MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014012	GGTT	2	8	847688	847695	0 %	50 %	50 %	0 %	294139485
15002	NC_014012	AC	3	6	847704	847709	50 %	0 %	0 %	50 %	294139485
15003	NC_014012	TGT	2	6	847829	847834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139485
15004	NC_014012	TTGGTT	2	12	847845	847856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139485
15005	NC_014012	CAC	2	6	847893	847898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139485
15006	NC_014012	GCG	2	6	847916	847921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139485
15007	NC_014012	AAG	2	6	847995	848000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139485
15008	NC_014012	AAGC	2	8	848016	848023	50 %	0 %	25 %	25 %	294139485
15009	NC_014012	ACCT	2	8	848103	848110	25 %	25 %	0 %	50 %	294139485
15010	NC_014012	GCT	2	6	848213	848218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139485
15011	NC_014012	CTA	2	6	848323	848328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139485
15012	NC_014012	GGT	2	6	848381	848386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139485
15013	NC_014012	TCA	2	6	848388	848393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139485
15014	NC_014012	ATG	2	6	848411	848416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139485
15015	NC_014012	AGC	2	6	848538	848543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139485
15016	NC_014012	GTC	2	6	848664	848669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139485
15017	NC_014012	CTG	2	6	848694	848699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139485
15018	NC_014012	GCT	2	6	848810	848815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139485
15019	NC_014012	AAG	2	6	848834	848839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139485
15020	NC_014012	CTA	2	6	848862	848867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139485
15021	NC_014012	CGG	2	6	848983	848988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139485
15022	NC_014012	GTT	2	6	848993	848998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139485
15023	NC_014012	TTG	2	6	849038	849043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139485
15024	NC_014012	TGT	2	6	849070	849075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139485
15025	NC_014012	AAT	2	6	849178	849183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_014012	GTT	2	6	849194	849199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_014012	CGTCT	2	10	849215	849224	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15028	NC_014012	GGATA	2	10	849232	849241	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_014012	TCT	2	6	849362	849367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_014012	CCAGAT	2	12	849508	849519	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294139486
15031	NC_014012	TTC	2	6	849555	849560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139486
15032	NC_014012	TGA	2	6	849643	849648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139486
15033	NC_014012	TCA	2	6	849651	849656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139486
15034	NC_014012	CAA	2	6	849679	849684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139486
15035	NC_014012	GATATC	2	12	849704	849715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294139486
15036	NC_014012	CAAG	2	8	849781	849788	50 %	0 %	25 %	25 %	294139486
15037	NC_014012	TCA	2	6	849792	849797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139486
15038	NC_014012	CAC	2	6	849964	849969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139486
15039	NC_014012	CAG	2	6	849992	849997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139486
15040	NC_014012	CGT	2	6	850025	850030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139486
15041	NC_014012	TGA	2	6	850267	850272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139486
15042	NC_014012	GAGT	2	8	850338	850345	25 %	25 %	50 %	0 %	294139486
15043	NC_014012	TGC	2	6	850365	850370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139486
15044	NC_014012	GAT	2	6	850426	850431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139486
15045	NC_014012	GAA	2	6	850440	850445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139486
15046	NC_014012	CGG	2	6	850531	850536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_014012	T	6	6	850563	850568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_014012	ATT	2	6	850614	850619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139487
15049	NC_014012	CGA	2	6	850732	850737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139487
15050	NC_014012	GTGATG	2	12	850767	850778	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294139487
15051	NC_014012	GTC	2	6	850789	850794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139487
15052	NC_014012	TC	3	6	850824	850829	0 %	50 %	0 %	50 %	294139487
15053	NC_014012	CGTT	2	8	850940	850947	0 %	50 %	25 %	25 %	294139487
15054	NC_014012	GAAAA	2	10	850959	850968	80 %	0 %	20 %	0 %	294139487
15055	NC_014012	GAA	2	6	850985	850990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139487
15056	NC_014012	GATG	2	8	851018	851025	25 %	25 %	50 %	0 %	294139487
15057	NC_014012	ATGC	2	8	851073	851080	25 %	25 %	25 %	25 %	294139487
15058	NC_014012	TTGC	2	8	851086	851093	0 %	50 %	25 %	25 %	294139487
15059	NC_014012	CTT	2	6	851103	851108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139487
15060	NC_014012	AG	3	6	851210	851215	50 %	0 %	50 %	0 %	294139487
15061	NC_014012	GGT	3	9	851247	851255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139487
15062	NC_014012	GCA	2	6	851277	851282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139487
15063	NC_014012	TGA	2	6	851324	851329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139487
15064	NC_014012	GTG	3	9	851362	851370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139487
15065	NC_014012	ACCG	2	8	851381	851388	25 %	0 %	25 %	50 %	294139487
15066	NC_014012	GTT	2	6	851394	851399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139487
15067	NC_014012	GC	3	6	851491	851496	0 %	0 %	50 %	50 %	294139487
15068	NC_014012	ATT	2	6	851511	851516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139487
15069	NC_014012	GTTCGA	2	12	851558	851569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139487
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15071	NC_014012	GGT	3	9	851706	851714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139487
15072	NC_014012	AACA	2	8	851782	851789	75 %	0 %	0 %	25 %	294139487
15073	NC_014012	TTATAA	2	12	851818	851829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_014012	AATC	2	8	851925	851932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15075	NC_014012	TAA	2	6	851969	851974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_014012	TAT	2	6	851997	852002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_014012	A	6	6	852009	852014	100 %	0 %	0 %	0 %	294139488
