MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_013959	TCA	2	6	2619270	2619275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615033
56502	NC_013959	GCGG	2	8	2619340	2619347	0 %	0 %	75 %	25 %	291615033
56503	NC_013959	GGC	2	6	2619379	2619384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615033
56504	NC_013959	GCGCCA	2	12	2619408	2619419	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291615033
56505	NC_013959	GGC	3	9	2619454	2619462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615033
56506	NC_013959	GC	3	6	2619482	2619487	0 %	0 %	50 %	50 %	291615033
56507	NC_013959	TCC	2	6	2619506	2619511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615033
56508	NC_013959	GCGCC	2	10	2619529	2619538	0 %	0 %	40 %	60 %	291615033
56509	NC_013959	CCG	2	6	2619557	2619562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615033
56510	NC_013959	CCAG	2	8	2619576	2619583	25 %	0 %	25 %	50 %	291615033
56511	NC_013959	GGC	2	6	2619589	2619594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615033
56512	NC_013959	CGC	2	6	2619654	2619659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615033
56513	NC_013959	GCG	2	6	2619670	2619675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615033
56514	NC_013959	TCT	2	6	2619678	2619683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615033
56515	NC_013959	GCG	2	6	2619740	2619745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615033
56516	NC_013959	GGC	2	6	2619774	2619779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615033
56517	NC_013959	GC	3	6	2619778	2619783	0 %	0 %	50 %	50 %	291615033
56518	NC_013959	CGC	2	6	2619817	2619822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615033
56519	NC_013959	CTG	2	6	2619853	2619858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615033
56520	NC_013959	CG	3	6	2619859	2619864	0 %	0 %	50 %	50 %	291615033
56521	NC_013959	GCA	2	6	2619903	2619908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615033
56522	NC_013959	GTT	2	6	2619937	2619942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615033
56523	NC_013959	GGT	2	6	2619964	2619969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615033
56524	NC_013959	CGA	2	6	2619999	2620004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615033
56525	NC_013959	CTG	2	6	2620021	2620026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615033
56526	NC_013959	TTG	2	6	2620031	2620036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615033
56527	NC_013959	GGC	2	6	2620071	2620076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615033
56528	NC_013959	CTG	2	6	2620081	2620086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615033
56529	NC_013959	CCG	2	6	2620143	2620148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615033
56530	NC_013959	CGG	2	6	2620216	2620221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615033
56531	NC_013959	ATC	2	6	2620232	2620237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615033
56532	NC_013959	CAG	2	6	2620288	2620293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615033
56533	NC_013959	TCG	2	6	2620313	2620318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615033
56534	NC_013959	GCG	2	6	2620347	2620352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615033
56535	NC_013959	TCA	2	6	2620383	2620388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615033
56536	NC_013959	CGG	2	6	2620413	2620418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615034
56537	NC_013959	GTT	2	6	2620452	2620457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615034
56538	NC_013959	GTG	2	6	2620485	2620490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615034
56539	NC_013959	TCT	2	6	2620553	2620558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615034
56540	NC_013959	CGT	2	6	2620563	2620568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615034
56541	NC_013959	GTT	2	6	2620653	2620658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615034
56542	NC_013959	GCC	2	6	2620672	2620677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615034
56543	NC_013959	CTG	2	6	2620681	2620686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615034
56544	NC_013959	TTC	2	6	2620705	2620710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615034
56545	NC_013959	CTT	2	6	2620749	2620754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615034
56546	NC_013959	CGA	2	6	2620763	2620768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615034
56547	NC_013959	T	6	6	2620862	2620867	0 %	100 %	0 %	0 %	291615034
56548	NC_013959	GAA	2	6	2620961	2620966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615034
56549	NC_013959	AGC	2	6	2620969	2620974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615034
56550	NC_013959	CCAAAT	2	12	2621066	2621077	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56551	NC_013959	CTTGC	2	10	2621099	2621108	0 %	40 %	20 %	40 %	291615035
56552	NC_013959	GC	3	6	2621184	2621189	0 %	0 %	50 %	50 %	291615035
56553	NC_013959	CCG	2	6	2621302	2621307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615035
56554	NC_013959	CGT	2	6	2621312	2621317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56555	NC_013959	CGGC	2	8	2621327	2621334	0 %	0 %	50 %	50 %	291615035
56556	NC_013959	CCT	2	6	2621411	2621416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615035
56557	NC_013959	CGG	2	6	2621463	2621468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615035
56558	NC_013959	CAG	2	6	2621493	2621498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56559	NC_013959	CG	3	6	2621564	2621569	0 %	0 %	50 %	50 %	291615035
56560	NC_013959	TGCC	2	8	2621642	2621649	0 %	25 %	25 %	50 %	291615035
