MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
73001	NC_014012	CAA	2	6	4112086	4112091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142402
73002	NC_014012	ACT	2	6	4112183	4112188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142402
73003	NC_014012	CAA	2	6	4112198	4112203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142402
73004	NC_014012	TTG	2	6	4112220	4112225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294142402
73005	NC_014012	GT	3	6	4112227	4112232	0 %	50 %	50 %	0 %	294142402
73006	NC_014012	CAA	2	6	4112254	4112259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142402
73007	NC_014012	CTTCA	2	10	4112306	4112315	20 %	40 %	0 %	40 %	294142402
73008	NC_014012	ACG	2	6	4112384	4112389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142402
73009	NC_014012	CAA	2	6	4112423	4112428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142402
73010	NC_014012	CCA	2	6	4112431	4112436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142402
73011	NC_014012	TCT	2	6	4112473	4112478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142402
73012	NC_014012	GATC	2	8	4112500	4112507	25 %	25 %	25 %	25 %	294142402
73013	NC_014012	ATC	2	6	4112520	4112525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142402
73014	NC_014012	GT	3	6	4112535	4112540	0 %	50 %	50 %	0 %	294142402
73015	NC_014012	CT	3	6	4112548	4112553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73016	NC_014012	ACTTT	2	10	4112556	4112565	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73017	NC_014012	TTAT	2	8	4112586	4112593	25 %	75 %	0 %	0 %	294142403
73018	NC_014012	GCC	2	6	4112731	4112736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142403
73019	NC_014012	ACA	2	6	4112768	4112773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142403
73020	NC_014012	CGG	2	6	4112852	4112857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142403
73021	NC_014012	GCG	2	6	4113011	4113016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142403
73022	NC_014012	AAC	2	6	4113040	4113045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142403
73023	NC_014012	CACGA	2	10	4113111	4113120	40 %	0 %	20 %	40 %	294142403
73024	NC_014012	ATC	2	6	4113133	4113138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142403
73025	NC_014012	CGG	2	6	4113155	4113160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142403
73026	NC_014012	T	6	6	4113238	4113243	0 %	100 %	0 %	0 %	294142403
73027	NC_014012	AC	3	6	4113329	4113334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73028	NC_014012	CTT	2	6	4113409	4113414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142404
73029	NC_014012	CCG	2	6	4113422	4113427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142404
73030	NC_014012	GCC	2	6	4113430	4113435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142404
73031	NC_014012	GCC	2	6	4113485	4113490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142404
73032	NC_014012	AAT	2	6	4113670	4113675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142404
73033	NC_014012	TGA	2	6	4113740	4113745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142404
73034	NC_014012	TCA	2	6	4113752	4113757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142404
73035	NC_014012	GGC	2	6	4113806	4113811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142404
73036	NC_014012	AGC	2	6	4113835	4113840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142404
73037	NC_014012	GCT	2	6	4113866	4113871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142404
73038	NC_014012	GCG	2	6	4113977	4113982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142404
73039	NC_014012	TGT	2	6	4114008	4114013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294142404
73040	NC_014012	CAG	2	6	4114017	4114022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142404
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73042	NC_014012	GCTC	2	8	4114077	4114084	0 %	25 %	25 %	50 %	294142404
73043	NC_014012	TGC	2	6	4114106	4114111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142404
73044	NC_014012	GAT	2	6	4114135	4114140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142404
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73052	NC_014012	AAG	2	6	4114385	4114390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142404
73053	NC_014012	TCT	2	6	4114409	4114414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142404
73054	NC_014012	CAC	2	6	4114591	4114596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142404
73055	NC_014012	CAT	2	6	4114608	4114613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142404
73056	NC_014012	CTC	2	6	4114669	4114674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294142404
73057	NC_014012	C	7	7	4114756	4114762	0 %	0 %	0 %	100 %	294142404
73058	NC_014012	CATG	2	8	4114794	4114801	25 %	25 %	25 %	25 %	294142404
73059	NC_014012	TGA	2	6	4114812	4114817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73060	NC_014012	AAT	2	6	4114820	4114825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73061	NC_014012	TTA	2	6	4114929	4114934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73062	NC_014012	TCAT	2	8	4115017	4115024	25 %	50 %	0 %	25 %	294142405
73063	NC_014012	TCT	2	6	4115039	4115044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142405
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73067	NC_014012	AAT	2	6	4115224	4115229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142405
73068	NC_014012	CTT	2	6	4115329	4115334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73069	NC_014012	C	6	6	4115343	4115348	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73070	NC_014012	TGA	2	6	4115350	4115355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73071	NC_014012	ATT	2	6	4115428	4115433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142406
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73073	NC_014012	GATTAA	2	12	4115518	4115529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294142406
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73077	NC_014012	A	6	6	4115614	4115619	100 %	0 %	0 %	0 %	294142406
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73081	NC_014012	T	6	6	4115797	4115802	0 %	100 %	0 %	0 %	294142406
73082	NC_014012	TGC	2	6	4115805	4115810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142406
73083	NC_014012	TAG	2	6	4115823	4115828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142406
