MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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62002	NC_013959	GTC	2	6	2866837	2866842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615305
62003	NC_013959	TCA	2	6	2866847	2866852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615305
62004	NC_013959	CG	3	6	2866867	2866872	0 %	0 %	50 %	50 %	291615305
62005	NC_013959	CGC	2	6	2866914	2866919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615305
62006	NC_013959	GGCAA	2	10	2866961	2866970	40 %	0 %	40 %	20 %	291615305
62007	NC_013959	GGA	2	6	2867034	2867039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615305
62008	NC_013959	TGC	2	6	2867042	2867047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615305
62009	NC_013959	ATC	2	6	2867077	2867082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615305
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62011	NC_013959	TGT	3	9	2867182	2867190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615306
62012	NC_013959	TCT	2	6	2867218	2867223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615306
62013	NC_013959	GCA	2	6	2867230	2867235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615306
62014	NC_013959	TCCAT	2	10	2867281	2867290	20 %	40 %	0 %	40 %	291615306
62015	NC_013959	TTA	2	6	2867333	2867338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291615306
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62019	NC_013959	CGGC	2	8	2867611	2867618	0 %	0 %	50 %	50 %	291615306
62020	NC_013959	GCCG	2	8	2867633	2867640	0 %	0 %	50 %	50 %	291615306
62021	NC_013959	ATCGT	2	10	2867700	2867709	20 %	40 %	20 %	20 %	291615306
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62033	NC_013959	CAT	3	9	2868098	2868106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615306
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62036	NC_013959	TA	4	8	2868145	2868152	50 %	50 %	0 %	0 %	291615306
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62041	NC_013959	TGGA	2	8	2868273	2868280	25 %	25 %	50 %	0 %	291615306
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62048	NC_013959	TGC	2	6	2868532	2868537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615306
62049	NC_013959	GC	3	6	2868624	2868629	0 %	0 %	50 %	50 %	291615306
62050	NC_013959	GT	3	6	2868680	2868685	0 %	50 %	50 %	0 %	291615306
62051	NC_013959	GAA	2	6	2868743	2868748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615306
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62053	NC_013959	GAC	2	6	2868789	2868794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615306
62054	NC_013959	TTC	2	6	2868843	2868848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615306
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62057	NC_013959	TCG	2	6	2869177	2869182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615307
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62061	NC_013959	TTTC	2	8	2869319	2869326	0 %	75 %	0 %	25 %	291615307
62062	NC_013959	T	6	6	2869356	2869361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62063	NC_013959	GAA	2	6	2869421	2869426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615308
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62065	NC_013959	CGAAA	2	10	2869535	2869544	60 %	0 %	20 %	20 %	291615308
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62082	NC_013959	TCA	2	6	2870440	2870445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615310
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62088	NC_013959	CAT	2	6	2870708	2870713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615311
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62090	NC_013959	CG	3	6	2870827	2870832	0 %	0 %	50 %	50 %	291615311
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62111	NC_013959	TTCG	2	8	2871801	2871808	0 %	50 %	25 %	25 %	291615311
62112	NC_013959	CGG	2	6	2871809	2871814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615311
62113	NC_013959	GC	3	6	2871895	2871900	0 %	0 %	50 %	50 %	291615312
62114	NC_013959	GC	3	6	2871948	2871953	0 %	0 %	50 %	50 %	291615312
62115	NC_013959	GGATGC	2	12	2871970	2871981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291615312
62116	NC_013959	GCA	2	6	2872042	2872047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615312
62117	NC_013959	CGC	2	6	2872126	2872131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615312
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62121	NC_013959	GCTG	2	8	2872338	2872345	0 %	25 %	50 %	25 %	291615312
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62128	NC_013959	GC	3	6	2872588	2872593	0 %	0 %	50 %	50 %	291615312
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62144	NC_013959	TCCG	2	8	2873562	2873569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62145	NC_013959	ACCG	2	8	2873578	2873585	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62146	NC_013959	CCA	2	6	2873597	2873602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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62187	NC_013959	GC	3	6	2875497	2875502	0 %	0 %	50 %	50 %	291615316
