MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_013959	TTGGC	2	10	2554351	2554360	0 %	40 %	40 %	20 %	291614974
55002	NC_013959	GCGCCA	2	12	2554495	2554506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291614974
55003	NC_013959	CAG	2	6	2554509	2554514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614974
55004	NC_013959	CTG	2	6	2554535	2554540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614974
55005	NC_013959	CGC	2	6	2554544	2554549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614974
55006	NC_013959	TGT	2	6	2554597	2554602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614974
55007	NC_013959	CCA	2	6	2554660	2554665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614974
55008	NC_013959	CGA	2	6	2554750	2554755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614974
55009	NC_013959	CTT	2	6	2554829	2554834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614974
55010	NC_013959	CGG	2	6	2554871	2554876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614974
55011	NC_013959	CAG	2	6	2554898	2554903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614974
55012	NC_013959	CGG	2	6	2554909	2554914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614974
55013	NC_013959	CTT	2	6	2554940	2554945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614974
55014	NC_013959	TCT	2	6	2554969	2554974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614974
55015	NC_013959	CTT	3	9	2554994	2555002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614974
55016	NC_013959	GACACC	2	12	2555085	2555096	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291614974
55017	NC_013959	CAG	2	6	2555120	2555125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614974
55018	NC_013959	CCA	2	6	2555182	2555187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614974
55019	NC_013959	CCA	2	6	2555197	2555202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614974
55020	NC_013959	GCA	2	6	2555214	2555219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614974
55021	NC_013959	CGG	2	6	2555278	2555283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614974
55022	NC_013959	CAG	2	6	2555285	2555290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614974
55023	NC_013959	GCG	2	6	2555299	2555304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614974
55024	NC_013959	AGC	2	6	2555334	2555339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614974
55025	NC_013959	CAG	2	6	2555342	2555347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614974
55026	NC_013959	AGGG	2	8	2555373	2555380	25 %	0 %	75 %	0 %	291614974
55027	NC_013959	ATG	2	6	2555419	2555424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55028	NC_013959	TG	3	6	2555423	2555428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55029	NC_013959	A	6	6	2555444	2555449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55030	NC_013959	CAC	2	6	2555497	2555502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55031	NC_013959	GCA	2	6	2555581	2555586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614975
55032	NC_013959	GAA	2	6	2555605	2555610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614975
55033	NC_013959	GCACCG	2	12	2555619	2555630	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291614975
55034	NC_013959	CAC	2	6	2555632	2555637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614975
55035	NC_013959	CAC	2	6	2555692	2555697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614975
55036	NC_013959	AAG	2	6	2555699	2555704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614975
55037	NC_013959	CAT	2	6	2555719	2555724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614975
55038	NC_013959	GCA	2	6	2555751	2555756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614975
55039	NC_013959	CGA	2	6	2555809	2555814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614975
55040	NC_013959	GCAA	2	8	2555841	2555848	50 %	0 %	25 %	25 %	291614975
55041	NC_013959	AAC	2	6	2555918	2555923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614975
55042	NC_013959	CGC	2	6	2555933	2555938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614975
55043	NC_013959	ATC	2	6	2555939	2555944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614975
55044	NC_013959	TGGCGC	2	12	2555979	2555990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291614975
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55048	NC_013959	CGCAA	2	10	2556205	2556214	40 %	0 %	20 %	40 %	291614975
55049	NC_013959	CG	3	6	2556219	2556224	0 %	0 %	50 %	50 %	291614975
55050	NC_013959	CG	4	8	2556228	2556235	0 %	0 %	50 %	50 %	291614975
55051	NC_013959	CGG	2	6	2556401	2556406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55052	NC_013959	CGC	2	6	2556526	2556531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614976
55053	NC_013959	TCCA	2	8	2556541	2556548	25 %	25 %	0 %	50 %	291614976
55054	NC_013959	TTG	2	6	2556666	2556671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614976
55055	NC_013959	TGC	2	6	2556690	2556695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614976
55056	NC_013959	AGGA	2	8	2556715	2556722	50 %	0 %	50 %	0 %	291614976
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55058	NC_013959	AAT	3	9	2556762	2556770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291614976
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55060	NC_013959	ATTG	2	8	2556828	2556835	25 %	50 %	25 %	0 %	291614977
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55069	NC_013959	CGC	2	6	2557256	2557261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614977
