MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

< Previous12...3031323334353637383940...175176Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_014012	TTA	3	9	961831	961839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_014012	ATTG	2	8	961891	961898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_014012	TCC	2	6	961904	961909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17004	NC_014012	CTT	2	6	961931	961936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17005	NC_014012	AG	3	6	962066	962071	50 %	0 %	50 %	0 %	294139600
17006	NC_014012	CAG	2	6	962098	962103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139600
17007	NC_014012	CTT	2	6	962134	962139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139600
17008	NC_014012	AGC	2	6	962172	962177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139600
17009	NC_014012	TCG	3	9	962220	962228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
17010	NC_014012	GAA	2	6	962267	962272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139600
17011	NC_014012	CGC	2	6	962314	962319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139600
17012	NC_014012	GTA	2	6	962320	962325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139600
17013	NC_014012	TGA	2	6	962386	962391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139600
17014	NC_014012	CAT	2	6	962537	962542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
17015	NC_014012	TTAG	2	8	962637	962644	25 %	50 %	25 %	0 %	294139600
17016	NC_014012	TGC	2	6	962696	962701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
17017	NC_014012	TCT	2	6	962868	962873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139600
17018	NC_014012	TCA	2	6	962890	962895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
17019	NC_014012	GCA	2	6	963078	963083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139600
17020	NC_014012	CAT	2	6	963095	963100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
17021	NC_014012	CTTAGA	2	12	963176	963187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294139600
17022	NC_014012	TTA	2	6	963192	963197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139600
17023	NC_014012	TCA	2	6	963204	963209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
17024	NC_014012	TGA	2	6	963271	963276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139600
17025	NC_014012	TCA	2	6	963286	963291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
17026	NC_014012	AGA	3	9	963310	963318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139600
17027	NC_014012	TTC	2	6	963378	963383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139600
17028	NC_014012	GCCA	2	8	963385	963392	25 %	0 %	25 %	50 %	294139600
17029	NC_014012	CAT	2	6	963439	963444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
17030	NC_014012	GTC	2	6	963467	963472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
17031	NC_014012	TCG	2	6	963501	963506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
17032	NC_014012	CCA	2	6	963560	963565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139600
17033	NC_014012	CTG	2	6	963629	963634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
17034	NC_014012	ATAC	2	8	963700	963707	50 %	25 %	0 %	25 %	294139600
17035	NC_014012	AGTA	2	8	963716	963723	50 %	25 %	25 %	0 %	294139600
17036	NC_014012	ATCT	2	8	963779	963786	25 %	50 %	0 %	25 %	294139600
17037	NC_014012	GAT	2	6	963818	963823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139600
17038	NC_014012	CAGG	2	8	963865	963872	25 %	0 %	50 %	25 %	294139600
17039	NC_014012	TGT	2	6	963955	963960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139600
17040	NC_014012	CA	3	6	964025	964030	50 %	0 %	0 %	50 %	294139600
17041	NC_014012	TCG	2	6	964059	964064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
17042	NC_014012	TCA	2	6	964134	964139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
17043	NC_014012	TGC	2	6	964264	964269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
17044	NC_014012	GAC	2	6	964459	964464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139600
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17046	NC_014012	CTT	2	6	964558	964563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139600
17047	NC_014012	CAAC	2	8	964582	964589	50 %	0 %	0 %	50 %	294139600
17048	NC_014012	TACC	2	8	964618	964625	25 %	25 %	0 %	50 %	294139600
17049	NC_014012	TGG	2	6	964727	964732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139600
17050	NC_014012	ATG	2	6	964740	964745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139600
17051	NC_014012	TCG	2	6	964764	964769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
17052	NC_014012	T	6	6	964843	964848	0 %	100 %	0 %	0 %	294139600
17053	NC_014012	CAAA	2	8	964869	964876	75 %	0 %	0 %	25 %	294139601
17054	NC_014012	GTT	2	6	964885	964890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139601
17055	NC_014012	AGA	2	6	965046	965051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139601
17056	NC_014012	ATA	2	6	965164	965169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139601