56561	NC_013959	GC	4	8	2621650	2621657	0 %	0 %	50 %	50 %	291615035
56562	NC_013959	GC	3	6	2621670	2621675	0 %	0 %	50 %	50 %	291615035
56563	NC_013959	TTC	2	6	2621682	2621687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615035
56564	NC_013959	CTT	2	6	2621691	2621696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615035
56565	NC_013959	CAC	2	6	2621700	2621705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615035
56566	NC_013959	CAT	2	6	2621706	2621711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615035
56567	NC_013959	TCG	2	6	2621725	2621730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56568	NC_013959	TCC	2	6	2621755	2621760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615035
56569	NC_013959	CGCC	2	8	2621810	2621817	0 %	0 %	25 %	75 %	291615035
56570	NC_013959	ACC	2	6	2621950	2621955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615035
56571	NC_013959	CAG	2	6	2621961	2621966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56572	NC_013959	CAG	3	9	2622015	2622023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56573	NC_013959	CTG	2	6	2622030	2622035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56574	NC_013959	CAG	2	6	2622051	2622056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56575	NC_013959	GGT	2	6	2622099	2622104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615035
56576	NC_013959	CCA	2	6	2622110	2622115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615035
56577	NC_013959	CCA	2	6	2622143	2622148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615035
56578	NC_013959	GCG	2	6	2622188	2622193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615035
56579	NC_013959	CAC	2	6	2622318	2622323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615035
56580	NC_013959	CGG	2	6	2622383	2622388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615035
56581	NC_013959	TGA	2	6	2622407	2622412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615035
56582	NC_013959	CGG	2	6	2622503	2622508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615035
56583	NC_013959	ACC	2	6	2622511	2622516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615035
56584	NC_013959	CTG	2	6	2622522	2622527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56585	NC_013959	CAG	2	6	2622540	2622545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56586	NC_013959	TTTC	2	8	2622599	2622606	0 %	75 %	0 %	25 %	291615035
56587	NC_013959	CTT	2	6	2622678	2622683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615035
56588	NC_013959	CTT	2	6	2622686	2622691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615035
56589	NC_013959	CGA	3	9	2622692	2622700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56590	NC_013959	GC	3	6	2622722	2622727	0 %	0 %	50 %	50 %	291615035
56591	NC_013959	GC	3	6	2622762	2622767	0 %	0 %	50 %	50 %	291615035
56592	NC_013959	GTC	2	6	2622788	2622793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56593	NC_013959	CCAG	2	8	2622797	2622804	25 %	0 %	25 %	50 %	291615035
56594	NC_013959	CAC	2	6	2622849	2622854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615035
56595	NC_013959	GCC	2	6	2622936	2622941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615035
56596	NC_013959	GC	3	6	2622992	2622997	0 %	0 %	50 %	50 %	291615035
56597	NC_013959	CAG	2	6	2623008	2623013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56598	NC_013959	A	6	6	2623018	2623023	100 %	0 %	0 %	0 %	291615035
56599	NC_013959	GC	3	6	2623045	2623050	0 %	0 %	50 %	50 %	291615035
56600	NC_013959	GCG	2	6	2623077	2623082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615035
56601	NC_013959	CA	3	6	2623093	2623098	50 %	0 %	0 %	50 %	291615035
56602	NC_013959	CAC	2	6	2623120	2623125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615035
56603	NC_013959	AGC	2	6	2623150	2623155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615035
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56605	NC_013959	TCGC	2	8	2623207	2623214	0 %	25 %	25 %	50 %	291615035
56606	NC_013959	GCCACC	2	12	2623276	2623287	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	291615035
56607	NC_013959	AGC	3	9	2623288	2623296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615035
56608	NC_013959	GCGG	2	8	2623392	2623399	0 %	0 %	75 %	25 %	291615036
56609	NC_013959	GC	3	6	2623415	2623420	0 %	0 %	50 %	50 %	291615036
56610	NC_013959	CCG	3	9	2623468	2623476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615036
56611	NC_013959	GC	3	6	2623596	2623601	0 %	0 %	50 %	50 %	291615036
56612	NC_013959	GTT	2	6	2623640	2623645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615036
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56614	NC_013959	GCG	2	6	2623666	2623671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615036
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56616	NC_013959	CGA	2	6	2623727	2623732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615036
56617	NC_013959	GTC	2	6	2623781	2623786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615036
56618	NC_013959	GAT	2	6	2623789	2623794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615036
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56964	NC_013959	TCG	2	6	2640044	2640049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615054
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56992	NC_013959	GCC	2	6	2641318	2641323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615054
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56995	NC_013959	GCC	2	6	2641505	2641510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615054
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