MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_013959	GCAC	2	8	691743	691750	25 %	0 %	25 %	50 %	291613156
15002	NC_013959	TTG	2	6	691770	691775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613156
15003	NC_013959	TTGACG	2	12	691779	691790	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291613156
15004	NC_013959	CTGT	2	8	691807	691814	0 %	50 %	25 %	25 %	291613156
15005	NC_013959	CGC	3	9	691864	691872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613156
15006	NC_013959	GCC	2	6	691895	691900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613156
15007	NC_013959	GATGC	2	10	691911	691920	20 %	20 %	40 %	20 %	291613156
15008	NC_013959	TGC	3	9	691918	691926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613156
15009	NC_013959	CGC	2	6	691952	691957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613156
15010	NC_013959	GGC	2	6	691958	691963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613156
15011	NC_013959	GTTCG	2	10	691978	691987	0 %	40 %	40 %	20 %	291613156
15012	NC_013959	GTC	3	9	692006	692014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613156
15013	NC_013959	TCA	2	6	692050	692055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613156
15014	NC_013959	GCT	2	6	692153	692158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613156
15015	NC_013959	TGA	2	6	692194	692199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613156
15016	NC_013959	CGATGT	2	12	692362	692373	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291613156
15017	NC_013959	GAC	2	6	692429	692434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613156
15018	NC_013959	TGC	2	6	692456	692461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613156
15019	NC_013959	GAC	2	6	692480	692485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613156
15020	NC_013959	CTG	2	6	692540	692545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613156
15021	NC_013959	CGA	2	6	692590	692595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613156
15022	NC_013959	AGT	2	6	692616	692621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613156
15023	NC_013959	CG	3	6	692623	692628	0 %	0 %	50 %	50 %	291613156
15024	NC_013959	TGT	2	6	692641	692646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_013959	CAT	2	6	692674	692679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15026	NC_013959	TA	3	6	692710	692715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_013959	TCG	2	6	692817	692822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613157
15028	NC_013959	T	6	6	692912	692917	0 %	100 %	0 %	0 %	291613157
15029	NC_013959	CGT	2	6	692956	692961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613157
15030	NC_013959	GCA	2	6	693040	693045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613157
15031	NC_013959	ATGCG	2	10	693101	693110	20 %	20 %	40 %	20 %	291613157
15032	NC_013959	GGCA	2	8	693140	693147	25 %	0 %	50 %	25 %	291613157
15033	NC_013959	GCA	2	6	693169	693174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613157
15034	NC_013959	CGCTT	2	10	693209	693218	0 %	40 %	20 %	40 %	291613157
15035	NC_013959	GCG	2	6	693223	693228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613157
15036	NC_013959	GCT	2	6	693264	693269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613157
15037	NC_013959	GAT	2	6	693273	693278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613157
15038	NC_013959	ACTG	2	8	693288	693295	25 %	25 %	25 %	25 %	291613157
15039	NC_013959	GCCTGC	2	12	693389	693400	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291613157
15040	NC_013959	GGC	2	6	693407	693412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613157
15041	NC_013959	GCC	2	6	693425	693430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613157
15042	NC_013959	GAT	2	6	693440	693445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613157
15043	NC_013959	GGC	2	6	693494	693499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613157
15044	NC_013959	GGC	2	6	693542	693547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613157
15045	NC_013959	AGC	2	6	693612	693617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613157
15046	NC_013959	CG	3	6	693659	693664	0 %	0 %	50 %	50 %	291613157
15047	NC_013959	GTC	2	6	693683	693688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613157
15048	NC_013959	GTG	2	6	693722	693727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613157
15049	NC_013959	GGCAT	2	10	693873	693882	20 %	20 %	40 %	20 %	291613157
15050	NC_013959	CCA	2	6	693892	693897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613157
15051	NC_013959	CGC	2	6	693913	693918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613157
15052	NC_013959	CAG	2	6	694016	694021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613157
15053	NC_013959	TGGA	2	8	694069	694076	25 %	25 %	50 %	0 %	291613157
15054	NC_013959	CAG	2	6	694085	694090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613157
15055	NC_013959	CGC	2	6	694126	694131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613157
15056	NC_013959	CGC	2	6	694189	694194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613157
15057	NC_013959	TTG	2	6	694278	694283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_013959	GGC	2	6	694371	694376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613158
15059	NC_013959	GTC	2	6	694446	694451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613158
15060	NC_013959	GCA	2	6	694469	694474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613158
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15062	NC_013959	GGAA	2	8	694634	694641	50 %	0 %	50 %	0 %	291613158
15063	NC_013959	GCG	2	6	694663	694668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613158
15064	NC_013959	CAG	3	9	694728	694736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613158
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15067	NC_013959	ATG	2	6	694864	694869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613158
15068	NC_013959	GCA	2	6	694934	694939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613158
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15070	NC_013959	CAG	2	6	695079	695084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613158
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15072	NC_013959	GCTG	2	8	695258	695265	0 %	25 %	50 %	25 %	291613158
15073	NC_013959	GAT	2	6	695271	695276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613158
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15076	NC_013959	GC	3	6	695406	695411	0 %	0 %	50 %	50 %	291613158
15077	NC_013959	TGA	2	6	695450	695455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613158
15078	NC_013959	CAG	2	6	695478	695483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613158
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15081	NC_013959	GCG	2	6	695519	695524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613158
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15083	NC_013959	GCG	2	6	695558	695563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613158
15084	NC_013959	GCGG	2	8	695597	695604	0 %	0 %	75 %	25 %	291613158
15085	NC_013959	GATG	2	8	695615	695622	25 %	25 %	50 %	0 %	291613158
15086	NC_013959	TCG	2	6	695629	695634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613158
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15089	NC_013959	CG	3	6	695745	695750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15090	NC_013959	GCG	3	9	695801	695809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_013959	CAA	2	6	695832	695837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15092	NC_013959	CAT	2	6	695956	695961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613159
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15097	NC_013959	ATGCG	2	10	696084	696093	20 %	20 %	40 %	20 %	291613159
15098	NC_013959	AC	3	6	696178	696183	50 %	0 %	0 %	50 %	291613159
15099	NC_013959	GGA	2	6	696193	696198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291613159
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15101	NC_013959	TGA	3	9	696216	696224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613159
15102	NC_013959	CGG	2	6	696280	696285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613159
15103	NC_013959	TGGCGC	2	12	696300	696311	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291613159
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15106	NC_013959	CGGA	2	8	696498	696505	25 %	0 %	50 %	25 %	291613159
15107	NC_013959	CAT	2	6	696508	696513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613159
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15111	NC_013959	TGA	2	6	696737	696742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613160
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15233	NC_013959	TACGG	2	10	701548	701557	20 %	20 %	40 %	20 %	291613166
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15248	NC_013959	AAAG	2	8	702761	702768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15249	NC_013959	T	6	6	702786	702791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15250	NC_013959	TGC	2	6	702848	702853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613169
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15356	NC_013959	CAA	2	6	707316	707321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613175
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15479	NC_013959	GCGA	2	8	713668	713675	25 %	0 %	50 %	25 %	291613180
15480	NC_013959	CTG	2	6	713707	713712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613180
15481	NC_013959	GTG	2	6	713725	713730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613180
15482	NC_013959	GC	3	6	713750	713755	0 %	0 %	50 %	50 %	291613180
15483	NC_013959	GC	3	6	713791	713796	0 %	0 %	50 %	50 %	291613180
15484	NC_013959	GAT	2	6	713911	713916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613180
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15487	NC_013959	GCTG	2	8	714005	714012	0 %	25 %	50 %	25 %	291613180
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