MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74501	NC_014012	TTGT	2	8	4199798	4199805	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74502	NC_014012	ATA	2	6	4199807	4199812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74503	NC_014012	AAC	2	6	4200031	4200036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142479
74504	NC_014012	GCT	2	6	4200176	4200181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142479
74505	NC_014012	TC	3	6	4200309	4200314	0 %	50 %	0 %	50 %	294142479
74506	NC_014012	TCA	2	6	4200340	4200345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142479
74507	NC_014012	TTA	2	6	4200585	4200590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142479
74508	NC_014012	TCT	2	6	4200606	4200611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142479
74509	NC_014012	CTT	2	6	4200659	4200664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142479
74510	NC_014012	GCCT	2	8	4200685	4200692	0 %	25 %	25 %	50 %	294142479
74511	NC_014012	TTAGTG	2	12	4200723	4200734	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294142479
74512	NC_014012	CTG	2	6	4200765	4200770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142479
74513	NC_014012	CTCA	2	8	4200797	4200804	25 %	25 %	0 %	50 %	294142479
74514	NC_014012	TCG	2	6	4200847	4200852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142479
74515	NC_014012	CCA	2	6	4200862	4200867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142479
74516	NC_014012	CCA	2	6	4200882	4200887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142479
74517	NC_014012	ATGG	2	8	4200890	4200897	25 %	25 %	50 %	0 %	294142479
74518	NC_014012	GCC	2	6	4200936	4200941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142479
74519	NC_014012	GCC	2	6	4200951	4200956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142479
74520	NC_014012	ATG	2	6	4201096	4201101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142479
74521	NC_014012	AAG	2	6	4201170	4201175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142479
74522	NC_014012	AGC	2	6	4201303	4201308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142479
74523	NC_014012	GCC	2	6	4201416	4201421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142479
74524	NC_014012	CGC	2	6	4201487	4201492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142479
74525	NC_014012	CAA	2	6	4201524	4201529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74526	NC_014012	CAG	2	6	4201553	4201558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74527	NC_014012	CCA	2	6	4201732	4201737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142480
74528	NC_014012	GCT	2	6	4201761	4201766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142480
74529	NC_014012	TAGGTA	2	12	4201825	4201836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142480
74530	NC_014012	ATCGA	2	10	4201844	4201853	40 %	20 %	20 %	20 %	294142480
74531	NC_014012	CAG	2	6	4201996	4202001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142480
74532	NC_014012	TCG	2	6	4202086	4202091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142480
74533	NC_014012	CCA	2	6	4202105	4202110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142480
74534	NC_014012	GCA	2	6	4202120	4202125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142480
74535	NC_014012	AG	3	6	4202126	4202131	50 %	0 %	50 %	0 %	294142480
74536	NC_014012	CTA	2	6	4202177	4202182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142480
74537	NC_014012	CAC	2	6	4202187	4202192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142480
74538	NC_014012	GTG	2	6	4202298	4202303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294142480
74539	NC_014012	GCA	2	6	4202317	4202322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142480
74540	NC_014012	CAA	2	6	4202367	4202372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142480
74541	NC_014012	ATC	2	6	4202385	4202390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142480
74542	NC_014012	ATG	2	6	4202440	4202445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142480
74543	NC_014012	AGC	2	6	4202466	4202471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142480
74544	NC_014012	GAT	2	6	4202493	4202498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142480
74545	NC_014012	A	6	6	4202530	4202535	100 %	0 %	0 %	0 %	294142480
74546	NC_014012	CAT	2	6	4202577	4202582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142480
74547	NC_014012	AGC	2	6	4202651	4202656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142480
74548	NC_014012	ATAACA	2	12	4202698	4202709	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74549	NC_014012	AC	3	6	4202734	4202739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74550	NC_014012	CAG	2	6	4202746	4202751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74551	NC_014012	A	7	7	4202772	4202778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74552	NC_014012	C	6	6	4202893	4202898	0 %	0 %	0 %	100 %	294142481
74553	NC_014012	T	6	6	4202907	4202912	0 %	100 %	0 %	0 %	294142481
74554	NC_014012	GCCAT	2	10	4203109	4203118	20 %	20 %	20 %	40 %	294142481
74555	NC_014012	TCT	2	6	4203238	4203243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142481
74556	NC_014012	GCG	2	6	4203255	4203260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142481
74557	NC_014012	CTTC	2	8	4203265	4203272	0 %	50 %	0 %	50 %	294142481
74558	NC_014012	ATT	2	6	4203346	4203351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142481
74559	NC_014012	ATC	2	6	4203384	4203389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142481
74560	NC_014012	TGC	2	6	4203427	4203432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142481
74561	NC_014012	AG	4	8	4203446	4203453	50 %	0 %	50 %	0 %	294142481
74562	NC_014012	AG	3	6	4203481	4203486	50 %	0 %	50 %	0 %	294142481
74563	NC_014012	CTCAAG	2	12	4203552	4203563	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294142481
74564	NC_014012	CAT	2	6	4203567	4203572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142481
74565	NC_014012	AGT	2	6	4203783	4203788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142481
74566	NC_014012	AGA	2	6	4203790	4203795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142481
