MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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85502	NC_014012	TTA	2	6	4820093	4820098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142986
85503	NC_014012	GTCT	2	8	4820101	4820108	0 %	50 %	25 %	25 %	294142986
85504	NC_014012	CAG	2	6	4820185	4820190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142986
85505	NC_014012	GCCT	2	8	4820201	4820208	0 %	25 %	25 %	50 %	294142986
85506	NC_014012	TCT	2	6	4820256	4820261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142986
85507	NC_014012	TCA	2	6	4820279	4820284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142986
85508	NC_014012	TGG	2	6	4820292	4820297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294142986
85509	NC_014012	CGA	2	6	4820337	4820342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142986
85510	NC_014012	TGAT	2	8	4820384	4820391	25 %	50 %	25 %	0 %	294142986
85511	NC_014012	C	6	6	4820396	4820401	0 %	0 %	0 %	100 %	294142986
85512	NC_014012	ACC	2	6	4820410	4820415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142986
85513	NC_014012	CCA	2	6	4820423	4820428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142986
85514	NC_014012	ATC	2	6	4820494	4820499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142986
85515	NC_014012	C	7	7	4820559	4820565	0 %	0 %	0 %	100 %	294142986
85516	NC_014012	TAA	2	6	4820754	4820759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142986
85517	NC_014012	GACT	2	8	4820837	4820844	25 %	25 %	25 %	25 %	294142986
85518	NC_014012	TGCT	2	8	4820977	4820984	0 %	50 %	25 %	25 %	294142986
85519	NC_014012	TCA	2	6	4821144	4821149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142986
85520	NC_014012	TCA	2	6	4821191	4821196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142986
85521	NC_014012	CTCTT	2	10	4821226	4821235	0 %	60 %	0 %	40 %	294142986
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85523	NC_014012	CTGG	2	8	4821289	4821296	0 %	25 %	50 %	25 %	294142986
85524	NC_014012	GCCTA	2	10	4821412	4821421	20 %	20 %	20 %	40 %	294142986
85525	NC_014012	TCTT	2	8	4821458	4821465	0 %	75 %	0 %	25 %	294142986
85526	NC_014012	CA	3	6	4821497	4821502	50 %	0 %	0 %	50 %	294142986
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85528	NC_014012	CAT	2	6	4821528	4821533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142986
85529	NC_014012	AT	3	6	4821565	4821570	50 %	50 %	0 %	0 %	294142986
85530	NC_014012	CTG	2	6	4821584	4821589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142986
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85532	NC_014012	CT	3	6	4821734	4821739	0 %	50 %	0 %	50 %	294142986
85533	NC_014012	CGA	2	6	4821751	4821756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142986
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85535	NC_014012	TCA	2	6	4821902	4821907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142986
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85537	NC_014012	ATC	2	6	4822006	4822011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142986
85538	NC_014012	AAT	2	6	4822020	4822025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142986
85539	NC_014012	T	6	6	4822072	4822077	0 %	100 %	0 %	0 %	294142986
85540	NC_014012	GGA	2	6	4822085	4822090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294142986
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85543	NC_014012	AAG	2	6	4822336	4822341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142987
85544	NC_014012	GAT	2	6	4822410	4822415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142987
85545	NC_014012	CGG	2	6	4822454	4822459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85546	NC_014012	TCGAT	2	10	4822469	4822478	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85547	NC_014012	TAA	2	6	4822480	4822485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85548	NC_014012	CAAG	2	8	4822516	4822523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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85550	NC_014012	CAG	2	6	4822555	4822560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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85552	NC_014012	AGT	2	6	4822637	4822642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85553	NC_014012	GA	4	8	4822659	4822666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85554	NC_014012	GTT	2	6	4822806	4822811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85555	NC_014012	ACA	2	6	4822897	4822902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142988
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85558	NC_014012	CGA	2	6	4823041	4823046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142988
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85585	NC_014012	GTAT	2	8	4824258	4824265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85586	NC_014012	TAT	2	6	4824290	4824295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85587	NC_014012	A	7	7	4824300	4824306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85589	NC_014012	ATT	2	6	4824407	4824412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85593	NC_014012	TA	3	6	4824665	4824670	50 %	50 %	0 %	0 %	294142990
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85602	NC_014012	G	6	6	4825176	4825181	0 %	0 %	100 %	0 %	294142990
85603	NC_014012	GAC	2	6	4825196	4825201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142990
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85606	NC_014012	GC	3	6	4825515	4825520	0 %	0 %	50 %	50 %	294142990
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85854	NC_014012	AAG	2	6	4842331	4842336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294143011
85855	NC_014012	TTG	2	6	4842414	4842419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294143011
85856	NC_014012	CAT	2	6	4842494	4842499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143011
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