MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_014012	GGT	2	6	932189	932194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139569
16503	NC_014012	CAT	2	6	932228	932233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139569
16504	NC_014012	A	6	6	932264	932269	100 %	0 %	0 %	0 %	294139569
16505	NC_014012	CCTG	2	8	932295	932302	0 %	25 %	25 %	50 %	294139569
16506	NC_014012	T	7	7	932361	932367	0 %	100 %	0 %	0 %	294139569
16507	NC_014012	TAA	2	6	932555	932560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139569
16508	NC_014012	AAC	2	6	932576	932581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139569
16509	NC_014012	CAG	2	6	932587	932592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139569
16510	NC_014012	CTG	2	6	932600	932605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139569
16511	NC_014012	GTC	2	6	932673	932678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139569
16512	NC_014012	ACG	2	6	932776	932781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139570
16513	NC_014012	GCCA	2	8	932862	932869	25 %	0 %	25 %	50 %	294139570
16514	NC_014012	GCT	2	6	933048	933053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139570
16515	NC_014012	CT	3	6	933083	933088	0 %	50 %	0 %	50 %	294139570
16516	NC_014012	TGA	2	6	933111	933116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139570
16517	NC_014012	ATA	2	6	933182	933187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139570
16518	NC_014012	AAT	2	6	933217	933222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139570
16519	NC_014012	CTT	2	6	933229	933234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139570
16520	NC_014012	CCTC	2	8	933299	933306	0 %	25 %	0 %	75 %	294139570
16521	NC_014012	ACG	2	6	933343	933348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139570
16522	NC_014012	GCT	2	6	933411	933416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139570
16523	NC_014012	TTC	2	6	933487	933492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139570
16524	NC_014012	GTT	2	6	933508	933513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139570
16525	NC_014012	CGC	2	6	933624	933629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139570
16526	NC_014012	CATCTG	2	12	933736	933747	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294139570
16527	NC_014012	GTC	2	6	933842	933847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139570
16528	NC_014012	AAT	2	6	933964	933969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139570
16529	NC_014012	GCA	2	6	934023	934028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16530	NC_014012	ATTT	2	8	934101	934108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16531	NC_014012	ACC	2	6	934193	934198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139571
16532	NC_014012	CT	3	6	934244	934249	0 %	50 %	0 %	50 %	294139571
16533	NC_014012	CCAT	2	8	934251	934258	25 %	25 %	0 %	50 %	294139571
16534	NC_014012	CAT	3	9	934256	934264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139571
16535	NC_014012	ATC	2	6	934271	934276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139571
16536	NC_014012	TCA	2	6	934278	934283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139571
16537	NC_014012	CAA	2	6	934326	934331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139571
16538	NC_014012	ATA	2	6	934388	934393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139571
16539	NC_014012	AT	3	6	934456	934461	50 %	50 %	0 %	0 %	294139571
16540	NC_014012	CTT	2	6	934565	934570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139571
16541	NC_014012	CAC	2	6	934603	934608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139571
16542	NC_014012	CTAAA	2	10	934750	934759	60 %	20 %	0 %	20 %	294139571
16543	NC_014012	ATA	2	6	934874	934879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139571
16544	NC_014012	GACT	2	8	935050	935057	25 %	25 %	25 %	25 %	294139571
16545	NC_014012	GTC	2	6	935060	935065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139571
16546	NC_014012	T	6	6	935076	935081	0 %	100 %	0 %	0 %	294139571
16547	NC_014012	ATC	2	6	935093	935098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139571
16548	NC_014012	AAT	2	6	935104	935109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139571
16549	NC_014012	GCA	2	6	935116	935121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139571
16550	NC_014012	CTG	2	6	935146	935151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139571
16551	NC_014012	AAAATC	2	12	935249	935260	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294139571
16552	NC_014012	TCT	3	9	935328	935336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139571
16553	NC_014012	TTTC	2	8	935379	935386	0 %	75 %	0 %	25 %	294139571
16554	NC_014012	GTT	2	6	935465	935470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139571
16555	NC_014012	TCG	2	6	935511	935516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139571
16556	NC_014012	GTT	2	6	935558	935563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139571
16557	NC_014012	TAA	2	6	935718	935723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139571
16558	NC_014012	TGG	2	6	935746	935751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139571
16559	NC_014012	CTAT	2	8	935889	935896	25 %	50 %	0 %	25 %	294139571
