MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pCHQ1

Total Repeats: 4275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014007	GCC	2	6	88	93	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023657
2	NC_014007	GCA	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023657
3	NC_014007	TCG	2	6	137	142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023657
4	NC_014007	TGA	2	6	200	205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023657
5	NC_014007	CCGC	2	8	237	244	0 %	0 %	25 %	75 %	294023657
6	NC_014007	CGC	2	6	268	273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023657
7	NC_014007	CGA	2	6	339	344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023657
8	NC_014007	AAG	2	6	361	366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023657
9	NC_014007	TCG	3	9	391	399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023657
10	NC_014007	CG	3	6	398	403	0 %	0 %	50 %	50 %	294023657
11	NC_014007	AAG	2	6	404	409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023657
12	NC_014007	TGCG	2	8	620	627	0 %	25 %	50 %	25 %	294023657
13	NC_014007	TCGG	2	8	830	837	0 %	25 %	50 %	25 %	294023657
14	NC_014007	GGCGC	2	10	855	864	0 %	0 %	60 %	40 %	294023657
15	NC_014007	CA	3	6	900	905	50 %	0 %	0 %	50 %	294023657
16	NC_014007	GGC	2	6	906	911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023657
17	NC_014007	GGC	2	6	915	920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023657
18	NC_014007	GGC	2	6	1021	1026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023657
19	NC_014007	CG	3	6	1060	1065	0 %	0 %	50 %	50 %	294023657
20	NC_014007	ACG	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023657
21	NC_014007	GCG	2	6	1240	1245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014007	CT	3	6	1355	1360	0 %	50 %	0 %	50 %	294023658
23	NC_014007	CTG	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023658
24	NC_014007	CG	3	6	1458	1463	0 %	0 %	50 %	50 %	294023658
25	NC_014007	GCG	2	6	1482	1487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023658
26	NC_014007	CGG	2	6	1538	1543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023658
27	NC_014007	GCC	3	9	1575	1583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023658
28	NC_014007	AAT	2	6	1597	1602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294023658
29	NC_014007	CTG	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023658
30	NC_014007	CGACCT	2	12	1842	1853	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294023658
31	NC_014007	GAG	2	6	1858	1863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023658
32	NC_014007	ACG	2	6	1889	1894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023658
33	NC_014007	GC	3	6	1996	2001	0 %	0 %	50 %	50 %	294023658
34	NC_014007	TGG	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023658
35	NC_014007	TGC	2	6	2123	2128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023658
36	NC_014007	GC	3	6	2127	2132	0 %	0 %	50 %	50 %	294023658
37	NC_014007	TGG	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023658
38	NC_014007	CCG	2	6	2158	2163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023658
39	NC_014007	TCG	2	6	2179	2184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023658
40	NC_014007	CGG	2	6	2186	2191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023658
41	NC_014007	CTG	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023658
42	NC_014007	CGC	2	6	2360	2365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023658
43	NC_014007	TGA	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023658
44	NC_014007	TGCCT	2	10	2461	2470	0 %	40 %	20 %	40 %	294023658
45	NC_014007	AGG	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023658
46	NC_014007	GAT	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023659
47	NC_014007	AAG	2	6	2616	2621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023659
48	NC_014007	GCG	2	6	2679	2684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023659
49	NC_014007	CGT	2	6	2756	2761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023659
50	NC_014007	CG	3	6	2789	2794	0 %	0 %	50 %	50 %	294023659
51	NC_014007	CTC	2	6	2832	2837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023659
52	NC_014007	GAG	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023659
53	NC_014007	GCAA	2	8	2884	2891	50 %	0 %	25 %	25 %	294023659
54	NC_014007	CGC	2	6	2910	2915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023659
55	NC_014007	GCG	2	6	2953	2958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023659
56	NC_014007	CG	3	6	2957	2962	0 %	0 %	50 %	50 %	294023659
57	NC_014007	GC	3	6	2987	2992	0 %	0 %	50 %	50 %	294023659
58	NC_014007	TCG	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023659
59	NC_014007	CGA	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023659
60	NC_014007	GC	3	6	3081	3086	0 %	0 %	50 %	50 %	294023659