55070	NC_013959	CGC	2	6	2557330	2557335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55071	NC_013959	CCAT	2	8	2557338	2557345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55072	NC_013959	TCG	2	6	2557386	2557391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55073	NC_013959	CGAA	2	8	2557393	2557400	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55074	NC_013959	TAA	2	6	2557425	2557430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55075	NC_013959	TG	3	6	2557569	2557574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55076	NC_013959	CG	3	6	2557610	2557615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55077	NC_013959	T	8	8	2557655	2557662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55078	NC_013959	TGC	2	6	2557712	2557717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55080	NC_013959	GGC	2	6	2557832	2557837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614978
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55083	NC_013959	A	8	8	2557968	2557975	100 %	0 %	0 %	0 %	291614978
55084	NC_013959	GCA	2	6	2558190	2558195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614978
55085	NC_013959	CTGGTG	2	12	2558208	2558219	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291614978
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55088	NC_013959	ATC	2	6	2558319	2558324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614978
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55090	NC_013959	AGC	2	6	2558410	2558415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614978
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55094	NC_013959	GCG	2	6	2558557	2558562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614978
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55099	NC_013959	CAT	2	6	2558669	2558674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614978
55100	NC_013959	GC	3	6	2558675	2558680	0 %	0 %	50 %	50 %	291614978
55101	NC_013959	GGT	2	6	2558729	2558734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614978
55102	NC_013959	CCG	2	6	2558786	2558791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614978
55103	NC_013959	TAC	2	6	2558826	2558831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614978
55104	NC_013959	GTG	2	6	2558946	2558951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614978
55105	NC_013959	TGC	2	6	2559007	2559012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614978
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55107	NC_013959	CCA	2	6	2559043	2559048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614978
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55109	NC_013959	GCA	3	9	2559136	2559144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614978
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55113	NC_013959	GGC	2	6	2559246	2559251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614978
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55116	NC_013959	TCGGCG	2	12	2559382	2559393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291614978
55117	NC_013959	CAT	2	6	2559537	2559542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614978
55118	NC_013959	CG	3	6	2559637	2559642	0 %	0 %	50 %	50 %	291614978
55119	NC_013959	CGC	2	6	2559662	2559667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614978
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55121	NC_013959	CGA	2	6	2559737	2559742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614978
55122	NC_013959	GCG	2	6	2559780	2559785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614978
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55125	NC_013959	TGC	2	6	2559949	2559954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614978
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55144	NC_013959	GGC	2	6	2561002	2561007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614980
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55213	NC_013959	TGG	2	6	2564000	2564005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614982
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55230	NC_013959	CCGG	2	8	2564914	2564921	0 %	0 %	50 %	50 %	291614984
55231	NC_013959	GCA	3	9	2564948	2564956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614984
55232	NC_013959	CA	3	6	2564998	2565003	50 %	0 %	0 %	50 %	291614984
55233	NC_013959	GCA	2	6	2565020	2565025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614984
55234	NC_013959	TGCC	2	8	2565065	2565072	0 %	25 %	25 %	50 %	291614984
55235	NC_013959	CAGCG	2	10	2565112	2565121	20 %	0 %	40 %	40 %	291614984
55236	NC_013959	GCA	2	6	2565128	2565133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614984
55237	NC_013959	CCG	2	6	2565187	2565192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614984
55238	NC_013959	GCG	2	6	2565223	2565228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614984
55239	NC_013959	TCCC	2	8	2565258	2565265	0 %	25 %	0 %	75 %	291614984
55240	NC_013959	CGA	2	6	2565281	2565286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614984
55241	NC_013959	TCAGCA	2	12	2565287	2565298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291614984
55242	NC_013959	CGTC	2	8	2565313	2565320	0 %	25 %	25 %	50 %	291614984
55243	NC_013959	TCC	2	6	2565330	2565335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614984
55244	NC_013959	GC	3	6	2565344	2565349	0 %	0 %	50 %	50 %	291614984
55245	NC_013959	CGA	2	6	2565372	2565377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614984
55246	NC_013959	TGT	2	6	2565386	2565391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614984
55247	NC_013959	GCCAG	2	10	2565392	2565401	20 %	0 %	40 %	40 %	291614984
