MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013959	GTCAA	2	10	551206	551215	40 %	20 %	20 %	20 %	291613013
12003	NC_013959	CTG	2	6	551226	551231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613013
12004	NC_013959	AAG	2	6	551238	551243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613013
12005	NC_013959	GAAA	2	8	551286	551293	75 %	0 %	25 %	0 %	291613013
12006	NC_013959	GAA	2	6	551363	551368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613013
12007	NC_013959	CGC	2	6	551631	551636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613013
12008	NC_013959	G	6	6	551649	551654	0 %	0 %	100 %	0 %	291613013
12009	NC_013959	AGA	2	6	551660	551665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613013
12010	NC_013959	GTC	2	6	551690	551695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613013
12011	NC_013959	GCTGT	2	10	551697	551706	0 %	40 %	40 %	20 %	291613013
12012	NC_013959	CCG	2	6	551738	551743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613013
12013	NC_013959	CAT	2	6	551750	551755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613013
12014	NC_013959	TGA	2	6	551758	551763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613013
12015	NC_013959	GGC	2	6	551796	551801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613013
12016	NC_013959	AAC	2	6	552019	552024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613014
12017	NC_013959	TGG	2	6	552025	552030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613014
12018	NC_013959	AGC	2	6	552031	552036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613014
12019	NC_013959	ATCA	2	8	552039	552046	50 %	25 %	0 %	25 %	291613014
12020	NC_013959	CTG	2	6	552079	552084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613014
12021	NC_013959	GTG	2	6	552085	552090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613014
12022	NC_013959	GCG	2	6	552097	552102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613014
12023	NC_013959	GGA	2	6	552141	552146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291613014
12024	NC_013959	CG	3	6	552157	552162	0 %	0 %	50 %	50 %	291613014
12025	NC_013959	GTA	2	6	552163	552168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613014
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12031	NC_013959	CGGCA	2	10	552300	552309	20 %	0 %	40 %	40 %	291613014
12032	NC_013959	CG	3	6	552367	552372	0 %	0 %	50 %	50 %	291613014
12033	NC_013959	CGGTGA	2	12	552530	552541	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291613014
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12036	NC_013959	GCA	2	6	552681	552686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613014
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12041	NC_013959	GA	3	6	552894	552899	50 %	0 %	50 %	0 %	291613014
12042	NC_013959	TTC	2	6	552915	552920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613014
12043	NC_013959	A	6	6	553001	553006	100 %	0 %	0 %	0 %	291613014
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12047	NC_013959	CTG	2	6	553180	553185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613014
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12050	NC_013959	CTG	2	6	553409	553414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613014
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12052	NC_013959	TCG	2	6	553469	553474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613014
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12055	NC_013959	CTG	2	6	553707	553712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613015
12056	NC_013959	CAT	2	6	553721	553726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613015
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12059	NC_013959	CAT	2	6	553838	553843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613015
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12089	NC_013959	CG	3	6	555191	555196	0 %	0 %	50 %	50 %	291613015
12090	NC_013959	GGA	2	6	555224	555229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291613015
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12099	NC_013959	GAAGCC	2	12	555720	555731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613016
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12114	NC_013959	TTC	2	6	556392	556397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613016
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12117	NC_013959	TGC	2	6	556522	556527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613016
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12119	NC_013959	GTG	2	6	556638	556643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613016
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12142	NC_013959	CTG	2	6	557451	557456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12220	NC_013959	CTG	2	6	560593	560598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613020
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12226	NC_013959	CCG	2	6	560985	560990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613021
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12231	NC_013959	CGA	2	6	561250	561255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613021
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12233	NC_013959	CCA	2	6	561291	561296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613021
12234	NC_013959	GCC	2	6	561309	561314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613021
12235	NC_013959	ACG	2	6	561335	561340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613021
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12237	NC_013959	ACCG	2	8	561404	561411	25 %	0 %	25 %	50 %	291613021
12238	NC_013959	GA	3	6	561438	561443	50 %	0 %	50 %	0 %	291613021
12239	NC_013959	GTCA	2	8	561536	561543	25 %	25 %	25 %	25 %	291613021
12240	NC_013959	TGG	2	6	561555	561560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613021
12241	NC_013959	TGA	2	6	561579	561584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613021
12242	NC_013959	GC	3	6	561635	561640	0 %	0 %	50 %	50 %	291613021
12243	NC_013959	GCG	2	6	561684	561689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613021
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12246	NC_013959	TCG	2	6	561822	561827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613021
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12252	NC_013959	GTC	2	6	562091	562096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613021
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12261	NC_013959	GCA	2	6	562335	562340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613021
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12266	NC_013959	GCA	2	6	562572	562577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12267	NC_013959	ATG	2	6	562588	562593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12268	NC_013959	GAG	2	6	562619	562624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12269	NC_013959	AGC	2	6	562762	562767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613022
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12271	NC_013959	AT	3	6	562802	562807	50 %	50 %	0 %	0 %	291613022
12272	NC_013959	GCA	2	6	562846	562851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613022
