MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_013959	TGC	2	6	461694	461699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612923
10002	NC_013959	GCG	2	6	461716	461721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612923
10003	NC_013959	GCG	2	6	461724	461729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612923
10004	NC_013959	CTG	2	6	461747	461752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612923
10005	NC_013959	GATC	2	8	461779	461786	25 %	25 %	25 %	25 %	291612923
10006	NC_013959	CGA	2	6	461815	461820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612923
10007	NC_013959	TGC	2	6	461915	461920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612924
10008	NC_013959	CG	4	8	461981	461988	0 %	0 %	50 %	50 %	291612924
10009	NC_013959	CTGG	2	8	462081	462088	0 %	25 %	50 %	25 %	291612924
10010	NC_013959	CGGCG	2	10	462114	462123	0 %	0 %	60 %	40 %	291612924
10011	NC_013959	CG	3	6	462122	462127	0 %	0 %	50 %	50 %	291612924
10012	NC_013959	GTT	2	6	462174	462179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612924
10013	NC_013959	CCG	2	6	462239	462244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612924
10014	NC_013959	TGT	2	6	462305	462310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612924
10015	NC_013959	ATG	2	6	462370	462375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612924
10016	NC_013959	CG	3	6	462376	462381	0 %	0 %	50 %	50 %	291612924
10017	NC_013959	TGT	2	6	462431	462436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612924
10018	NC_013959	GGT	2	6	462501	462506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612924
10019	NC_013959	CAG	2	6	462562	462567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612924
10020	NC_013959	TGC	2	6	462650	462655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612924
10021	NC_013959	TGCG	2	8	462686	462693	0 %	25 %	50 %	25 %	291612924
10022	NC_013959	CAT	2	6	462706	462711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612924
10023	NC_013959	CGA	2	6	462786	462791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612924
10024	NC_013959	AGC	2	6	462824	462829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612924
10025	NC_013959	TAC	2	6	462872	462877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612925
10026	NC_013959	GTG	2	6	462943	462948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612925
10027	NC_013959	GCA	2	6	462972	462977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612925
10028	NC_013959	GC	3	6	463003	463008	0 %	0 %	50 %	50 %	291612925
10029	NC_013959	GCG	2	6	463055	463060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612925
10030	NC_013959	GCG	2	6	463168	463173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612925
10031	NC_013959	CGCA	2	8	463192	463199	25 %	0 %	25 %	50 %	291612925
10032	NC_013959	GCA	2	6	463201	463206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612925
10033	NC_013959	TGG	2	6	463211	463216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612925
10034	NC_013959	CGA	3	9	463232	463240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612925
10035	NC_013959	CT	3	6	463249	463254	0 %	50 %	0 %	50 %	291612925
10036	NC_013959	GCA	2	6	463305	463310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612925
10037	NC_013959	CCAT	2	8	463388	463395	25 %	25 %	0 %	50 %	291612925
10038	NC_013959	TGC	2	6	463403	463408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612925
10039	NC_013959	TGC	2	6	463445	463450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612925
10040	NC_013959	GC	3	6	463468	463473	0 %	0 %	50 %	50 %	291612925
10041	NC_013959	CGG	3	9	463482	463490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612925
10042	NC_013959	GCG	2	6	463492	463497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612925
10043	NC_013959	GA	3	6	463574	463579	50 %	0 %	50 %	0 %	291612925
10044	NC_013959	GTT	3	9	463607	463615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612926
10045	NC_013959	CTG	2	6	463659	463664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612926
10046	NC_013959	CCG	3	9	463744	463752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612926
10047	NC_013959	CGG	2	6	463763	463768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612926
10048	NC_013959	GCC	2	6	463800	463805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612926
10049	NC_013959	GCCTGC	2	12	463823	463834	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291612926
10050	NC_013959	AC	3	6	463845	463850	50 %	0 %	0 %	50 %	291612926
10051	NC_013959	TGA	2	6	463981	463986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612926
10052	NC_013959	TA	3	6	464041	464046	50 %	50 %	0 %	0 %	291612926
10053	NC_013959	GAA	2	6	464057	464062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612926
10054	NC_013959	AGA	2	6	464080	464085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612926
10055	NC_013959	AAT	2	6	464370	464375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291612926
10056	NC_013959	GCC	2	6	464404	464409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10057	NC_013959	CAG	2	6	464431	464436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_013959	AGCAC	2	10	464483	464492	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10059	NC_013959	GGT	2	6	464509	464514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_013959	CAC	2	6	464529	464534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_013959	CAGC	2	8	464718	464725	25 %	0 %	25 %	50 %	291612927
10062	NC_013959	CCGAT	2	10	464730	464739	20 %	20 %	20 %	40 %	291612927
10063	NC_013959	CTC	2	6	464773	464778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_013959	T	6	6	464837	464842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_013959	GAT	2	6	465106	465111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_013959	ATGA	2	8	465176	465183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_013959	GC	3	6	465306	465311	0 %	0 %	50 %	50 %	291612929
10068	NC_013959	CAT	2	6	465354	465359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612929
