MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_014012	CTGA	2	8	588228	588235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10502	NC_014012	GGA	2	6	588518	588523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_014012	TAC	2	6	588722	588727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_014012	AC	3	6	588735	588740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10505	NC_014012	CGTC	2	8	588753	588760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10506	NC_014012	AAC	2	6	588772	588777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_014012	AGC	2	6	588862	588867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_014012	AAAG	2	8	588876	588883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_014012	AGTCG	2	10	588898	588907	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10510	NC_014012	CAGGG	2	10	589123	589132	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10511	NC_014012	CTA	2	6	589200	589205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_014012	GA	3	6	589215	589220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_014012	AGGCT	2	10	589227	589236	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10514	NC_014012	GCG	2	6	589240	589245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_014012	TGA	2	6	589325	589330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_014012	TGA	2	6	589344	589349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_014012	AGT	2	6	589350	589355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_014012	TCT	2	6	589378	589383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_014012	TAG	2	6	589395	589400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_014012	GGT	2	6	589424	589429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_014012	GA	3	6	589454	589459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_014012	TGA	2	6	589523	589528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_014012	CT	3	6	589535	589540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10524	NC_014012	ATTG	2	8	589657	589664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_014012	CGG	2	6	589705	589710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_014012	ATG	2	6	589781	589786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_014012	ACC	2	6	589976	589981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10528	NC_014012	TGG	2	6	590037	590042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_014012	TCC	2	6	590063	590068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10530	NC_014012	GGA	2	6	590080	590085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_014012	GGT	2	6	590200	590205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_014012	CGG	2	6	590287	590292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_014012	TCA	2	6	590315	590320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_014012	CGT	2	6	590395	590400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_014012	GAT	2	6	590435	590440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_014012	GAAG	2	8	590442	590449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_014012	GTT	2	6	590498	590503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_014012	GT	3	6	590648	590653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_014012	ATG	2	6	590735	590740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_014012	ATT	2	6	590789	590794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_014012	TTTA	2	8	590798	590805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_014012	AGA	2	6	590815	590820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_014012	CAC	2	6	590889	590894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10544	NC_014012	T	6	6	591019	591024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_014012	TAA	2	6	591037	591042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_014012	ACGT	2	8	591119	591126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10547	NC_014012	GTC	2	6	591145	591150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_014012	CCG	2	6	591151	591156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10549	NC_014012	AAC	2	6	591371	591376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_014012	TCC	2	6	591405	591410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10551	NC_014012	TTAA	2	8	591459	591466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_014012	TGGTTT	3	18	591492	591509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_014012	ATC	2	6	591605	591610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_014012	TCAT	2	8	591617	591624	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10555	NC_014012	CAA	2	6	591644	591649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_014012	TGC	2	6	591672	591677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_014012	ATA	2	6	591808	591813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_014012	CTT	2	6	591814	591819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_014012	ATAA	2	8	591868	591875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_014012	TGG	2	6	591997	592002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_014012	TCT	2	6	592114	592119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_014012	CAA	2	6	592146	592151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_014012	T	7	7	592170	592176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_014012	AGTA	2	8	592246	592253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_014012	CGG	2	6	592276	592281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_014012	CAC	2	6	592292	592297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10567	NC_014012	TG	3	6	592326	592331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_014012	AGCA	2	8	592462	592469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10569	NC_014012	AAG	2	6	592481	592486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_014012	GGC	2	6	592621	592626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10571	NC_014012	GCG	2	6	592685	592690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_014012	AGG	2	6	592780	592785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_014012	GGTAA	2	10	592837	592846	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_014012	CGA	2	6	592860	592865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_014012	GAT	2	6	592885	592890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_014012	GCA	2	6	592934	592939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10577	NC_014012	GT	3	6	592987	592992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_014012	GAA	2	6	592993	592998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_014012	GAG	2	6	593027	593032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_014012	AGGT	2	8	593036	593043	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_014012	TAA	2	6	593047	593052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_014012	AGA	2	6	593076	593081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_014012	CAG	2	6	