MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
71001	NC_014012	GCG	2	6	3996498	3996503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142305
71002	NC_014012	CGG	2	6	3996666	3996671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142305
71003	NC_014012	CCA	2	6	3996672	3996677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142305
71004	NC_014012	CAT	2	6	3996702	3996707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142305
71005	NC_014012	CAG	2	6	3996715	3996720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142305
71006	NC_014012	CT	3	6	3996782	3996787	0 %	50 %	0 %	50 %	294142305
71007	NC_014012	GACC	2	8	3996810	3996817	25 %	0 %	25 %	50 %	294142305
71008	NC_014012	ATGT	2	8	3996907	3996914	25 %	50 %	25 %	0 %	294142305
71009	NC_014012	GC	3	6	3997003	3997008	0 %	0 %	50 %	50 %	294142305
71010	NC_014012	T	6	6	3997090	3997095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71011	NC_014012	CGC	2	6	3997128	3997133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71012	NC_014012	CAA	2	6	3997134	3997139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71013	NC_014012	TTG	2	6	3997188	3997193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71014	NC_014012	TCT	2	6	3997205	3997210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71015	NC_014012	TCT	2	6	3997228	3997233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71016	NC_014012	AAT	2	6	3997279	3997284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71017	NC_014012	CTT	2	6	3997316	3997321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294142306
71018	NC_014012	AGCAG	2	10	3997361	3997370	40 %	0 %	40 %	20 %	294142306
71019	NC_014012	TGA	2	6	3997472	3997477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142306
71020	NC_014012	CTCTTC	2	12	3997587	3997598	0 %	50 %	0 %	50 %	294142306
71021	NC_014012	CAT	2	6	3997703	3997708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142306
71022	NC_014012	ACC	2	6	3997758	3997763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142306
71023	NC_014012	AAT	2	6	3997767	3997772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142306
71024	NC_014012	CCA	2	6	3997775	3997780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142306
71025	NC_014012	GCT	2	6	3997831	3997836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142306
71026	NC_014012	AGG	2	6	3997860	3997865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294142306
71027	NC_014012	GTAA	2	8	3998009	3998016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71028	NC_014012	AGCTC	2	10	3998071	3998080	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71029	NC_014012	TC	3	6	3998082	3998087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71030	NC_014012	TTG	2	6	3998097	3998102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71031	NC_014012	CGAAG	2	10	3998133	3998142	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71032	NC_014012	GTTT	2	8	3998288	3998295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71033	NC_014012	GTCT	2	8	3998367	3998374	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71034	NC_014012	ACA	2	6	3998381	3998386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71035	NC_014012	AG	4	8	3998556	3998563	50 %	0 %	50 %	0 %	294142307
71036	NC_014012	GCA	2	6	3998568	3998573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142307
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71038	NC_014012	GAA	2	6	3998686	3998691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142307
71039	NC_014012	A	7	7	3998696	3998702	100 %	0 %	0 %	0 %	294142307
71040	NC_014012	TAA	2	6	3998712	3998717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142307
71041	NC_014012	GATG	2	8	3998721	3998728	25 %	25 %	50 %	0 %	294142307
71042	NC_014012	A	6	6	3998729	3998734	100 %	0 %	0 %	0 %	294142307
71043	NC_014012	AGA	2	6	3998787	3998792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142307
71044	NC_014012	TGTAC	2	10	3998810	3998819	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71045	NC_014012	TCA	2	6	3998926	3998931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71046	NC_014012	TGA	2	6	3999043	3999048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71047	NC_014012	GCTCG	2	10	3999059	3999068	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71048	NC_014012	T	7	7	3999207	3999213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71049	NC_014012	GGC	2	6	3999291	3999296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71050	NC_014012	T	7	7	3999369	3999375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71051	NC_014012	AAGAC	2	10	3999412	3999421	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71052	NC_014012	CAT	2	6	3999542	3999547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71053	NC_014012	CAAT	2	8	3999673	3999680	50 %	25 %	0 %	25 %	294142308
71054	NC_014012	CAA	2	6	3999724	3999729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142308
71055	NC_014012	AGC	2	6	3999747	3999752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142308
71056	NC_014012	ATC	2	6	4000024	4000029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142308
71057	NC_014012	ATGGGC	2	12	4000066	4000077	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294142308
71058	NC_014012	TTA	2	6	4000083	4000088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142308
