MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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79002	NC_014012	TCA	3	9	4453753	4453761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142657
79003	NC_014012	TGA	2	6	4453787	4453792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142657
79004	NC_014012	TGC	2	6	4453808	4453813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142657
79005	NC_014012	AGA	2	6	4453839	4453844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142657
79006	NC_014012	GAG	2	6	4453885	4453890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294142657
79007	NC_014012	C	7	7	4454016	4454022	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79008	NC_014012	ATT	2	6	4454060	4454065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79009	NC_014012	A	6	6	4454094	4454099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79010	NC_014012	ATC	2	6	4454157	4454162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79011	NC_014012	CTG	2	6	4454181	4454186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79012	NC_014012	TA	3	6	4454188	4454193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79013	NC_014012	GAAG	2	8	4454207	4454214	50 %	0 %	50 %	0 %	294142658
79014	NC_014012	ATC	2	6	4454215	4454220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142658
79015	NC_014012	ACA	2	6	4454222	4454227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142658
79016	NC_014012	TCG	2	6	4454296	4454301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142658
79017	NC_014012	TCT	2	6	4454314	4454319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142658
79018	NC_014012	GCT	2	6	4454337	4454342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142658
79019	NC_014012	CAG	2	6	4454399	4454404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142658
79020	NC_014012	ATC	2	6	4454436	4454441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142658
79021	NC_014012	CAT	2	6	4454450	4454455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142658
79022	NC_014012	TGC	2	6	4454495	4454500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142658
79023	NC_014012	TGC	2	6	4454507	4454512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142658
79024	NC_014012	TC	3	6	4454514	4454519	0 %	50 %	0 %	50 %	294142658
79025	NC_014012	CAA	2	6	4454702	4454707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142658
79026	NC_014012	CAA	2	6	4454744	4454749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142658
79027	NC_014012	TAG	2	6	4454752	4454757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142658
79028	NC_014012	ATCA	2	8	4454779	4454786	50 %	25 %	0 %	25 %	294142658
79029	NC_014012	CAA	2	6	4454882	4454887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142658
79030	NC_014012	TAT	2	6	4454934	4454939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142658
79031	NC_014012	TA	4	8	4454966	4454973	50 %	50 %	0 %	0 %	294142658
79032	NC_014012	CACTC	2	10	4454977	4454986	20 %	20 %	0 %	60 %	294142658
79033	NC_014012	AT	3	6	4455050	4455055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79034	NC_014012	TGC	2	6	4455067	4455072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79035	NC_014012	AG	3	6	4455121	4455126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79036	NC_014012	CATA	2	8	4455132	4455139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79037	NC_014012	TGC	2	6	4455150	4455155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79038	NC_014012	TTA	2	6	4455207	4455212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79039	NC_014012	GGCA	2	8	4455228	4455235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79040	NC_014012	AAG	2	6	4455256	4455261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79041	NC_014012	CA	3	6	4455264	4455269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79042	NC_014012	AT	3	6	4455281	4455286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79043	NC_014012	CA	3	6	4455337	4455342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79044	NC_014012	AAG	2	6	4455402	4455407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79045	NC_014012	CA	3	6	4455410	4455415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79046	NC_014012	AT	3	6	4455427	4455432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79047	NC_014012	ATCCC	2	10	4455460	4455469	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79048	NC_014012	GGAA	2	8	4455489	4455496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79049	NC_014012	GCTA	2	8	4455498	4455505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79050	NC_014012	TA	4	8	4455504	4455511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79051	NC_014012	TGC	2	6	4455522	4455527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79052	NC_014012	GAA	2	6	4455556	4455561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79053	NC_014012	AGCT	2	8	4455571	4455578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79054	NC_014012	AT	3	6	4455579	4455584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79055	NC_014012	AGCC	2	8	4455586	4455593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79056	NC_014012	TGC	2	6	4455596	4455601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79057	NC_014012	ATCCC	2	10	4455612	4455621	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79058	NC_014012	TA	4	8	4455652	4455659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79059	NC_014012	TGC	2	6	4455670	4455675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79060	NC_014012	ATCCC	2	10	4455686	4455695	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79061	NC_014012	AGCT	2	8	4455719	4455726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79062	NC_014012	AT	3	6	4455727	4455732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79063	NC_014012	TGC	2	6	4455744	4455749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79064	NC_014012	ATCCC	2	10	4455760	4455769	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79065	NC_014012	AGCT	2	8	4455793	4455800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79066	NC_014012	AT	3	6	4455801	4455806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79067	NC_014012	TGC	2	6	4455818	4455823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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79069	NC_014012	AGCT	2	8	4455867	4455874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79070	NC_014012	AT	3	6	4455875	4455880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79071	NC_014012	AGCC	2	8	4455882	4455889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79072	NC_014012	AGCT	2	8	4455941	4455948	25 %	25 %	25 %	25 %	294142659
79073	NC_014012	TGC	2	6	4455966	4455971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142659
79074	NC_014012	TTA	2	6	4456131	4456136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142660
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79079	NC_014012	ATTC	2	8	4456262	4456269	25 %	50 %	0 %	25 %	294142660
79080	NC_014012	AAAAT	2	10	4456286	4456295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79081	NC_014012	CATA	2	8	4456342	4456349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79082	NC_014012	AAT	2	6	4456359	4456364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79083	NC_014012	TGT	2	6	4456395	4456400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79084	NC_014012	GAAAC	2	10	4456423	4456432	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79085	NC_014012	ATA	2	6	4456435	4456440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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79092	NC_014012	TGA	2	6	4456707	4456712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142661
79093	NC_014012	TGAA	2	8	4456790	4456797	50 %	25 %	25 %	0 %	294142661
79094	NC_014012	CTG	2	6	4456856	4456861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142661
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79109	NC_014012	ACT	2	6	4457555	4457560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79110	NC_014012	TTCA	2	8	4457675	4457682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79111	NC_014012	GAC	2	6	4457868	4457873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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79113	NC_014012	AT	3	6	4457936	4457941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79114	NC_014012	CTTAG	2	10	4458068	4458077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79115	NC_014012	GCT	2	6	4458079	4458084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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79119	NC_014012	CAA	2	6	4458296	4458301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142662
79120	NC_014012	AGCTAT	2	12	4458302	4458313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294142662
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79122	NC_014012	AGAGT	2	10	4458586	4458595	40 %	20 %	40 %	0 %	294142662
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