MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pCHQ1

Total Repeats: 4275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014007	AGC	2	6	180347	180352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023873
4002	NC_014007	CAG	2	6	180385	180390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023874
4003	NC_014007	TTC	2	6	180391	180396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023874
4004	NC_014007	GTC	2	6	180452	180457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023874
4005	NC_014007	GGC	2	6	180561	180566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023874
4006	NC_014007	GCG	2	6	180655	180660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023874
4007	NC_014007	CG	3	6	180741	180746	0 %	0 %	50 %	50 %	294023874
4008	NC_014007	GAC	2	6	180796	180801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023874
4009	NC_014007	ATGCA	2	10	180832	180841	40 %	20 %	20 %	20 %	294023874
4010	NC_014007	GCTC	2	8	180929	180936	0 %	25 %	25 %	50 %	294023874
4011	NC_014007	CAA	2	6	180964	180969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294023874
4012	NC_014007	GCG	2	6	180970	180975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023874
4013	NC_014007	GCA	3	9	180978	180986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023874
4014	NC_014007	GCC	2	6	181016	181021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023874
4015	NC_014007	CGC	2	6	181034	181039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023874
4016	NC_014007	GGT	2	6	181114	181119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023874
4017	NC_014007	CAG	2	6	181123	181128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023874
4018	NC_014007	GC	4	8	181147	181154	0 %	0 %	50 %	50 %	294023874
4019	NC_014007	ACG	2	6	181264	181269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023874
4020	NC_014007	GC	3	6	181274	181279	0 %	0 %	50 %	50 %	294023874
4021	NC_014007	CCG	2	6	181305	181310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023874
4022	NC_014007	TCG	2	6	181330	181335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023874
4023	NC_014007	CGAG	2	8	181407	181414	25 %	0 %	50 %	25 %	294023874
4024	NC_014007	GCC	2	6	181467	181472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023874
4025	NC_014007	GAT	2	6	181479	181484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023874
4026	NC_014007	CAT	2	6	181494	181499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023874
4027	NC_014007	CAGA	2	8	181514	181521	50 %	0 %	25 %	25 %	294023874
4028	NC_014007	CAT	2	6	181563	181568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023874
4029	NC_014007	GC	3	6	181577	181582	0 %	0 %	50 %	50 %	294023874
4030	NC_014007	CGCGAA	2	12	181592	181603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023874
4031	NC_014007	CCG	2	6	181698	181703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023874
4032	NC_014007	TCCC	2	8	181757	181764	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4033	NC_014007	GC	3	6	181799	181804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_014007	GGT	2	6	181814	181819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_014007	C	6	6	181871	181876	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4036	NC_014007	CTC	2	6	181948	181953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023875
4037	NC_014007	GGCC	2	8	182025	182032	0 %	0 %	50 %	50 %	294023875
4038	NC_014007	TGG	2	6	182043	182048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023875
4039	NC_014007	GGC	2	6	182056	182061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023875
4040	NC_014007	GC	3	6	182060	182065	0 %	0 %	50 %	50 %	294023875
4041	NC_014007	CGG	2	6	182083	182088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023875
4042	NC_014007	TGA	2	6	182094	182099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023875
4043	NC_014007	CG	3	6	182104	182109	0 %	0 %	50 %	50 %	294023875
4044	NC_014007	ATA	2	6	182116	182121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294023875
4045	NC_014007	CGC	3	9	182130	182138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023875
4046	NC_014007	CG	3	6	182147	182152	0 %	0 %	50 %	50 %	294023875
4047	NC_014007	CGA	2	6	182163	182168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023875
4048	NC_014007	CCGC	2	8	182175	182182	0 %	0 %	25 %	75 %	294023875
4049	NC_014007	CGG	2	6	182200	182205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023875
4050	NC_014007	GCT	2	6	182295	182300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023875
4051	NC_014007	CGA	2	6	182304	182309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023875
4052	NC_014007	CTT	2	6	182338	182343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023875
4053	NC_014007	AGA	2	6	182358	182363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023875
4054	NC_014007	CCG	2	6	182399	182404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023875
4055	NC_014007	CGG	2	6	182460	182465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023875
4056	NC_014007	GC	3	6	182513	182518	0 %	0 %	50 %	50 %	294023875
4057	NC_014007	GCG	2	6	182534	182539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023875
4058	NC_014007	GAT	2	6	182590	182595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023875
4059	NC_014007	GC	3	6	182597	182602	0 %	0 %	50 %	50 %	294023875
4060	NC_014007	CGGC	2	8	182613	182620	0 %	0 %	50 %	50 %	294023875
4061	NC_014007	GAT	2	6	182633	182638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023875
4062	NC_014007	TGG	2	6	182646	182651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023875
4063	NC_014007	GCC	2	6	182681	182686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_014007	GCG	2	6	182695	182700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_014007	GCC	2	6	182715	182720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_014007	GGC	2	6	182742	182747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023876
4067	NC_014007	CCG	2	6	182794	182799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023876
4068	NC_014007	GTC	2	6	182805	182810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023876
