MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 1

Total Repeats: 89117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014006	TGC	2	6	233326	233331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010207
6002	NC_014006	TGA	2	6	233338	233343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010207
6003	NC_014006	GTGG	2	8	233365	233372	0 %	25 %	75 %	0 %	294010207
6004	NC_014006	CAG	2	6	233373	233378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010207
6005	NC_014006	CGA	2	6	233413	233418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010207
6006	NC_014006	CTC	2	6	233543	233548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010207
6007	NC_014006	CTG	2	6	233627	233632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010207
6008	NC_014006	GTT	2	6	233642	233647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294010207
6009	NC_014006	GC	3	6	233654	233659	0 %	0 %	50 %	50 %	294010207
6010	NC_014006	CGCC	2	8	233674	233681	0 %	0 %	25 %	75 %	294010207
6011	NC_014006	GCG	2	6	233713	233718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010207
6012	NC_014006	CG	4	8	233767	233774	0 %	0 %	50 %	50 %	294010207
6013	NC_014006	TCT	2	6	233776	233781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294010207
6014	NC_014006	CCG	3	9	233791	233799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010207
6015	NC_014006	TTG	2	6	233823	233828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294010207
6016	NC_014006	TCA	2	6	233872	233877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010207
6017	NC_014006	TGGGCG	2	12	233883	233894	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	294010207
6018	NC_014006	GAT	2	6	233897	233902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010207
6019	NC_014006	CCGCG	2	10	233949	233958	0 %	0 %	40 %	60 %	294010208
6020	NC_014006	GC	3	6	233980	233985	0 %	0 %	50 %	50 %	294010208
6021	NC_014006	CCAG	2	8	234015	234022	25 %	0 %	25 %	50 %	294010208
6022	NC_014006	CG	3	6	234041	234046	0 %	0 %	50 %	50 %	294010208
6023	NC_014006	CGT	2	6	234048	234053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010208
6024	NC_014006	CAC	2	6	234076	234081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010208
6025	NC_014006	GGC	2	6	234139	234144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010208
6026	NC_014006	TCC	2	6	234158	234163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010208
6027	NC_014006	CG	3	6	234171	234176	0 %	0 %	50 %	50 %	294010208
6028	NC_014006	ATG	2	6	234194	234199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010208
6029	NC_014006	CCG	2	6	234200	234205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010208
6030	NC_014006	CGAT	2	8	234258	234265	25 %	25 %	25 %	25 %	294010208
6031	NC_014006	TGC	2	6	234276	234281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010208
6032	NC_014006	TCC	2	6	234296	234301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010208
6033	NC_014006	GCCCGT	2	12	234328	234339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	294010209
6034	NC_014006	GCCG	2	8	234403	234410	0 %	0 %	50 %	50 %	294010209
6035	NC_014006	GCG	2	6	234476	234481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010209
6036	NC_014006	TCG	2	6	234527	234532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010209
6037	NC_014006	GCC	2	6	234550	234555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010209
6038	NC_014006	TCC	2	6	234581	234586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010209
6039	NC_014006	CGGCG	2	10	234635	234644	0 %	0 %	60 %	40 %	294010209
6040	NC_014006	ATA	2	6	234661	234666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010209
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6042	NC_014006	TCA	2	6	234794	234799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010209
6043	NC_014006	GC	3	6	234823	234828	0 %	0 %	50 %	50 %	294010209
6044	NC_014006	ATA	2	6	234871	234876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010209
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6047	NC_014006	CCA	2	6	234895	234900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010209
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6051	NC_014006	CGA	2	6	235044	235049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010209
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6053	NC_014006	C	6	6	235071	235076	0 %	0 %	0 %	100 %	294010209
6054	NC_014006	GGC	2	6	235081	235086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010209
6055	NC_014006	GC	3	6	235085	235090	0 %	0 %	50 %	50 %	294010209
6056	NC_014006	TCG	2	6	235097	235102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010209
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6059	NC_014006	CAG	2	6	235150	235155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010209
6060	NC_014006	CCTT	2	8	235178	235185	0 %	50 %	0 %	50 %	294010209
6061	NC_014006	CTC	2	6	235213	235218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010209
6062	NC_014006	GAG	2	6	235265	235270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_014006	CAT	2	6	235294	235299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6072	NC_014006	CG	3	6	235505	235510	0 %	0 %	50 %	50 %	294010210
6073	NC_014006	TCG	2	6	235513	235518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010210
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6113	NC_014006	CG	3	6	236950	236955	0 %	0 %	50 %	50 %	294010211