71059	NC_014012	CAG	2	6	4000156	4000161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142308
71060	NC_014012	TGCCAC	2	12	4000193	4000204	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294142308
71061	NC_014012	CTTAAG	2	12	4000247	4000258	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71062	NC_014012	TCA	2	6	4000261	4000266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71063	NC_014012	CTTT	2	8	4000292	4000299	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71064	NC_014012	G	6	6	4000382	4000387	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71065	NC_014012	TCC	2	6	4000390	4000395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71066	NC_014012	AAG	2	6	4000592	4000597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294142309
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71068	NC_014012	TTTTA	2	10	4000919	4000928	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71069	NC_014012	ATT	2	6	4000944	4000949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71070	NC_014012	T	6	6	4001006	4001011	0 %	100 %	0 %	0 %	294142310
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71073	NC_014012	A	6	6	4001116	4001121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71079	NC_014012	CTAAGC	2	12	4001532	4001543	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294142311
71080	NC_014012	TGA	2	6	4001568	4001573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142311
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71083	NC_014012	A	6	6	4001695	4001700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71084	NC_014012	T	9	9	4001719	4001727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71085	NC_014012	ATT	2	6	4001752	4001757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142312
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71087	NC_014012	TACA	2	8	4001927	4001934	50 %	25 %	0 %	25 %	294142312
71088	NC_014012	ATG	2	6	4001961	4001966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142312
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71093	NC_014012	CTA	2	6	4002147	4002152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142312
71094	NC_014012	ATA	2	6	4002164	4002169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142312
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71104	NC_014012	CAGC	2	8	4002564	4002571	25 %	0 %	25 %	50 %	294142312
71105	NC_014012	CAT	2	6	4002622	4002627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142312
71106	NC_014012	AGCCA	2	10	4002655	4002664	40 %	0 %	20 %	40 %	294142312
71107	NC_014012	CAC	3	9	4002676	4002684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142312
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71117	NC_014012	CTG	2	6	4003280	4003285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142312
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71119	NC_014012	TCG	2	6	4003333	4003338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142312
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71144	NC_014012	TTA	2	6	4004607	4004612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71239	NC_014012	AGAA	2	8	4009603	4009610	75 %	0 %	25 %	0 %	294142317
71240	NC_014012	ACC	2	6	4009674	4009679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142317
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71353	NC_014012	GCA	2	6	4016448	4016453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142320
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71478	NC_014012	TGGCGA	2	12	4023037	4023048	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294142326
71479	NC_014012	C	6	6	4023062	4023067	0 %	0 %	0 %	100 %	294142326
71480	NC_014012	CTC	2	6	4023079	4023084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294142326
71481	NC_014012	CCT	3	9	4023166	4023174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294142326
71482	NC_014012	AC	3	6	4023211	4023216	50 %	0 %	0 %	50 %	294142326
71483	NC_014012	TGG	2	6	4023217	4023222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294142326
71484	NC_014012	TTG	2	6	4023257	4023262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294142326
71485	NC_014012	GTA	2	6	4023265	4023270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142326
71486	NC_014012	CAC	2	6	4023373	4023378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142326
71487	NC_014012	CAT	2	6	4023445	4023450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142326
71488	NC_014012	AGC	2	6	4023452	4023457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142326
71489	NC_014012	TCTG	2	8	4023477	4023484	0 %	50 %	25 %	25 %	294142326
71490	NC_014012	ATT	2	6	4023575	4023580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142326
71491	NC_014012	CGG	2	6	4023637	4023642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142326
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71493	NC_014012	TGG	2	6	4023673	4023678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294142326
71494	NC_014012	CCG	2	6	4023729	4023734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142326
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71499	NC_014012	CAA	2	6	4024055	4024060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142326
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