MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013959	GGC	2	6	573363	573368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613032
12502	NC_013959	GC	3	6	573380	573385	0 %	0 %	50 %	50 %	291613032
12503	NC_013959	TTG	2	6	573405	573410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613032
12504	NC_013959	ACG	2	6	573495	573500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613032
12505	NC_013959	AGC	2	6	573512	573517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613032
12506	NC_013959	TCG	2	6	573522	573527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613032
12507	NC_013959	GCTT	2	8	573671	573678	0 %	50 %	25 %	25 %	291613033
12508	NC_013959	CTT	2	6	573691	573696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613033
12509	NC_013959	GCG	2	6	573708	573713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613033
12510	NC_013959	TGC	2	6	573723	573728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613033
12511	NC_013959	TGG	2	6	573753	573758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613033
12512	NC_013959	GCTGT	2	10	573791	573800	0 %	40 %	40 %	20 %	291613033
12513	NC_013959	GCT	2	6	573821	573826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613033
12514	NC_013959	GC	3	6	573830	573835	0 %	0 %	50 %	50 %	291613033
12515	NC_013959	GGGT	2	8	573858	573865	0 %	25 %	75 %	0 %	291613033
12516	NC_013959	T	6	6	573879	573884	0 %	100 %	0 %	0 %	291613033
12517	NC_013959	TAC	2	6	573927	573932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_013959	GCG	2	6	573974	573979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_013959	GCT	2	6	574013	574018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613034
12520	NC_013959	GAC	2	6	574030	574035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613034
12521	NC_013959	ATT	2	6	574081	574086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291613034
12522	NC_013959	CGT	2	6	574141	574146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613034
12523	NC_013959	GC	4	8	574170	574177	0 %	0 %	50 %	50 %	291613034
12524	NC_013959	TCGC	2	8	574298	574305	0 %	25 %	25 %	50 %	291613034
12525	NC_013959	GCAG	2	8	574507	574514	25 %	0 %	50 %	25 %	291613034
12526	NC_013959	GCG	2	6	574525	574530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613034
12527	NC_013959	GCC	2	6	574637	574642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613034
12528	NC_013959	T	8	8	574722	574729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_013959	GCA	2	6	574839	574844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_013959	CGC	2	6	574862	574867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12531	NC_013959	GGGC	2	8	574907	574914	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12532	NC_013959	AAG	2	6	574916	574921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_013959	AGG	2	6	574928	574933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_013959	AGC	2	6	574942	574947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613035
12535	NC_013959	GC	3	6	574992	574997	0 %	0 %	50 %	50 %	291613035
12536	NC_013959	TCA	2	6	575297	575302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613035
12537	NC_013959	CGA	2	6	575304	575309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613035
12538	NC_013959	AGG	2	6	575420	575425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_013959	AT	3	6	575446	575451	50 %	50 %	0 %	0 %	291613036
12540	NC_013959	GTG	2	6	575499	575504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613036
12541	NC_013959	ACCGG	2	10	575535	575544	20 %	0 %	40 %	40 %	291613036
12542	NC_013959	GCG	2	6	575625	575630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613036
12543	NC_013959	CGA	2	6	575729	575734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613036
12544	NC_013959	AAC	2	6	575772	575777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613036
12545	NC_013959	GACAT	2	10	575842	575851	40 %	20 %	20 %	20 %	291613037
12546	NC_013959	ACC	2	6	575853	575858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613037
12547	NC_013959	AGC	2	6	575868	575873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613037
12548	NC_013959	GCG	2	6	575901	575906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613037
12549	NC_013959	GCT	2	6	575948	575953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613037
12550	NC_013959	GAA	2	6	575966	575971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613037
12551	NC_013959	ATCA	2	8	576045	576052	50 %	25 %	0 %	25 %	291613037
12552	NC_013959	GAT	2	6	576119	576124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613037
12553	NC_013959	GATC	2	8	576155	576162	25 %	25 %	25 %	25 %	291613037
12554	NC_013959	GCG	2	6	576183	576188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613037
12555	NC_013959	CGG	2	6	576205	576210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613037
12556	NC_013959	GCA	2	6	576272	576277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613037
12557	NC_013959	CGT	2	6	576290	576295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613037
12558	NC_013959	GGT	2	6	576378	576383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613037
12559	NC_013959	CAG	2	6	576389	576394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613037
12560	NC_013959	CGA	2	6	576397	576402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613037
12561	NC_013959	TGGTC	2	10	576413	576422	0 %	40 %	40 %	20 %	291613037
12562	NC_013959	AAC	2	6	576423	576428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613037
12563	NC_013959	GTG	2	6	576445	576450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613037
12564	NC_013959	TGGGTA	2	12	576457	576468	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291613037
12565	NC_013959	AGG	2	6	576549	576554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_013959	CAA	2	6	576569	576574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613038
12567	NC_013959	CAA	2	6	576622	576627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613038
12568	NC_013959	CGGT	2	8	576645	576652	0 %	25 %	50 %	25 %	291613038
12569	NC_013959	CG	3	6	576735	576740	0 %	0 %	50 %	50 %	291613038
12570	NC_013959	GCA	2	6	576754	576759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613038
12571	NC_013959	ACC	2	6	576782	576787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613038
12572	NC_013959	CTT	2	6	576823	576828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613038
12573	NC_013959	ACA	2	6	576837	576842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613038
12574	NC_013959	CTT	2	6	577116	577121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613038
