MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 87981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
70001	NC_014012	A	6	6	3941469	3941474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70002	NC_014012	AC	3	6	3941531	3941536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70003	NC_014012	ATT	2	6	3941567	3941572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70004	NC_014012	ATTC	2	8	3941605	3941612	25 %	50 %	0 %	25 %	294142246
70005	NC_014012	CCA	2	6	3941687	3941692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142246
70006	NC_014012	CGA	2	6	3941718	3941723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142246
70007	NC_014012	TCG	2	6	3941737	3941742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142246
70008	NC_014012	ACG	2	6	3941861	3941866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142246
70009	NC_014012	ATT	2	6	3941943	3941948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70010	NC_014012	ATA	2	6	3942072	3942077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70011	NC_014012	GAT	2	6	3942191	3942196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70012	NC_014012	ATT	2	6	3942200	3942205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70013	NC_014012	TCAA	2	8	3942383	3942390	50 %	25 %	0 %	25 %	294142247
70014	NC_014012	GTC	2	6	3942448	3942453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142247
70015	NC_014012	AATG	2	8	3942473	3942480	50 %	25 %	25 %	0 %	294142247
70016	NC_014012	ACG	2	6	3942501	3942506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142247
70017	NC_014012	CACTGA	2	12	3942561	3942572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294142247
70018	NC_014012	ACG	2	6	3942654	3942659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142247
70019	NC_014012	CA	3	6	3942719	3942724	50 %	0 %	0 %	50 %	294142247
70020	NC_014012	GTA	2	6	3942728	3942733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142247
70021	NC_014012	GGC	2	6	3942734	3942739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142247
70022	NC_014012	AGC	2	6	3942749	3942754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142247
70023	NC_014012	TAT	2	6	3942847	3942852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294142247
70024	NC_014012	TAA	2	6	3943057	3943062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70025	NC_014012	C	6	6	3943143	3943148	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70026	NC_014012	TTAAT	2	10	3943172	3943181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70027	NC_014012	GCT	2	6	3943186	3943191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70028	NC_014012	TTA	3	9	3943220	3943228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70029	NC_014012	CTTC	2	8	3943254	3943261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70030	NC_014012	GGC	3	9	3943391	3943399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142249
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70032	NC_014012	ACTGA	2	10	3943550	3943559	40 %	20 %	20 %	20 %	294142249
70033	NC_014012	GCGATA	2	12	3943560	3943571	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294142249
70034	NC_014012	CGC	2	6	3943588	3943593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142249
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70036	NC_014012	CA	3	6	3943676	3943681	50 %	0 %	0 %	50 %	294142249
70037	NC_014012	CAAT	2	8	3943829	3943836	50 %	25 %	0 %	25 %	294142249
70038	NC_014012	CGA	2	6	3943879	3943884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294142249
70039	NC_014012	TAG	2	6	3944101	3944106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142249
70040	NC_014012	ATA	2	6	3944220	3944225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294142249
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70045	NC_014012	ACT	2	6	3944561	3944566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142249
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70050	NC_014012	CGAA	2	8	3944994	3945001	50 %	0 %	25 %	25 %	294142249
70051	NC_014012	TGA	2	6	3945115	3945120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142250
70052	NC_014012	GCCGT	2	10	3945163	3945172	0 %	20 %	40 %	40 %	294142250
70053	NC_014012	TTCGAT	2	12	3945261	3945272	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294142250
70054	NC_014012	CAAG	2	8	3945302	3945309	50 %	0 %	25 %	25 %	294142250
70055	NC_014012	ATC	2	6	3945342	3945347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142250
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70063	NC_014012	GCC	2	6	3945792	3945797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294142250
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70084	NC_014012	CTGCG	2	10	3947074	3947083	0 %	20 %	40 %	40 %	294142251
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70089	NC_014012	GGCT	2	8	3947395	3947402	0 %	25 %	50 %	25 %	294142252
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70101	NC_014012	GGCT	2	8	3948001	3948008	0 %	25 %	50 %	25 %	294142253
70102	NC_014012	TA	3	6	3948056	3948061	50 %	50 %	0 %	0 %	294142253
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70108	NC_014012	AAAC	2	8	3948366	3948373	75 %	0 %	0 %	25 %	294142253
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70236	NC_014012	TGATC	2	10	3955745	3955754	20 %	40 %	20 %	20 %	294142259
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70240	NC_014012	CTGT	2	8	3955936	3955943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70241	NC_014012	TCA	2	6	3955993	3955998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142260
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70251	NC_014012	ATAC	2	8	3956489	3956496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70252	NC_014012	GCT	2	6	3956526	3956531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142261
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70306	NC_014012	GCC	2	6	3959508	3959513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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70334	NC_014012	ATTTAT	2	12	3961356	3961367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70338	NC_014012	CAT	2	6	3961512	3961517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142267
70339	NC_014012	CAT	2	6	3961529	3961534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142267
70340	NC_014012	ATC	2	6	3961543	3961548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294142267
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70345	NC_014012	CGCC	2	8	3961826	3961833	0 %	0 %	25 %	75 %	294142267
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70347	NC_014012	CAA	2	6	3961860	3961865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294142267
70348	NC_014012	TA	3	6	3961881	3961886	50 %	50 %	0 %	0 %	294142267
70349	NC_014012	GCG	2	6	3961897	3961902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294142267
70350	NC_014012	GTC	2	6	3961920	3961925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294142267
70351	NC_014012	ATGC	2	8	3961965	3961972	25 %	25 %	25 %	25 %	294142267
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70353	NC_014012	CCT	2	6	3962081	3962086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294142267
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70422	NC_014012	AAGG	2	8	3966523	3966530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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70426	NC_014012	A	7	7	3966666	3966672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70442	NC_014012	ATG	2	6	3967580	3967585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142273
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70469	NC_014012	GCCAT	2	10	3968851	3968860	20 %	20 %	20 %	40 %	294142277
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70471	NC_014012	AGC	2	6	3968893	3968898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70472	NC_014012	AATCAT	2	12	3968930	3968941	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70473	NC_014012	AGT	2	6	3969025	3969030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294142278
70474	NC_014012	ACC	2	6	3969054	3969059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294142278
70475	NC_014012	GCCAT	2	10	3969072	3969081	20 %	20 %	20 %	40 %	294142278
70476	NC_014012	CAAG	2	8	3969103	3969110	50 %	0 %	25 %	25 %	294142278
70477	NC_014012	AAGAT	2	10	3969184	3969193	60 %	20 %	20 %	0 %	294142278
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70481	NC_014012	A	7	7	3969373	3969379	100 %	0 %	0 %	0 %	294142278
70482	NC_014012	ACATCA	2	12	3969424	3969435	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294142278
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70487	NC_014012	CTG	2	6	3969763	3969768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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