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73086	NC_014012	TCT	2	6	4116097	4116102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142406
73087	NC_014012	ATAC	2	8	4116109	4116116	50 %	25 %	0 %	25 %	294142406
73088	NC_014012	ATAGT	2	10	4116180	4116189	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73089	NC_014012	CAAA	2	8	4116205	4116212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73090	NC_014012	CCA	2	6	4116214	4116219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73091	NC_014012	AGGC	2	8	4116252	4116259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73092	NC_014012	ATG	2	6	4116265	4116270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73093	NC_014012	A	6	6	4116302	4116307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73094	NC_014012	AGC	2	6	4116460	4116465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142407
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73096	NC_014012	GCTGA	2	10	4116496	4116505	20 %	20 %	40 %	20 %	294142407
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73101	NC_014012	GA	3	6	4116675	4116680	50 %	0 %	50 %	0 %	294142407
73102	NC_014012	CCG	2	6	4116740	4116745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142407
73103	NC_014012	GTC	2	6	4116778	4116783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142407
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73105	NC_014012	ATG	2	6	4117052	4117057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142407
73106	NC_014012	TTAT	2	8	4117109	4117116	25 %	75 %	0 %	0 %	294142407
73107	NC_014012	ACT	2	6	4117243	4117248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73108	NC_014012	ATG	2	6	4117284	4117289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142408
73109	NC_014012	AGCA	2	8	4117336	4117343	50 %	0 %	25 %	25 %	294142408
73110	NC_014012	AT	3	6	4117358	4117363	50 %	50 %	0 %	0 %	294142408
73111	NC_014012	AGA	2	6	4117487	4117492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142408
73112	NC_014012	TACT	2	8	4117505	4117512	25 %	50 %	0 %	25 %	294142408
73113	NC_014012	AGCA	2	8	4117725	4117732	50 %	0 %	25 %	25 %	294142408
73114	NC_014012	TC	3	6	4117781	4117786	0 %	50 %	0 %	50 %	294142408
73115	NC_014012	ACGA	2	8	4117792	4117799	50 %	0 %	25 %	25 %	294142408
73116	NC_014012	ATG	2	6	4117816	4117821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142408
73117	NC_014012	CAT	2	6	4117952	4117957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142408
73118	NC_014012	ATCGCT	2	12	4118005	4118016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294142408
73119	NC_014012	TCA	2	6	4118056	4118061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142408
73120	NC_014012	CCG	2	6	4118143	4118148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142408
73121	NC_014012	ATC	2	6	4118389	4118394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142409
73122	NC_014012	CTC	2	6	4118446	4118451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294142409
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73127	NC_014012	GATAG	2	10	4118884	4118893	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73128	NC_014012	TTCAA	2	10	4118945	4118954	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73129	NC_014012	TGC	2	6	4119054	4119059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73130	NC_014012	TAG	2	6	4119149	4119154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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73138	NC_014012	TCTT	2	8	4119539	4119546	0 %	75 %	0 %	25 %	294142410
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73142	NC_014012	AGA	2	6	4119751	4119756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73143	NC_014012	CCA	2	6	4119762	4119767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73144	NC_014012	ATT	2	6	4119860	4119865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73147	NC_014012	GCG	2	6	4120019	4120024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142411
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73171	NC_014012	TAA	3	9	4121369	4121377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73188	NC_014012	CTT	2	6	4122285	4122290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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73220	NC_014012	TTG	2	6	4123972	4123977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294142413
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73222	NC_014012	AAC	2	6	4124085	4124090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73223	NC_014012	TCT	2	6	4124183	4124188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142414
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73225	NC_014012	CTG	2	6	4124225	4124230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142414
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73228	NC_014012	GAA	2	6	4124551	4124556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142414
73229	NC_014012	CAG	2	6	4124669	4124674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142414
73230	NC_014012	AT	3	6	4124699	4124704	50 %	50 %	0 %	0 %	294142414
73231	NC_014012	GAT	2	6	4124759	4124764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142414
73232	NC_014012	ATAGAT	2	12	4124813	4124824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294142414
73233	NC_014012	GCT	2	6	4124910	4124915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142414
73234	NC_014012	CAAG	2	8	4124962	4124969	50 %	0 %	25 %	25 %	294142414
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73479	NC_014012	AAT	2	6	4138632	4138637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142427
73480	NC_014012	CCAT	2	8	4138666	4138673	25 %	25 %	0 %	50 %	294142427
73481	NC_014012	TCG	2	6	4138685	4138690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142427
73482	NC_014012	ATAC	2	8	4138693	4138700	50 %	25 %	0 %	25 %	294142427
73483	NC_014012	TGAAG	2	10	4138713	4138722	40 %	20 %	40 %	0 %	294142427
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73491	NC_014012	AAT	2	6	4138924	4138929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142427
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73497	NC_014012	AT	3	6	4139329	4139334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73498	NC_014012	GA	3	6	4139381	4139386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73499	NC_014012	GTT	2	6	4139477	4139482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73500	NC_014012	TGC	2	6	4139548	4139553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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