12575	NC_013959	CGA	2	6	577122	577127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613038
12576	NC_013959	GGGC	2	8	577141	577148	0 %	0 %	75 %	25 %	291613038
12577	NC_013959	TCGCT	2	10	577155	577164	0 %	40 %	20 %	40 %	291613038
12578	NC_013959	CAA	2	6	577182	577187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613038
12579	NC_013959	GCG	2	6	577266	577271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613038
12580	NC_013959	CGG	2	6	577284	577289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613038
12581	NC_013959	GGC	2	6	577322	577327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613038
12582	NC_013959	GCG	2	6	577331	577336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613038
12583	NC_013959	GCA	2	6	577377	577382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613038
12584	NC_013959	CAA	2	6	577555	577560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613038
12585	NC_013959	CGC	2	6	577590	577595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613038
12586	NC_013959	TGG	2	6	577596	577601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613038
12587	NC_013959	GT	3	6	577704	577709	0 %	50 %	50 %	0 %	291613038
12588	NC_013959	TGC	2	6	577749	577754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613038
12589	NC_013959	GAG	2	6	577790	577795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_013959	GCA	3	9	577849	577857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613039
12591	NC_013959	TGG	2	6	577938	577943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613039
12592	NC_013959	TGC	2	6	578121	578126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613039
12593	NC_013959	CCG	2	6	578192	578197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613039
12594	NC_013959	ACC	2	6	578246	578251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613039
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12596	NC_013959	GTG	3	9	578267	578275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613039
12597	NC_013959	CCCG	2	8	578299	578306	0 %	0 %	25 %	75 %	291613039
12598	NC_013959	CGCCGA	2	12	578362	578373	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291613039
12599	NC_013959	GTG	2	6	578387	578392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613039
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12601	NC_013959	TGG	2	6	578424	578429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613039
12602	NC_013959	CAG	2	6	578471	578476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613039
12603	NC_013959	CGG	2	6	578493	578498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613039
12604	NC_013959	CAG	2	6	578518	578523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613039
12605	NC_013959	CAA	2	6	578635	578640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613040
12606	NC_013959	CG	4	8	578676	578683	0 %	0 %	50 %	50 %	291613040
12607	NC_013959	CTG	2	6	578696	578701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613040
12608	NC_013959	GTC	2	6	578731	578736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613040
12609	NC_013959	GCA	2	6	578737	578742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613040
12610	NC_013959	TTCC	2	8	578751	578758	0 %	50 %	0 %	50 %	291613040
12611	NC_013959	GCA	2	6	578824	578829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613040
12612	NC_013959	TTC	2	6	578870	578875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613040
12613	NC_013959	CCA	2	6	579003	579008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613040
12614	NC_013959	GGTCAC	2	12	579034	579045	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291613040
12615	NC_013959	GCA	2	6	579078	579083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613040
12616	NC_013959	TCA	2	6	579099	579104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613040
12617	NC_013959	TGG	2	6	579243	579248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613040
12618	NC_013959	GC	3	6	579277	579282	0 %	0 %	50 %	50 %	291613040
12619	NC_013959	TGC	2	6	579324	579329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613040
12620	NC_013959	TGAG	2	8	579347	579354	25 %	25 %	50 %	0 %	291613040
12621	NC_013959	GCTGGC	2	12	579391	579402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291613041
12622	NC_013959	TCG	2	6	579404	579409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613041
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12625	NC_013959	GC	3	6	579547	579552	0 %	0 %	50 %	50 %	291613041
12626	NC_013959	GAC	2	6	579592	579597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613041
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12638	NC_013959	GTT	2	6	580187	580192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613042
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12644	NC_013959	GTGACG	2	12	580422	580433	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291613042
12645	NC_013959	GCC	2	6	580442	580447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613042
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12668	NC_013959	CGCAG	2	10	581419	581428	20 %	0 %	40 %	40 %	291613043
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12684	NC_013959	AGCCA	2	10	582207	582216	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12685	NC_013959	GC	3	6	582274	582279	0 %	0 %	50 %	50 %	291613044
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12732	NC_013959	CGA	2	6	584350	584355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613045
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12736	NC_013959	CGAC	2	8	584515	584522	25 %	0 %	25 %	50 %	291613045
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12978	NC_013959	AGC	2	6	596658	596663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613055
12979	NC_013959	GTC	2	6	596702	596707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613055
12980	NC_013959	G	6	6	596750	596755	0 %	0 %	100 %	0 %	291613055
12981	NC_013959	TC	3	6	596797	596802	0 %	50 %	0 %	50 %	291613055
12982	NC_013959	GCTC	2	8	596860	596867	0 %	25 %	25 %	50 %	291613055
12983	NC_013959	CAT	2	6	596888	596893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613055
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12989	NC_013959	CTT	2	6	597307	597312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613055
12990	NC_013959	GCT	2	6	597394	597399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613055
12991	NC_013959	GTG	2	6	597454	597459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613055
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