MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013959	GC	3	6	528612	528617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11502	NC_013959	AGC	2	6	528654	528659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_013959	CCA	2	6	528702	528707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11504	NC_013959	CGC	2	6	528721	528726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_013959	GTC	2	6	528767	528772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_013959	A	6	6	528804	528809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_013959	T	8	8	528829	528836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_013959	CGA	2	6	528876	528881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612995
11509	NC_013959	GCC	2	6	528919	528924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612995
11510	NC_013959	TTG	2	6	528995	529000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612995
11511	NC_013959	TTC	2	6	529073	529078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612995
11512	NC_013959	GCT	2	6	529134	529139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612995
11513	NC_013959	GCC	2	6	529154	529159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612995
11514	NC_013959	ACG	2	6	529184	529189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612995
11515	NC_013959	CATG	2	8	529194	529201	25 %	25 %	25 %	25 %	291612995
11516	NC_013959	GCG	2	6	529275	529280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612995
11517	NC_013959	CGG	2	6	529286	529291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612995
11518	NC_013959	AGC	2	6	529301	529306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612995
11519	NC_013959	TGG	2	6	529332	529337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612995
11520	NC_013959	GAC	2	6	529342	529347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612995
11521	NC_013959	TGA	2	6	529416	529421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612995
11522	NC_013959	CGA	2	6	529479	529484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612995
11523	NC_013959	TTG	2	6	529517	529522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612995
11524	NC_013959	CCT	3	9	529554	529562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291612995
11525	NC_013959	ATG	2	6	529637	529642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612995
11526	NC_013959	CGT	2	6	529647	529652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612995
11527	NC_013959	TGC	3	9	529659	529667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612995
11528	NC_013959	GCC	2	6	529735	529740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612995
11529	NC_013959	ACTT	2	8	529789	529796	25 %	50 %	0 %	25 %	291612995
11530	NC_013959	TGGG	2	8	529889	529896	0 %	25 %	75 %	0 %	291612995
11531	NC_013959	GCCTT	2	10	529910	529919	0 %	40 %	20 %	40 %	291612995
11532	NC_013959	CAA	2	6	530044	530049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612995
11533	NC_013959	GTC	2	6	530423	530428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_013959	CAT	2	6	530441	530446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612996
11535	NC_013959	CG	3	6	530503	530508	0 %	0 %	50 %	50 %	291612996
11536	NC_013959	TGC	2	6	530540	530545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612996
11537	NC_013959	GGC	2	6	530559	530564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612996
11538	NC_013959	GTG	2	6	530574	530579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612996
11539	NC_013959	G	7	7	530597	530603	0 %	0 %	100 %	0 %	291612996
11540	NC_013959	GCAT	2	8	530677	530684	25 %	25 %	25 %	25 %	291612996
11541	NC_013959	TCA	2	6	530693	530698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612996
11542	NC_013959	GGT	2	6	530717	530722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612996
11543	NC_013959	TGG	3	9	530779	530787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612996
11544	NC_013959	CTG	2	6	530811	530816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612996
11545	NC_013959	GGC	2	6	530829	530834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612996
11546	NC_013959	ATAC	2	8	530874	530881	50 %	25 %	0 %	25 %	291612996
11547	NC_013959	GC	4	8	530934	530941	0 %	0 %	50 %	50 %	291612996
11548	NC_013959	GCG	2	6	530958	530963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612996
11549	NC_013959	GATGC	2	10	531018	531027	20 %	20 %	40 %	20 %	291612996
11550	NC_013959	TCG	2	6	531130	531135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612996
11551	NC_013959	TGGCGA	2	12	531247	531258	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291612996
11552	NC_013959	ATC	2	6	531267	531272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612996
11553	NC_013959	GGC	2	6	531282	531287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612996
11554	NC_013959	CGG	3	9	531311	531319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612996
11555	NC_013959	GAA	2	6	531362	531367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612996
11556	NC_013959	CGG	2	6	531401	531406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612996
11557	NC_013959	CAT	2	6	531407	531412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612996
11558	NC_013959	GTG	2	6	531438	531443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612996
11559	NC_013959	GC	3	6	531450	531455	0 %	0 %	50 %	50 %	291612996
11560	NC_013959	TGCCG	2	10	531467	531476	0 %	20 %	40 %	40 %	291612996
11561	NC_013959	TGG	2	6	531478	531483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612996
11562	NC_013959	AAG	2	6	531516	531521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612996
11563	NC_013959	CAT	2	6	531545	531550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612996
11564	NC_013959	TCA	2	6	531621	531626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612997
11565	NC_013959	TCA	2	6	531642	531647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612997
11566	NC_013959	GGCG	2	8	531727	531734	0 %	0 %	75 %	25 %	291612997
11567	NC_013959	GAA	2	6	531742	531747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612997
11568	NC_013959	GCC	2	6	531838	531843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612997
11569	NC_013959	CGA	2	6	531865	531870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612997
11570	NC_013959	GCAAG	2	10	531955	531964	40 %	0 %	40 %	20 %	291612997
11571	NC_013959	GCT	2	6	531970	531975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612997
11572	NC_013959	TCA	2	6	531999	532004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612997
