MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014012	CA	3	6	703040	703045	50 %	0 %	0 %	50 %	294139362
12502	NC_014012	ACA	2	6	703056	703061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139362
12503	NC_014012	CTT	2	6	703112	703117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139362
12504	NC_014012	CTT	2	6	703346	703351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139362
12505	NC_014012	GT	3	6	703420	703425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_014012	CATA	2	8	703427	703434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12507	NC_014012	AAC	2	6	703529	703534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_014012	CGC	2	6	703575	703580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12509	NC_014012	TGA	2	6	703599	703604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_014012	ACC	3	9	703611	703619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12511	NC_014012	GAT	2	6	703653	703658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139363
12512	NC_014012	GAT	2	6	703672	703677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139363
12513	NC_014012	GAG	2	6	703717	703722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139363
12514	NC_014012	GCA	2	6	703777	703782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139363
12515	NC_014012	AAG	2	6	703784	703789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139363
12516	NC_014012	GGC	2	6	703797	703802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139363
12517	NC_014012	GAT	2	6	703963	703968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139363
12518	NC_014012	TGA	2	6	704112	704117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139363
12519	NC_014012	GCA	2	6	704305	704310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139363
12520	NC_014012	CTG	2	6	704312	704317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139363
12521	NC_014012	CAT	2	6	704376	704381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139363
12522	NC_014012	CAAG	2	8	704427	704434	50 %	0 %	25 %	25 %	294139363
12523	NC_014012	TGA	2	6	704496	704501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139363
12524	NC_014012	CAT	2	6	704505	704510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139363
12525	NC_014012	CTG	2	6	704594	704599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139363
12526	NC_014012	TGT	2	6	704640	704645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139363
12527	NC_014012	TAA	2	6	704655	704660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139363
12528	NC_014012	TTAG	2	8	704686	704693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_014012	CCT	2	6	704729	704734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12530	NC_014012	AATAAG	2	12	704760	704771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_014012	GCT	2	6	704783	704788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_014012	TG	4	8	704800	704807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_014012	GAT	2	6	704815	704820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139364
12534	NC_014012	GAA	2	6	704921	704926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139364
12535	NC_014012	GA	3	6	704967	704972	50 %	0 %	50 %	0 %	294139364
12536	NC_014012	ACC	2	6	704975	704980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139364
12537	NC_014012	CAA	2	6	705142	705147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139364
12538	NC_014012	TCA	2	6	705166	705171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139364
12539	NC_014012	TGG	2	6	705337	705342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139364
12540	NC_014012	GC	3	6	705371	705376	0 %	0 %	50 %	50 %	294139364
12541	NC_014012	TC	3	6	705421	705426	0 %	50 %	0 %	50 %	294139364
12542	NC_014012	GAA	2	6	705475	705480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139364
12543	NC_014012	ATG	2	6	705507	705512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139364
12544	NC_014012	ATG	2	6	705663	705668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139364
12545	NC_014012	TAAC	2	8	705831	705838	50 %	25 %	0 %	25 %	294139364
12546	NC_014012	TCT	2	6	705972	705977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139364
12547	NC_014012	GC	3	6	706038	706043	0 %	0 %	50 %	50 %	294139364
12548	NC_014012	GGC	2	6	706115	706120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139364
12549	NC_014012	ACATG	2	10	706180	706189	40 %	20 %	20 %	20 %	294139364
12550	NC_014012	CCTT	2	8	706422	706429	0 %	50 %	0 %	50 %	294139364
12551	NC_014012	TTA	2	6	706509	706514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_014012	TTTA	2	8	706527	706534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_014012	AT	3	6	706561	706566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_014012	TC	3	6	706642	706647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12555	NC_014012	TAT	2	6	706737	706742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_014012	CTTGG	2	10	706819	706828	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12557	NC_014012	TGAA	2	8	706863	706870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_014012	CTAAT	2	10	706896	706905	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12559	NC_014012	G	6	6	706910	706915	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_014012	TATTT	2	10	706939	706948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_014012	TTAT	2	8	707033	707040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_014012	T	6	6	707150	707155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_014012	T	8	8	707157	707164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_014012	AGC	2	6	707192	707197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_014012	CGC	2	6	707210	707215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12566	NC_014012	TCCAC	2	10	707216	707225	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12567	NC_014012	AG	4	8	707232	707239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_014012	GC	3	6	707248	707253	0 %	0 %	50 %	50 %	294139365
