MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_013959	CTC	2	6	2288094	2288099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614715
49003	NC_013959	GC	3	6	2288109	2288114	0 %	0 %	50 %	50 %	291614715
49004	NC_013959	CAC	3	9	2288154	2288162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614715
49005	NC_013959	GGCGCC	2	12	2288217	2288228	0 %	0 %	50 %	50 %	291614715
49006	NC_013959	CAC	2	6	2288232	2288237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614715
49007	NC_013959	TCG	2	6	2288317	2288322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614715
49008	NC_013959	CAC	2	6	2288346	2288351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614715
49009	NC_013959	CCATG	2	10	2288354	2288363	20 %	20 %	20 %	40 %	291614715
49010	NC_013959	GAA	2	6	2288370	2288375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614715
49011	NC_013959	GCC	2	6	2288378	2288383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614715
49012	NC_013959	GC	3	6	2288424	2288429	0 %	0 %	50 %	50 %	291614715
49013	NC_013959	GCCA	2	8	2288449	2288456	25 %	0 %	25 %	50 %	291614715
49014	NC_013959	GC	3	6	2288502	2288507	0 %	0 %	50 %	50 %	291614715
49015	NC_013959	GC	3	6	2288547	2288552	0 %	0 %	50 %	50 %	291614715
49016	NC_013959	TCC	2	6	2288696	2288701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614716
49017	NC_013959	GTG	2	6	2288759	2288764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614716
49018	NC_013959	GCC	2	6	2288870	2288875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614716
49019	NC_013959	CCG	3	9	2288904	2288912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614716
49020	NC_013959	AAC	2	6	2289011	2289016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614716
49021	NC_013959	GCA	2	6	2289035	2289040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614716
49022	NC_013959	TGC	2	6	2289041	2289046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614716
49023	NC_013959	CG	3	6	2289066	2289071	0 %	0 %	50 %	50 %	291614716
49024	NC_013959	GC	3	6	2289103	2289108	0 %	0 %	50 %	50 %	291614716
49025	NC_013959	TCG	2	6	2289146	2289151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614716
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49028	NC_013959	GTG	2	6	2289311	2289316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614716
49029	NC_013959	CAC	2	6	2289325	2289330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614716
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49031	NC_013959	AGCG	2	8	2289510	2289517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49032	NC_013959	CCG	2	6	2289535	2289540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49033	NC_013959	CACC	2	8	2289543	2289550	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49034	NC_013959	GCA	2	6	2289581	2289586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49035	NC_013959	AT	3	6	2289625	2289630	50 %	50 %	0 %	0 %	291614717
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49038	NC_013959	TCACC	2	10	2289709	2289718	20 %	20 %	0 %	60 %	291614717
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49040	NC_013959	CAT	3	9	2289775	2289783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614717
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49054	NC_013959	CTT	2	6	2290228	2290233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614717
49055	NC_013959	GACTG	2	10	2290237	2290246	20 %	20 %	40 %	20 %	291614717
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49057	NC_013959	GCGG	2	8	2290289	2290296	0 %	0 %	75 %	25 %	291614717
49058	NC_013959	CATC	2	8	2290366	2290373	25 %	25 %	0 %	50 %	291614717
49059	NC_013959	CTG	2	6	2290379	2290384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614717
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49066	NC_013959	TGC	2	6	2290591	2290596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614718
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49100	NC_013959	GC	3	6	2291964	2291969	0 %	0 %	50 %	50 %	291614719
49101	NC_013959	A	8	8	2291989	2291996	100 %	0 %	0 %	0 %	291614719
49102	NC_013959	GCC	2	6	2292084	2292089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614719
49103	NC_013959	AC	3	6	2292112	2292117	50 %	0 %	0 %	50 %	291614719
49104	NC_013959	CGC	2	6	2292151	2292156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49105	NC_013959	ATG	2	6	2292190	2292195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614720
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49107	NC_013959	CTG	2	6	2292235	2292240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614720
49108	NC_013959	GAC	2	6	2292277	2292282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614720
49109	NC_013959	GC	3	6	2292288	2292293	0 %	0 %	50 %	50 %	291614720
49110	NC_013959	GCT	2	6	2292300	2292305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614720
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49112	NC_013959	GGCG	2	8	2292357	2292364	0 %	0 %	75 %	25 %	291614720