10069	NC_013959	GC	3	6	465424	465429	0 %	0 %	50 %	50 %	291612929
10070	NC_013959	CGG	2	6	465468	465473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612929
10071	NC_013959	TG	3	6	465475	465480	0 %	50 %	50 %	0 %	291612929
10072	NC_013959	CAT	2	6	465501	465506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612929
10073	NC_013959	CGCGG	2	10	465573	465582	0 %	0 %	60 %	40 %	291612929
10074	NC_013959	ACC	2	6	465658	465663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612929
10075	NC_013959	CACGG	2	10	465664	465673	20 %	0 %	40 %	40 %	291612929
10076	NC_013959	CAT	2	6	465684	465689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612929
10077	NC_013959	GCA	2	6	465698	465703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612929
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10079	NC_013959	CG	3	6	465734	465739	0 %	0 %	50 %	50 %	291612929
10080	NC_013959	GCT	2	6	465819	465824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612929
10081	NC_013959	CTG	2	6	465889	465894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612929
10082	NC_013959	CGCTG	2	10	465903	465912	0 %	20 %	40 %	40 %	291612929
10083	NC_013959	CG	3	6	465950	465955	0 %	0 %	50 %	50 %	291612929
10084	NC_013959	GATC	2	8	465972	465979	25 %	25 %	25 %	25 %	291612929
10085	NC_013959	TCG	2	6	466148	466153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612929
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10087	NC_013959	GC	3	6	466244	466249	0 %	0 %	50 %	50 %	291612929
10088	NC_013959	GAC	2	6	466279	466284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612929
10089	NC_013959	GC	3	6	466306	466311	0 %	0 %	50 %	50 %	291612929
10090	NC_013959	GCA	2	6	466347	466352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612929
10091	NC_013959	CGT	2	6	466386	466391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612929
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10094	NC_013959	TCG	2	6	466463	466468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612929
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10099	NC_013959	GC	3	6	466722	466727	0 %	0 %	50 %	50 %	291612930
10100	NC_013959	TGA	2	6	466852	466857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612930
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10102	NC_013959	ACCT	2	8	466965	466972	25 %	25 %	0 %	50 %	291612930
10103	NC_013959	CGG	2	6	466984	466989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612930
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10105	NC_013959	ACG	2	6	467119	467124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612930
10106	NC_013959	CGC	2	6	467191	467196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612930
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10108	NC_013959	GCA	2	6	467305	467310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612930
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10111	NC_013959	AGA	2	6	467461	467466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612930
10112	NC_013959	GA	3	6	467481	467486	50 %	0 %	50 %	0 %	291612930
10113	NC_013959	CA	3	6	467513	467518	50 %	0 %	0 %	50 %	291612931
10114	NC_013959	CGC	2	6	467581	467586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612931
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10118	NC_013959	CAAGG	2	10	467785	467794	40 %	0 %	40 %	20 %	291612931
10119	NC_013959	AAG	2	6	467863	467868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612931
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10121	NC_013959	AGT	2	6	467974	467979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612932
10122	NC_013959	TGC	2	6	468017	468022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612932
10123	NC_013959	CTG	2	6	468082	468087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612932
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10126	NC_013959	GATG	2	8	468171	468178	25 %	25 %	50 %	0 %	291612932
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10240	NC_013959	CGG	2	6	473012	473017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612937
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10481	NC_013959	TGGT	2	8	483789	483796	0 %	50 %	50 %	0 %	291612948
10482	NC_013959	GCA	2	6	483799	483804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612948
10483	NC_013959	TCC	2	6	483810	483815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291612948
10484	NC_013959	T	7	7	483831	483837	0 %	100 %	0 %	0 %	291612948
10485	NC_013959	CGT	2	6	483934	483939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612948
10486	NC_013959	GAT	2	6	484058	484063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612948
10487	NC_013959	CAT	2	6	484111	484116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612948
10488	NC_013959	TTG	2	6	484133	484138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612948
10489	NC_013959	GTC	2	6	484161	484166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612948
10490	NC_013959	TGA	2	6	484201	484206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612948
10491	NC_013959	GAT	2	6	484219	484224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612948
10492	NC_013959	ATG	2	6	484254	484259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612948
10493	NC_013959	TCATT	2	10	484357	484366	20 %	60 %	0 %	20 %	291612948
10494	NC_013959	TGC	2	6	484386	484391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10495	NC_013959	ATG	2	6	484394	484399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10496	NC_013959	AC	3	6	484434	484439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10497	NC_013959	AAT	2	6	484496	484501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10498	NC_013959	GGCA	2	8	484526	484533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10499	NC_013959	GA	3	6	484554	484559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10500	NC_013959	TC	3	6	484599	484604	0 %	50 %	0 %	50 %	291612949

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