 %	50 %	294139647
18021	NC_014012	CAA	2	6	1023568	1023573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139647
18022	NC_014012	AAT	2	6	1023601	1023606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139647
18023	NC_014012	TTA	2	6	1023670	1023675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139647
18024	NC_014012	TTA	2	6	1023708	1023713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_014012	TCA	2	6	1023714	1023719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18026	NC_014012	AAT	2	6	1023727	1023732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_014012	A	7	7	1023810	1023816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18028	NC_014012	CAA	2	6	1023878	1023883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18029	NC_014012	TAA	2	6	1023899	1023904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_014012	ATA	2	6	1023910	1023915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_014012	CT	3	6	1023946	1023951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18032	NC_014012	T	6	6	1023981	1023986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_014012	ATTT	2	8	1024010	1024017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_014012	AG	3	6	1024024	1024029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_014012	ATTT	2	8	1024069	1024076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_014012	ATT	2	6	1024089	1024094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_014012	AGG	2	6	1024132	1024137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_014012	G	6	6	1024170	1024175	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_014012	AAG	2	6	1024188	1024193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_014012	T	6	6	1024197	1024202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_014012	T	8	8	1024238	1024245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_014012	AT	4	8	1024303	1024310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18043	NC_014012	TA	3	6	1024315	1024320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_014012	ATT	2	6	1024342	1024347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_014012	TAT	2	6	1024348	1024353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_014012	TAT	2	6	1024370	1024375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_014012	G	6	6	1024379	1024384	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18048	NC_014012	TGC	2	6	1024397	1024402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18049	NC_014012	GAG	2	6	1024407	1024412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18051	NC_014012	TGT	2	6	1024675	1024680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_014012	ATT	2	6	1024683	1024688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_014012	AGG	2	6	1024713	1024718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18055	NC_014012	GGC	2	6	1024826	1024831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139648
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18057	NC_014012	A	6	6	1024999	1025004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18059	NC_014012	TCT	2	6	1025044	1025049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18061	NC_014012	AGG	2	6	1025102	1025107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_014012	GGGA	2	8	1025108	1025115	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_014012	TTC	2	6	1025155	1025160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18064	NC_014012	TGG	2	6	1025179	1025184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18069	NC_014012	TAT	3	9	1025402	1025410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18071	NC_014012	T	6	6	1025471	1025476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18072	NC_014012	CTTCAA	2	12	1025520	1025531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18073	NC_014012	G	6	6	1025570	1025575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_014012	ATTTA	2	10	1025620	1025629	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_014012	T	6	6	1025661	1025666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18076	NC_014012	GA	3	6	1025667	1025672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18089	NC_014012	ATA	2	6	1026567	1026572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139649
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18110	NC_014012	TCA	2	6	1027419	1027424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139649
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18122	NC_014012	AT	3	6	1027838	1027843	50 %	50 %	0 %	0 %	294139650
18123	NC_014012	TGC	2	6	1027880	1027885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139650
18124	NC_014012	T	7	7	1027924	1027930	0 %	100 %	0 %	0 %	294139650
18125	NC_014012	AGT	2	6	1027967	1027972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139650
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18151	NC_014012	ACAA	2	8	1029521	1029528	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18212	NC_014012	AGA	2	6	1032628	1032633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139655
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18221	NC_014012	GCT	2	6	1032879	1032884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139655
18222	NC_014012	GCT	3	9	1033013	1033021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139656
18223	NC_014012	CTC	2	6	1033022	1033027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139656
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18225	NC_014012	TGGATC	2	12	1033192	1033203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139656
18226	NC_014012	ATG	2	6	1033213	1033218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139656
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18228	NC_014012	ATCTT	2	10	1033593	1033602	20 %	60 %	0 %	20 %	294139657
18229	NC_014012	CTT	2	6	1033613	1033618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139657
18230	NC_014012	ATC	2	6	1033682	1033687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139657
18231	NC_014012	GCA	2	6	1033731	1033736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139657
18232	NC_014012	ATG	2	6	1033755	1033760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139657
18233	NC_014012	TGG	2	6	1033775	1033780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139657
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18235	NC_014012	TGC	2	6	1033819	1033824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139657
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18237	NC_014012	CGA	2	6	1033869	1033874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139657
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