61	NC_014007	GC	5	10	3107	3116	0 %	0 %	50 %	50 %	294023659
62	NC_014007	GC	4	8	3125	3132	0 %	0 %	50 %	50 %	294023659
63	NC_014007	TAT	2	6	3141	3146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294023659
64	NC_014007	CGG	2	6	3229	3234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023659
65	NC_014007	GGC	2	6	3242	3247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023659
66	NC_014007	CT	3	6	3298	3303	0 %	50 %	0 %	50 %	294023659
67	NC_014007	GGA	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023659
68	NC_014007	CGG	2	6	3318	3323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023659
69	NC_014007	GT	3	6	3328	3333	0 %	50 %	50 %	0 %	294023659
70	NC_014007	GCA	2	6	3375	3380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023659
71	NC_014007	CG	3	6	3405	3410	0 %	0 %	50 %	50 %	294023659
72	NC_014007	GCC	2	6	3420	3425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023659
73	NC_014007	C	6	6	3429	3434	0 %	0 %	0 %	100 %	294023659
74	NC_014007	AAG	2	6	3453	3458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023659
75	NC_014007	G	6	6	3489	3494	0 %	0 %	100 %	0 %	294023659
76	NC_014007	GGT	2	6	3561	3566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023659
77	NC_014007	GCT	2	6	3599	3604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023659
78	NC_014007	ATC	2	6	3727	3732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023660
79	NC_014007	CGT	2	6	3739	3744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023660
80	NC_014007	GGA	2	6	3852	3857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023660
81	NC_014007	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023660
82	NC_014007	CGATAT	2	12	3981	3992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294023660
83	NC_014007	TCT	3	9	4094	4102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023661
84	NC_014007	CGG	2	6	4280	4285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023661
85	NC_014007	AGGGC	2	10	4306	4315	20 %	0 %	60 %	20 %	294023661
86	NC_014007	GGTG	2	8	4523	4530	0 %	25 %	75 %	0 %	294023661
87	NC_014007	TCC	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023661
88	NC_014007	TCG	2	6	4606	4611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023661
89	NC_014007	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023661
90	NC_014007	CGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023661
91	NC_014007	CATC	2	8	4760	4767	25 %	25 %	0 %	50 %	294023661
92	NC_014007	AT	3	6	4785	4790	50 %	50 %	0 %	0 %	294023662
93	NC_014007	CAC	2	6	4796	4801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023662
94	NC_014007	GCG	2	6	4861	4866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023662
95	NC_014007	CGC	2	6	4976	4981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023662
96	NC_014007	CCGCG	2	10	4984	4993	0 %	0 %	40 %	60 %	294023662
97	NC_014007	CTT	2	6	5175	5180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014007	TATG	2	8	5189	5196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014007	AAG	2	6	5215	5220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014007	GC	3	6	5246	5251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014007	AGC	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
102	NC_014007	CGC	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023663
103	NC_014007	TTC	2	6	5390	5395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023663
104	NC_014007	GAC	2	6	5396	5401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
105	NC_014007	CAG	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
106	NC_014007	CCG	2	6	5429	5434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023663
107	NC_014007	GC	3	6	5441	5446	0 %	0 %	50 %	50 %	294023663
108	NC_014007	TGATC	2	10	5506	5515	20 %	40 %	20 %	20 %	294023663
109	NC_014007	GCG	2	6	5524	5529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
110	NC_014007	CG	3	6	5565	5570	0 %	0 %	50 %	50 %	294023663
111	NC_014007	GCT	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023663
112	NC_014007	CGG	2	6	5722	5727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
113	NC_014007	CGC	2	6	5764	5769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023663
114	NC_014007	CAG	2	6	5777	5782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
115	NC_014007	GGC	2	6	5825	5830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
116	NC_014007	CG	3	6	5846	5851	0 %	0 %	50 %	50 %	294023663
117	NC_014007	GCG	2	6	5887	5892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
118	NC_014007	GC	3	6	5907	5912	0 %	0 %	50 %	50 %	294023663
119	NC_014007	AGC	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
120	NC_014007	GC	3	6	5927	5932	0 %	0 %	50 %	50 %	294023663
121	NC_014007	G	6	6	5950	5955	0 %	0 %	100 %	0 %	294023663
122	NC_014007	CCT	2	6	6007	6012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023663