4069	NC_014007	TCG	2	6	182878	182883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023876
4070	NC_014007	CGA	2	6	182921	182926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023876
4071	NC_014007	TGCCC	2	10	182927	182936	0 %	20 %	20 %	60 %	294023876
4072	NC_014007	AGCGC	2	10	182944	182953	20 %	0 %	40 %	40 %	294023876
4073	NC_014007	CTT	2	6	182973	182978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023876
4074	NC_014007	GCA	2	6	182999	183004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023876
4075	NC_014007	CCG	2	6	183010	183015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023876
4076	NC_014007	TCG	2	6	183019	183024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023876
4077	NC_014007	CTT	2	6	183045	183050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023876
4078	NC_014007	CCCG	2	8	183053	183060	0 %	0 %	25 %	75 %	294023876
4079	NC_014007	GCC	2	6	183080	183085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023876
4080	NC_014007	AGC	2	6	183109	183114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023876
4081	NC_014007	GAT	2	6	183122	183127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023876
4082	NC_014007	GCG	2	6	183141	183146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023876
4083	NC_014007	TCG	2	6	183154	183159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023876
4084	NC_014007	GC	4	8	183211	183218	0 %	0 %	50 %	50 %	294023876
4085	NC_014007	GAC	2	6	183253	183258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023876
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4087	NC_014007	CGG	3	9	183365	183373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023876
4088	NC_014007	GCT	2	6	183402	183407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023876
4089	NC_014007	CGCC	2	8	183584	183591	0 %	0 %	25 %	75 %	294023876
4090	NC_014007	GC	3	6	183601	183606	0 %	0 %	50 %	50 %	294023876
4091	NC_014007	AGAT	2	8	183652	183659	50 %	25 %	25 %	0 %	294023876
4092	NC_014007	CAT	2	6	183686	183691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023876
4093	NC_014007	GCC	2	6	183757	183762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023876
4094	NC_014007	GA	3	6	183829	183834	50 %	0 %	50 %	0 %	294023876
4095	NC_014007	GCG	2	6	183875	183880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023876
4096	NC_014007	GAT	2	6	183881	183886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023876
4097	NC_014007	AGCG	2	8	183966	183973	25 %	0 %	50 %	25 %	294023876
4098	NC_014007	GCT	2	6	184007	184012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023876
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4100	NC_014007	CGA	2	6	184106	184111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023876
4101	NC_014007	GTCG	2	8	184125	184132	0 %	25 %	50 %	25 %	294023876
4102	NC_014007	CCGTT	2	10	184139	184148	0 %	40 %	20 %	40 %	294023876
4103	NC_014007	GAG	2	6	184149	184154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023876
4104	NC_014007	CGG	2	6	184159	184164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023876
4105	NC_014007	ATA	2	6	184185	184190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294023876
4106	NC_014007	CG	3	6	184214	184219	0 %	0 %	50 %	50 %	294023876
4107	NC_014007	CGCC	2	8	184277	184284	0 %	0 %	25 %	75 %	294023876
4108	NC_014007	GAG	2	6	184304	184309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023876
4109	NC_014007	GCT	2	6	184331	184336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023876
4110	NC_014007	CCG	2	6	184427	184432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023876
4111	NC_014007	CAT	2	6	184487	184492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023876
4112	NC_014007	AGCACC	2	12	184498	184509	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294023876
4113	NC_014007	GCG	2	6	184569	184574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023876
4114	NC_014007	CTT	2	6	184605	184610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023876
4115	NC_014007	GCG	2	6	184613	184618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023876
4116	NC_014007	GCG	2	6	184648	184653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023876
4117	NC_014007	CGAGAG	2	12	184713	184724	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294023876
4118	NC_014007	ATC	2	6	184747	184752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023876
4119	NC_014007	TCG	2	6	184782	184787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_014007	CT	3	6	184833	184838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_014007	GAAC	2	8	184907	184914	50 %	0 %	25 %	25 %	294023877
4122	NC_014007	GAT	2	6	184932	184937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023877
4123	NC_014007	AGC	2	6	184946	184951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023877
4124	NC_014007	CCG	2	6	184952	184957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023877
4125	NC_014007	TCCAG	2	10	184985	184994	20 %	20 %	20 %	40 %	294023877
4126	NC_014007	GC	3	6	185026	185031	0 %	0 %	50 %	50 %	294023877
4127	NC_014007	CG	3	6	185089	185094	0 %	0 %	50 %	50 %	294023877
4128	NC_014007	GCG	2	6	185153	185158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023877
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4133	NC_014007	TGCG	2	8	185281	185288	0 %	25 %	50 %	25 %	294023877
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4141	NC_014007	GCTC	2	8	185542	185549	0 %	25 %	25 %	50 %	294023877
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4152	NC_014007	TGG	2	6	186115	186120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023877
4153	NC_014007	GTGCG	2	10	186121	186130	0 %	20 %	60 %	20 %	294023877
4154	NC_014007	CGC	2	6	186150	186155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023877
4155	NC_014007	CG	3	6	186159	186164	0 %	0 %	50 %	50 %	294023877
4156	NC_014007	GAG	2	6	186177	186182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023877
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4164	NC_014007	GAG	2	6	186468	186473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023877
