MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75501	NC_014012	AAT	2	6	4256277	4256282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142522
75502	NC_014012	CGG	2	6	4256398	4256403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142522
75503	NC_014012	A	6	6	4256405	4256410	100 %	0 %	0 %	0 %	294142522
75504	NC_014012	GCA	2	6	4256446	4256451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142522
75505	NC_014012	AC	3	6	4256502	4256507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75506	NC_014012	ATA	2	6	4256548	4256553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75507	NC_014012	CTCA	2	8	4256719	4256726	25 %	25 %	0 %	50 %	294142523
75508	NC_014012	GATA	2	8	4256817	4256824	50 %	25 %	25 %	0 %	294142523
75509	NC_014012	TTG	2	6	4256836	4256841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294142523
75510	NC_014012	ATC	2	6	4256858	4256863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142523
75511	NC_014012	TG	3	6	4256888	4256893	0 %	50 %	50 %	0 %	294142523
75512	NC_014012	TGCT	2	8	4257052	4257059	0 %	50 %	25 %	25 %	294142523
75513	NC_014012	AAT	2	6	4257163	4257168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142523
75514	NC_014012	TGCT	2	8	4257179	4257186	0 %	50 %	25 %	25 %	294142523
75515	NC_014012	GAC	2	6	4257264	4257269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142523
75516	NC_014012	CGG	2	6	4257273	4257278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142523
75517	NC_014012	GAT	2	6	4257289	4257294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142523
75518	NC_014012	TGG	2	6	4257305	4257310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294142523
75519	NC_014012	GCT	2	6	4257326	4257331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142523
75520	NC_014012	TA	3	6	4257356	4257361	50 %	50 %	0 %	0 %	294142523
75521	NC_014012	ATT	2	6	4257467	4257472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142523
75522	NC_014012	CAA	2	6	4257535	4257540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75523	NC_014012	GAT	2	6	4257630	4257635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75524	NC_014012	TAC	2	6	4257746	4257751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142524
75525	NC_014012	GAC	2	6	4258009	4258014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142525
75526	NC_014012	TCA	2	6	4258080	4258085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142525
75527	NC_014012	CAT	2	6	4258174	4258179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142525
75528	NC_014012	CTG	2	6	4258308	4258313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142525
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75531	NC_014012	CAGA	2	8	4258444	4258451	50 %	0 %	25 %	25 %	294142525
75532	NC_014012	GAA	2	6	4258568	4258573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142525
75533	NC_014012	CAT	3	9	4258577	4258585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142525
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75535	NC_014012	A	6	6	4258762	4258767	100 %	0 %	0 %	0 %	294142525
75536	NC_014012	TCTG	2	8	4258842	4258849	0 %	50 %	25 %	25 %	294142525
75537	NC_014012	CCAA	2	8	4258852	4258859	50 %	0 %	0 %	50 %	294142525
75538	NC_014012	GAA	2	6	4259054	4259059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142525
75539	NC_014012	CAA	2	6	4259102	4259107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142525
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75541	NC_014012	CCTC	2	8	4259403	4259410	0 %	25 %	0 %	75 %	294142525
75542	NC_014012	TGA	2	6	4259434	4259439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142525
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75544	NC_014012	GAT	2	6	4259503	4259508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142525
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75546	NC_014012	AAT	2	6	4259536	4259541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142525
75547	NC_014012	CTG	2	6	4259588	4259593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142525
75548	NC_014012	TCTCC	2	10	4259614	4259623	0 %	40 %	0 %	60 %	294142525
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75553	NC_014012	AGCT	2	8	4259806	4259813	25 %	25 %	25 %	25 %	294142525
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75555	NC_014012	ATCA	2	8	4259897	4259904	50 %	25 %	0 %	25 %	294142525
75556	NC_014012	ATC	2	6	4259960	4259965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142525
75557	NC_014012	ATG	2	6	4259970	4259975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142525
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75559	NC_014012	CAT	2	6	4260154	4260159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142525
75560	NC_014012	AT	3	6	4260158	4260163	50 %	50 %	0 %	0 %	294142525
75561	NC_014012	GCT	2	6	4260295	4260300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142525
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75565	NC_014012	TAG	2	6	4260529	4260534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142525
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75568	NC_014012	CAG	2	6	4260628	4260633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142525
75569	NC_014012	CAG	2	6	4260638	4260643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142525
75570	NC_014012	TCT	2	6	4260799	4260804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75571	NC_014012	TA	3	6	4260884	4260889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75572	NC_014012	AGCT	2	8	4260946	4260953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75573	NC_014012	ATG	2	6	4261071	4261076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142526
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75583	NC_014012	GCG	2	6	4261540	4261545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142526
75584	NC_014012	GAT	2	6	4261560	4261565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142526