49113	NC_013959	CGC	2	6	2292375	2292380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614720
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49117	NC_013959	CTG	3	9	2292547	2292555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614720
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49235	NC_013959	GC	3	6	2298807	2298812	0 %	0 %	50 %	50 %	291614723
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49352	NC_013959	GTG	2	6	2304181	2304186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614729
49353	NC_013959	TGC	2	6	2304221	2304226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614729
49354	NC_013959	TTC	2	6	2304283	2304288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614729
49355	NC_013959	GC	3	6	2304342	2304347	0 %	0 %	50 %	50 %	291614729
49356	NC_013959	CGA	2	6	2304360	2304365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614729
49357	NC_013959	TAC	2	6	2304376	2304381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614729
49358	NC_013959	TGG	2	6	2304389	2304394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614729
49359	NC_013959	GCT	2	6	2304450	2304455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614729
49360	NC_013959	TCC	2	6	2304465	2304470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614729
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49363	NC_013959	GCC	2	6	2304675	2304680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614729
49364	NC_013959	GAGATC	2	12	2304691	2304702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291614729
49365	NC_013959	CGA	2	6	2304786	2304791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614729
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49369	NC_013959	TGG	2	6	2304950	2304955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614729
49370	NC_013959	CTG	2	6	2305012	2305017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614729
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49372	NC_013959	CAC	2	6	2305177	2305182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49373	NC_013959	CAT	2	6	2305252	2305257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614730
49374	NC_013959	CTG	2	6	2305283	2305288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614730
49375	NC_013959	CG	3	6	2305300	2305305	0 %	0 %	50 %	50 %	291614730
49376	NC_013959	ACG	3	9	2305311	2305319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614730
49377	NC_013959	CG	3	6	2305324	2305329	0 %	0 %	50 %	50 %	291614730
49378	NC_013959	GCG	2	6	2305358	2305363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614730
49379	NC_013959	TCGAT	2	10	2305374	2305383	20 %	40 %	20 %	20 %	291614730
49380	NC_013959	TGC	2	6	2305560	2305565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614730
49381	NC_013959	GAA	2	6	2305573	2305578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614730
49382	NC_013959	ACC	2	6	2305589	2305594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614730
49383	NC_013959	GGC	2	6	2305631	2305636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614730
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49385	NC_013959	TCCG	2	8	2305654	2305661	0 %	25 %	25 %	50 %	291614730
49386	NC_013959	GAGC	2	8	2305717	2305724	25 %	0 %	50 %	25 %	291614730
49387	NC_013959	GCA	2	6	2305764	2305769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614730
49388	NC_013959	GCC	2	6	2305841	2305846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49389	NC_013959	ATA	2	6	2305913	2305918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49390	NC_013959	TCA	2	6	2305945	2305950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614731
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49392	NC_013959	TCG	2	6	2306071	2306076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614731
49393	NC_013959	GGC	2	6	2306115	2306120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614731
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49420	NC_013959	CG	3	6	2307206	2307211	0 %	0 %	50 %	50 %	291614732
49421	NC_013959	TCG	2	6	2307294	2307299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614732
49422	NC_013959	ACG	2	6	2307339	2307344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614732
49423	NC_013959	CCGAAT	2	12	2307393	2307404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49424	NC_013959	CCGAG	2	10	2307502	2307511	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49425	NC_013959	ATT	2	6	2307527	2307532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49426	NC_013959	GTGAT	2	10	2307588	2307597	20 %	40 %	40 %	0 %	291614733
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49431	NC_013959	GGCCA	2	10	2307926	2307935	20 %	0 %	40 %	40 %	291614733
