MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_013959	GCC	2	6	2266192	2266197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48502	NC_013959	TGG	2	6	2266220	2266225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614691
48503	NC_013959	TTA	2	6	2266264	2266269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291614691
48504	NC_013959	CGC	2	6	2266304	2266309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48505	NC_013959	GCA	2	6	2266355	2266360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48506	NC_013959	CAA	2	6	2266366	2266371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614691
48507	NC_013959	CCGC	2	8	2266373	2266380	0 %	0 %	25 %	75 %	291614691
48508	NC_013959	CTC	2	6	2266385	2266390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614691
48509	NC_013959	GA	3	6	2266424	2266429	50 %	0 %	50 %	0 %	291614691
48510	NC_013959	GTG	2	6	2266462	2266467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614691
48511	NC_013959	GCC	2	6	2266494	2266499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48512	NC_013959	GCC	2	6	2266513	2266518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48513	NC_013959	CTT	2	6	2266524	2266529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614691
48514	NC_013959	CCTCGA	2	12	2266548	2266559	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291614691
48515	NC_013959	GCA	2	6	2266602	2266607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48516	NC_013959	TGCG	2	8	2266630	2266637	0 %	25 %	50 %	25 %	291614691
48517	NC_013959	CGG	2	6	2266638	2266643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614691
48518	NC_013959	CAT	2	6	2266644	2266649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614691
48519	NC_013959	TGC	2	6	2266673	2266678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48520	NC_013959	CGA	3	9	2266698	2266706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48521	NC_013959	CTG	2	6	2266774	2266779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48522	NC_013959	CG	4	8	2266782	2266789	0 %	0 %	50 %	50 %	291614691
48523	NC_013959	AGGCC	2	10	2266809	2266818	20 %	0 %	40 %	40 %	291614691
48524	NC_013959	CGG	2	6	2266904	2266909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614691
48525	NC_013959	TAC	2	6	2266918	2266923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614691
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48527	NC_013959	GCC	2	6	2267035	2267040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48528	NC_013959	CTG	2	6	2267053	2267058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48529	NC_013959	GCA	2	6	2267070	2267075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48530	NC_013959	GCT	2	6	2267079	2267084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48531	NC_013959	TTC	2	6	2267119	2267124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614691
48532	NC_013959	CG	3	6	2267142	2267147	0 %	0 %	50 %	50 %	291614691
48533	NC_013959	ACC	2	6	2267266	2267271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614691
48534	NC_013959	GCT	2	6	2267273	2267278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48535	NC_013959	CCG	2	6	2267282	2267287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48536	NC_013959	CCCA	2	8	2267292	2267299	25 %	0 %	0 %	75 %	291614691
48537	NC_013959	CGC	2	6	2267311	2267316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48538	NC_013959	TGC	3	9	2267372	2267380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48539	NC_013959	GCC	2	6	2267396	2267401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48540	NC_013959	CGC	2	6	2267604	2267609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48541	NC_013959	TGC	2	6	2267633	2267638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48542	NC_013959	GGT	2	6	2267670	2267675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614691
48543	NC_013959	AGC	2	6	2267681	2267686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48544	NC_013959	CG	3	6	2267694	2267699	0 %	0 %	50 %	50 %	291614691
48545	NC_013959	ACCTCG	2	12	2267717	2267728	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291614691
48546	NC_013959	CTG	3	9	2267749	2267757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48547	NC_013959	GCG	3	9	2267822	2267830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614691
48548	NC_013959	CGG	2	6	2267831	2267836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614691
48549	NC_013959	GCGCC	2	10	2267886	2267895	0 %	0 %	40 %	60 %	291614691
48550	NC_013959	GCA	2	6	2267898	2267903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48551	NC_013959	CCG	3	9	2267915	2267923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48552	NC_013959	GC	3	6	2267946	2267951	0 %	0 %	50 %	50 %	291614691
48553	NC_013959	CGC	2	6	2268003	2268008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48554	NC_013959	CGGCTT	2	12	2268009	2268020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48555	NC_013959	GAG	2	6	2268022	2268027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291614691
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48558	NC_013959	TGC	2	6	2268059	2268064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
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48560	NC_013959	GCC	2	6	2268145	2268150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48561	NC_013959	GCT	2	6	2268201	2268206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
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48564	NC_013959	GCTCAC	2	12	2268477	2268488	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291614691
48565	NC_013959	GCC	2	6	2268569	2268574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614691
48566	NC_013959	TGC	2	6	2268629	2268634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
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48568	NC_013959	GCT	2	6	2268717	2268722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614691
48569	NC_013959	GC	3	6	2268730	2268735	0 %	0 %	50 %	50 %	291614691
48570	NC_013959	CCA	3	9	2268795	2268803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614691
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48572	NC_013959	CAT	3	9	2268870	2268878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614691
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48582	NC_013959	CAAG	2	8	2269182	2269189	50 %	0 %	25 %	25 %	291614691
48583	NC_013959	AC	3	6	2269207	2269212	50 %	0 %	0 %	50 %	291614691
48584	NC_013959	ACC	2	6	2269225	2269230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614691
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48588	NC_013959	CCA	2	6	2269284	2269289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614691
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48597	NC_013959	CCG	2	6	2269711	2269716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48598	NC_013959	AT	3	6	2269731	2269736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48599	NC_013959	CAT	2	6	2269781	2269786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48600	NC_013959	GAG	2	6	2269798	2269803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48601	NC_013959	GGA	2	6	2269874	2269879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291614692
48602	NC_013959	TGC	2	6	2269900	2269905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614692
48603	NC_013959	TGAT	2	8	2269912	2269919	25 %	50 %	25 %	0 %	291614692
48604	NC_013959	CGGCA	2	10	2269975	2269984	20 %	0 %	40 %	40 %	291614692
48605	NC_013959	TGT	2	6	2269993	2269998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614692
48606	NC_013959	AGG	2	6	2270065	2270070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291614692
48607	NC_013959	ACT	2	6	2270082	2270087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614693
48608	NC_013959	CGA	2	6	2270093	2270098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614693
48609	NC_013959	GAC	2	6	2270100	2270105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614693
48610	NC_013959	AC	3	6	2270166	2270171	50 %	0 %	0 %	50 %	291614693
48611	NC_013959	GTG	2	6	2270205	2270210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614693
48612	NC_013959	CTG	2	6	2270211	2270216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614693
48613	NC_013959	GC	4	8	2270220	2270227	0 %	0 %	50 %	50 %	291614693
48614	NC_013959	TCA	2	6	2270337	2270342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614694
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48616	NC_013959	CTT	2	6	2270375	2270380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614694
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48849	NC_013959	TG	3	6	2280911	2280916	0 %	50 %	50 %	0 %	291614704
48850	NC_013959	TTC	2	6	2280935	2280940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614704
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48855	NC_013959	TA	3	6	2281116	2281121	50 %	50 %	0 %	0 %	291614704
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48860	NC_013959	CAT	2	6	2281337	2281342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614705
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48953	NC_013959	CGG	2	6	2285607	2285612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614712
48954	NC_013959	CGAG	2	8	2285693	2285700	25 %	0 %	50 %	25 %	291614712
48955	NC_013959	TCA	2	6	2285786	2285791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614712
48956	NC_013959	CGC	2	6	2285795	2285800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614712
48957	NC_013959	CGT	2	6	2285837	2285842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614712
48958	NC_013959	TCC	2	6	2285914	2285919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48959	NC_013959	GCA	2	6	2286015	2286020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614713
48960	NC_013959	GTG	2	6	2286050	2286055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614713
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