MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014012	CTTA	2	8	647004	647011	25 %	50 %	0 %	25 %	294139315
11502	NC_014012	ATT	2	6	647026	647031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139315
11503	NC_014012	TGA	2	6	647036	647041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11504	NC_014012	TGTGAG	2	12	647096	647107	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294139315
11505	NC_014012	GAT	3	9	647139	647147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11506	NC_014012	GGA	2	6	647162	647167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139315
11507	NC_014012	TAGC	2	8	647227	647234	25 %	25 %	25 %	25 %	294139315
11508	NC_014012	GAT	2	6	647307	647312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11509	NC_014012	ACT	2	6	647314	647319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139315
11510	NC_014012	ATG	2	6	647356	647361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11511	NC_014012	ATAG	2	8	647394	647401	50 %	25 %	25 %	0 %	294139315
11512	NC_014012	GAT	2	6	647427	647432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11513	NC_014012	TAA	2	6	647458	647463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139315
11514	NC_014012	ATC	2	6	647523	647528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139315
11515	NC_014012	TA	3	6	647583	647588	50 %	50 %	0 %	0 %	294139315
11516	NC_014012	GAT	2	6	647637	647642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11517	NC_014012	G	8	8	647643	647650	0 %	0 %	100 %	0 %	294139315
11518	NC_014012	ATG	2	6	647695	647700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11519	NC_014012	GCTA	2	8	647883	647890	25 %	25 %	25 %	25 %	294139315
11520	NC_014012	ATG	2	6	648037	648042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11521	NC_014012	GAT	2	6	648114	648119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11522	NC_014012	TTA	2	6	648133	648138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139315
11523	NC_014012	TGA	2	6	648143	648148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11524	NC_014012	CAAGCC	2	12	648195	648206	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294139315
11525	NC_014012	CCT	2	6	648285	648290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139315
11526	NC_014012	TGC	2	6	648323	648328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139315
11527	NC_014012	TC	3	6	648376	648381	0 %	50 %	0 %	50 %	294139315
11528	NC_014012	TC	3	6	648400	648405	0 %	50 %	0 %	50 %	294139315
11529	NC_014012	TGGC	2	8	648481	648488	0 %	25 %	50 %	25 %	294139315
11530	NC_014012	GTG	2	6	648528	648533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139315
11531	NC_014012	AAGA	2	8	648654	648661	75 %	0 %	25 %	0 %	294139315
11532	NC_014012	AAT	2	6	648906	648911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139315
11533	NC_014012	GTT	2	6	648929	648934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139315
11534	NC_014012	TGA	2	6	648986	648991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11535	NC_014012	GAG	2	6	649098	649103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139315
11536	NC_014012	TTG	2	6	649153	649158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139315
11537	NC_014012	GA	3	6	649176	649181	50 %	0 %	50 %	0 %	294139315
11538	NC_014012	TGG	2	6	649204	649209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139315
11539	NC_014012	GT	3	6	649258	649263	0 %	50 %	50 %	0 %	294139315
11540	NC_014012	CAT	2	6	649313	649318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139315
11541	NC_014012	GTG	2	6	649342	649347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139315
11542	NC_014012	TTCA	2	8	649449	649456	25 %	50 %	0 %	25 %	294139315
11543	NC_014012	TCC	2	6	649532	649537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139315
11544	NC_014012	TGA	2	6	649547	649552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11545	NC_014012	TCAA	2	8	649567	649574	50 %	25 %	0 %	25 %	294139315
11546	NC_014012	ATG	2	6	649618	649623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11547	NC_014012	GCT	2	6	649660	649665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139315
11548	NC_014012	GAGG	2	8	649725	649732	25 %	0 %	75 %	0 %	294139315
11549	NC_014012	TAT	2	6	649784	649789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139315
11550	NC_014012	CTT	2	6	649793	649798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139315
11551	NC_014012	CTT	2	6	649808	649813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139315
11552	NC_014012	ATT	2	6	649913	649918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139315
11553	NC_014012	TAT	2	6	649925	649930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139315
11554	NC_014012	GAC	2	6	649943	649948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139315
11555	NC_014012	CTT	2	6	650006	650011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139315
11556	NC_014012	GAT	2	6	650112	650117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11557	NC_014012	AT	3	6	650183	650188	50 %	50 %	0 %	0 %	294139315
11558	NC_014012	GACG	2	8	650225	650232	25 %	0 %	50 %	25 %	294139315
11559	NC_014012	GCTATC	2	12	650305	650316	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294139315