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75588	NC_014012	TGC	2	6	4261708	4261713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142526
75589	NC_014012	ACC	2	6	4261762	4261767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142526
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75594	NC_014012	TCAGG	2	10	4261964	4261973	20 %	20 %	40 %	20 %	294142526
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75599	NC_014012	AATCT	2	10	4262323	4262332	40 %	40 %	0 %	20 %	294142526
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75602	NC_014012	CATTCG	2	12	4262624	4262635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294142526
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75612	NC_014012	AGA	2	6	4263568	4263573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75613	NC_014012	TCA	3	9	4263721	4263729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142528
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75717	NC_014012	AC	3	6	4269220	4269225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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75739	NC_014012	GAC	2	6	4270057	4270062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142534
75740	NC_014012	CT	3	6	4270298	4270303	0 %	50 %	0 %	50 %	294142534
75741	NC_014012	GTG	2	6	4270319	4270324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294142534
75742	NC_014012	TAT	2	6	4270393	4270398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142534
75743	NC_014012	TGA	3	9	4270446	4270454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142534
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75745	NC_014012	TGG	2	6	4270657	4270662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294142534
75746	NC_014012	T	6	6	4270673	4270678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75747	NC_014012	AGA	2	6	4270758	4270763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75748	NC_014012	C	11	11	4270861	4270871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75749	NC_014012	A	14	14	4270872	4270885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75750	NC_014012	CTA	2	6	4270948	4270953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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75752	NC_014012	ATA	2	6	4271085	4271090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75753	NC_014012	AGC	2	6	4271176	4271181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142535
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75757	NC_014012	TGA	2	6	4271571	4271576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142535
75758	NC_014012	TAA	2	6	4271593	4271598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142535
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75761	NC_014012	GGTT	2	8	4271670	4271677	0 %	50 %	50 %	0 %	294142535
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75775	NC_014012	ATT	2	6	4272497	4272502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142535
75776	NC_014012	CAG	2	6	4272569	4272574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142535
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75796	NC_014012	TTAG	2	8	4273519	4273526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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75811	NC_014012	AAAC	2	8	4274490	4274497	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75812	NC_014012	A	6	6	4274498	4274503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75813	NC_014012	CAA	2	6	4274613	4274618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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75818	NC_014012	A	7	7	4274839	4274845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75845	NC_014012	ATC	2	6	4276256	4276261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75846	NC_014012	ATCA	2	8	4276271	4276278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75847	NC_014012	TCA	2	6	4276287	4276292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75848	NC_014012	C	6	6	4276338	4276343	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75849	NC_014012	AAATAC	2	12	4276383	4276394	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75850	NC_014012	TAA	2	6	4276488	4276493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142539
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75853	NC_014012	TCC	2	6	4276582	4276587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294142539
75854	NC_014012	ACA	2	6	4276604	4276609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142539
75855	NC_014012	TCA	2	6	4276622	4276627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142539
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75976	NC_014012	CCG	2	6	4283359	4283364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142544
75977	NC_014012	CCTCGG	2	12	4283371	4283382	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	294142544
75978	NC_014012	GCAATA	2	12	4283463	4283474	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294142544
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75980	NC_014012	GCTT	2	8	4283564	4283571	0 %	50 %	25 %	25 %	294142545
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75982	NC_014012	CATCTT	2	12	4283722	4283733	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294142545
75983	NC_014012	AATA	2	8	4283735	4283742	75 %	25 %	0 %	0 %	294142545
75984	NC_014012	TAAA	2	8	4283816	4283823	75 %	25 %	0 %	0 %	294142545
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75988	NC_014012	TGC	2	6	4284099	4284104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142545
75989	NC_014012	ATCG	2	8	4284113	4284120	25 %	25 %	25 %	25 %	294142545
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75991	NC_014012	GC	3	6	4284210	4284215	0 %	0 %	50 %	50 %	294142545
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75999	NC_014012	CTC	2	6	4284569	4284574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294142545
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