123	NC_014007	AGCG	2	8	6055	6062	25 %	0 %	50 %	25 %	294023663
124	NC_014007	GCG	2	6	6081	6086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
125	NC_014007	GAT	2	6	6106	6111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023663
126	NC_014007	AGC	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
127	NC_014007	GCA	2	6	6271	6276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023663
128	NC_014007	TCC	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023663
129	NC_014007	GAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023663
130	NC_014007	GC	3	6	6349	6354	0 %	0 %	50 %	50 %	294023663
131	NC_014007	CGG	2	6	6400	6405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023663
132	NC_014007	ACT	2	6	6462	6467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014007	TGGT	2	8	6472	6479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014007	TGG	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014007	GCG	2	6	6548	6553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014007	A	6	6	6581	6586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014007	CGC	2	6	6609	6614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014007	GC	3	6	6747	6752	0 %	0 %	50 %	50 %	294023664
139	NC_014007	GACGT	2	10	6842	6851	20 %	20 %	40 %	20 %	294023664
140	NC_014007	TCG	2	6	6858	6863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023664
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159	NC_014007	CGG	2	6	7498	7503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023664
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253	NC_014007	GGAC	2	8	12614	12621	25 %	0 %	50 %	25 %	294023669
254	NC_014007	GTGAT	2	10	12659	12668	20 %	40 %	40 %	0 %	294023669
255	NC_014007	ACG	2	6	12760	12765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023669
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257	NC_014007	ACCT	2	8	12889	12896	25 %	25 %	0 %	50 %	294023669
258	NC_014007	CGAT	2	8	12926	12933	25 %	25 %	25 %	25 %	294023669
259	NC_014007	GA	3	6	13312	13317	50 %	0 %	50 %	0 %	294023669
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264	NC_014007	GA	3	6	13457	13462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
265	NC_014007	ACC	2	6	13512	13517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
266	NC_014007	GCA	2	6	13523	13528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_014007	GCC	2	6	13529	13534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_014007	GCC	2	6	13568	13573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_014007	TCGA	2	8	13632	13639	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
270	NC_014007	CGG	2	6	13713	13718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023670
271	NC_014007	CGC	2	6	13872	13877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023670
272	NC_014007	CGC	2	6	13879	13884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023670
273	NC_014007	CTG	2	6	13989	13994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023670
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275	NC_014007	GGC	2	6	14068	14073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023670
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311	NC_014007	GGA	2	6	15162	15167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
312	NC_014007	CAA	2	6	15176	15181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
313	NC_014007	TTA	2	6	15226	15231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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362	NC_014007	AGCGC	2	10	17850	17859	20 %	0 %	40 %	40 %	294023677
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387	NC_014007	G	7	7	18472	18478	0 %	0 %	100 %	0 %	294023678
388	NC_014007	CGC	2	6	18488	18493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023678
389	NC_014007	GCC	3	9	18516	18524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023678
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393	NC_014007	CGCC	2	8	18569	18576	0 %	0 %	25 %	75 %	294023678
394	NC_014007	GCC	2	6	18612	18617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023678
395	NC_014007	CAC	2	6	18620	18625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023678
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397	NC_014007	GGC	2	6	18648	18653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023678
398	NC_014007	CAG	2	6	18692	18697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023678
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401	NC_014007	CCGC	2	8	18781	18788	0 %	0 %	25 %	75 %	294023678
402	NC_014007	GCC	2	6	18801	18806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023678
403	NC_014007	GAC	2	6	18858	18863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023678
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