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49435	NC_013959	TAA	2	6	2308149	2308154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49437	NC_013959	ACCAT	2	10	2308206	2308215	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49438	NC_013959	ATCC	2	8	2308225	2308232	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49439	NC_013959	CTG	2	6	2308246	2308251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49440	NC_013959	CG	3	6	2308252	2308257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49441	NC_013959	TTG	2	6	2308319	2308324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49442	NC_013959	GCA	2	6	2308416	2308421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49443	NC_013959	TCG	2	6	2308504	2308509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614734
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49446	NC_013959	ACA	2	6	2308558	2308563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614734
49447	NC_013959	CACCAT	2	12	2308568	2308579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	291614734
49448	NC_013959	C	8	8	2308613	2308620	0 %	0 %	0 %	100 %	291614734
49449	NC_013959	TTCGA	2	10	2308650	2308659	20 %	40 %	20 %	20 %	291614734
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49451	NC_013959	CGA	2	6	2308745	2308750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614734
49452	NC_013959	GCG	2	6	2308805	2308810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614734
49453	NC_013959	CGA	2	6	2308823	2308828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614734
49454	NC_013959	TGAG	2	8	2308879	2308886	25 %	25 %	50 %	0 %	291614734
49455	NC_013959	GTG	2	6	2308902	2308907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614734
49456	NC_013959	CGG	3	9	2308910	2308918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614734
49457	NC_013959	GCT	2	6	2308938	2308943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614734
49458	NC_013959	TAC	2	6	2309043	2309048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614734
49459	NC_013959	TGG	2	6	2309068	2309073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614734
49460	NC_013959	GTC	2	6	2309118	2309123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614734
49461	NC_013959	CGT	2	6	2309159	2309164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614734
49462	NC_013959	GGCC	2	8	2309207	2309214	0 %	0 %	50 %	50 %	291614734
49463	NC_013959	GTG	2	6	2309235	2309240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614734
49464	NC_013959	TGC	2	6	2309248	2309253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614734
49465	NC_013959	TCT	2	6	2309419	2309424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614734
49466	NC_013959	TCG	2	6	2309485	2309490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614734
49467	NC_013959	CTA	2	6	2309525	2309530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614734
49468	NC_013959	GCG	2	6	2309551	2309556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614734
49469	NC_013959	TGC	2	6	2309557	2309562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614734
49470	NC_013959	CTG	2	6	2309598	2309603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614734
49471	NC_013959	GCA	2	6	2309618	2309623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614734
49472	NC_013959	GTC	2	6	2309630	2309635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614734
49473	NC_013959	TCG	2	6	2309691	2309696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49474	NC_013959	GCCA	2	8	2309728	2309735	25 %	0 %	25 %	50 %	291614735
49475	NC_013959	GCG	2	6	2309747	2309752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614735
49476	NC_013959	TTG	2	6	2309765	2309770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614735
49477	NC_013959	GC	3	6	2309772	2309777	0 %	0 %	50 %	50 %	291614735
49478	NC_013959	GCC	2	6	2309807	2309812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614735
49479	NC_013959	TCA	2	6	2309850	2309855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614735
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49481	NC_013959	CTC	2	6	2309938	2309943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614735
49482	NC_013959	TTC	3	9	2309957	2309965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614735
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49489	NC_013959	CTCTT	2	10	2310293	2310302	0 %	60 %	0 %	40 %	291614735
49490	NC_013959	CAG	2	6	2310307	2310312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614735
49491	NC_013959	CCT	2	6	2310315	2310320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614735
49492	NC_013959	ATCG	2	8	2310373	2310380	25 %	25 %	25 %	25 %	291614735
49493	NC_013959	T	6	6	2310414	2310419	0 %	100 %	0 %	0 %	291614735
49494	NC_013959	TGT	2	6	2310487	2310492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49495	NC_013959	GCGG	2	8	2310569	2310576	0 %	0 %	75 %	25 %	291614736
49496	NC_013959	GCA	2	6	2310608	2310613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614736
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49500	NC_013959	GCC	2	6	2310680	2310685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614736

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