MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pCHQ1

Total Repeats: 4275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014007	AGA	2	6	48323	48328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023724
1002	NC_014007	GCCC	2	8	48362	48369	0 %	0 %	25 %	75 %	294023724
1003	NC_014007	GCG	2	6	48373	48378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023724
1004	NC_014007	CAGCCA	2	12	48432	48443	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294023724
1005	NC_014007	CGC	2	6	48455	48460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023724
1006	NC_014007	GAT	2	6	48552	48557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023724
1007	NC_014007	GCG	2	6	48599	48604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023724
1008	NC_014007	TCC	2	6	48667	48672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_014007	C	6	6	48676	48681	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1010	NC_014007	CTC	2	6	48686	48691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_014007	CG	3	6	48787	48792	0 %	0 %	50 %	50 %	294023725
1012	NC_014007	GGC	2	6	48812	48817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023725
1013	NC_014007	GCC	2	6	48921	48926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023725
1014	NC_014007	TGCG	2	8	48982	48989	0 %	25 %	50 %	25 %	294023725
1015	NC_014007	AGG	2	6	49095	49100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023725
1016	NC_014007	GATG	2	8	49111	49118	25 %	25 %	50 %	0 %	294023725
1017	NC_014007	CCT	2	6	49153	49158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023725
1018	NC_014007	GCC	2	6	49258	49263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023725
1019	NC_014007	CGC	2	6	49450	49455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023725
1020	NC_014007	GCA	2	6	49471	49476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1021	NC_014007	AAG	2	6	49625	49630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023725
1022	NC_014007	CAGC	2	8	49637	49644	25 %	0 %	25 %	50 %	294023725
1023	NC_014007	GGC	2	6	49653	49658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023725
1024	NC_014007	GCC	2	6	49835	49840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023725
1025	NC_014007	CG	3	6	49855	49860	0 %	0 %	50 %	50 %	294023725
1026	NC_014007	GCGA	2	8	49886	49893	25 %	0 %	50 %	25 %	294023725
1027	NC_014007	CCG	2	6	49907	49912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023725
1028	NC_014007	CGC	2	6	49915	49920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023725
1029	NC_014007	TGT	2	6	49928	49933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294023725
1030	NC_014007	TGGT	2	8	49962	49969	0 %	50 %	50 %	0 %	294023725
1031	NC_014007	GCCA	2	8	50011	50018	25 %	0 %	25 %	50 %	294023725
1032	NC_014007	AAG	2	6	50028	50033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023725
1033	NC_014007	GCC	2	6	50093	50098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023725
1034	NC_014007	GCC	2	6	50142	50147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023725
1035	NC_014007	TGC	2	6	50161	50166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1036	NC_014007	GC	4	8	50165	50172	0 %	0 %	50 %	50 %	294023725
1037	NC_014007	TCGCGG	2	12	50199	50210	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294023725
1038	NC_014007	GCA	2	6	50299	50304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1039	NC_014007	GCT	2	6	50311	50316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1040	NC_014007	GCGTC	2	10	50325	50334	0 %	20 %	40 %	40 %	294023725
1041	NC_014007	CCT	2	6	50344	50349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023725
1042	NC_014007	TCG	2	6	50409	50414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1043	NC_014007	CG	3	6	50501	50506	0 %	0 %	50 %	50 %	294023725
1044	NC_014007	GTC	2	6	50556	50561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1045	NC_014007	GCT	2	6	50662	50667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1046	NC_014007	CCCA	2	8	50723	50730	25 %	0 %	0 %	75 %	294023725
1047	NC_014007	CGA	2	6	50737	50742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1048	NC_014007	CAT	2	6	50806	50811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023725
1049	NC_014007	GC	3	6	50878	50883	0 %	0 %	50 %	50 %	294023725
1050	NC_014007	GGC	2	6	51013	51018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023725
1051	NC_014007	GTCG	2	8	51041	51048	0 %	25 %	50 %	25 %	294023725
1052	NC_014007	AGG	2	6	51087	51092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023725
1053	NC_014007	CATGG	2	10	51173	51182	20 %	20 %	40 %	20 %	294023725
1054	NC_014007	CTG	2	6	51236	51241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1055	NC_014007	GCC	2	6	51368	51373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023725
