MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014012	ATC	2	6	560323	560328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139263
10002	NC_014012	CCA	2	6	560359	560364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139263
10003	NC_014012	ATG	2	6	560407	560412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139263
10004	NC_014012	CATCG	2	10	560413	560422	20 %	20 %	20 %	40 %	294139263
10005	NC_014012	TAT	2	6	560588	560593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139263
10006	NC_014012	AAG	2	6	560639	560644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139263
10007	NC_014012	AT	3	6	560652	560657	50 %	50 %	0 %	0 %	294139263
10008	NC_014012	TGC	2	6	560764	560769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139264
10009	NC_014012	GTC	2	6	560814	560819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139264
10010	NC_014012	CAA	2	6	560853	560858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139264
10011	NC_014012	GTAA	2	8	560904	560911	50 %	25 %	25 %	0 %	294139264
10012	NC_014012	GTT	2	6	560973	560978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139264
10013	NC_014012	GCT	2	6	560988	560993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139264
10014	NC_014012	TTG	2	6	560995	561000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139264
10015	NC_014012	CAG	2	6	561073	561078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139264
10016	NC_014012	CT	3	6	561087	561092	0 %	50 %	0 %	50 %	294139264
10017	NC_014012	GTG	2	6	561093	561098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139264
10018	NC_014012	AAG	2	6	561195	561200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139264
10019	NC_014012	CGT	2	6	561222	561227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139264
10020	NC_014012	T	6	6	561292	561297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_014012	ATT	2	6	561298	561303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_014012	GCC	2	6	561323	561328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_014012	TGA	2	6	561365	561370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139265
10024	NC_014012	CTTTTA	2	12	561386	561397	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294139265
10025	NC_014012	CAG	2	6	561415	561420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139265
10026	NC_014012	TCA	2	6	561600	561605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139265
10027	NC_014012	C	6	6	561716	561721	0 %	0 %	0 %	100 %	294139265
10028	NC_014012	AG	3	6	561811	561816	50 %	0 %	50 %	0 %	294139265
10029	NC_014012	CCTA	2	8	561840	561847	25 %	25 %	0 %	50 %	294139265
10030	NC_014012	TAA	2	6	562021	562026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_014012	CTG	2	6	562057	562062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_014012	TTC	2	6	562090	562095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_014012	A	6	6	562143	562148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_014012	CTTATC	2	12	562155	562166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_014012	ATA	2	6	562193	562198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_014012	GAC	2	6	562204	562209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_014012	AAT	2	6	562245	562250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_014012	GAAG	2	8	562252	562259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_014012	TGC	2	6	562274	562279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10040	NC_014012	GTT	2	6	562322	562327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139266
10041	NC_014012	CCT	2	6	562405	562410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139266
10042	NC_014012	CACT	2	8	562424	562431	25 %	25 %	0 %	50 %	294139266
10043	NC_014012	ATT	2	6	562550	562555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139266
10044	NC_014012	CAG	2	6	562621	562626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10045	NC_014012	TCA	2	6	562809	562814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139266
10046	NC_014012	CAG	2	6	562903	562908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10047	NC_014012	GCA	2	6	562935	562940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139266
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10049	NC_014012	AGCAT	2	10	562996	563005	40 %	20 %	20 %	20 %	294139266
10050	NC_014012	CAT	2	6	563124	563129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139266
10051	NC_014012	ATT	2	6	563135	563140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139266
10052	NC_014012	GCCA	2	8	563169	563176	25 %	0 %	25 %	50 %	294139266
10053	NC_014012	TCC	2	6	563199	563204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139266
10054	NC_014012	AAGA	2	8	563245	563252	75 %	0 %	25 %	0 %	294139266
10055	NC_014012	TA	3	6	563336	563341	50 %	50 %	0 %	0 %	294139266
10056	NC_014012	GAG	2	6	563347	563352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139266
10057	NC_014012	TGC	2	6	563430	563435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10058	NC_014012	TC	3	6	563449	563454	0 %	50 %	0 %	50 %	294139266
10059	NC_014012	ATA	2	6	563456	563461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139266
10060	NC_014012	TAT	2	6	563590	563595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139266
10061	NC_014012	TTTA	2	8	563624	563631	25 %	75 %	0 %	0 %	294139266
