MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75002	NC_014012	CGG	2	6	4227802	4227807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142499
75003	NC_014012	CGG	2	6	4227818	4227823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142499
75004	NC_014012	GCCA	2	8	4227846	4227853	25 %	0 %	25 %	50 %	294142499
75005	NC_014012	ATGT	2	8	4227879	4227886	25 %	50 %	25 %	0 %	294142499
75006	NC_014012	AG	3	6	4227916	4227921	50 %	0 %	50 %	0 %	294142499
75007	NC_014012	TCG	3	9	4227979	4227987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142499
75008	NC_014012	ACG	2	6	4227991	4227996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142499
75009	NC_014012	GGC	2	6	4228056	4228061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142499
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75011	NC_014012	CAA	2	6	4228214	4228219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142499
75012	NC_014012	ACT	2	6	4228334	4228339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142499
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75018	NC_014012	AGGT	2	8	4228798	4228805	25 %	25 %	50 %	0 %	294142499
75019	NC_014012	CT	3	6	4228806	4228811	0 %	50 %	0 %	50 %	294142499
75020	NC_014012	TA	3	6	4228812	4228817	50 %	50 %	0 %	0 %	294142499
75021	NC_014012	CGA	2	6	4228922	4228927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142499
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75029	NC_014012	AGCT	2	8	4229197	4229204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75030	NC_014012	AGCT	2	8	4229212	4229219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75031	NC_014012	GGAT	2	8	4229387	4229394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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75033	NC_014012	CTG	2	6	4229467	4229472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142500
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75054	NC_014012	TAC	2	6	4230513	4230518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75055	NC_014012	ATT	2	6	4230556	4230561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75056	NC_014012	AT	3	6	4230564	4230569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75057	NC_014012	GAC	2	6	4230795	4230800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142501
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75092	NC_014012	T	7	7	4232650	4232656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75099	NC_014012	AAGAC	2	10	4233030	4233039	60 %	0 %	20 %	20 %	294142502
75100	NC_014012	A	7	7	4233066	4233072	100 %	0 %	0 %	0 %	294142502
75101	NC_014012	TCA	2	6	4233136	4233141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75102	NC_014012	GAT	2	6	4233244	4233249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75103	NC_014012	CT	3	6	4233278	4233283	0 %	50 %	0 %	50 %	294142503
75104	NC_014012	TCGCTA	2	12	4233309	4233320	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294142503
75105	NC_014012	CGAG	2	8	4233559	4233566	25 %	0 %	50 %	25 %	294142503
75106	NC_014012	C	7	7	4233601	4233607	0 %	0 %	0 %	100 %	294142503
75107	NC_014012	AAT	2	6	4233702	4233707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142503
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75110	NC_014012	ATC	2	6	4234054	4234059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142503
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75112	NC_014012	TCC	2	6	4234243	4234248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294142503
75113	NC_014012	ATGA	2	8	4234249	4234256	50 %	25 %	25 %	0 %	294142503
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75117	NC_014012	AAT	2	6	4234375	4234380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142503
75118	NC_014012	CTTA	2	8	4234405	4234412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75119	NC_014012	TACT	2	8	4234441	4234448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75120	NC_014012	CCATC	2	10	4234458	4234467	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75121	NC_014012	ATT	2	6	4234562	4234567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75122	NC_014012	AAAATA	2	12	4234616	4234627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75123	NC_014012	GCT	2	6	4234657	4234662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142504
75124	NC_014012	AAT	2	6	4234680	4234685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142504
75125	NC_014012	TGA	2	6	4234745	4234750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142504
75126	NC_014012	AT	3	6	4234751	4234756	50 %	50 %	0 %	0 %	294142504
75127	NC_014012	TAA	2	6	4234793	4234798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142504
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75130	NC_014012	ATG	2	6	4234891	4234896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142504
75131	NC_014012	GA	3	6	4234920	4234925	50 %	0 %	50 %	0 %	294142504
75132	NC_014012	GTT	2	6	4234952	4234957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294142504
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75134	NC_014012	TCC	2	6	4235054	4235059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75135	NC_014012	ATC	2	6	4235120	4235125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142505
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75139	NC_014012	ACA	2	6	4235436	4235441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142505
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75147	NC_014012	TCTA	2	8	4235806	4235813	25 %	50 %	0 %	25 %	294142505
75148	NC_014012	A	6	6	4235842	4235847	100 %	0 %	0 %	0 %	294142505
75149	NC_014012	GAAAC	2	10	4235881	4235890	60 %	0 %	20 %	20 %	294142505
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75152	NC_014012	TA	3	6	4236075	4236080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75153	NC_014012	TTG	2	6	4236106	4236111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75154	NC_014012	AATT	2	8	4236113	4236120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75155	NC_014012	TAGC	2	8	4236153	4236160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75156	NC_014012	CAA	2	6	4236219	4236224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142506