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6120	NC_014006	AAT	2	6	237218	237223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010211
6121	NC_014006	CGACC	2	10	237243	237252	20 %	0 %	20 %	60 %	294010211
6122	NC_014006	CGATAT	2	12	237269	237280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294010211
6123	NC_014006	CGG	2	6	237304	237309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010211
6124	NC_014006	GGC	2	6	237315	237320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010211
6125	NC_014006	TCA	2	6	237350	237355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010211
6126	NC_014006	ACC	2	6	237361	237366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010211
6127	NC_014006	TCA	2	6	237425	237430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010211
6128	NC_014006	GCCC	2	8	237431	237438	0 %	0 %	25 %	75 %	294010211
6129	NC_014006	GGC	2	6	237462	237467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010211
6130	NC_014006	GC	3	6	237475	237480	0 %	0 %	50 %	50 %	294010211
6131	NC_014006	GCC	2	6	237573	237578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010211
6132	NC_014006	GGC	2	6	237612	237617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010211
6133	NC_014006	CG	3	6	237660	237665	0 %	0 %	50 %	50 %	294010211
6134	NC_014006	CG	3	6	237755	237760	0 %	0 %	50 %	50 %	294010211
6135	NC_014006	GTC	2	6	237762	237767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010211
6136	NC_014006	GCC	2	6	237768	237773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010211
6137	NC_014006	TCCT	2	8	237899	237906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6138	NC_014006	TCAA	2	8	237908	237915	50 %	25 %	0 %	25 %	294010212
6139	NC_014006	GGC	2	6	237972	237977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010212
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6141	NC_014006	CGCCTC	2	12	238089	238100	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	294010212
6142	NC_014006	CTG	2	6	238158	238163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010212
6143	NC_014006	GCC	2	6	238187	238192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010212
6144	NC_014006	AGC	3	9	238195	238203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010212
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6146	NC_014006	C	6	6	238260	238265	0 %	0 %	0 %	100 %	294010212
6147	NC_014006	CGG	2	6	238319	238324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010212
6148	NC_014006	TCC	2	6	238345	238350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010212
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6150	NC_014006	CGCGAT	2	12	238464	238475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294010212
6151	NC_014006	GCA	3	9	238514	238522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010212
6152	NC_014006	GC	5	10	238547	238556	0 %	0 %	50 %	50 %	294010212
6153	NC_014006	TG	3	6	238620	238625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6154	NC_014006	CGC	2	6	238643	238648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6155	NC_014006	GCT	2	6	238691	238696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6156	NC_014006	TGC	2	6	238709	238714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6157	NC_014006	AGG	2	6	238731	238736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6158	NC_014006	GCC	2	6	238858	238863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010213
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6160	NC_014006	CG	3	6	238877	238882	0 %	0 %	50 %	50 %	294010213
6161	NC_014006	GCT	2	6	239046	239051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010213
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6177	NC_014006	GGC	2	6	239497	239502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6178	NC_014006	ATT	2	6	239507	239512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6179	NC_014006	GACG	2	8	239559	239566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6180	NC_014006	GGC	2	6	239575	239580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6181	NC_014006	AGC	2	6	239587	239592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6183	NC_014006	CG	3	6	239702	239707	0 %	0 %	50 %	50 %	294010214
6184	NC_014006	TGC	2	6	239783	239788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010214
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6189	NC_014006	CGA	2	6	239967	239972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010214
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6191	NC_014006	TAT	2	6	240094	240099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294010214
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6195	NC_014006	GAG	2	6	240226	240231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6196	NC_014006	GAG	2	6	240245	240250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010215
6197	NC_014006	TGC	2	6	240300	240305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010215
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6199	NC_014006	CGC	2	6	240446	240451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010215
6200	NC_014006	TGGC	2	8	240505	240512	0 %	25 %	50 %	25 %	294010215
6201	NC_014006	CGA	2	6	240517	240522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010215
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6203	NC_014006	AGC	2	6	240540	240545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010215
