MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 1

Total Repeats: 89117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014006	CCG	2	6	196277	196282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010173
5002	NC_014006	C	6	6	196375	196380	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5003	NC_014006	CTGA	2	8	196389	196396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_014006	TGGG	2	8	196403	196410	0 %	25 %	75 %	0 %	294010174
5005	NC_014006	TCC	2	6	196428	196433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010174
5006	NC_014006	CG	3	6	196458	196463	0 %	0 %	50 %	50 %	294010174
5007	NC_014006	GTG	2	6	196468	196473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294010174
5008	NC_014006	CCA	2	6	196509	196514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010174
5009	NC_014006	GGA	2	6	196555	196560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010174
5010	NC_014006	AAC	2	6	196676	196681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294010174
5011	NC_014006	CCCA	2	8	196745	196752	25 %	0 %	0 %	75 %	294010174
5012	NC_014006	CCG	2	6	196759	196764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010174
5013	NC_014006	TC	3	6	196765	196770	0 %	50 %	0 %	50 %	294010174
5014	NC_014006	CCA	2	6	196809	196814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010174
5015	NC_014006	CA	3	6	196813	196818	50 %	0 %	0 %	50 %	294010174
5016	NC_014006	GCT	2	6	196959	196964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010175
5017	NC_014006	CGA	2	6	196986	196991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010175
5018	NC_014006	GGC	2	6	197014	197019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010175
5019	NC_014006	GCG	2	6	197027	197032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010175
5020	NC_014006	CCA	2	6	197057	197062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010175
5021	NC_014006	GGC	2	6	197210	197215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010175
5022	NC_014006	TGC	2	6	197234	197239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010175
5023	NC_014006	ATG	2	6	197275	197280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010175
5024	NC_014006	GCC	2	6	197392	197397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010175
5025	NC_014006	GCT	2	6	197402	197407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010175
5026	NC_014006	GGA	2	6	197415	197420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010175
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5028	NC_014006	CCGC	2	8	197472	197479	0 %	0 %	25 %	75 %	294010175
5029	NC_014006	CGCC	2	8	197493	197500	0 %	0 %	25 %	75 %	294010175
5030	NC_014006	GCC	2	6	197515	197520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010175
5031	NC_014006	GCC	2	6	197559	197564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010175
5032	NC_014006	GGC	3	9	197586	197594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010175
5033	NC_014006	GGC	2	6	197605	197610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010175
5034	NC_014006	CGCC	2	8	197625	197632	0 %	0 %	25 %	75 %	294010175
5035	NC_014006	CCG	2	6	197652	197657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010175
5036	NC_014006	CGT	2	6	197658	197663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010175
5037	NC_014006	GCTGG	2	10	197682	197691	0 %	20 %	60 %	20 %	294010175
5038	NC_014006	CGCC	2	8	197724	197731	0 %	0 %	25 %	75 %	294010175
5039	NC_014006	CGC	2	6	197739	197744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010175
5040	NC_014006	A	7	7	197793	197799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014006	AGG	2	6	197839	197844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_014006	GGCG	2	8	197855	197862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_014006	GCCC	2	8	197875	197882	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5044	NC_014006	AGT	2	6	197893	197898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010176
5045	NC_014006	GC	3	6	197904	197909	0 %	0 %	50 %	50 %	294010176
5046	NC_014006	GAT	2	6	197981	197986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010176
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5048	NC_014006	GCC	2	6	198093	198098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010176
5049	NC_014006	GCC	2	6	198128	198133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010176
5050	NC_014006	CGA	2	6	198148	198153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010176
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5053	NC_014006	GTC	2	6	198215	198220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010176
5054	NC_014006	CAG	2	6	198368	198373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010176
5055	NC_014006	TGG	2	6	198387	198392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294010176
5056	NC_014006	CCG	3	9	198418	198426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010176
5057	NC_014006	TGA	2	6	198448	198453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010176
5058	NC_014006	CAG	2	6	198521	198526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010176
5059	NC_014006	TCATGG	2	12	198538	198549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294010176
5060	NC_014006	GCG	2	6	198559	198564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010176
5061	NC_014006	CCA	2	6	198613	198618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010176
5062	NC_014006	CAC	2	6	198644	198649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010176
5063	NC_014006	GCC	2	6	198653	198658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010176