12273	NC_013959	GCC	3	9	562862	562870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613022
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12292	NC_013959	GCC	2	6	563558	563563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613022
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12295	NC_013959	GCA	2	6	563673	563678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613022
12296	NC_013959	CTG	2	6	563735	563740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613022
12297	NC_013959	CGC	2	6	563748	563753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613022
12298	NC_013959	ATGC	2	8	563760	563767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12299	NC_013959	CGT	2	6	563900	563905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613023
12300	NC_013959	GC	3	6	563908	563913	0 %	0 %	50 %	50 %	291613023
12301	NC_013959	CTG	2	6	563948	563953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613023
12302	NC_013959	CAC	2	6	563998	564003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613023
12303	NC_013959	CTTT	2	8	564015	564022	0 %	75 %	0 %	25 %	291613023
12304	NC_013959	GAA	2	6	564119	564124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613023
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12307	NC_013959	CAT	2	6	564184	564189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613023
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12309	NC_013959	TTTC	2	8	564286	564293	0 %	75 %	0 %	25 %	291613023
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12311	NC_013959	CTG	2	6	564374	564379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613023
12312	NC_013959	GAT	2	6	564380	564385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613023
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12321	NC_013959	ATC	2	6	564761	564766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613024
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12324	NC_013959	GTT	2	6	564936	564941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613024
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12326	NC_013959	AGCG	2	8	565034	565041	25 %	0 %	50 %	25 %	291613024
12327	NC_013959	GTG	2	6	565078	565083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613024
12328	NC_013959	CG	3	6	565094	565099	0 %	0 %	50 %	50 %	291613024
12329	NC_013959	CGG	2	6	565200	565205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12330	NC_013959	CGA	2	6	565304	565309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613025
12331	NC_013959	GC	3	6	565319	565324	0 %	0 %	50 %	50 %	291613025
12332	NC_013959	GAA	2	6	565325	565330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613025
12333	NC_013959	CG	3	6	565347	565352	0 %	0 %	50 %	50 %	291613025
12334	NC_013959	TGGC	2	8	565377	565384	0 %	25 %	50 %	25 %	291613025
12335	NC_013959	GGC	2	6	565406	565411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613025
12336	NC_013959	GCA	2	6	565420	565425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613025
12337	NC_013959	TGC	2	6	565554	565559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613025
12338	NC_013959	GCA	2	6	565568	565573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613025
12339	NC_013959	TC	3	6	565575	565580	0 %	50 %	0 %	50 %	291613025
12340	NC_013959	CTG	3	9	565583	565591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613025
12341	NC_013959	GGCT	2	8	565595	565602	0 %	25 %	50 %	25 %	291613025
12342	NC_013959	CCA	2	6	565674	565679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613025
12343	NC_013959	GTG	2	6	565718	565723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613025
12344	NC_013959	CGG	2	6	565726	565731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613025
12345	NC_013959	CAA	2	6	565756	565761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613025
12346	NC_013959	TGC	2	6	565773	565778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613025
12347	NC_013959	TGC	2	6	565840	565845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613025
12348	NC_013959	CTG	2	6	565859	565864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613025
12349	NC_013959	CAA	2	6	565906	565911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613025
12350	NC_013959	GCA	2	6	565992	565997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613025
12351	NC_013959	CGC	3	9	566015	566023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613025
12352	NC_013959	ATG	2	6	566024	566029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613025
12353	NC_013959	TGG	2	6	566052	566057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613025
12354	NC_013959	TGCG	2	8	566109	566116	0 %	25 %	50 %	25 %	291613025
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12474	NC_013959	GAT	2	6	571420	571425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613029
12475	NC_013959	GCAT	2	8	571428	571435	25 %	25 %	25 %	25 %	291613029
12476	NC_013959	CG	3	6	571491	571496	0 %	0 %	50 %	50 %	291613029
12477	NC_013959	GC	3	6	571523	571528	0 %	0 %	50 %	50 %	291613029
12478	NC_013959	GTC	2	6	571582	571587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613030
12479	NC_013959	ATC	2	6	571600	571605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613030
12480	NC_013959	GGTC	2	8	571628	571635	0 %	25 %	50 %	25 %	291613030
12481	NC_013959	GGC	2	6	571653	571658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613030
12482	NC_013959	CGG	2	6	571674	571679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613030
12483	NC_013959	TGC	2	6	571697	571702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613030
12484	NC_013959	GC	3	6	571816	571821	0 %	0 %	50 %	50 %	291613030
12485	NC_013959	CGA	2	6	571863	571868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613030
12486	NC_013959	ACT	2	6	571893	571898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613030
12487	NC_013959	CCA	2	6	572015	572020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613030
12488	NC_013959	CCA	2	6	572117	572122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613030
12489	NC_013959	TCGGC	2	10	572132	572141	0 %	20 %	40 %	40 %	291613030
12490	NC_013959	ATC	2	6	572179	572184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613030
12491	NC_013959	TCA	2	6	572371	572376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613031
12492	NC_013959	CTG	2	6	572379	572384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613031
12493	NC_013959	CTT	2	6	572390	572395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613031
12494	NC_013959	GTG	2	6	572397	572402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613031
12495	NC_013959	GAA	2	6	572645	572650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613031
12496	NC_013959	CAG	2	6	572885	572890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613031
12497	NC_013959	CGT	2	6	572891	572896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613031
12498	NC_013959	AGC	2	6	573073	573078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613031
12499	NC_013959	AAT	2	6	573079	573084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291613031
12500	NC_013959	CTG	2	6	573212	573217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613032

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