1056	NC_014007	GC	3	6	51376	51381	0 %	0 %	50 %	50 %	294023725
1057	NC_014007	CGG	2	6	51390	51395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023725
1058	NC_014007	ATG	2	6	51468	51473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023725
1059	NC_014007	CCCGT	2	10	51501	51510	0 %	20 %	20 %	60 %	294023725
1060	NC_014007	GAA	2	6	51518	51523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023725
1061	NC_014007	GAG	2	6	51560	51565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023725
1062	NC_014007	GTGGGC	2	12	51696	51707	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	294023725
1063	NC_014007	CG	3	6	51759	51764	0 %	0 %	50 %	50 %	294023725
1064	NC_014007	GGC	2	6	51878	51883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023725
1065	NC_014007	GAG	2	6	51926	51931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023725
1066	NC_014007	CTGC	2	8	51933	51940	0 %	25 %	25 %	50 %	294023725
1067	NC_014007	AGC	2	6	51954	51959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1068	NC_014007	ATG	2	6	51975	51980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023725
1069	NC_014007	AGC	2	6	52170	52175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1070	NC_014007	ACA	2	6	52182	52187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294023725
1071	NC_014007	ATC	2	6	52307	52312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023725
1072	NC_014007	CG	3	6	52315	52320	0 %	0 %	50 %	50 %	294023725
1073	NC_014007	TGC	2	6	52324	52329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1074	NC_014007	TGA	2	6	52345	52350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023725
1075	NC_014007	GACG	2	8	52355	52362	25 %	0 %	50 %	25 %	294023725
1076	NC_014007	GAC	2	6	52367	52372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1077	NC_014007	GA	3	6	52377	52382	50 %	0 %	50 %	0 %	294023725
1078	NC_014007	TCG	2	6	52386	52391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1079	NC_014007	AT	3	6	52392	52397	50 %	50 %	0 %	0 %	294023725
1080	NC_014007	GCG	2	6	52446	52451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023725
1081	NC_014007	GCG	2	6	52572	52577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023725
1082	NC_014007	GCG	2	6	52594	52599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023725
1083	NC_014007	CGCC	2	8	52696	52703	0 %	0 %	25 %	75 %	294023725
1084	NC_014007	AGCC	2	8	52710	52717	25 %	0 %	25 %	50 %	294023725
1085	NC_014007	CAT	2	6	52759	52764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023725
1086	NC_014007	CG	3	6	52820	52825	0 %	0 %	50 %	50 %	294023725
1087	NC_014007	CAGC	2	8	52828	52835	25 %	0 %	25 %	50 %	294023725
1088	NC_014007	TCG	2	6	52849	52854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023725
1089	NC_014007	CGTG	2	8	52930	52937	0 %	25 %	50 %	25 %	294023725
1090	NC_014007	CTCC	2	8	52990	52997	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1091	NC_014007	CT	3	6	53005	53010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_014007	CTG	2	6	53020	53025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_014007	GC	3	6	53048	53053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_014007	TCGCG	2	10	53100	53109	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1095	NC_014007	GAG	2	6	53128	53133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014007	A	7	7	53135	53141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014007	ATG	2	6	53153	53158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014007	CCAGG	2	10	53314	53323	20 %	0 %	40 %	40 %	294023726
1099	NC_014007	CGC	2	6	53358	53363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023726
1100	NC_014007	CGG	2	6	53376	53381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023726
1101	NC_014007	CTT	2	6	53398	53403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023726
1102	NC_014007	GC	3	6	53475	53480	0 %	0 %	50 %	50 %	294023726
1103	NC_014007	CCA	2	6	53509	53514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023726
1104	NC_014007	GCT	2	6	53535	53540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023726
1105	NC_014007	TGA	2	6	53553	53558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023726
1106	NC_014007	GCG	2	6	53624	53629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023726
1107	NC_014007	TCA	2	6	53636	53641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023726
1108	NC_014007	CGG	2	6	53733	53738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023726
1109	NC_014007	GCA	2	6	53802	53807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023726
1110	NC_014007	ACC	2	6	53837	53842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023726
