MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_014012	GTG	2	6	502807	502812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139209
9002	NC_014012	TCT	2	6	502841	502846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139209
9003	NC_014012	GCGCC	2	10	502871	502880	0 %	0 %	40 %	60 %	294139209
9004	NC_014012	AGT	2	6	502958	502963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139209
9005	NC_014012	TAC	2	6	503052	503057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139209
9006	NC_014012	ATA	2	6	503065	503070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139209
9007	NC_014012	GACA	2	8	503160	503167	50 %	0 %	25 %	25 %	294139209
9008	NC_014012	ATG	2	6	503178	503183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139209
9009	NC_014012	TCG	2	6	503213	503218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139209
9010	NC_014012	GCT	3	9	503340	503348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139209
9011	NC_014012	AAG	2	6	503415	503420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139209
9012	NC_014012	A	6	6	503444	503449	100 %	0 %	0 %	0 %	294139209
9013	NC_014012	A	6	6	503459	503464	100 %	0 %	0 %	0 %	294139209
9014	NC_014012	AAGT	2	8	503492	503499	50 %	25 %	25 %	0 %	294139209
9015	NC_014012	A	6	6	503520	503525	100 %	0 %	0 %	0 %	294139210
9016	NC_014012	TGA	2	6	503615	503620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139210
9017	NC_014012	GGT	3	9	503709	503717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139210
9018	NC_014012	GT	3	6	503728	503733	0 %	50 %	50 %	0 %	294139210
9019	NC_014012	AGC	2	6	503755	503760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139210
9020	NC_014012	CTGCT	2	10	503779	503788	0 %	40 %	20 %	40 %	294139210
9021	NC_014012	CA	3	6	503854	503859	50 %	0 %	0 %	50 %	294139210
9022	NC_014012	TGC	2	6	503888	503893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139210
9023	NC_014012	CGT	2	6	504144	504149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139210
9024	NC_014012	GT	3	6	504377	504382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_014012	TATC	2	8	504404	504411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9026	NC_014012	CGC	2	6	504448	504453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9027	NC_014012	TTA	2	6	504522	504527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_014012	TGT	2	6	504615	504620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_014012	GCG	2	6	504688	504693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_014012	GTGCA	2	10	504694	504703	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9031	NC_014012	CT	3	6	504941	504946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9032	NC_014012	ATG	2	6	504997	505002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_014012	CTG	2	6	505004	505009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_014012	TCA	2	6	505016	505021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_014012	AAT	2	6	505042	505047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_014012	TGC	2	6	505135	505140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139211
9037	NC_014012	TAA	2	6	505171	505176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139211
9038	NC_014012	TGG	2	6	505241	505246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139211
9039	NC_014012	TGT	2	6	505273	505278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139211
9040	NC_014012	AGT	2	6	505282	505287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139211
9041	NC_014012	TGC	2	6	505288	505293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139211
9042	NC_014012	GGTT	2	8	505368	505375	0 %	50 %	50 %	0 %	294139211
9043	NC_014012	GGT	2	6	505415	505420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139211
9044	NC_014012	AT	3	6	505427	505432	50 %	50 %	0 %	0 %	294139211
9045	NC_014012	GCT	2	6	505469	505474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9046	NC_014012	TCA	2	6	505485	505490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_014012	TTA	2	6	505540	505545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_014012	AAT	2	6	505631	505636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_014012	GCA	2	6	505706	505711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_014012	CTG	2	6	505778	505783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_014012	TCAA	2	8	505815	505822	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9052	NC_014012	AGCC	2	8	505838	505845	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9053	NC_014012	CTG	2	6	505929	505934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_014012	TCAA	2	8	505966	505973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9055	NC_014012	CCAG	2	8	505991	505998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9056	NC_014012	AATA	2	8	506091	506098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_014012	TCTG	2	8	506242	506249	0 %	50 %	25 %	25 %	294139212
9058	NC_014012	TTGACG	2	12	506281	506292	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139212
9059	NC_014012	TGT	2	6	506357	506362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139212
9060	NC_014012	ATG	2	6	506446	506451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139212
9061	NC_014012	AT	3	6	506639	506644	50 %	50 %	0 %	0 %	294139212
9062	NC_014012	CAT	2	6	506648	506653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139212
9063	NC_014012	GTT	2	6	506719	506724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139212
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9065	NC_014012	CTT	2	6	506762	506767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139212
9066	NC_014012	ATT	2	6	506962	506967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139212
9067	NC_014012	TAT	2	6	506978	506983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139213
9068	NC_014012	ATA	2	6	507019	507024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139213