74567	NC_014012	GGC	2	6	4203822	4203827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142481
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74569	NC_014012	TGA	2	6	4203940	4203945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142481
74570	NC_014012	AGCAA	2	10	4203946	4203955	60 %	0 %	20 %	20 %	294142481
74571	NC_014012	TAT	2	6	4204031	4204036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142481
74572	NC_014012	CGA	2	6	4204037	4204042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142481
74573	NC_014012	CGA	2	6	4204073	4204078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142481
74574	NC_014012	GCTG	2	8	4204105	4204112	0 %	25 %	50 %	25 %	294142481
74575	NC_014012	CCA	2	6	4204118	4204123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142481
74576	NC_014012	ATC	3	9	4204170	4204178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142481
74577	NC_014012	GTC	2	6	4204255	4204260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142481
74578	NC_014012	GGCA	2	8	4204277	4204284	25 %	0 %	50 %	25 %	294142481
74579	NC_014012	CA	3	6	4204283	4204288	50 %	0 %	0 %	50 %	294142481
74580	NC_014012	CCATG	2	10	4204391	4204400	20 %	20 %	20 %	40 %	294142481
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74582	NC_014012	AAG	2	6	4204638	4204643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142481
74583	NC_014012	CAA	2	6	4204761	4204766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142481
74584	NC_014012	AGCA	2	8	4204855	4204862	50 %	0 %	25 %	25 %	294142481
74585	NC_014012	TAA	2	6	4204871	4204876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142481
74586	NC_014012	ATC	2	6	4204888	4204893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142481
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74588	NC_014012	CAG	2	6	4204974	4204979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142481
74589	NC_014012	CAC	2	6	4205105	4205110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142481
74590	NC_014012	C	6	6	4205134	4205139	0 %	0 %	0 %	100 %	294142481
74591	NC_014012	GCCT	2	8	4205188	4205195	0 %	25 %	25 %	50 %	294142481
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74596	NC_014012	CCGA	2	8	4205479	4205486	25 %	0 %	25 %	50 %	294142481
74597	NC_014012	TTGG	2	8	4205503	4205510	0 %	50 %	50 %	0 %	294142481
74598	NC_014012	CGC	2	6	4205630	4205635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142481
74599	NC_014012	TC	3	6	4205665	4205670	0 %	50 %	0 %	50 %	294142481
74600	NC_014012	GCCCA	2	10	4205859	4205868	20 %	0 %	20 %	60 %	294142481
74601	NC_014012	CAG	2	6	4205916	4205921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142481
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74604	NC_014012	CCG	2	6	4205992	4205997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74605	NC_014012	ACCT	2	8	4206119	4206126	25 %	25 %	0 %	50 %	294142482
74606	NC_014012	AAACG	2	10	4206143	4206152	60 %	0 %	20 %	20 %	294142482
74607	NC_014012	GGT	2	6	4206199	4206204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294142482
74608	NC_014012	TGA	3	9	4206219	4206227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142482
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74612	NC_014012	CAC	2	6	4206364	4206369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142482
74613	NC_014012	GAC	2	6	4206370	4206375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142482
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74616	NC_014012	CAT	2	6	4206538	4206543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142482
74617	NC_014012	CGG	2	6	4206577	4206582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142482
74618	NC_014012	ATT	2	6	4206641	4206646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142482
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74621	NC_014012	TTG	2	6	4206752	4206757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294142482
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74623	NC_014012	AG	3	6	4206813	4206818	50 %	0 %	50 %	0 %	294142482
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74722	NC_014012	A	6	6	4212422	4212427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74723	NC_014012	TATAT	2	10	4212445	4212454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74724	NC_014012	ACACCA	2	12	4212483	4212494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74725	NC_014012	CATG	2	8	4212521	4212528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74726	NC_014012	CTT	2	6	4212535	4212540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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74729	NC_014012	GTC	2	6	4212642	4212647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142488
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74731	NC_014012	AAGT	2	8	4212691	4212698	50 %	25 %	25 %	0 %	294142488
74732	NC_014012	GCA	2	6	4212798	4212803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142488
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74851	NC_014012	GCA	2	6	4219766	4219771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142492
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74880	NC_014012	TTG	2	6	4221478	4221483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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74883	NC_014012	CGCAG	2	10	4221820	4221829	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74884	NC_014012	CGCAG	2	10	4221898	4221907	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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74967	NC_014012	ATAA	2	8	4226049	4226056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74969	NC_014012	GCA	2	6	4226141	4226146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74970	NC_014012	TTG	2	6	4226211	4226216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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74972	NC_014012	AGC	2	6	4226279	4226284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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74975	NC_014012	AG	3	6	4226336	4226341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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