17057	NC_014012	GCT	3	9	965221	965229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139601
17058	NC_014012	AGGG	2	8	965372	965379	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_014012	GTTA	2	8	965398	965405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_014012	TATC	2	8	965478	965485	25 %	50 %	0 %	25 %	294139602
17061	NC_014012	TC	3	6	965513	965518	0 %	50 %	0 %	50 %	294139602
17062	NC_014012	AT	3	6	965784	965789	50 %	50 %	0 %	0 %	294139603
17063	NC_014012	GCAC	2	8	965804	965811	25 %	0 %	25 %	50 %	294139603
17064	NC_014012	AT	3	6	965845	965850	50 %	50 %	0 %	0 %	294139603
17065	NC_014012	TGT	2	6	965852	965857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139603
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17067	NC_014012	AATG	2	8	966013	966020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17068	NC_014012	ATG	2	6	966093	966098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17069	NC_014012	TTAA	2	8	966120	966127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_014012	TTC	2	6	966150	966155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17071	NC_014012	ATG	2	6	966300	966305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17072	NC_014012	TAA	2	6	966433	966438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139604
17073	NC_014012	GAA	2	6	966502	966507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139604
17074	NC_014012	CT	3	6	966614	966619	0 %	50 %	0 %	50 %	294139604
17075	NC_014012	TAT	2	6	966713	966718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139604
17076	NC_014012	TAAA	2	8	966844	966851	75 %	25 %	0 %	0 %	294139604
17077	NC_014012	TG	3	6	966919	966924	0 %	50 %	50 %	0 %	294139604
17078	NC_014012	TTG	2	6	966951	966956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139604
17079	NC_014012	TAT	2	6	967013	967018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139604
17080	NC_014012	TGC	2	6	967082	967087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139604
17081	NC_014012	A	7	7	967116	967122	100 %	0 %	0 %	0 %	294139604
17082	NC_014012	CTG	2	6	967158	967163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139604
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17085	NC_014012	TTA	2	6	967219	967224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139604
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17087	NC_014012	TCA	2	6	967246	967251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139604
17088	NC_014012	AGT	2	6	967298	967303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139604
17089	NC_014012	CAT	2	6	967307	967312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139604
17090	NC_014012	AAT	2	6	967337	967342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139604
17091	NC_014012	GGTT	2	8	967354	967361	0 %	50 %	50 %	0 %	294139604
17092	NC_014012	GCC	2	6	967392	967397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139604
17093	NC_014012	AT	3	6	967413	967418	50 %	50 %	0 %	0 %	294139604
17094	NC_014012	ACC	2	6	967498	967503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139604
17095	NC_014012	TGC	2	6	967585	967590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139604
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17098	NC_014012	TAGA	2	8	967902	967909	50 %	25 %	25 %	0 %	294139604
17099	NC_014012	TA	3	6	967979	967984	50 %	50 %	0 %	0 %	294139604
17100	NC_014012	AAG	2	6	968035	968040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139604
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17102	NC_014012	ATT	2	6	968070	968075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139604
17103	NC_014012	ACA	2	6	968111	968116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139604
17104	NC_014012	G	6	6	968135	968140	0 %	0 %	100 %	0 %	294139604
17105	NC_014012	GCTG	2	8	968157	968164	0 %	25 %	50 %	25 %	294139604
17106	NC_014012	TAAG	2	8	968208	968215	50 %	25 %	25 %	0 %	294139604
17107	NC_014012	ATA	2	6	968339	968344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139604
17108	NC_014012	TCGA	2	8	968661	968668	25 %	25 %	25 %	25 %	294139604
17109	NC_014012	TTA	2	6	968707	968712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139604
17110	NC_014012	AAT	2	6	968751	968756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139604
17111	NC_014012	GTA	2	6	968767	968772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139604
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17113	NC_014012	CAT	2	6	968811	968816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139604
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17115	NC_014012	TTTA	2	8	968907	968914	25 %	75 %	0 %	0 %	294139604
17116	NC_014012	CGC	2	6	968933	968938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139604
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17119	NC_014012	TA	3	6	969126	969131	50 %	50 %	0 %	0 %	294139604
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17359	NC_014012	GATG	2	8	983510	983517	25 %	25 %	50 %	0 %	294139621
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