5064	NC_014006	GC	3	6	198670	198675	0 %	0 %	50 %	50 %	294010176
5065	NC_014006	GTCG	2	8	198698	198705	0 %	25 %	50 %	25 %	294010176
5066	NC_014006	GGCC	2	8	198727	198734	0 %	0 %	50 %	50 %	294010176
5067	NC_014006	ACG	2	6	198786	198791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010176
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5094	NC_014006	GCC	2	6	199849	199854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_014006	GATG	2	8	199954	199961	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5114	NC_014006	GCGCCT	2	12	200623	200634	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	294010179
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5123	NC_014006	CGG	2	6	201028	201033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010179
5124	NC_014006	TCG	2	6	201128	201133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010179
5125	NC_014006	GAGC	2	8	201156	201163	25 %	0 %	50 %	25 %	294010179
5126	NC_014006	CGT	2	6	201185	201190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010179
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5130	NC_014006	CGG	2	6	201481	201486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010179
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5132	NC_014006	GTCG	2	8	201537	201544	0 %	25 %	50 %	25 %	294010179
5133	NC_014006	GC	3	6	201559	201564	0 %	0 %	50 %	50 %	294010179
5134	NC_014006	CCA	2	6	201572	201577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010179
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5142	NC_014006	CGC	2	6	201854	201859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010179
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5147	NC_014006	TCG	2	6	201961	201966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010179
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5153	NC_014006	GGC	2	6	202099	202104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5154	NC_014006	TTG	2	6	202118	202123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_014006	GCG	2	6	202183	202188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5156	NC_014006	GGACT	2	10	202189	202198	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5157	NC_014006	GCG	2	6	202308	202313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010180
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5162	NC_014006	CAG	3	9	202520	202528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010181
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5169	NC_014006	TGG	2	6	202776	202781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5170	NC_014006	CCG	2	6	202799	202804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5171	NC_014006	GCG	2	6	202917	202922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5172	NC_014006	GC	3	6	202925	202930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5229	NC_014006	CGCGT	2	10	204737	204746	0 %	20 %	40 %	40 %	294010183
5230	NC_014006	C	6	6	204750	204755	0 %	0 %	0 %	100 %	294010183
5231	NC_014006	GC	3	6	204796	204801	0 %	0 %	50 %	50 %	294010183
5232	NC_014006	GCC	2	6	204818	204823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010183
5233	NC_014006	CCG	2	6	204927	204932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010183
5234	NC_014006	CGC	2	6	205079	205084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5235	NC_014006	GCG	2	6	205093	205098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5236	NC_014006	TCCCC	2	10	205122	205131	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5237	NC_014006	ACC	2	6	205132	205137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5238	NC_014006	C	7	7	205245	205251	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5239	NC_014006	GCC	2	6	205257	205262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010184
5240	NC_014006	GCC	3	9	205282	205290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010184
5241	NC_014006	CGA	2	6	205298	205303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010184
5242	NC_014006	GCG	2	6	205340	205345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010184
5243	NC_014006	GC	3	6	205365	205370	0 %	0 %	50 %	50 %	294010184
5244	NC_014006	GTC	2	6	205388	205393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010184
5245	NC_014006	CCG	2	6	205417	205422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010184
5246	NC_014006	CGC	2	6	205474	205479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010184
5247	NC_014006	CCG	3	9	205480	205488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010184
5248	NC_014006	CGC	2	6	205492	205497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010184
5249	NC_014006	GAA	2	6	205502	205507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294010184
5250	NC_014006	TCAGCG	2	12	205609	205620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294010184
5251	NC_014006	GAA	2	6	205646	205651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294010184
5252	NC_014006	TCC	2	6	205653	205658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010184
5253	NC_014006	TCGC	2	8	205674	205681	0 %	25 %	25 %	50 %	294010184
5254	NC_014006	TCT	2	6	205696	205701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294010184
5255	NC_014006	CCAG	2	8	205723	205730	25 %	0 %	25 %	50 %	294010184
5256	NC_014006	GCCA	2	8	205752	205759	25 %	0 %	25 %	50 %	294010184
5257	NC_014006	GTCCT	2	10	205770	205779	0 %	40 %	20 %	40 %	294010184
5258	NC_014006	ATA	2	6	205802	205807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010184
5259	NC_014006	CGGCG	2	10	205901	205910	0 %	0 %	60 %	40 %	294010184
5260	NC_014006	GGA	2	6	205916	205921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010184