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6206	NC_014006	CGG	2	6	240619	240624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010215
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6212	NC_014006	GAG	2	6	240860	240865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010215
6213	NC_014006	GAG	2	6	240911	240916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010215
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6222	NC_014006	CG	3	6	241368	241373	0 %	0 %	50 %	50 %	294010215
6223	NC_014006	CCTATC	2	12	241416	241427	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	294010215
6224	NC_014006	CCGA	2	8	241439	241446	25 %	0 %	25 %	50 %	294010215
6225	NC_014006	GC	3	6	241465	241470	0 %	0 %	50 %	50 %	294010215
6226	NC_014006	GCCGA	2	10	241511	241520	20 %	0 %	40 %	40 %	294010215
6227	NC_014006	G	7	7	241540	241546	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6228	NC_014006	AGGA	2	8	241567	241574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6229	NC_014006	GC	3	6	241601	241606	0 %	0 %	50 %	50 %	294010216
6230	NC_014006	GC	3	6	241669	241674	0 %	0 %	50 %	50 %	294010216
6231	NC_014006	CGGCC	2	10	241683	241692	0 %	0 %	40 %	60 %	294010216
6232	NC_014006	CAA	2	6	241728	241733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294010216
6233	NC_014006	TCA	2	6	241745	241750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010216
6234	NC_014006	GGCG	2	8	241809	241816	0 %	0 %	75 %	25 %	294010216
6235	NC_014006	GCG	3	9	241814	241822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010216
6236	NC_014006	GGCG	2	8	241853	241860	0 %	0 %	75 %	25 %	294010216
6237	NC_014006	TCGC	2	8	241941	241948	0 %	25 %	25 %	50 %	294010216
6238	NC_014006	GCC	2	6	241984	241989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010216
6239	NC_014006	CGC	2	6	242012	242017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010216
6240	NC_014006	TCCG	2	8	242084	242091	0 %	25 %	25 %	50 %	294010216
6241	NC_014006	GGC	2	6	242127	242132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010216
6242	NC_014006	CGC	2	6	242169	242174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010216
6243	NC_014006	GCG	2	6	242293	242298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010217
6244	NC_014006	CG	3	6	242441	242446	0 %	0 %	50 %	50 %	294010217
6245	NC_014006	GCG	2	6	242457	242462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010217
6246	NC_014006	CCG	2	6	242550	242555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010217
6247	NC_014006	GCCG	2	8	242569	242576	0 %	0 %	50 %	50 %	294010217
6248	NC_014006	AGC	2	6	242615	242620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010217
6249	NC_014006	GC	3	6	242681	242686	0 %	0 %	50 %	50 %	294010217
6250	NC_014006	CGA	2	6	242766	242771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010217
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6252	NC_014006	GCG	2	6	242804	242809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010217
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6255	NC_014006	CG	4	8	242868	242875	0 %	0 %	50 %	50 %	294010217
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6259	NC_014006	ATC	2	6	242971	242976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010217
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6267	NC_014006	GA	3	6	243213	243218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6268	NC_014006	CG	4	8	243264	243271	0 %	0 %	50 %	50 %	294010218
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6319	NC_014006	GGCA	2	8	244635	244642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6320	NC_014006	TGAG	2	8	244815	244822	25 %	25 %	50 %	0 %	294010220
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6357	NC_014006	TTC	2	6	246203	246208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6361	NC_014006	TGA	2	6	246422	246427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6363	NC_014006	GC	3	6	246503	246508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6364	NC_014006	GAT	2	6	246546	246551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010221
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6369	NC_014006	GCG	2	6	246817	246822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010221
6370	NC_014006	CGGCG	2	10	246828	246837	0 %	0 %	60 %	40 %	294010221
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6489	NC_014006	TAA	2	6	251971	251976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6490	NC_014006	CGG	2	6	252176	252181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6491	NC_014006	AGG	2	6	252197	252202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6492	NC_014006	CAA	2	6	252232	252237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6493	NC_014006	GTT	2	6	252253	252258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6494	NC_014006	GGA	2	6	252293	252298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010225
6495	NC_014006	CG	3	6	252314	252319	0 %	0 %	50 %	50 %	294010225
6496	NC_014006	GTT	2	6	252326	252331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294010225
6497	NC_014006	GCGCT	2	10	252349	252358	0 %	20 %	40 %	40 %	294010225
6498	NC_014006	CGG	2	6	252362	252367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010225
6499	NC_014006	ACG	2	6	252390	252395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010225
6500	NC_014006	TGC	2	6	252421	252426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010225

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