MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pUT1

Total Repeats: 663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014005	C	7	7	24596	24602	0 %	0 %	0 %	100 %	293980678
502	NC_014005	CGC	2	6	24611	24616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980678
503	NC_014005	GA	3	6	24618	24623	50 %	0 %	50 %	0 %	293980678
504	NC_014005	CCCG	2	8	24630	24637	0 %	0 %	25 %	75 %	293980678
505	NC_014005	GCT	2	6	24670	24675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980678
506	NC_014005	CG	3	6	24691	24696	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
507	NC_014005	CGC	2	6	24712	24717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980678
508	NC_014005	CCA	2	6	24736	24741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293980678
509	NC_014005	TCA	2	6	24766	24771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980678
510	NC_014005	CGC	2	6	24828	24833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980678
511	NC_014005	CTG	2	6	24845	24850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980678
512	NC_014005	TCT	2	6	24892	24897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980678
513	NC_014005	CG	4	8	24907	24914	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
514	NC_014005	GCC	2	6	25017	25022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980678
515	NC_014005	CG	3	6	25041	25046	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
516	NC_014005	CTT	2	6	25139	25144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980678
517	NC_014005	ACA	2	6	25177	25182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293980678
518	NC_014005	CCA	2	6	25246	25251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293980678
519	NC_014005	CGA	2	6	25261	25266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980678
520	NC_014005	CGA	2	6	25276	25281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980678
521	NC_014005	CTG	3	9	25304	25312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980678
522	NC_014005	CG	3	6	25321	25326	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
523	NC_014005	CG	3	6	25403	25408	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
524	NC_014005	GCA	2	6	25438	25443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980678
525	NC_014005	GAC	2	6	25457	25462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980678
526	NC_014005	CCG	2	6	25519	25524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980678
527	NC_014005	GC	3	6	25653	25658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_014005	CAC	2	6	25662	25667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_014005	GA	3	6	25771	25776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014005	ATG	2	6	25777	25782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980679
531	NC_014005	CG	3	6	25790	25795	0 %	0 %	50 %	50 %	293980679
532	NC_014005	GAA	2	6	25848	25853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293980679
533	NC_014005	GCT	2	6	25926	25931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980679
534	NC_014005	CGC	2	6	25932	25937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980679
535	NC_014005	GGA	2	6	25956	25961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980679
536	NC_014005	CTT	2	6	25992	25997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980679
537	NC_014005	GGC	2	6	26032	26037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980679
538	NC_014005	GCC	2	6	26087	26092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_014005	GGC	2	6	26162	26167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980680
540	NC_014005	TCG	2	6	26187	26192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980680
541	NC_014005	CGA	3	9	26200	26208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980680
542	NC_014005	GCC	2	6	26243	26248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980680
543	NC_014005	CG	3	6	26249	26254	0 %	0 %	50 %	50 %	293980680
544	NC_014005	GCG	2	6	26287	26292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980680
545	NC_014005	CGGAAG	2	12	26313	26324	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	293980680
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547	NC_014005	TGAC	2	8	26353	26360	25 %	25 %	25 %	25 %	293980680
548	NC_014005	CTCGC	2	10	26436	26445	0 %	20 %	20 %	60 %	293980681
549	NC_014005	CG	3	6	26512	26517	0 %	0 %	50 %	50 %	293980681
550	NC_014005	TGG	2	6	26554	26559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980681
551	NC_014005	CGC	3	9	26567	26575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980681
552	NC_014005	CG	3	6	26628	26633	0 %	0 %	50 %	50 %	293980682
553	NC_014005	CG	3	6	26666	26671	0 %	0 %	50 %	50 %	293980682
554	NC_014005	CCG	2	6	26694	26699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980682
555	NC_014005	CGA	2	6	26773	26778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980682
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557	NC_014005	GC	3	6	26800	26805	0 %	0 %	50 %	50 %	293980682
558	NC_014005	C	6	6	26815	26820	0 %	0 %	0 %	100 %	293980682
559	NC_014005	GCT	2	6	26848	26853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980682
560	NC_014005	ATC	2	6	26856	26861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980682
561	NC_014005	ATC	2	6	26927	26932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980683
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565	NC_014005	TCG	3	9	27128	27136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980683
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569	NC_014005	CG	4	8	27279	27286	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
570	NC_014005	CTT	2	6	27294	27299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980683
571	NC_014005	ACGCC	2	10	27384	27393	20 %	0 %	20 %	60 %	293980683
572	NC_014005	CGC	2	6	27429	27434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980683
573	NC_014005	CG	3	6	27479	27484	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
574	NC_014005	GCG	2	6	27487	27492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980683
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588	NC_014005	CGA	2	6	27920	27925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980684
589	NC_014005	GC	3	6	27953	27958	0 %	0 %	50 %	50 %	293980684
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597	NC_014005	CG	4	8	28325	28332	0 %	0 %	50 %	50 %	293980684
598	NC_014005	GCC	4	12	28350	28361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980684
599	NC_014005	CG	3	6	28375	28380	0 %	0 %	50 %	50 %	293980684
600	NC_014005	GGC	2	6	28398	28403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980684
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611	NC_014005	GC	3	6	28832	28837	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
612	NC_014005	TGG	2	6	28865	28870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980685
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616	NC_014005	CAT	2	6	29057	29062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980685
617	NC_014005	CCCGG	2	10	29082	29091	0 %	0 %	40 %	60 %	293980685
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624	NC_014005	GCC	2	6	29490	29495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980685
625	NC_014005	CGG	2	6	29587	29592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980685
626	NC_014005	TGC	2	6	29656	29661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980685
627	NC_014005	GC	3	6	29685	29690	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
628	NC_014005	CG	5	10	29729	29738	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
629	NC_014005	CGC	2	6	29783	29788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980685
630	NC_014005	GCC	2	6	29794	29799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980685
631	NC_014005	GC	3	6	29813	29818	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
632	NC_014005	CG	3	6	29883	29888	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
633	NC_014005	GCGCC	2	10	29897	29906	0 %	0 %	40 %	60 %	293980685
634	NC_014005	CG	3	6	30024	30029	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
635	NC_014005	GCA	2	6	30065	30070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980685
636	NC_014005	GCC	2	6	30076	30081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980685
637	NC_014005	TCG	2	6	30157	30162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980685
638	NC_014005	CGAT	2	8	30288	30295	25 %	25 %	25 %	25 %	293980686
639	NC_014005	CGA	2	6	30375	30380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980686
640	NC_014005	ATC	2	6	30472	30477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980686
641	NC_014005	GGC	2	6	30637	30642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980686
642	NC_014005	CGA	2	6	30696	30701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980686
643	NC_014005	CAC	2	6	30729	30734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_014005	GTT	2	6	30801	30806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293980687
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659	NC_014005	GGC	2	6	31534	31539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_014005	ATA	2	6	31606	31611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
662	NC_014005	T	6	6	31625	31630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_014005	TCG	2	6	31703	31708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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