5261	NC_014006	TCC	2	6	205980	205985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010184
5262	NC_014006	CGC	2	6	205993	205998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010184
5263	NC_014006	C	6	6	206023	206028	0 %	0 %	0 %	100 %	294010184
5264	NC_014006	CAG	2	6	206051	206056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010184
5265	NC_014006	CCT	2	6	206086	206091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010184
5266	NC_014006	GGTCG	2	10	206138	206147	0 %	20 %	60 %	20 %	294010184
5267	NC_014006	CCATG	2	10	206197	206206	20 %	20 %	20 %	40 %	294010184
5268	NC_014006	CAG	2	6	206216	206221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010184
5269	NC_014006	TCG	2	6	206244	206249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010184
5270	NC_014006	GCG	2	6	206268	206273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010184
5271	NC_014006	ATC	2	6	206274	206279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010184
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5273	NC_014006	GC	3	6	206303	206308	0 %	0 %	50 %	50 %	294010184
5274	NC_014006	CGC	2	6	206374	206379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010184
5275	NC_014006	GCC	2	6	206381	206386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010184
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5277	NC_014006	TCG	2	6	206448	206453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010184
5278	NC_014006	GC	3	6	206544	206549	0 %	0 %	50 %	50 %	294010184
5279	NC_014006	TGC	2	6	206556	206561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010184
5280	NC_014006	CCG	2	6	206563	206568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010184
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5282	NC_014006	GCG	2	6	206590	206595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010184
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5285	NC_014006	CAG	2	6	206621	206626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010184
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5288	NC_014006	CTG	2	6	206699	206704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010184
5289	NC_014006	GCG	2	6	206710	206715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010184
5290	NC_014006	TCA	2	6	206716	206721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010184
5291	NC_014006	TCA	2	6	206764	206769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010184
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5293	NC_014006	GCCC	2	8	206798	206805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5294	NC_014006	GCC	2	6	206806	206811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5295	NC_014006	GCC	2	6	206845	206850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010185
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5315	NC_014006	GA	3	6	207933	207938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5316	NC_014006	CTT	2	6	207951	207956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5343	NC_014006	ATC	2	6	209058	209063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010187
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5347	NC_014006	CGG	2	6	209182	209187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010187
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5350	NC_014006	GAT	2	6	209477	209482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010187
5351	NC_014006	CG	3	6	209500	209505	0 %	0 %	50 %	50 %	294010187
5352	NC_014006	GC	3	6	209506	209511	0 %	0 %	50 %	50 %	294010187
5353	NC_014006	GC	3	6	209524	209529	0 %	0 %	50 %	50 %	294010187
5354	NC_014006	GC	4	8	209573	209580	0 %	0 %	50 %	50 %	294010187
5355	NC_014006	GCC	2	6	209593	209598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010187
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5360	NC_014006	ACAT	2	8	209766	209773	50 %	25 %	0 %	25 %	294010187
5361	NC_014006	ACC	2	6	209784	209789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010187
5362	NC_014006	TGC	2	6	209802	209807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010187
5363	NC_014006	GTCGAA	2	12	209819	209830	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294010187
5364	NC_014006	TGATC	2	10	209869	209878	20 %	40 %	20 %	20 %	294010187
5365	NC_014006	AAT	2	6	209887	209892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010187
5366	NC_014006	GCC	2	6	209909	209914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010187
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5489	NC_014006	GCG	2	6	213964	213969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010191
5490	NC_014006	CG	3	6	213968	213973	0 %	0 %	50 %	50 %	294010191
5491	NC_014006	GGC	2	6	214051	214056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010191
5492	NC_014006	CGC	2	6	214192	214197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010191
5493	NC_014006	GC	3	6	214196	214201	0 %	0 %	50 %	50 %	294010191
5494	NC_014006	CGC	3	9	214266	214274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010192
5495	NC_014006	CGG	2	6	214287	214292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010192
5496	NC_014006	CCG	2	6	214380	214385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010192
5497	NC_014006	GCG	2	6	214397	214402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010192
5498	NC_014006	GGCGC	2	10	214501	214510	0 %	0 %	60 %	40 %	294010192
5499	NC_014006	GGCGTC	2	12	214511	214522	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294010192
5500	NC_014006	CGA	2	6	214537	214542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010192

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