MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pCHQ1

Total Repeats: 4275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014007	CGT	2	6	160098	160103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023853
3502	NC_014007	CTG	2	6	160125	160130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023853
3503	NC_014007	CCG	2	6	160148	160153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023853
3504	NC_014007	GCG	2	6	160210	160215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023853
3505	NC_014007	GGT	2	6	160296	160301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_014007	TGCTC	2	10	160335	160344	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3507	NC_014007	TGC	2	6	160388	160393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_014007	GGC	2	6	160395	160400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_014007	GAAC	2	8	160418	160425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_014007	GAA	2	6	160462	160467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023854
3511	NC_014007	TGC	2	6	160548	160553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023854
3512	NC_014007	GA	3	6	160688	160693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014007	GGC	2	6	160702	160707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_014007	CGC	2	6	160715	160720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023855
3515	NC_014007	CTT	2	6	160746	160751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023855
3516	NC_014007	CG	3	6	160851	160856	0 %	0 %	50 %	50 %	294023855
3517	NC_014007	CCG	2	6	161038	161043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023855
3518	NC_014007	ACG	2	6	161047	161052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023855
3519	NC_014007	G	6	6	161064	161069	0 %	0 %	100 %	0 %	294023855
3520	NC_014007	AGC	2	6	161071	161076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023855
3521	NC_014007	CCT	2	6	161078	161083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023855
3522	NC_014007	GC	3	6	161089	161094	0 %	0 %	50 %	50 %	294023855
3523	NC_014007	TTC	2	6	161095	161100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023855
3524	NC_014007	ATC	2	6	161125	161130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023855
3525	NC_014007	GGT	2	6	161147	161152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023855
3526	NC_014007	GCC	2	6	161212	161217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023855
3527	NC_014007	CGAC	2	8	161291	161298	25 %	0 %	25 %	50 %	294023855
3528	NC_014007	GC	4	8	161327	161334	0 %	0 %	50 %	50 %	294023855
3529	NC_014007	GTC	2	6	161352	161357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023855
3530	NC_014007	TCG	2	6	161419	161424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023855
3531	NC_014007	GTG	2	6	161601	161606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023855
3532	NC_014007	GTC	2	6	161616	161621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023855
3533	NC_014007	CGA	2	6	161678	161683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_014007	AGCGC	2	10	161714	161723	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3535	NC_014007	GCC	2	6	161778	161783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_014007	GCC	3	9	161796	161804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_014007	GC	3	6	161886	161891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_014007	CGG	2	6	161893	161898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_014007	GCC	2	6	161931	161936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023856
3540	NC_014007	GCCG	2	8	162113	162120	0 %	0 %	50 %	50 %	294023856
3541	NC_014007	GT	3	6	162154	162159	0 %	50 %	50 %	0 %	294023856
3542	NC_014007	GGC	2	6	162173	162178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023856
3543	NC_014007	GCC	2	6	162198	162203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023856
3544	NC_014007	ATC	2	6	162204	162209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023856
3545	NC_014007	GCCG	2	8	162260	162267	0 %	0 %	50 %	50 %	294023856
3546	NC_014007	AAG	2	6	162308	162313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023856
3547	NC_014007	TCGG	2	8	162444	162451	0 %	25 %	50 %	25 %	294023856
3548	NC_014007	GTC	2	6	162458	162463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023856
3549	NC_014007	GTA	2	6	162470	162475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023856
3550	NC_014007	CG	3	6	162524	162529	0 %	0 %	50 %	50 %	294023856
3551	NC_014007	GCG	2	6	162613	162618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023856
3552	NC_014007	TCG	2	6	162684	162689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023856
3553	NC_014007	GGC	2	6	162761	162766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023856
3554	NC_014007	CGA	2	6	162850	162855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023856
3555	NC_014007	GGC	2	6	162895	162900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023856
3556	NC_014007	CGC	2	6	162964	162969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023857
3557	NC_014007	GC	3	6	162985	162990	0 %	0 %	50 %	50 %	294023857
3558	NC_014007	CAG	2	6	163006	163011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023857
3559	NC_014007	CGG	2	6	163041	163046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023857
3560	NC_014007	GAA	2	6	163051	163056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023857
3561	NC_014007	GAT	2	6	163072	163077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023857
3562	NC_014007	GC	3	6	163149	163154	0 %	0 %	50 %	50 %	294023857
3563	NC_014007	TCG	2	6	163203	163208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023857
3564	NC_014007	GTC	2	6	163262	163267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023857
3565	NC_014007	GCG	2	6	163268	163273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023857
3566	NC_014007	CGG	2	6	163307	163312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023857
3567	NC_014007	GAT	2	6	163315	163320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023857
3568	NC_014007	CGTC	2	8	163332	163339	0 %	25 %	25 %	50 %	294023857
3569	NC_014007	CGA	2	6	163404	163409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023857
3570	NC_014007	GGC	3	9	163462	163470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023857
3571	NC_014007	AGC	2	6	163474	163479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023857
3572	NC_014007	TCC	2	6	163490	163495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023857
3573	NC_014007	CAT	2	6	163510	163515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023857
3574	NC_014007	GCG	2	6	163521	163526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023857
3575	NC_014007	TGC	2	6	163532	163537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023857
