MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

< Previous12...2425262728293031323334...175176Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_014012	TGC	2	6	788048	788053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139423
14003	NC_014012	GAT	2	6	788134	788139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139423
14004	NC_014012	GAA	2	6	788166	788171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139423
14005	NC_014012	CA	3	6	788226	788231	50 %	0 %	0 %	50 %	294139423
14006	NC_014012	GGA	2	6	788334	788339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139423
14007	NC_014012	T	7	7	788346	788352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_014012	AGT	2	6	788391	788396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_014012	TAGAAA	2	12	788399	788410	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_014012	ACA	2	6	788457	788462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_014012	CAC	2	6	788491	788496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139424
14012	NC_014012	TCT	2	6	788499	788504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139424
14013	NC_014012	TCT	2	6	788506	788511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139424
14014	NC_014012	C	6	6	788655	788660	0 %	0 %	0 %	100 %	294139424
14015	NC_014012	GGA	2	6	788722	788727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139424
14016	NC_014012	AGG	2	6	788736	788741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139424
14017	NC_014012	AG	3	6	788773	788778	50 %	0 %	50 %	0 %	294139424
14018	NC_014012	GAT	2	6	788800	788805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139424
14019	NC_014012	AG	3	6	788806	788811	50 %	0 %	50 %	0 %	294139424
14020	NC_014012	CGC	2	6	788838	788843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139424
14021	NC_014012	GCA	2	6	788905	788910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139424
14022	NC_014012	TGC	2	6	789028	789033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139424
14023	NC_014012	GAGT	2	8	789134	789141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_014012	ATA	2	6	789211	789216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_014012	TAT	2	6	789248	789253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_014012	AAT	2	6	789313	789318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_014012	CTT	2	6	789507	789512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_014012	AAC	2	6	789514	789519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_014012	TACC	2	8	789531	789538	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14030	NC_014012	CTG	2	6	789652	789657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139425
14031	NC_014012	CAT	2	6	789724	789729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139425
14032	NC_014012	TATC	2	8	789769	789776	25 %	50 %	0 %	25 %	294139425
14033	NC_014012	AT	3	6	789778	789783	50 %	50 %	0 %	0 %	294139425
14034	NC_014012	CG	3	6	789850	789855	0 %	0 %	50 %	50 %	294139425
14035	NC_014012	CAT	2	6	789887	789892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139425
14036	NC_014012	TGG	2	6	789915	789920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139425
14037	NC_014012	TC	3	6	790042	790047	0 %	50 %	0 %	50 %	294139425
14038	NC_014012	TGG	2	6	790048	790053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139425
14039	NC_014012	CTG	2	6	790103	790108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139425
14040	NC_014012	CAGATC	2	12	790148	790159	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294139425
14041	NC_014012	GTT	2	6	790165	790170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139425
14042	NC_014012	TG	3	6	790230	790235	0 %	50 %	50 %	0 %	294139425
14043	NC_014012	CTG	2	6	790247	790252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139425
14044	NC_014012	TTA	2	6	790378	790383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139425
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14047	NC_014012	AG	3	6	790575	790580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_014012	TTA	2	6	790653	790658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_014012	CGC	2	6	790679	790684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139426
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14051	NC_014012	TGC	2	6	790858	790863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139426
14052	NC_014012	GCT	2	6	790985	790990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139426
14053	NC_014012	TG	3	6	791086	791091	0 %	50 %	50 %	0 %	294139426
14054	NC_014012	AGT	2	6	791103	791108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139426
14055	NC_014012	TGC	2	6	791122	791127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139426
14056	NC_014012	TGGCG	2	10	791132	791141	0 %	20 %	60 %	20 %	294139426
14057	NC_014012	GGC	2	6	791198	791203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139426
14058	NC_014012	GATT	2	8	791257	791264	25 %	50 %	25 %	0 %	294139426
14059	NC_014012	TAT	2	6	791297	791302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139426
14060	NC_014012	GC	3	6	791333	791338	0 %	0 %	50 %	50 %	294139426
14061	NC_014012	TGA	2	6	791342	791347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139426
14062	NC_014012	TGT	2	6	791395	791400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139426
14063	NC_014012	TGCTC	2	10	791401	791410	0 %	40 %	20 %	40 %	294139426
14064	NC_014012	CAT	2	6	791411	791416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139426
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14069	NC_014012	GCA	2	6	791623	791628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139426
14070	NC_014012	TCT	2	6	791629	791634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139426
14071	NC_014012	CT	3	6	791667	791672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14072	NC_014012	AAT	2	6	791684	791689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_014012	AAACC	2	10	791783	791792	60 %	0 %	0 %	40 %	294139427
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14079	NC_014012	GTC	2	6	792002	792007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139427
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14082	NC_014012	GGC	2	6	792162	792167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139427
14083	NC_014012	CGAAT	2	10	792172	792181	40 %	20 %	20 %	20 %	294139427
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14089	NC_014012	GA	3	6	792463	792468	50 %	0 %	50 %	0 %	294139427
14090	NC_014012	TCA	2	6	792564	792569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139427
14091	NC_014012	TGA	2	6	792593	792598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139427
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14093	NC_014012	GCT	2	6	792688	792693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139427
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14103	NC_014012	CGCTG	2	10	793342	793351	0 %	20 %	40 %	40 %	294139428
14104	NC_014012	TAT	2	6	793390	793395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139428
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14108	NC_014012	TGGTT	2	10	793731	793740	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_014012	AGG	2	6	793785	793790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_014012	TA	3	6	793893	793898	50 %	50 %	0 %	0 %	294139429
14111	NC_014012	GAT	2	6	793917	793922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139429
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14121	NC_014012	TAA	2	6	794459	794464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_014012	CGAT	2	8	794467	794474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14123	NC_014012	AGGC	2	8	794576	794583	25 %	0 %	50 %	25 %	294139430
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14152	NC_014012	GA	3	6	796312	796317	50 %	0 %	50 %	0 %	294139431
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14174	NC_014012	TGAA	2	8	797477	797484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14493	NC_014012	TAG	2	6	817211	817216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139451
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14499	NC_014012	GTAG	2	8	817813	817820	25 %	25 %	50 %	0 %	294139452
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