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75169	NC_014012	CAGGA	2	10	4237120	4237129	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75170	NC_014012	TTTA	2	8	4237139	4237146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75171	NC_014012	CAAA	2	8	4237163	4237170	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75172	NC_014012	ATGAA	2	10	4237173	4237182	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75173	NC_014012	ATA	2	6	4237204	4237209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75174	NC_014012	TAAA	2	8	4237245	4237252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75175	NC_014012	CACAG	2	10	4237422	4237431	40 %	0 %	20 %	40 %	294142507
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75177	NC_014012	AT	3	6	4237596	4237601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75178	NC_014012	CAG	2	6	4237645	4237650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142508
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75188	NC_014012	T	7	7	4238316	4238322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75189	NC_014012	CTAT	2	8	4238377	4238384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75190	NC_014012	TCAGC	2	10	4238549	4238558	20 %	20 %	20 %	40 %	294142509
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75230	NC_014012	GAT	2	6	4240792	4240797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142510
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75234	NC_014012	CTT	2	6	4240877	4240882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142510
75235	NC_014012	CAA	2	6	4240889	4240894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142510
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75237	NC_014012	CGA	2	6	4241031	4241036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142510
75238	NC_014012	TGAG	2	8	4241046	4241053	25 %	25 %	50 %	0 %	294142510
75239	NC_014012	CTTG	2	8	4241254	4241261	0 %	50 %	25 %	25 %	294142510
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75242	NC_014012	GAAC	2	8	4241484	4241491	50 %	0 %	25 %	25 %	294142510
75243	NC_014012	TAA	2	6	4241773	4241778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142510
75244	NC_014012	GCG	2	6	4241901	4241906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142510
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75248	NC_014012	AG	3	6	4242074	4242079	50 %	0 %	50 %	0 %	294142510
75249	NC_014012	TA	3	6	4242169	4242174	50 %	50 %	0 %	0 %	294142510
75250	NC_014012	TCG	2	6	4242216	4242221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142510
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75253	NC_014012	ATC	2	6	4242395	4242400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142511
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75277	NC_014012	ATAA	2	8	4243661	4243668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75332	NC_014012	C	6	6	4246683	4246688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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75335	NC_014012	AGTA	2	8	4246782	4246789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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75356	NC_014012	TA	3	6	4247793	4247798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75357	NC_014012	CAA	2	6	4247800	4247805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75358	NC_014012	TTGA	2	8	4247833	4247840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75359	NC_014012	TAA	2	6	4247872	4247877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75395	NC_014012	AATC	2	8	4249710	4249717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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75469	NC_014012	TCCC	2	8	4254406	4254413	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75470	NC_014012	T	6	6	4254452	4254457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75471	NC_014012	AAT	2	6	4254625	4254630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142521
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75474	NC_014012	TG	3	6	4254814	4254819	0 %	50 %	50 %	0 %	294142521
75475	NC_014012	TCC	2	6	4254961	4254966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294142521
75476	NC_014012	CAG	2	6	4255014	4255019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142521
75477	NC_014012	CAT	2	6	4255034	4255039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142521
75478	NC_014012	CA	3	6	4255049	4255054	50 %	0 %	0 %	50 %	294142521
75479	NC_014012	CA	3	6	4255086	4255091	50 %	0 %	0 %	50 %	294142521
75480	NC_014012	GTC	2	6	4255104	4255109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142521
75481	NC_014012	GAT	2	6	4255113	4255118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142521
75482	NC_014012	TGTC	2	8	4255133	4255140	0 %	50 %	25 %	25 %	294142521
75483	NC_014012	CAA	2	6	4255151	4255156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75484	NC_014012	TCCC	2	8	4255285	4255292	0 %	25 %	0 %	75 %	294142522
75485	NC_014012	CGTAAA	2	12	4255422	4255433	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294142522
75486	NC_014012	ACC	2	6	4255439	4255444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142522
75487	NC_014012	CCT	2	6	4255519	4255524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294142522
75488	NC_014012	AG	4	8	4255551	4255558	50 %	0 %	50 %	0 %	294142522
75489	NC_014012	GTA	2	6	4255567	4255572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142522
75490	NC_014012	CTC	2	6	4255597	4255602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294142522
75491	NC_014012	CTG	2	6	4255658	4255663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142522
75492	NC_014012	GT	4	8	4255750	4255757	0 %	50 %	50 %	0 %	294142522
75493	NC_014012	GCC	2	6	4255773	4255778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142522
75494	NC_014012	ATC	2	6	4255802	4255807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142522
75495	NC_014012	CCA	2	6	4255831	4255836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142522
75496	NC_014012	TAGAC	2	10	4255844	4255853	40 %	20 %	20 %	20 %	294142522
75497	NC_014012	AAC	2	6	4255905	4255910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142522
75498	NC_014012	CCATG	2	10	4256059	4256068	20 %	20 %	20 %	40 %	294142522
75499	NC_014012	CAC	2	6	4256218	4256223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142522
75500	NC_014012	AGC	2	6	4256262	4256267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142522

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