15078	NC_014012	TGC	2	6	852049	852054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139488
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15080	NC_014012	GCT	2	6	852122	852127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139488
15081	NC_014012	CTG	2	6	852162	852167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139488
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15085	NC_014012	TGA	2	6	852318	852323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139488
15086	NC_014012	CTT	2	6	852360	852365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139488
15087	NC_014012	GT	3	6	852420	852425	0 %	50 %	50 %	0 %	294139488
15088	NC_014012	GAA	2	6	852479	852484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139488
15089	NC_014012	TGC	2	6	852645	852650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139488
15090	NC_014012	ATCG	2	8	852653	852660	25 %	25 %	25 %	25 %	294139488
15091	NC_014012	TTC	2	6	852712	852717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139488
15092	NC_014012	GA	3	6	852762	852767	50 %	0 %	50 %	0 %	294139488
15093	NC_014012	AGA	2	6	852793	852798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139488
15094	NC_014012	TCG	2	6	852801	852806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139488
15095	NC_014012	AGTT	2	8	853080	853087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_014012	TAT	2	6	853178	853183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_014012	GTTT	2	8	853184	853191	0 %	75 %	25 %	0 %	294139489
15098	NC_014012	ATT	2	6	853211	853216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139489
15099	NC_014012	A	6	6	853291	853296	100 %	0 %	0 %	0 %	294139489
15100	NC_014012	GCA	2	6	853324	853329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139489
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15104	NC_014012	TA	3	6	853588	853593	50 %	50 %	0 %	0 %	294139489
15105	NC_014012	GATC	2	8	853614	853621	25 %	25 %	25 %	25 %	294139489
15106	NC_014012	TTC	2	6	853653	853658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139489
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15109	NC_014012	TGC	2	6	853752	853757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139489
15110	NC_014012	TGA	2	6	853802	853807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139489
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15112	NC_014012	ATT	2	6	853912	853917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139489
15113	NC_014012	TTG	2	6	853943	853948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139489
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15115	NC_014012	AAAG	2	8	853978	853985	75 %	0 %	25 %	0 %	294139489
15116	NC_014012	AT	3	6	854069	854074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_014012	GT	3	6	854110	854115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_014012	TGTT	2	8	854130	854137	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_014012	TTA	2	6	854143	854148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_014012	TG	3	6	854155	854160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_014012	CTT	2	6	854173	854178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_014012	TGC	2	6	854283	854288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139490
15123	NC_014012	TGG	2	6	854353	854358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139490
15124	NC_014012	GTT	2	6	854417	854422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139490
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15153	NC_014012	ATTC	2	8	855633	855640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15154	NC_014012	ATT	2	6	855645	855650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15155	NC_014012	TTA	2	6	855707	855712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15156	NC_014012	CAT	2	6	855731	855736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15225	NC_014012	TAT	2	6	859432	859437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15226	NC_014012	T	6	6	859471	859476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15227	NC_014012	AGCT	2	8	859574	859581	25 %	25 %	25 %	25 %	294139494
15228	NC_014012	TGA	2	6	859618	859623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139494
15229	NC_014012	TTTA	2	8	859639	859646	25 %	75 %	0 %	0 %	294139494
15230	NC_014012	CCA	3	9	859752	859760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139495
15231	NC_014012	GCG	2	6	859770	859775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139495
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15239	NC_014012	ATG	2	6	860176	860181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139495
15240	NC_014012	GAA	3	9	860244	860252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139495
15241	NC_014012	GCA	2	6	860258	860263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139495
15242	NC_014012	GACT	2	8	860264	860271	25 %	25 %	25 %	25 %	294139495
15243	NC_014012	TCC	2	6	860353	860358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139495
15244	NC_014012	GCG	2	6	860427	860432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139495
15245	NC_014012	ATC	2	6	860524	860529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139495
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15247	NC_014012	CCT	3	9	860591	860599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139495
15248	NC_014012	CTGG	2	8	860649	860656	0 %	25 %	50 %	25 %	294139495
15249	NC_014012	CAC	2	6	860846	860851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139495
15250	NC_014012	TCT	2	6	860882	860887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139495
15251	NC_014012	TCAT	2	8	861061	861068	25 %	50 %	0 %	25 %	294139495
15252	NC_014012	TCT	2	6	861082	861087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139495
15253	NC_014012	ACC	2	6	861097	861102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139495
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15256	NC_014012	ACC	3	9	861451	861459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139495
15257	NC_014012	TGG	2	6	861527	861532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139495
15258	NC_014012	C	6	6	861572	861577	0 %	0 %	0 %	100 %	294139495
15259	NC_014012	GAC	2	6	861579	861584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139495
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15262	NC_014012	AC	3	6	861753	861758	50 %	0 %	0 %	50 %	294139495
15263	NC_014012	CAT	2	6	861768	861773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139495
15264	NC_014012	CAT	2	6	861855	861860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139495