11573	NC_013959	CAT	2	6	532027	532032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612997
11574	NC_013959	AAG	2	6	532049	532054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612997
11575	NC_013959	GTG	2	6	532067	532072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612997
11576	NC_013959	CGG	2	6	532153	532158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612997
11577	NC_013959	TGA	2	6	532191	532196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612997
11578	NC_013959	ACG	2	6	532206	532211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612997
11579	NC_013959	TGG	2	6	532236	532241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612997
11580	NC_013959	CGG	2	6	532249	532254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612997
11581	NC_013959	GC	4	8	532272	532279	0 %	0 %	50 %	50 %	291612997
11582	NC_013959	GAA	2	6	532297	532302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612997
11583	NC_013959	GGT	2	6	532306	532311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612997
11584	NC_013959	ATC	2	6	532370	532375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612997
11585	NC_013959	CGG	2	6	532378	532383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612997
11586	NC_013959	GTG	2	6	532389	532394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612997
11587	NC_013959	ATG	2	6	532504	532509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612998
11588	NC_013959	ACC	2	6	532513	532518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612998
11589	NC_013959	CTG	2	6	532558	532563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612998
11590	NC_013959	GGT	2	6	532581	532586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612998
11591	NC_013959	CCA	2	6	532612	532617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612998
11592	NC_013959	AAG	2	6	532627	532632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612998
11593	NC_013959	CTG	2	6	532663	532668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612998
11594	NC_013959	TTC	2	6	532684	532689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612998
11595	NC_013959	TGT	2	6	532700	532705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612998
11596	NC_013959	TTG	2	6	532738	532743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612998
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11598	NC_013959	G	6	6	532820	532825	0 %	0 %	100 %	0 %	291612998
11599	NC_013959	CAT	3	9	532836	532844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612998
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11601	NC_013959	GGC	2	6	532884	532889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612998
11602	NC_013959	TGC	2	6	532910	532915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612998
11603	NC_013959	CTG	2	6	532927	532932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612998
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11605	NC_013959	TCA	2	6	532997	533002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612998
11606	NC_013959	GAG	2	6	533012	533017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612998
11607	NC_013959	GGCG	2	8	533034	533041	0 %	0 %	75 %	25 %	291612998
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11609	NC_013959	GCA	2	6	533085	533090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612998
11610	NC_013959	CTGG	2	8	533100	533107	0 %	25 %	50 %	25 %	291612998
11611	NC_013959	GTGCTG	2	12	533125	533136	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291612998
11612	NC_013959	TGGC	2	8	533149	533156	0 %	25 %	50 %	25 %	291612998
11613	NC_013959	GGC	2	6	533166	533171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612998
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11615	NC_013959	GC	3	6	533215	533220	0 %	0 %	50 %	50 %	291612998
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11617	NC_013959	CG	3	6	533288	533293	0 %	0 %	50 %	50 %	291612999
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11740	NC_013959	CTG	2	6	539206	539211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613003
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11975	NC_013959	GCT	2	6	550285	550290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11976	NC_013959	AAG	2	6	550305	550310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613012
11977	NC_013959	AG	3	6	550348	550353	50 %	0 %	50 %	0 %	291613012
11978	NC_013959	GCTG	2	8	550381	550388	0 %	25 %	50 %	25 %	291613012
11979	NC_013959	ACC	2	6	550389	550394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613012
11980	NC_013959	CAT	2	6	550426	550431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613012
11981	NC_013959	GATG	2	8	550471	550478	25 %	25 %	50 %	0 %	291613012
11982	NC_013959	CAC	2	6	550496	550501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613012
11983	NC_013959	TCG	2	6	550563	550568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11984	NC_013959	GTG	2	6	550583	550588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613012
11985	NC_013959	TCCC	2	8	550611	550618	0 %	25 %	0 %	75 %	291613012
11986	NC_013959	TTG	2	6	550673	550678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613012
11987	NC_013959	GAA	2	6	550727	550732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613012
11988	NC_013959	TGC	2	6	550743	550748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11989	NC_013959	GTC	2	6	550760	550765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11990	NC_013959	CTG	2	6	550766	550771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11991	NC_013959	TCG	2	6	550851	550856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11992	NC_013959	ACGC	2	8	550901	550908	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11993	NC_013959	CGAA	2	8	550927	550934	50 %	0 %	25 %	25 %	291613013
11994	NC_013959	TCA	2	6	550951	550956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613013
11995	NC_013959	A	6	6	550964	550969	100 %	0 %	0 %	0 %	291613013
11996	NC_013959	TGG	2	6	550988	550993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613013
11997	NC_013959	ATG	2	6	551031	551036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613013
11998	NC_013959	TTC	2	6	551040	551045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613013
11999	NC_013959	CTG	2	6	551046	551051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613013
12000	NC_013959	GGT	2	6	551136	551141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613013

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