MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_013959	GGA	2	6	670772	670777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291613135
14502	NC_013959	GTG	2	6	670794	670799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613135
14503	NC_013959	AGC	2	6	670819	670824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613135
14504	NC_013959	TGCA	2	8	670854	670861	25 %	25 %	25 %	25 %	291613135
14505	NC_013959	GC	3	6	670898	670903	0 %	0 %	50 %	50 %	291613135
14506	NC_013959	CGG	2	6	670925	670930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613135
14507	NC_013959	GAATT	2	10	670958	670967	40 %	40 %	20 %	0 %	291613135
14508	NC_013959	CAG	2	6	670981	670986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14509	NC_013959	CCA	2	6	670996	671001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14510	NC_013959	TCT	2	6	671025	671030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14511	NC_013959	TCT	2	6	671106	671111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14512	NC_013959	ACA	2	6	671208	671213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613136
14513	NC_013959	ATC	2	6	671297	671302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613136
14514	NC_013959	GC	3	6	671363	671368	0 %	0 %	50 %	50 %	291613136
14515	NC_013959	GAT	2	6	671468	671473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_013959	TGA	2	6	671476	671481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_013959	TC	3	6	671558	671563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14518	NC_013959	GC	4	8	671620	671627	0 %	0 %	50 %	50 %	291613137
14519	NC_013959	CG	4	8	671680	671687	0 %	0 %	50 %	50 %	291613137
14520	NC_013959	GC	3	6	671693	671698	0 %	0 %	50 %	50 %	291613137
14521	NC_013959	GCC	2	6	671816	671821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613137
14522	NC_013959	CGG	2	6	671843	671848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613137
14523	NC_013959	GC	3	6	671868	671873	0 %	0 %	50 %	50 %	291613137
14524	NC_013959	CCA	2	6	671911	671916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613137
14525	NC_013959	GTGGAT	2	12	672011	672022	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291613137
14526	NC_013959	TGA	2	6	672049	672054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613137
14527	NC_013959	AGC	2	6	672115	672120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613137
14528	NC_013959	TCAGCG	2	12	672178	672189	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291613137
14529	NC_013959	GCA	2	6	672208	672213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613137
14530	NC_013959	TGC	2	6	672234	672239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613137
14531	NC_013959	ACTG	2	8	672263	672270	25 %	25 %	25 %	25 %	291613137
14532	NC_013959	TGC	2	6	672349	672354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613137
14533	NC_013959	CCT	2	6	672379	672384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291613137
14534	NC_013959	CG	3	6	672414	672419	0 %	0 %	50 %	50 %	291613137
14535	NC_013959	CAC	2	6	672479	672484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613137
14536	NC_013959	GTC	2	6	672494	672499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613137
14537	NC_013959	ATG	2	6	672591	672596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613137
14538	NC_013959	CGA	3	9	672610	672618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613137
14539	NC_013959	TGC	2	6	672661	672666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613137
14540	NC_013959	TGT	2	6	672691	672696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613137
14541	NC_013959	GC	3	6	672704	672709	0 %	0 %	50 %	50 %	291613137
14542	NC_013959	CG	3	6	672748	672753	0 %	0 %	50 %	50 %	291613137
14543	NC_013959	AGC	2	6	672807	672812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613137
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14545	NC_013959	GCT	2	6	672931	672936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613137
14546	NC_013959	GGC	2	6	672982	672987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613137
14547	NC_013959	CGG	4	12	672994	673005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613137
14548	NC_013959	CG	3	6	673085	673090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14549	NC_013959	GCATC	2	10	673240	673249	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14550	NC_013959	ATC	2	6	673277	673282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14551	NC_013959	AATT	2	8	673341	673348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_013959	GCC	2	6	673417	673422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613138
14553	NC_013959	CGT	2	6	673501	673506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613138
14554	NC_013959	CGA	2	6	673537	673542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613138
14555	NC_013959	GGGC	2	8	673546	673553	0 %	0 %	75 %	25 %	291613138
14556	NC_013959	GTC	2	6	673574	673579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613138
14557	NC_013959	TGA	2	6	673587	673592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613138
14558	NC_013959	AAAAC	2	10	673626	673635	80 %	0 %	0 %	20 %	291613138
14559	NC_013959	GGA	2	6	673636	673641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291613138
14560	NC_013959	CAT	2	6	673690	673695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14561	NC_013959	TCG	2	6	673743	673748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14562	NC_013959	TCG	2	6	673799	673804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613139
14563	NC_013959	GT	4	8	673900	673907	0 %	50 %	50 %	0 %	291613139
14564	NC_013959	TGC	2	6	673931	673936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613139
14565	NC_013959	GTTC	2	8	673947	673954	0 %	50 %	25 %	25 %	291613139
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14570	NC_013959	GTC	2	6	674194	674199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613139
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14585	NC_013959	CAG	2	6	675081	675086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14586	NC_013959	TCATTT	2	12	675107	675118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14587	NC_013959	GCC	2	6	675134	675139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613141
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14589	NC_013959	GTT	2	6	675211	675216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613141
14590	NC_013959	ACC	3	9	675242	675250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613141
14591	NC_013959	GGCT	2	8	675257	675264	0 %	25 %	50 %	25 %	291613141
14592	NC_013959	TGC	2	6	675363	675368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613141
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14599	NC_013959	GGC	2	6	675606	675611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613141
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14601	NC_013959	CAT	2	6	675654	675659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613141
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14604	NC_013959	CTT	2	6	675811	675816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613141
14605	NC_013959	ACC	2	6	675902	675907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613141
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14607	NC_013959	GC	4	8	675975	675982	0 %	0 %	50 %	50 %	291613141
14608	NC_013959	GCG	2	6	676029	676034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613141
14609	NC_013959	GCT	2	6	676054	676059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613141
14610	NC_013959	GC	3	6	676072	676077	0 %	0 %	50 %	50 %	291613141
14611	NC_013959	CAG	2	6	676081	676086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613141
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14615	NC_013959	CGCC	2	8	676233	676240	0 %	0 %	25 %	75 %	291613141
14616	NC_013959	AGC	2	6	676265	676270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613141
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14618	NC_013959	GTCT	2	8	676399	676406	0 %	50 %	25 %	25 %	291613142
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14975	NC_013959	CTT	2	6	690768	690773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613155
14976	NC_013959	GTC	2	6	690801	690806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613156
14977	NC_013959	AGTC	2	8	690829	690836	25 %	25 %	25 %	25 %	291613156
14978	NC_013959	TGC	2	6	690847	690852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613156
14979	NC_013959	TGA	3	9	690889	690897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613156
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14983	NC_013959	GCT	2	6	691055	691060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613156
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