12569	NC_014012	TCT	2	6	707262	707267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139365
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12571	NC_014012	CGA	2	6	707383	707388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139365
12572	NC_014012	GAT	2	6	707468	707473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139365
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12576	NC_014012	CTAT	2	8	707862	707869	25 %	50 %	0 %	25 %	294139365
12577	NC_014012	TTAA	2	8	707888	707895	50 %	50 %	0 %	0 %	294139365
12578	NC_014012	TA	3	6	707931	707936	50 %	50 %	0 %	0 %	294139365
12579	NC_014012	GATA	2	8	708001	708008	50 %	25 %	25 %	0 %	294139365
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12582	NC_014012	TAC	2	6	708216	708221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139365
12583	NC_014012	TA	3	6	708233	708238	50 %	50 %	0 %	0 %	294139365
12584	NC_014012	ATT	2	6	708245	708250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139365
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12589	NC_014012	GATA	2	8	708442	708449	50 %	25 %	25 %	0 %	294139365
12590	NC_014012	TGG	2	6	708571	708576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139365
12591	NC_014012	GCT	2	6	708619	708624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139365
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12593	NC_014012	TGA	2	6	708820	708825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139365
12594	NC_014012	ATC	2	6	708833	708838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139365
12595	NC_014012	CTT	2	6	708920	708925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12596	NC_014012	GTT	2	6	709108	709113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139366
12597	NC_014012	T	6	6	709131	709136	0 %	100 %	0 %	0 %	294139366
12598	NC_014012	GGCT	2	8	709170	709177	0 %	25 %	50 %	25 %	294139366
12599	NC_014012	AT	3	6	709186	709191	50 %	50 %	0 %	0 %	294139366
12600	NC_014012	ATG	2	6	709245	709250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139366
12601	NC_014012	GAT	2	6	709253	709258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139366
12602	NC_014012	AG	5	10	709273	709282	50 %	0 %	50 %	0 %	294139366
12603	NC_014012	T	6	6	709378	709383	0 %	100 %	0 %	0 %	294139366
12604	NC_014012	CGAC	2	8	709438	709445	25 %	0 %	25 %	50 %	294139366
12605	NC_014012	CCG	2	6	709521	709526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139366
12606	NC_014012	AG	3	6	709530	709535	50 %	0 %	50 %	0 %	294139366
12607	NC_014012	ATTT	2	8	709538	709545	25 %	75 %	0 %	0 %	294139366
12608	NC_014012	GCA	2	6	709684	709689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139366
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12610	NC_014012	ACG	2	6	709762	709767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139366
12611	NC_014012	TA	3	6	709784	709789	50 %	50 %	0 %	0 %	294139366
12612	NC_014012	TA	3	6	709797	709802	50 %	50 %	0 %	0 %	294139366
12613	NC_014012	TGA	2	6	709807	709812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139366
12614	NC_014012	CTA	2	6	709855	709860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139366
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12617	NC_014012	ACTCAG	2	12	709979	709990	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294139366
12618	NC_014012	TGG	2	6	710116	710121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139366
12619	NC_014012	ATTG	2	8	710176	710183	25 %	50 %	25 %	0 %	294139366
12620	NC_014012	AGAA	2	8	710184	710191	75 %	0 %	25 %	0 %	294139366
12621	NC_014012	CGC	2	6	710279	710284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139366
12622	NC_014012	AGG	2	6	710304	710309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139366
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12624	NC_014012	GATA	2	8	710356	710363	50 %	25 %	25 %	0 %	294139366
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12989	NC_014012	T	7	7	731950	731956	0 %	100 %	0 %	0 %	294139385
12990	NC_014012	GAT	2	6	731966	731971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139385
12991	NC_014012	ATA	2	6	732004	732009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139385
12992	NC_014012	ATG	2	6	732031	732036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12993	NC_014012	GTG	2	6	732219	732224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139386
12994	NC_014012	ATC	2	6	732243	732248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139386
12995	NC_014012	CAT	2	6	732355	732360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139386
12996	NC_014012	TCC	2	6	732405	732410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139386
12997	NC_014012	GAT	2	6	732429	732434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139386
12998	NC_014012	TA	3	6	732550	732555	50 %	50 %	0 %	0 %	294139386
12999	NC_014012	TTA	2	6	732652	732657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139386
13000	NC_014012	ACA	2	6	732740	732745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139386

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