10062	NC_014012	AGC	2	6	563792	563797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10063	NC_014012	CTG	3	9	563851	563859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10064	NC_014012	TCG	2	6	563868	563873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10065	NC_014012	CTG	2	6	563882	563887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10066	NC_014012	GTT	2	6	563889	563894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139266
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10068	NC_014012	AGC	2	6	563921	563926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10069	NC_014012	GTG	2	6	563980	563985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139266
10070	NC_014012	TACC	2	8	564031	564038	25 %	25 %	0 %	50 %	294139266
10071	NC_014012	AGT	2	6	564078	564083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139266
10072	NC_014012	ATGGAT	2	12	564190	564201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139266
10073	NC_014012	GCT	2	6	564304	564309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10074	NC_014012	GCT	2	6	564552	564557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10075	NC_014012	CAT	2	6	564558	564563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139266
10076	NC_014012	GAT	2	6	564577	564582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139266
10077	NC_014012	TCT	2	6	564587	564592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139266
10078	NC_014012	CGTC	2	8	564603	564610	0 %	25 %	25 %	50 %	294139266
10079	NC_014012	AGC	2	6	564686	564691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10080	NC_014012	CGT	2	6	564715	564720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139266
10081	NC_014012	TAAA	2	8	564747	564754	75 %	25 %	0 %	0 %	294139266
10082	NC_014012	AAT	2	6	564764	564769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_014012	TAT	2	6	564809	564814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_014012	TATT	2	8	564839	564846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_014012	GTG	2	6	565001	565006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139267
10086	NC_014012	GGT	2	6	565019	565024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139267
10087	NC_014012	ATT	2	6	565040	565045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139267
10088	NC_014012	CAA	2	6	565067	565072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139267
10089	NC_014012	TGA	2	6	565108	565113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139267
10090	NC_014012	TAA	2	6	565141	565146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139267
10091	NC_014012	CGAG	2	8	565156	565163	25 %	0 %	50 %	25 %	294139267
10092	NC_014012	AAC	2	6	565227	565232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139267
10093	NC_014012	AAC	2	6	565247	565252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139267
10094	NC_014012	TCT	2	6	565271	565276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139267
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10096	NC_014012	TTA	2	6	565334	565339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139267
10097	NC_014012	CTT	2	6	565431	565436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139267
10098	NC_014012	CGC	2	6	565445	565450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139267
10099	NC_014012	CTAC	2	8	565556	565563	25 %	25 %	0 %	50 %	294139267
10100	NC_014012	AGTG	2	8	565615	565622	25 %	25 %	50 %	0 %	294139267
10101	NC_014012	TCAG	2	8	565692	565699	25 %	25 %	25 %	25 %	294139267
10102	NC_014012	GTG	2	6	565712	565717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139267
10103	NC_014012	AG	3	6	565766	565771	50 %	0 %	50 %	0 %	294139267
10104	NC_014012	AAG	2	6	565791	565796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139267
10105	NC_014012	ACC	2	6	565842	565847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139267
10106	NC_014012	CAT	2	6	565889	565894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139267
10107	NC_014012	AAC	2	6	565943	565948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139267
10108	NC_014012	TGC	2	6	565975	565980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139267
10109	NC_014012	GCGA	2	8	565990	565997	25 %	0 %	50 %	25 %	294139267
10110	NC_014012	GATC	2	8	566038	566045	25 %	25 %	25 %	25 %	294139267
10111	NC_014012	GAT	2	6	566059	566064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139267
10112	NC_014012	TAT	2	6	566072	566077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139267
10113	NC_014012	AAG	2	6	566123	566128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139267
10114	NC_014012	TAT	2	6	566134	566139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139267
10115	NC_014012	GGTA	2	8	566169	566176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_014012	CT	4	8	566187	566194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10117	NC_014012	GCA	2	6	566200	566205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_014012	AGTG	2	8	566238	566245	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_014012	GCA	2	6	566251	566256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_014012	T	7	7	566347	566353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_014012	ATG	2	6	566443	566448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_014012	AAC	2	6	566508	566513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_014012	ACA	2	6	566577	566582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_014012	CAA	2	6	566604	566609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139268
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10152	NC_014012	TC	3	6	567840	567845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10153	NC_014012	T	6	6	567848	567853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10154	NC_014012	GCT	2	6	567885	567890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10364	NC_014012	GTTA	2	8	579986	579993	25 %	50 %	25 %	0 %	294139282
