MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014012	TAA	2	6	447820	447825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139144
8002	NC_014012	TC	4	8	447844	447851	0 %	50 %	0 %	50 %	294139144
8003	NC_014012	GCT	2	6	447875	447880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139144
8004	NC_014012	AAG	2	6	447932	447937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139144
8005	NC_014012	GGT	2	6	447946	447951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139144
8006	NC_014012	ATG	2	6	447963	447968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139144
8007	NC_014012	TATT	2	8	447984	447991	25 %	75 %	0 %	0 %	294139144
8008	NC_014012	CGA	2	6	448111	448116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139144
8009	NC_014012	TAA	2	6	448120	448125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139144
8010	NC_014012	ATT	2	6	448215	448220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139144
8011	NC_014012	CAT	2	6	448229	448234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139144
8012	NC_014012	TC	3	6	448272	448277	0 %	50 %	0 %	50 %	294139144
8013	NC_014012	AG	3	6	448286	448291	50 %	0 %	50 %	0 %	294139144
8014	NC_014012	ATT	2	6	448315	448320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_014012	GTT	2	6	448390	448395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139145
8016	NC_014012	CGT	2	6	448411	448416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139145
8017	NC_014012	GTT	2	6	448445	448450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139145
8018	NC_014012	GTT	2	6	448495	448500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139145
8019	NC_014012	CT	3	6	448575	448580	0 %	50 %	0 %	50 %	294139145
8020	NC_014012	GGC	2	6	448607	448612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139145
8021	NC_014012	CGG	2	6	448660	448665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139145
8022	NC_014012	GAT	2	6	448740	448745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139145
8023	NC_014012	GCTG	2	8	448756	448763	0 %	25 %	50 %	25 %	294139145
8024	NC_014012	AAC	2	6	448829	448834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139145
8025	NC_014012	TTG	2	6	448883	448888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139145
8026	NC_014012	GTTT	2	8	448940	448947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_014012	TGGTCT	2	12	448980	448991	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8028	NC_014012	A	6	6	449047	449052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_014012	TCT	2	6	449115	449120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139146
8030	NC_014012	AGGT	2	8	449134	449141	25 %	25 %	50 %	0 %	294139146
8031	NC_014012	TGGCT	2	10	449144	449153	0 %	40 %	40 %	20 %	294139146
8032	NC_014012	ACT	2	6	449199	449204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139146
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8034	NC_014012	GCTAAT	2	12	449340	449351	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294139146
8035	NC_014012	ATG	2	6	449352	449357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139146
8036	NC_014012	ATG	2	6	449370	449375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139146
8037	NC_014012	A	6	6	449549	449554	100 %	0 %	0 %	0 %	294139146
8038	NC_014012	ACTG	2	8	449613	449620	25 %	25 %	25 %	25 %	294139146
8039	NC_014012	AAG	2	6	449622	449627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139146
8040	NC_014012	TTG	2	6	449639	449644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139146
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8042	NC_014012	CAA	2	6	449687	449692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139146
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8045	NC_014012	ACC	2	6	449822	449827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139146
8046	NC_014012	TTG	2	6	449916	449921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139146
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8048	NC_014012	ATA	2	6	450024	450029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139146
8049	NC_014012	ATG	2	6	450039	450044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139146
8050	NC_014012	CTG	2	6	450107	450112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139146
8051	NC_014012	AG	3	6	450155	450160	50 %	0 %	50 %	0 %	294139146
8052	NC_014012	AAT	2	6	450201	450206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139146
8053	NC_014012	ACA	2	6	450243	450248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139146
8054	NC_014012	AGT	2	6	450336	450341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139146
8055	NC_014012	AAATA	2	10	450353	450362	80 %	20 %	0 %	0 %	294139146
8056	NC_014012	A	6	6	450366	450371	100 %	0 %	0 %	0 %	294139146
8057	NC_014012	TG	3	6	450445	450450	0 %	50 %	50 %	0 %	294139146
8058	NC_014012	TCG	2	6	450463	450468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139146
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8064	NC_014012	GTA	2	6	450637	450642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139147
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8070	NC_014012	CTG	2	6	450987	450992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139147
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8073	NC_014012	ACTCA	2	10	451048	451057	40 %	20 %	0 %	40 %	294139147
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8076	NC_014012	GTAA	2	8	451180	451187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_014012	TAA	3	9	451185	451193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_014012	TAGG	2	8	451261	451268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_014012	AT	3	6	451293	451298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_014012	CTG	2	6	451389	451394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8083	NC_014012	GCCA	2	8	451524	451531	25 %	0 %	25 %	50 %	294139148
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8085	NC_014012	AAG	2	6	451590	451595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_014012	TTAT	2	8	451614	451621	25 %	75 %	0 %	0 %	294139149
8087	NC_014012	CTT	2	6	451679	451684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139149
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8090	NC_014012	ATG	2	6	451879	451884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_014012	TCAT	2	8	451911	451918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8092	NC_014012	GAA	2	6	451940	451945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_014012	CTG	2	6	451955	451960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_014012	GTT	2	6	451983	451988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139150
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8106	NC_014012	ATA	2	6	452539	452544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139150
8107	NC_014012	CCA	2	6	452642	452647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139150
8108	NC_014012	CAT	2	6	452670	452675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139150
8109	NC_014012	TCCAGG	2	12	452733	452744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294139150
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8111	NC_014012	CCA	2	6	452910	452915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139150
8112	NC_014012	TTAC	2	8	452933	452940	25 %	50 %	0 %	25 %	294139150
8113	NC_014012	ATT	3	9	452995	453003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139150
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8118	NC_014012	TCAA	2	8	453122	453129	50 %	25 %	0 %	25 %	294139150
8119	NC_014012	AAT	2	6	453157	453162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139150
8120	NC_014012	T	6	6	453178	453183	0 %	100 %	0 %	0 %	294139150
8121	NC_014012	ATC	2	6	453190	453195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139150
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8123	NC_014012	TGC	2	6	453472	453477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139150
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8126	NC_014012	CT	3	6	453629	453634	0 %	50 %	0 %	50 %	294139150
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8131	NC_014012	CTG	2	6	453909	453914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8132	NC_014012	GCTT	2	8	453915	453922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8133	NC_014012	T	6	6	453976	453981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8239	NC_014012	AAT	2	6	459736	459741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8240	NC_014012	TGA	2	6	459773	459778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8242	NC_014012	TTG	2	6	460091	460096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139159
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8245	NC_014012	TGG	2	6	460363	460368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139160
8246	NC_014012	CTGG	2	8	460415	460422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8247	NC_014012	TCAGT	2	10	460424	460433	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8248	NC_014012	CAG	2	6	460496	460501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8495	NC_014012	GTG	2	6	474806	474811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139176
8496	NC_014012	GGC	2	6	474841	474846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139176
8497	NC_014012	GAT	2	6	474883	474888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139176
8498	NC_014012	GAT	2	6	475013	475018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139177
8499	NC_014012	GCAA	2	8	475030	475037	50 %	0 %	25 %	25 %	294139177
8500	NC_014012	CCAT	2	8	475090	475097	25 %	25 %	0 %	50 %	294139177

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