MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_014012	CAT	2	6	390465	390470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139091
7003	NC_014012	GTT	2	6	390490	390495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139091
7004	NC_014012	CAG	2	6	390557	390562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139091
7005	NC_014012	T	6	6	390732	390737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_014012	GCCT	2	8	390821	390828	0 %	25 %	25 %	50 %	294139092
7007	NC_014012	TCA	2	6	390851	390856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139092
7008	NC_014012	TGG	2	6	390905	390910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139092
7009	NC_014012	TCA	2	6	390921	390926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139092
7010	NC_014012	TCT	2	6	390965	390970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139092
7011	NC_014012	TGG	2	6	391002	391007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139092
7012	NC_014012	TAA	2	6	391032	391037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139092
7013	NC_014012	TGC	2	6	391082	391087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139092
7014	NC_014012	TCAA	2	8	391183	391190	50 %	25 %	0 %	25 %	294139092
7015	NC_014012	TGC	2	6	391193	391198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139092
7016	NC_014012	GTGA	2	8	391201	391208	25 %	25 %	50 %	0 %	294139092
7017	NC_014012	AGGC	2	8	391211	391218	25 %	0 %	50 %	25 %	294139092
7018	NC_014012	GCT	2	6	391237	391242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139092
7019	NC_014012	GAT	2	6	391243	391248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139092
7020	NC_014012	AGC	2	6	391259	391264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139092
7021	NC_014012	TTCT	2	8	391327	391334	0 %	75 %	0 %	25 %	294139092
7022	NC_014012	CTG	2	6	391345	391350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139092
7023	NC_014012	GCCATC	2	12	391372	391383	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294139092
7024	NC_014012	GCA	2	6	391493	391498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139092
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7026	NC_014012	TGC	2	6	391533	391538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139092
7027	NC_014012	TGG	2	6	391556	391561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139092
7028	NC_014012	GGA	2	6	391612	391617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139092
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7031	NC_014012	CACT	2	8	391733	391740	25 %	25 %	0 %	50 %	294139092
7032	NC_014012	TTA	2	6	391798	391803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139092
7033	NC_014012	T	6	6	391857	391862	0 %	100 %	0 %	0 %	294139092
7034	NC_014012	GAC	2	6	391882	391887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139092
7035	NC_014012	TAC	2	6	391912	391917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139092
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7037	NC_014012	TCA	2	6	392005	392010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139092
7038	NC_014012	TTTA	2	8	392090	392097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_014012	TGGG	2	8	392107	392114	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_014012	TTG	2	6	392126	392131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_014012	A	6	6	392395	392400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_014012	AAT	2	6	392407	392412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_014012	GGAA	2	8	392438	392445	50 %	0 %	50 %	0 %	294139093
7044	NC_014012	TC	3	6	392525	392530	0 %	50 %	0 %	50 %	294139093
7045	NC_014012	CTGGT	2	10	392585	392594	0 %	40 %	40 %	20 %	294139093
7046	NC_014012	AGATAA	2	12	392603	392614	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294139093
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7049	NC_014012	TGG	2	6	392758	392763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139093
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7062	NC_014012	GT	3	6	393569	393574	0 %	50 %	50 %	0 %	294139093
7063	NC_014012	AGTT	2	8	393647	393654	25 %	50 %	25 %	0 %	294139093
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7074	NC_014012	AC	3	6	394152	394157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7089	NC_014012	TA	3	6	395230	395235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7091	NC_014012	ATT	2	6	395269	395274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7093	NC_014012	ATGA	2	8	395326	395333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_014012	ATT	2	6	395345	395350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_014012	A	7	7	395397	395403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7103	NC_014012	T	6	6	395930	395935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7121	NC_014012	TTA	2	6	396776	396781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_014012	TG	3	6	396810	396815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_014012	AGGT	2	8	396866	396873	25 %	25 %	50 %	0 %	294139099
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7252	NC_014012	GAT	2	6	405212	405217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139109
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7373	NC_014012	AGAA	2	8	411806	411813	75 %	0 %	25 %	0 %	294139116
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7375	NC_014012	GTCT	2	8	411870	411877	0 %	50 %	25 %	25 %	294139116
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