3576	NC_014007	TCGG	2	8	163542	163549	0 %	25 %	50 %	25 %	294023857
3577	NC_014007	CGT	2	6	163578	163583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023857
3578	NC_014007	CAT	2	6	163588	163593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023857
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3580	NC_014007	GAG	2	6	163642	163647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023857
3581	NC_014007	CG	4	8	163649	163656	0 %	0 %	50 %	50 %	294023857
3582	NC_014007	GAT	2	6	163668	163673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023857
3583	NC_014007	CGC	2	6	163712	163717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023857
3584	NC_014007	ATG	2	6	163718	163723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023857
3585	NC_014007	CAG	2	6	163726	163731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023857
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3587	NC_014007	CAG	2	6	163918	163923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023857
3588	NC_014007	GGT	2	6	163936	163941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023857
3589	NC_014007	CGG	2	6	163945	163950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023857
3590	NC_014007	GTC	2	6	163972	163977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023857
3591	NC_014007	CGAG	2	8	164013	164020	25 %	0 %	50 %	25 %	294023857
3592	NC_014007	AGA	2	6	164048	164053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023857
3593	NC_014007	GCGCA	2	10	164062	164071	20 %	0 %	40 %	40 %	294023857
3594	NC_014007	CG	3	6	164142	164147	0 %	0 %	50 %	50 %	294023857
3595	NC_014007	GCC	2	6	164169	164174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023857
3596	NC_014007	TCGG	2	8	164223	164230	0 %	25 %	50 %	25 %	294023857
3597	NC_014007	GCG	2	6	164235	164240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023857
3598	NC_014007	CGC	2	6	164284	164289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023857
3599	NC_014007	CCAG	2	8	164299	164306	25 %	0 %	25 %	50 %	294023857
3600	NC_014007	GGC	2	6	164344	164349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023857
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3602	NC_014007	GCC	2	6	164429	164434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023857
3603	NC_014007	CGC	2	6	164452	164457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023857
3604	NC_014007	CGC	2	6	164481	164486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023857
3605	NC_014007	GAC	2	6	164491	164496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023857
3606	NC_014007	GCG	2	6	164497	164502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023857
3607	NC_014007	G	6	6	164575	164580	0 %	0 %	100 %	0 %	294023857
3608	NC_014007	GCGAG	2	10	164583	164592	20 %	0 %	60 %	20 %	294023857
3609	NC_014007	TCG	2	6	164606	164611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023857
3610	NC_014007	CGA	2	6	164668	164673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023857
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3613	NC_014007	CGG	2	6	164853	164858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023857
3614	NC_014007	CCGT	2	8	164864	164871	0 %	25 %	25 %	50 %	294023857
3615	NC_014007	TCGA	2	8	164882	164889	25 %	25 %	25 %	25 %	294023857
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3620	NC_014007	GGC	2	6	165019	165024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023857
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3623	NC_014007	CGT	2	6	165138	165143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023857
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3743	NC_014007	GCG	2	6	170046	170051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023861
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3868	NC_014007	GTC	2	6	174275	174280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023868
3869	NC_014007	CGC	2	6	174288	174293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023868
3870	NC_014007	CGAC	2	8	174294	174301	25 %	0 %	25 %	50 %	294023868
3871	NC_014007	CCT	2	6	174324	174329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023868
3872	NC_014007	TGA	2	6	174371	174376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023868
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3874	NC_014007	CGG	2	6	174453	174458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023868
3875	NC_014007	CGGAG	2	10	174497	174506	20 %	0 %	60 %	20 %	294023868
3876	NC_014007	CG	3	6	174550	174555	0 %	0 %	50 %	50 %	294023868
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3880	NC_014007	CGG	2	6	174633	174638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023868
3881	NC_014007	GCT	2	6	174681	174686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023868
3882	NC_014007	GGA	2	6	174690	174695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023868
3883	NC_014007	CG	3	6	174700	174705	0 %	0 %	50 %	50 %	294023868
3884	NC_014007	GCG	2	6	174711	174716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023868
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3897	NC_014007	GTC	2	6	175163	175168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023870
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3918	NC_014007	CGT	2	6	176011	176016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023871
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3924	NC_014007	ACG	2	6	176316	176321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3939	NC_014007	CG	3	6	177235	177240	0 %	0 %	50 %	50 %	294023872
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3972	NC_014007	GGCA	2	8	178772	178779	25 %	0 %	50 %	25 %	294023873
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3989	NC_014007	GAAC	2	8	179853	179860	50 %	0 %	25 %	25 %	294023873
3990	NC_014007	GTC	2	6	179924	179929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023873
3991	NC_014007	CGA	2	6	179937	179942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023873
3992	NC_014007	GC	3	6	179998	180003	0 %	0 %	50 %	50 %	294023873
3993	NC_014007	CAG	2	6	180046	180051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023873
3994	NC_014007	AAG	2	6	180090	180095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023873
3995	NC_014007	CGA	2	6	180125	180130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023873
3996	NC_014007	ATG	2	6	180138	180143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023873
3997	NC_014007	CG	3	6	180148	180153	0 %	0 %	50 %	50 %	294023873
3998	NC_014007	AGC	2	6	180155	180160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023873
3999	NC_014007	CGA	2	6	180223	180228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023873
4000	NC_014007	CGC	2	6	180235	180240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023873

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