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15266	NC_014012	GGCA	2	8	861918	861925	25 %	0 %	50 %	25 %	294139495
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15270	NC_014012	ATC	2	6	861987	861992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139495
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15274	NC_014012	TGA	2	6	862121	862126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139495
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15283	NC_014012	TTG	2	6	862744	862749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139495
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15300	NC_014012	AAAG	2	8	864020	864027	75 %	0 %	25 %	0 %	294139496
15301	NC_014012	TCT	2	6	864050	864055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139496
15302	NC_014012	ATT	2	6	864060	864065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139496
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15304	NC_014012	G	6	6	864130	864135	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15305	NC_014012	T	6	6	864143	864148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15306	NC_014012	AT	3	6	864186	864191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15307	NC_014012	G	6	6	864214	864219	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15308	NC_014012	GA	3	6	864294	864299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15309	NC_014012	AGC	2	6	864333	864338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15310	NC_014012	ACAA	2	8	864343	864350	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15311	NC_014012	A	8	8	864356	864363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15312	NC_014012	CTT	2	6	864382	864387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15313	NC_014012	TTA	2	6	864388	864393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15314	NC_014012	GAATAA	2	12	864396	864407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15315	NC_014012	GT	3	6	864409	864414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15316	NC_014012	CTT	3	9	864429	864437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139497
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15319	NC_014012	TGA	2	6	864533	864538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139497
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15321	NC_014012	GCGG	2	8	864639	864646	0 %	0 %	75 %	25 %	294139497
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15326	NC_014012	ATT	2	6	865284	865289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139497
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15335	NC_014012	AATA	2	8	865666	865673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15336	NC_014012	A	6	6	865694	865699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15337	NC_014012	ATT	2	6	865728	865733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15338	NC_014012	ATC	2	6	865803	865808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139498
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15347	NC_014012	TC	3	6	866276	866281	0 %	50 %	0 %	50 %	294139498
15348	NC_014012	TGT	2	6	866512	866517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139498
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15350	NC_014012	GCTG	2	8	866634	866641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15351	NC_014012	TGATTT	2	12	866655	866666	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15352	NC_014012	TTG	2	6	866679	866684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15353	NC_014012	GTT	2	6	866695	866700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15354	NC_014012	ATA	2	6	866746	866751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15355	NC_014012	ATT	2	6	866885	866890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15356	NC_014012	TTA	2	6	866915	866920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15357	NC_014012	TAA	2	6	866937	866942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15358	NC_014012	AGA	2	6	866965	866970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15359	NC_014012	A	6	6	866979	866984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15360	NC_014012	AAAC	2	8	866990	866997	75 %	0 %	0 %	25 %	294139499
15361	NC_014012	TTCT	2	8	867045	867052	0 %	75 %	0 %	25 %	294139499
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15366	NC_014012	ATT	2	6	867477	867482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139499
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15383	NC_014012	GC	3	6	868441	868446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15384	NC_014012	T	6	6	868464	868469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15393	NC_014012	AAT	2	6	869502	869507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15395	NC_014012	CTAG	2	8	869768	869775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15396	NC_014012	TTA	2	6	869806	869811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15397	NC_014012	ACTGA	2	10	869862	869871	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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15399	NC_014012	AT	3	6	869911	869916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15423	NC_014012	TTG	2	6	871185	871190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139503
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15458	NC_014012	TGA	2	6	873801	873806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139505
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15487	NC_014012	CTG	2	6	875301	875306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15488	NC_014012	TCA	2	6	875315	875320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15489	NC_014012	ATACCC	2	12	875334	875345	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
15490	NC_014012	GCTT	2	8	875376	875383	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15491	NC_014012	T	6	6	875470	875475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15492	NC_014012	GCTT	2	8	875527	875534	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15493	NC_014012	CTATTT	2	12	875611	875622	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15494	NC_014012	T	6	6	875620	875625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15495	NC_014012	GCTT	2	8	875677	875684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15496	NC_014012	CTATTT	2	12	875761	875772	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15497	NC_014012	T	9	9	875793	875801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15498	NC_014012	ATC	2	6	875843	875848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15499	NC_014012	TAA	2	6	875877	875882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15500	NC_014012	ATCT	2	8	875932	875939	25 %	50 %	0 %	25 %	294139507

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