MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

< Previous12...2829303132333435363738...175176Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_014012	TGA	2	6	903969	903974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139537
16003	NC_014012	TGCC	2	8	904066	904073	0 %	25 %	25 %	50 %	294139537
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16005	NC_014012	ATC	2	6	904357	904362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139537
16006	NC_014012	GAAT	2	8	904403	904410	50 %	25 %	25 %	0 %	294139537
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16012	NC_014012	TAG	2	6	904662	904667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139537
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16017	NC_014012	CTG	2	6	905013	905018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139538
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16118	NC_014012	T	6	6	910456	910461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_014012	TTG	2	6	910476	910481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_014012	AGGT	2	8	910529	910536	25 %	25 %	50 %	0 %	294139543
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16124	NC_014012	GTT	2	6	911190	911195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139545
16125	NC_014012	GGAT	2	8	911249	911256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_014012	ATC	2	6	911305	911310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16127	NC_014012	CAT	2	6	911390	911395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139546
16128	NC_014012	ATT	2	6	911513	911518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139546
16129	NC_014012	AGG	2	6	911529	911534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139546
16130	NC_014012	TGA	2	6	911551	911556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139546
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16132	NC_014012	TTC	2	6	911711	911716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139546
16133	NC_014012	TGA	2	6	911752	911757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139546
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16140	NC_014012	TAT	2	6	912010	912015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16141	NC_014012	AGT	2	6	912104	912109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139547
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16154	NC_014012	TGAT	2	8	912856	912863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16155	NC_014012	TGA	2	6	912977	912982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139548
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16163	NC_014012	CT	3	6	913539	913544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16164	NC_014012	TAA	2	6	913594	913599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16165	NC_014012	ATA	2	6	913604	913609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16166	NC_014012	CAG	2	6	913664	913669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16236	NC_014012	GTTA	2	8	917691	917698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16240	NC_014012	GT	4	8	917801	917808	0 %	50 %	50 %	0 %	294139552
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16367	NC_014012	TCAG	2	8	924632	924639	25 %	25 %	25 %	25 %	294139561
16368	NC_014012	TCA	2	6	924685	924690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139561
16369	NC_014012	ACT	3	9	924733	924741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139561
16370	NC_014012	TGC	2	6	924948	924953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139561
16371	NC_014012	T	6	6	924967	924972	0 %	100 %	0 %	0 %	294139561
16372	NC_014012	CAT	2	6	925015	925020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139561
16373	NC_014012	ACT	2	6	925060	925065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139561
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16376	NC_014012	ATG	2	6	925333	925338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139562
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16378	NC_014012	AGT	2	6	925437	925442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139562
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16391	NC_014012	A	6	6	926279	926284	100 %	0 %	0 %	0 %	294139563
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16394	NC_014012	ATAA	2	8	926359	926366	75 %	25 %	0 %	0 %	294139564
16395	NC_014012	AAG	2	6	926368	926373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139564
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16402	NC_014012	T	7	7	926824	926830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16403	NC_014012	CT	3	6	926856	926861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16404	NC_014012	CTC	2	6	926877	926882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16406	NC_014012	TTC	2	6	926982	926987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16409	NC_014012	CT	3	6	927171	927176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16410	NC_014012	TTC	2	6	927192	927197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16411	NC_014012	TGA	2	6	927214	927219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16467	NC_014012	T	6	6	929570	929575	0 %	100 %	0 %	0 %	294139566
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16474	NC_014012	AGCC	2	8	930061	930068	25 %	0 %	25 %	50 %	294139566
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16482	NC_014012	TGA	2	6	930654	930659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139567
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16484	NC_014012	GAT	2	6	930701	930706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139567
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16486	NC_014012	A	8	8	930782	930789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16487	NC_014012	CTATT	2	10	930805	930814	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16488	NC_014012	CTT	2	6	930882	930887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139568
16489	NC_014012	ATG	2	6	930947	930952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139568
16490	NC_014012	TCA	2	6	930979	930984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139568
16491	NC_014012	ACC	2	6	931252	931257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139568
16492	NC_014012	CTT	2	6	931373	931378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139568
16493	NC_014012	GC	3	6	931532	931537	0 %	0 %	50 %	50 %	294139568
16494	NC_014012	CATGA	2	10	931560	931569	40 %	20 %	20 %	20 %	294139568
16495	NC_014012	T	6	6	931644	931649	0 %	100 %	0 %	0 %	294139568
16496	NC_014012	TTA	2	6	931672	931677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139568
16497	NC_014012	CTATT	2	10	931686	931695	20 %	60 %	0 %	20 %	294139569
16498	NC_014012	TTTA	2	8	931724	931731	25 %	75 %	0 %	0 %	294139569
16499	NC_014012	TCT	2	6	932040	932045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139569
16500	NC_014012	CATA	2	8	932067	932074	50 %	25 %	0 %	25 %	294139569

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