593102	593107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10584	NC_014012	G	6	6	593249	593254	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_014012	GGC	2	6	593313	593318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10586	NC_014012	GAA	2	6	593556	593561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_014012	TGC	2	6	593632	593637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10588	NC_014012	GTC	2	6	593644	593649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10589	NC_014012	CCTTAT	2	12	593696	593707	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10590	NC_014012	TGG	2	6	593722	593727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_014012	GGA	2	6	593758	593763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_014012	GAC	2	6	593771	593776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_014012	TCA	2	6	593783	593788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10594	NC_014012	AC	3	6	593809	593814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10595	NC_014012	CGC	2	6	593846	593851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10596	NC_014012	AC	3	6	593978	593983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10597	NC_014012	CCT	2	6	594121	594126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10598	NC_014012	CA	3	6	594162	594167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10599	NC_014012	CTTGTT	2	12	594173	594184	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10600	NC_014012	GTT	2	6	594210	594215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_014012	ATAA	2	8	594325	594332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_014012	TTAG	2	8	594376	594383	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_014012	GTT	2	6	594446	594451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_014012	CGA	2	6	594555	594560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_014012	GTA	2	6	594681	594686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_014012	GGA	2	6	594832	594837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_014012	TAG	2	6	594861	594866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_014012	GCGA	2	8	594869	594876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10609	NC_014012	G	6	6	595018	595023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_014012	TCC	2	6	595028	595033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10611	NC_014012	CTGA	2	8	595048	595055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10612	NC_014012	GGA	2	6	595338	595343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_014012	TAC	2	6	595542	595547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10614	NC_014012	AC	3	6	595555	595560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10615	NC_014012	CGTC	2	8	595573	595580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10616	NC_014012	AAC	2	6	595592	595597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10617	NC_014012	AGC	2	6	595682	595687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10618	NC_014012	AAAG	2	8	595696	595703	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_014012	AGTCG	2	10	595718	595727	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10620	NC_014012	CAGGG	2	10	595943	595952	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10621	NC_014012	CTA	2	6	596020	596025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10622	NC_014012	GA	3	6	596035	596040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_014012	AGGCT	2	10	596047	596056	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10624	NC_014012	GCG	2	6	596060	596065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10625	NC_014012	TGA	2	6	596145	596150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_014012	TGA	2	6	596164	596169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_014012	AGT	2	6	596170	596175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_014012	TCT	2	6	596198	596203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10629	NC_014012	TAG	2	6	596215	596220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10630	NC_014012	GGT	2	6	596244	596249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10631	NC_014012	GA	3	6	596274	596279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10632	NC_014012	TGA	2	6	596343	596348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10898	NC_014012	GC	3	6	612285	612290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10899	NC_014012	TTA	2	6	612318	612323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10900	NC_014012	ACGT	2	8	612345	612352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10901	NC_014012	CGC	2	6	612391	612396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10902	NC_014012	CAC	2	6	612438	612443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10903	NC_014012	ACGAA	2	10	612468	612477	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10904	NC_014012	CTT	2	6	612528	612533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10905	NC_014012	T	6	6	612574	612579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10906	NC_014012	ACT	2	6	612600	612605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139290
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10918	NC_014012	TTAG	2	8	613018	613025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10919	NC_014012	AGA	2	6	613038	613043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10921	NC_014012	T	7	7	613215	613221	0 %	100 %	0 %	0 %	294139291
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10924	NC_014012	TA	3	6	613330	613335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10932	NC_014012	TCA	2	6	613689	613694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10933	NC_014012	CTG	2	6	613732	613737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10936	NC_014012	GCA	2	6	613917	613922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10939	NC_014012	AAGT	2	8	614313	614320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10943	NC_014012	AGT	2	6	614424	614429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10972	NC_014012	T	7	7	616257	616263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10973	NC_014012	GCT	2	6	616351	616356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139294
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10993	NC_014012	TTA	2	6	617897	617902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10994	NC_014012	TGG	2	6	617946	617951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10996	NC_014012	AAG	2	6	617985	617990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10997	NC_014012	AAG	2	6	617993	617998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10998	NC_014012	AAG	2	6	618001	618006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10999	NC_014012	AAG	2	6	618009	618014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11000	NC_014012	AAG	2	6	618017	618022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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