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62217	NC_013959	GACCA	2	10	2876714	2876723	40 %	0 %	20 %	40 %	291615316
62218	NC_013959	CGA	2	6	2876731	2876736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615316
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62221	NC_013959	GAT	2	6	2876947	2876952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615316
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62223	NC_013959	CTG	2	6	2877170	2877175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615316
62224	NC_013959	CG	3	6	2877198	2877203	0 %	0 %	50 %	50 %	291615316
62225	NC_013959	GTG	2	6	2877221	2877226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615316
62226	NC_013959	CTC	2	6	2877235	2877240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615316
62227	NC_013959	CAGCG	2	10	2877262	2877271	20 %	0 %	40 %	40 %	291615316
62228	NC_013959	GTG	3	9	2877290	2877298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615316
62229	NC_013959	GAC	2	6	2877329	2877334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615316
62230	NC_013959	GC	3	6	2877337	2877342	0 %	0 %	50 %	50 %	291615316
62231	NC_013959	GAA	2	6	2877350	2877355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615316
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62233	NC_013959	GCAC	2	8	2877396	2877403	25 %	0 %	25 %	50 %	291615316
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62349	NC_013959	CGT	2	6	2882349	2882354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62350	NC_013959	GA	3	6	2882392	2882397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62351	NC_013959	ACG	2	6	2882408	2882413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615320
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62353	NC_013959	GCT	2	6	2882527	2882532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615320
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62431	NC_013959	TCA	2	6	2886504	2886509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615324
62432	NC_013959	GGC	2	6	2886521	2886526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615324
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62435	NC_013959	TCTT	2	8	2886733	2886740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62436	NC_013959	TGGCCA	2	12	2886756	2886767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291615325
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62442	NC_013959	CGT	2	6	2887361	2887366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615326
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62448	NC_013959	GT	3	6	2887595	2887600	0 %	50 %	50 %	0 %	291615326
62449	NC_013959	CGGTG	2	10	2887601	2887610	0 %	20 %	60 %	20 %	291615326
62450	NC_013959	CGG	2	6	2887616	2887621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615326
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62452	NC_013959	GCA	2	6	2887703	2887708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615326
62453	NC_013959	CACC	2	8	2887742	2887749	25 %	0 %	0 %	75 %	291615326
62454	NC_013959	CAG	2	6	2887791	2887796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615326
62455	NC_013959	CCGT	2	8	2887860	2887867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62456	NC_013959	GTT	2	6	2888012	2888017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615327
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62458	NC_013959	CAT	2	6	2888043	2888048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615327
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62461	NC_013959	TCG	2	6	2888076	2888081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615327
62462	NC_013959	TCT	2	6	2888086	2888091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615327
62463	NC_013959	TGC	2	6	2888122	2888127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615327
62464	NC_013959	GCA	2	6	2888183	2888188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615327
62465	NC_013959	CG	3	6	2888195	2888200	0 %	0 %	50 %	50 %	291615327
62466	NC_013959	CGC	2	6	2888228	2888233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615327
62467	NC_013959	CTG	2	6	2888238	2888243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615327
62468	NC_013959	CTA	2	6	2888252	2888257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615327
62469	NC_013959	TTTCC	2	10	2888273	2888282	0 %	60 %	0 %	40 %	291615327
62470	NC_013959	CAT	2	6	2888324	2888329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615327
62471	NC_013959	TTC	2	6	2888349	2888354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615327
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62494	NC_013959	TCA	2	6	2889337	2889342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615327
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62499	NC_013959	TCGA	2	8	2889613	2889620	25 %	25 %	25 %	25 %	291615328
62500	NC_013959	GCA	2	6	2889633	2889638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615328

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