1111	NC_014007	CCA	2	6	53847	53852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023726
1112	NC_014007	TCT	2	6	53919	53924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023726
1113	NC_014007	TCG	2	6	53936	53941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023726
1114	NC_014007	CTC	2	6	53974	53979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023726
1115	NC_014007	CGGCGC	2	12	54049	54060	0 %	0 %	50 %	50 %	294023726
1116	NC_014007	CCA	2	6	54063	54068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023726
1117	NC_014007	TGG	2	6	54086	54091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023726
1118	NC_014007	CGA	2	6	54136	54141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023726
1119	NC_014007	GC	3	6	54211	54216	0 %	0 %	50 %	50 %	294023726
1120	NC_014007	GCC	2	6	54235	54240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023726
1121	NC_014007	GTC	2	6	54251	54256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023726
1122	NC_014007	CTC	2	6	54262	54267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023726
1123	NC_014007	TCG	2	6	54308	54313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023726
1124	NC_014007	GC	4	8	54347	54354	0 %	0 %	50 %	50 %	294023726
1125	NC_014007	CG	3	6	54414	54419	0 %	0 %	50 %	50 %	294023726
1126	NC_014007	CGC	2	6	54489	54494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023726
1127	NC_014007	CGT	3	9	54498	54506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023726
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1237	NC_014007	GGT	2	6	59499	59504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1238	NC_014007	CGC	2	6	59518	59523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1239	NC_014007	CGC	2	6	59540	59545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1240	NC_014007	ATG	2	6	59553	59558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_014007	GCT	2	6	59598	59603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1242	NC_014007	GCG	2	6	59651	59656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1243	NC_014007	TGAT	2	8	59657	59664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1244	NC_014007	CGA	2	6	59673	59678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023734
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1247	NC_014007	AGCG	2	8	59864	59871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1248	NC_014007	GC	3	6	59944	59949	0 %	0 %	50 %	50 %	294023735
1249	NC_014007	GAT	2	6	59965	59970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023735
1250	NC_014007	GCC	2	6	60043	60048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023735
1251	NC_014007	TGCC	2	8	60051	60058	0 %	25 %	25 %	50 %	294023735
1252	NC_014007	ATTG	2	8	60073	60080	25 %	50 %	25 %	0 %	294023735
1253	NC_014007	AGC	2	6	60087	60092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023735
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1255	NC_014007	CAAG	2	8	60262	60269	50 %	0 %	25 %	25 %	294023736
1256	NC_014007	TGC	2	6	60356	60361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023736
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1259	NC_014007	CGG	2	6	60524	60529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023736
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1262	NC_014007	CTC	2	6	60726	60731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1263	NC_014007	CTC	2	6	60740	60745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1264	NC_014007	TTGC	2	8	60781	60788	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1265	NC_014007	CGA	2	6	60852	60857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1365	NC_014007	GCCT	2	8	65996	66003	0 %	25 %	25 %	50 %	294023745
1366	NC_014007	GGTT	2	8	66014	66021	0 %	50 %	50 %	0 %	294023745
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1370	NC_014007	TGA	2	6	66352	66357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1371	NC_014007	CCA	2	6	66413	66418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1372	NC_014007	A	7	7	66487	66493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1373	NC_014007	C	6	6	66511	66516	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1374	NC_014007	GCT	2	6	66584	66589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1375	NC_014007	GC	3	6	66762	66767	0 %	0 %	50 %	50 %	294023746
1376	NC_014007	GAAC	2	8	66888	66895	50 %	0 %	25 %	25 %	294023746
1377	NC_014007	GCC	2	6	66943	66948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023746
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1380	NC_014007	CTT	2	6	67063	67068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023746
1381	NC_014007	AGG	2	6	67073	67078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023746
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