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9072	NC_014012	TAT	2	6	507244	507249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_014012	CTGA	2	8	507299	507306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9074	NC_014012	CAA	2	6	507309	507314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9075	NC_014012	AGA	2	6	507460	507465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139214
9076	NC_014012	CGT	2	6	507473	507478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139214
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9080	NC_014012	CTAAA	2	10	507651	507660	60 %	20 %	0 %	20 %	294139214
9081	NC_014012	AGA	2	6	507661	507666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139214
9082	NC_014012	CGT	2	6	507698	507703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139214
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9087	NC_014012	CA	3	6	507848	507853	50 %	0 %	0 %	50 %	294139215
9088	NC_014012	GTG	2	6	507938	507943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139215
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9090	NC_014012	CGT	2	6	508107	508112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139216
9091	NC_014012	GATT	2	8	508151	508158	25 %	50 %	25 %	0 %	294139216
9092	NC_014012	GAA	2	6	508178	508183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139216
9093	NC_014012	CAA	2	6	508325	508330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9094	NC_014012	TAA	2	6	508342	508347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139217
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9099	NC_014012	CTG	2	6	508534	508539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139217
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9103	NC_014012	GCT	2	6	508659	508664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139217
9104	NC_014012	TAC	2	6	508715	508720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139217
9105	NC_014012	GAAGTT	2	12	508731	508742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139217
9106	NC_014012	TGT	2	6	508781	508786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139217
9107	NC_014012	TAATT	2	10	508871	508880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_014012	T	7	7	508890	508896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_014012	A	7	7	508966	508972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_014012	AATT	2	8	508981	508988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_014012	CTT	2	6	509027	509032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_014012	ACA	2	6	509035	509040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9113	NC_014012	T	7	7	509042	509048	0 %	100 %	0 %	0 %	294139218
9114	NC_014012	ATG	2	6	509112	509117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139218
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9118	NC_014012	TGT	2	6	509214	509219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139218
9119	NC_014012	TGT	2	6	509232	509237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139218
9120	NC_014012	ATA	2	6	509314	509319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139218
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9122	NC_014012	GGC	2	6	509466	509471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139218
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9124	NC_014012	CAGT	2	8	509522	509529	25 %	25 %	25 %	25 %	294139218
9125	NC_014012	GTC	2	6	509542	509547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139218
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9168	NC_014012	ATT	2	6	512104	512109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9169	NC_014012	TAA	2	6	512148	512153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9170	NC_014012	T	7	7	512267	512273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9171	NC_014012	TA	3	6	512283	512288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9172	NC_014012	AATT	2	8	512296	512303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9203	NC_014012	GA	4	8	514808	514815	50 %	0 %	50 %	0 %	294139219
9204	NC_014012	TTG	2	6	514886	514891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9230	NC_014012	GAT	2	6	515911	515916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139220
9231	NC_014012	GAT	2	6	515988	515993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139220
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9233	NC_014012	TGA	2	6	516234	516239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139220
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9235	NC_014012	TGA	2	6	516378	516383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139220
9236	NC_014012	TA	3	6	516496	516501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9237	NC_014012	GAA	2	6	516614	516619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139221
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9244	NC_014012	TAGGT	2	10	516959	516968	20 %	40 %	40 %	0 %	294139221
9245	NC_014012	CTG	2	6	517005	517010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139221
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9251	NC_014012	CTG	2	6	517327	517332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139221
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9495	NC_014012	GTC	2	6	531975	531980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139238
9496	NC_014012	TGC	2	6	531998	532003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139238
9497	NC_014012	TAA	2	6	532035	532040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139238
9498	NC_014012	GGT	2	6	532129	532134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139238
9499	NC_014012	AGA	2	6	532230	532235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139238
9500	NC_014012	GCA	2	6	532247	532252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139238

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