MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_013959	CAG	2	6	824978	824983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613308
18003	NC_013959	ATC	2	6	824997	825002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613308
18004	NC_013959	ATGG	2	8	825006	825013	25 %	25 %	50 %	0 %	291613308
18005	NC_013959	TCT	2	6	825149	825154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613309
18006	NC_013959	GCG	2	6	825204	825209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613309
18007	NC_013959	CGA	2	6	825298	825303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613309
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18009	NC_013959	GGC	2	6	825343	825348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613309
18010	NC_013959	CGA	2	6	825367	825372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613309
18011	NC_013959	GGCT	2	8	825390	825397	0 %	25 %	50 %	25 %	291613309
18012	NC_013959	CAC	2	6	825690	825695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613309
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18014	NC_013959	GCT	2	6	825713	825718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613309
18015	NC_013959	CTG	2	6	825804	825809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613309
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18018	NC_013959	GAC	2	6	825845	825850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613309
18019	NC_013959	CGC	2	6	825926	825931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613309
18020	NC_013959	TCG	2	6	825975	825980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613309
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18028	NC_013959	CCAT	2	8	826428	826435	25 %	25 %	0 %	50 %	291613309
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18055	NC_013959	CTG	2	6	827462	827467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613311
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18061	NC_013959	GAT	2	6	827567	827572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613311
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18122	NC_013959	GCT	2	6	829731	829736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18123	NC_013959	GTT	2	6	829742	829747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_013959	CTTG	2	8	829787	829794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18125	NC_013959	GCC	2	6	829806	829811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18126	NC_013959	TGCCGA	2	12	829844	829855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18127	NC_013959	T	6	6	829887	829892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18128	NC_013959	GCC	2	6	829909	829914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18129	NC_013959	CAC	3	9	829938	829946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18130	NC_013959	GCC	3	9	829959	829967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18131	NC_013959	TGCC	2	8	829982	829989	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18132	NC_013959	ATG	2	6	830029	830034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18136	NC_013959	CGT	2	6	830075	830080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18139	NC_013959	CG	3	6	830132	830137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18140	NC_013959	GC	3	6	830144	830149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18141	NC_013959	TCG	2	6	830161	830166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18144	NC_013959	CTG	2	6	830283	830288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18153	NC_013959	CG	3	6	830628	830633	0 %	0 %	50 %	50 %	291613312
18154	NC_013959	GT	3	6	830659	830664	0 %	50 %	50 %	0 %	291613312
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18368	NC_013959	AGC	2	6	840077	840082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18369	NC_013959	TCA	2	6	840112	840117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613321
18370	NC_013959	TTC	2	6	840127	840132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613321
18371	NC_013959	T	6	6	840148	840153	0 %	100 %	0 %	0 %	291613321
18372	NC_013959	TCG	2	6	840299	840304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613321
18373	NC_013959	TCG	2	6	840377	840382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613322
18374	NC_013959	TTGCCG	2	12	840421	840432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613322
18375	NC_013959	TCG	2	6	840505	840510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613322
18376	NC_013959	GTTC	2	8	840560	840567	0 %	50 %	25 %	25 %	291613322
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18379	NC_013959	CTT	2	6	840692	840697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613322
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18381	NC_013959	TCG	2	6	840718	840723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613322
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18386	NC_013959	T	7	7	841073	841079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18387	NC_013959	GCA	2	6	841096	841101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18389	NC_013959	TTC	2	6	841150	841155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18390	NC_013959	GCCT	2	8	841252	841259	0 %	25 %	25 %	50 %	291613324
18391	NC_013959	GCG	2	6	841268	841273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613324
18392	NC_013959	TCG	2	6	841289	841294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613324
18393	NC_013959	GTC	2	6	841303	841308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613324
18394	NC_013959	CGC	2	6	841329	841334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613324
18395	NC_013959	TCG	2	6	841352	841357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613324
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18474	NC_013959	CGG	2	6	844339	844344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18475	NC_013959	GC	3	6	844381	844386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18476	NC_013959	T	6	6	844409	844414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18477	NC_013959	TGCA	2	8	844469	844476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18479	NC_013959	TGT	2	6	844539	844544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613326
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18483	NC_013959	TGA	2	6	844665	844670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613326
18484	NC_013959	CTG	2	6	844687	844692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613326
18485	NC_013959	GCT	2	6	844708	844713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613326
18486	NC_013959	CGT	3	9	844768	844776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613326
18487	NC_013959	TGG	2	6	844791	844796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613326
18488	NC_013959	TATC	2	8	844834	844841	25 %	50 %	0 %	25 %	291613326
18489	NC_013959	TCA	2	6	844848	844853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613326
18490	NC_013959	CCA	2	6	844854	844859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613326
18491	NC_013959	TCGGC	2	10	844935	844944	0 %	20 %	40 %	40 %	291613326
18492	NC_013959	TGC	2	6	844965	844970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613326
18493	NC_013959	TCG	2	6	845022	845027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613326
18494	NC_013959	TCA	2	6	845043	845048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613326
18495	NC_013959	CTG	2	6	845057	845062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613326
18496	NC_013959	TG	3	6	845165	845170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18497	NC_013959	CG	3	6	845278	845283	0 %	0 %	50 %	50 %	291613327
18498	NC_013959	CCG	2	6	845426	845431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613327
18499	NC_013959	GC	3	6	845437	845442	0 %	0 %	50 %	50 %	291613327
18500	NC_013959	GGT	2	6	845443	845448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613327

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