10365	NC_014012	CAG	2	6	580034	580039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139282
10366	NC_014012	TCA	2	6	580048	580053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139282
10367	NC_014012	CAT	2	6	580062	580067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139282
10368	NC_014012	CAT	2	6	580157	580162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139282
10369	NC_014012	GCC	2	6	580164	580169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139282
10370	NC_014012	CAA	2	6	580186	580191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139282
10371	NC_014012	CTC	2	6	580309	580314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139282
10372	NC_014012	CCT	2	6	580389	580394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139282
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10374	NC_014012	ACT	2	6	580831	580836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139282
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10376	NC_014012	AACGC	2	10	580926	580935	40 %	0 %	20 %	40 %	294139282
10377	NC_014012	ATC	2	6	580955	580960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139282
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10379	NC_014012	CTG	2	6	581059	581064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10380	NC_014012	ATC	2	6	581118	581123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10381	NC_014012	GA	3	6	581147	581152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10382	NC_014012	CAG	2	6	581203	581208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10383	NC_014012	ATC	2	6	581261	581266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139283
10384	NC_014012	TG	3	6	581287	581292	0 %	50 %	50 %	0 %	294139283
10385	NC_014012	TTTA	2	8	581388	581395	25 %	75 %	0 %	0 %	294139284
10386	NC_014012	AAAC	2	8	581400	581407	75 %	0 %	0 %	25 %	294139284
10387	NC_014012	GCT	2	6	581450	581455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139284
10388	NC_014012	CTG	2	6	581517	581522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139284
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10391	NC_014012	TAA	2	6	581831	581836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10392	NC_014012	AAT	2	6	581848	581853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10393	NC_014012	CT	3	6	581958	581963	0 %	50 %	0 %	50 %	294139285
10394	NC_014012	TC	3	6	581987	581992	0 %	50 %	0 %	50 %	294139285
10395	NC_014012	CAT	2	6	582028	582033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139285
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10401	NC_014012	TGGT	2	8	582420	582427	0 %	50 %	50 %	0 %	294139285
10402	NC_014012	TCA	2	6	582432	582437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139285
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10411	NC_014012	TAA	2	6	583283	583288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139285
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10413	NC_014012	ATAGC	2	10	583425	583434	40 %	20 %	20 %	20 %	294139285
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10424	NC_014012	CTAT	2	8	584242	584249	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10425	NC_014012	ATAA	2	8	584266	584273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10426	NC_014012	TTA	2	6	584283	584288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139287
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10478	NC_014012	GTC	2	6	587013	587018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10480	NC_014012	TGG	2	6	587091	587096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10481	NC_014012	GGA	2	6	587127	587132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10482	NC_014012	GAC	2	6	587140	587145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10483	NC_014012	TCA	2	6	587152	587157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10485	NC_014012	CGC	2	6	587215	587220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10486	NC_014012	AC	3	6	587347	587352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10487	NC_014012	CCT	2	6	587490	587495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10488	NC_014012	CA	3	6	587531	587536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10489	NC_014012	CTTGTT	2	12	587542	587553	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10490	NC_014012	GTT	2	6	587579	587584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10491	NC_014012	ACTT	2	8	587636	587643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10492	NC_014012	GTT	2	6	587648	587653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10493	NC_014012	ATAA	3	12	587676	587687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10494	NC_014012	ACA	2	6	587780	587785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10495	NC_014012	GTA	2	6	587861	587866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10496	NC_014012	GGA	2	6	588012	588017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10497	NC_014012	TAG	2	6	588041	588046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10498	NC_014012	GCGA	2	8	588049	588056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10499	NC_014012	G	6	6	588198	588203	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10500	NC_014012	TCC	2	6	588208	588213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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