11560	NC_014012	CAG	2	6	650400	650405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139315
11561	NC_014012	GAT	2	6	650421	650426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
11562	NC_014012	TTTAG	2	10	650505	650514	20 %	60 %	20 %	0 %	294139315
11563	NC_014012	TGATT	2	10	650528	650537	20 %	60 %	20 %	0 %	294139315
11564	NC_014012	GCA	2	6	650632	650637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_014012	TTA	2	6	650726	650731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_014012	ACAG	2	8	650817	650824	50 %	0 %	25 %	25 %	294139316
11567	NC_014012	TTTG	2	8	650832	650839	0 %	75 %	25 %	0 %	294139316
11568	NC_014012	TTC	2	6	650908	650913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139316
11569	NC_014012	GCTA	2	8	650931	650938	25 %	25 %	25 %	25 %	294139316
11570	NC_014012	TAG	2	6	650991	650996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139316
11571	NC_014012	ATC	2	6	651004	651009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139316
11572	NC_014012	TGG	2	6	651041	651046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139316
11573	NC_014012	TAA	2	6	651087	651092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139316
11574	NC_014012	AT	3	6	651362	651367	50 %	50 %	0 %	0 %	294139316
11575	NC_014012	TGAG	2	8	651422	651429	25 %	25 %	50 %	0 %	294139316
11576	NC_014012	GA	3	6	651459	651464	50 %	0 %	50 %	0 %	294139316
11577	NC_014012	AGC	2	6	651531	651536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139317
11578	NC_014012	TGA	2	6	651540	651545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139317
11579	NC_014012	TAT	2	6	651661	651666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_014012	GAAT	2	8	651785	651792	50 %	25 %	25 %	0 %	294139318
11581	NC_014012	TAA	3	9	651795	651803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139318
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11583	NC_014012	A	7	7	651900	651906	100 %	0 %	0 %	0 %	294139318
11584	NC_014012	T	6	6	652011	652016	0 %	100 %	0 %	0 %	294139318
11585	NC_014012	AT	3	6	652035	652040	50 %	50 %	0 %	0 %	294139318
11586	NC_014012	AGTC	2	8	652051	652058	25 %	25 %	25 %	25 %	294139318
11587	NC_014012	TTA	2	6	652129	652134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139318
11588	NC_014012	GATA	2	8	652252	652259	50 %	25 %	25 %	0 %	294139318
11589	NC_014012	G	6	6	652319	652324	0 %	0 %	100 %	0 %	294139318
11590	NC_014012	GCA	2	6	652395	652400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139318
11591	NC_014012	AGA	2	6	652401	652406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139318
11592	NC_014012	T	6	6	652412	652417	0 %	100 %	0 %	0 %	294139318
11593	NC_014012	CTT	2	6	652436	652441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139318
11594	NC_014012	TTG	2	6	652591	652596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_014012	TAT	2	6	652698	652703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_014012	TTA	2	6	652759	652764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_014012	GCAC	2	8	652827	652834	25 %	0 %	25 %	50 %	294139319
11598	NC_014012	AAT	2	6	652928	652933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139319
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11601	NC_014012	GCTG	2	8	652990	652997	0 %	25 %	50 %	25 %	294139319
11602	NC_014012	GA	3	6	653001	653006	50 %	0 %	50 %	0 %	294139319
11603	NC_014012	CTA	2	6	653047	653052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139319
11604	NC_014012	TCT	2	6	653055	653060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139319
11605	NC_014012	CTTT	2	8	653183	653190	0 %	75 %	0 %	25 %	294139319
11606	NC_014012	TCT	2	6	653226	653231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139319
11607	NC_014012	CTT	2	6	653263	653268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139319
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11609	NC_014012	CTT	2	6	653449	653454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139319
11610	NC_014012	GTG	2	6	653517	653522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139319
11611	NC_014012	CGG	2	6	653605	653610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139319
11612	NC_014012	TGA	2	6	653763	653768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_014012	GGT	2	6	653862	653867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139320
11614	NC_014012	CT	3	6	654071	654076	0 %	50 %	0 %	50 %	294139320
11615	NC_014012	GAT	2	6	654089	654094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139320
11616	NC_014012	AG	3	6	654118	654123	50 %	0 %	50 %	0 %	294139320
11617	NC_014012	CGGG	2	8	654124	654131	0 %	0 %	75 %	25 %	294139320
11618	NC_014012	CA	3	6	654142	654147	50 %	0 %	0 %	50 %	294139320
11619	NC_014012	GAT	2	6	654179	654184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139320
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11847	NC_014012	T	6	6	667074	667079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11848	NC_014012	TAT	2	6	667117	667122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11991	NC_014012	CTT	2	6	673120	673125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139337
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