16560	NC_014012	AAG	2	6	935923	935928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139571
16561	NC_014012	GGT	2	6	935945	935950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139571
16562	NC_014012	ATT	2	6	935975	935980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139571
16563	NC_014012	AG	3	6	936087	936092	50 %	0 %	50 %	0 %	294139571
16564	NC_014012	CT	3	6	936156	936161	0 %	50 %	0 %	50 %	294139571
16565	NC_014012	TTC	2	6	936383	936388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16566	NC_014012	A	6	6	936423	936428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16567	NC_014012	TAT	2	6	936454	936459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16568	NC_014012	AAT	2	6	936528	936533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16569	NC_014012	TAA	2	6	936564	936569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16570	NC_014012	TTC	2	6	936618	936623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139572
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16572	NC_014012	TA	3	6	936734	936739	50 %	50 %	0 %	0 %	294139572
16573	NC_014012	CCA	2	6	936752	936757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139572
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16575	NC_014012	TGC	2	6	936961	936966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139572
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16577	NC_014012	CTTTG	2	10	937111	937120	0 %	60 %	20 %	20 %	294139572
16578	NC_014012	TGAT	2	8	937227	937234	25 %	50 %	25 %	0 %	294139572
16579	NC_014012	ATG	2	6	937266	937271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139572
16580	NC_014012	GGC	2	6	937441	937446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139572
16581	NC_014012	GCCT	2	8	937483	937490	0 %	25 %	25 %	50 %	294139572
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16584	NC_014012	AG	3	6	937644	937649	50 %	0 %	50 %	0 %	294139573
16585	NC_014012	GT	4	8	937687	937694	0 %	50 %	50 %	0 %	294139573
16586	NC_014012	CGC	2	6	937734	937739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139573
16587	NC_014012	TGA	2	6	937749	937754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139573
16588	NC_014012	ATCA	2	8	937762	937769	50 %	25 %	0 %	25 %	294139573
16589	NC_014012	CAG	2	6	937795	937800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139573
16590	NC_014012	TGCCT	2	10	937884	937893	0 %	40 %	20 %	40 %	294139573
16591	NC_014012	CTG	2	6	937894	937899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139573
16592	NC_014012	GAT	2	6	937942	937947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139573
16593	NC_014012	TGC	2	6	938070	938075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139573
16594	NC_014012	ATC	2	6	938126	938131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139573
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16596	NC_014012	GAT	2	6	938143	938148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139573
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16598	NC_014012	TA	3	6	938347	938352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16599	NC_014012	T	6	6	938381	938386	0 %	100 %	0 %	0 %	294139574
16600	NC_014012	A	7	7	938462	938468	100 %	0 %	0 %	0 %	294139574
16601	NC_014012	CAT	2	6	938485	938490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139574
16602	NC_014012	AGGC	2	8	938507	938514	25 %	0 %	50 %	25 %	294139574
16603	NC_014012	ATT	2	6	938740	938745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139574
16604	NC_014012	GATCCA	2	12	938761	938772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294139574
16605	NC_014012	AGG	2	6	938908	938913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139574
16606	NC_014012	ATC	3	9	938968	938976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139574
16607	NC_014012	TGA	2	6	939009	939014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139574
16608	NC_014012	GCCT	2	8	939048	939055	0 %	25 %	25 %	50 %	294139574
16609	NC_014012	GAT	2	6	939061	939066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139574
16610	NC_014012	TGA	3	9	939388	939396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139575
16611	NC_014012	CAT	2	6	939551	939556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139575
16612	NC_014012	TA	3	6	939594	939599	50 %	50 %	0 %	0 %	294139575
16613	NC_014012	TGT	2	6	939623	939628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139575
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16615	NC_014012	CAT	2	6	939726	939731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139575
16616	NC_014012	TCA	2	6	939749	939754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139575
16617	NC_014012	GTCTG	2	10	939774	939783	0 %	40 %	40 %	20 %	294139575
16618	NC_014012	GAGTG	2	10	939957	939966	20 %	20 %	60 %	0 %	294139575
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16620	NC_014012	AAGC	2	8	940128	940135	50 %	0 %	25 %	25 %	294139575
16621	NC_014012	GCT	2	6	940158	940163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139575
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16628	NC_014012	CAGT	2	8	940555	940562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16736	NC_014012	ATGA	2	8	946578	946585	50 %	25 %	25 %	0 %	294139583
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