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4169	NC_014007	GC	3	6	186652	186657	0 %	0 %	50 %	50 %	294023877
4170	NC_014007	GAC	2	6	186720	186725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023877
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4192	NC_014007	CGC	2	6	187409	187414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023877
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4203	NC_014007	CCG	2	6	188036	188041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023877
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4205	NC_014007	CGGCTG	2	12	188106	188117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294023877
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4207	NC_014007	CATCG	2	10	188136	188145	20 %	20 %	20 %	40 %	294023877
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4214	NC_014007	GAG	2	6	188466	188471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023877
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4218	NC_014007	GCCT	2	8	188537	188544	0 %	25 %	25 %	50 %	294023877
4219	NC_014007	GCA	2	6	188561	188566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023877
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4222	NC_014007	AGG	2	6	188635	188640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023877
4223	NC_014007	GGC	2	6	188697	188702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023877
4224	NC_014007	ACGC	2	8	188760	188767	25 %	0 %	25 %	50 %	294023877
4225	NC_014007	GCC	2	6	188782	188787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023877
4226	NC_014007	TTC	2	6	188842	188847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023877
4227	NC_014007	GGA	2	6	188852	188857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023877
4228	NC_014007	AGG	2	6	188947	188952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023877
4229	NC_014007	AGC	2	6	189003	189008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023877
4230	NC_014007	CGGG	2	8	189013	189020	0 %	0 %	75 %	25 %	294023877
4231	NC_014007	ATC	2	6	189021	189026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023877
4232	NC_014007	GT	3	6	189051	189056	0 %	50 %	50 %	0 %	294023877
4233	NC_014007	TCA	2	6	189102	189107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4234	NC_014007	CTCC	2	8	189117	189124	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4235	NC_014007	GCC	2	6	189133	189138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023878
4236	NC_014007	CGG	2	6	189140	189145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023878
4237	NC_014007	CGG	2	6	189148	189153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023878
4238	NC_014007	CAT	2	6	189164	189169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023878
4239	NC_014007	T	6	6	189240	189245	0 %	100 %	0 %	0 %	294023878
4240	NC_014007	GGC	2	6	189252	189257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023878
4241	NC_014007	GCG	2	6	189259	189264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023878
4242	NC_014007	GAT	2	6	189285	189290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023878
4243	NC_014007	CTC	2	6	189414	189419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023878
4244	NC_014007	GCCG	2	8	189420	189427	0 %	0 %	50 %	50 %	294023878
4245	NC_014007	ATC	2	6	189565	189570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023878
4246	NC_014007	CGG	2	6	189583	189588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023878
4247	NC_014007	CGA	2	6	189602	189607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023878
4248	NC_014007	GGC	2	6	189646	189651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023878
4249	NC_014007	CG	3	6	189656	189661	0 %	0 %	50 %	50 %	294023878
4250	NC_014007	GGCT	2	8	189697	189704	0 %	25 %	50 %	25 %	294023878
4251	NC_014007	GCC	2	6	189745	189750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023878
4252	NC_014007	AGC	2	6	189804	189809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023878
4253	NC_014007	CG	3	6	189818	189823	0 %	0 %	50 %	50 %	294023878
4254	NC_014007	CGC	2	6	189920	189925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023878
4255	NC_014007	CCCA	2	8	189942	189949	25 %	0 %	0 %	75 %	294023878
4256	NC_014007	AGC	2	6	189981	189986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023878
4257	NC_014007	GTG	2	6	190012	190017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_014007	GCT	2	6	190025	190030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_014007	CCCTC	2	10	190038	190047	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4260	NC_014007	CGA	2	6	190098	190103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023879
4261	NC_014007	GCG	2	6	190285	190290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023879
4262	NC_014007	CAG	2	6	190309	190314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023879
4263	NC_014007	CG	3	6	190328	190333	0 %	0 %	50 %	50 %	294023879
4264	NC_014007	GAT	2	6	190354	190359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023879
4265	NC_014007	GGC	2	6	190427	190432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4266	NC_014007	G	6	6	190456	190461	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_014007	CGC	2	6	190521	190526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023880
4268	NC_014007	GATTCA	2	12	190559	190570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294023880
4269	NC_014007	TGCC	2	8	190635	190642	0 %	25 %	25 %	50 %	294023880
4270	NC_014007	ACCTG	2	10	190680	190689	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4271	NC_014007	CTG	2	6	190724	190729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4272	NC_014007	TCGC	2	8	190737	190744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4273	NC_014007	TTC	2	6	190765	190770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4274	NC_014007	CGC	2	6	190820	190825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4275	NC_014007	TGC	2	6	190840	190845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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