55248	NC_013959	AAC	2	6	2565436	2565441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614984
55249	NC_013959	TGC	2	6	2565486	2565491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614984
55250	NC_013959	CAGC	3	12	2565530	2565541	25 %	0 %	25 %	50 %	291614984
55251	NC_013959	TGC	2	6	2565545	2565550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614984
55252	NC_013959	GCA	2	6	2565571	2565576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614984
55253	NC_013959	GAT	2	6	2565585	2565590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614984
55254	NC_013959	GAT	2	6	2565621	2565626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614984
55255	NC_013959	CAGTG	2	10	2565674	2565683	20 %	20 %	40 %	20 %	291614985
55256	NC_013959	TGC	2	6	2565844	2565849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614985
55257	NC_013959	CGGC	2	8	2565868	2565875	0 %	0 %	50 %	50 %	291614985
55258	NC_013959	GAT	2	6	2565883	2565888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614985
55259	NC_013959	AACC	2	8	2565896	2565903	50 %	0 %	0 %	50 %	291614985
55260	NC_013959	CTG	2	6	2565916	2565921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614985
55261	NC_013959	GCG	2	6	2565927	2565932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614985
55262	NC_013959	CAG	2	6	2565941	2565946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614985
55263	NC_013959	CTC	2	6	2565975	2565980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55264	NC_013959	TTGCAA	2	12	2566013	2566024	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55265	NC_013959	CAT	2	6	2566036	2566041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55266	NC_013959	GAA	2	6	2566096	2566101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614986
55267	NC_013959	GAT	2	6	2566214	2566219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614986
55268	NC_013959	GCT	2	6	2566270	2566275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614986
55269	NC_013959	GGC	2	6	2566295	2566300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614986
55270	NC_013959	CAC	2	6	2566331	2566336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614986
55271	NC_013959	GAG	2	6	2566370	2566375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291614986
55272	NC_013959	ACC	2	6	2566385	2566390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614986
55273	NC_013959	AGA	2	6	2566404	2566409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614986
55274	NC_013959	CAAAA	2	10	2566474	2566483	80 %	0 %	0 %	20 %	291614986
55275	NC_013959	TCA	2	6	2566589	2566594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55276	NC_013959	CGC	2	6	2566606	2566611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55277	NC_013959	GCC	2	6	2566687	2566692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614987
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55279	NC_013959	CGG	2	6	2566737	2566742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614987
55280	NC_013959	GC	3	6	2566756	2566761	0 %	0 %	50 %	50 %	291614987
55281	NC_013959	GC	3	6	2566825	2566830	0 %	0 %	50 %	50 %	291614987
55282	NC_013959	CG	3	6	2566878	2566883	0 %	0 %	50 %	50 %	291614987
55283	NC_013959	CTG	2	6	2566945	2566950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614987
55284	NC_013959	GCC	2	6	2566962	2566967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614987
55285	NC_013959	GC	3	6	2567017	2567022	0 %	0 %	50 %	50 %	291614987
55286	NC_013959	GC	3	6	2567059	2567064	0 %	0 %	50 %	50 %	291614987
55287	NC_013959	GC	3	6	2567094	2567099	0 %	0 %	50 %	50 %	291614987
55288	NC_013959	TGCC	2	8	2567105	2567112	0 %	25 %	25 %	50 %	291614987
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55290	NC_013959	GCC	2	6	2567231	2567236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614987
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55295	NC_013959	CTG	3	9	2567422	2567430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614987
55296	NC_013959	CTG	2	6	2567488	2567493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614987
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55307	NC_013959	CGG	2	6	2568251	2568256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614987
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55310	NC_013959	A	6	6	2568517	2568522	100 %	0 %	0 %	0 %	291614987
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55313	NC_013959	CTT	2	6	2568613	2568618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55314	NC_013959	GC	3	6	2568711	2568716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55315	NC_013959	TGCG	2	8	2568835	2568842	0 %	25 %	50 %	25 %	291614988
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55318	NC_013959	GCA	2	6	2569097	2569102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614988
55319	NC_013959	GCAAG	2	10	2569142	2569151	40 %	0 %	40 %	20 %	291614988
55320	NC_013959	TAG	2	6	2569156	2569161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614988
55321	NC_013959	TC	3	6	2569190	2569195	0 %	50 %	0 %	50 %	291614988
55322	NC_013959	ACT	2	6	2569231	2569236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614988
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55327	NC_013959	CTGGG	2	10	2569629	2569638	0 %	20 %	60 %	20 %	291614988
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55329	NC_013959	TGA	2	6	2569705	2569710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614988
55330	NC_013959	CTG	2	6	2569728	2569733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614988
55331	NC_013959	CTGG	2	8	2569739	2569746	0 %	25 %	50 %	25 %	291614988
55332	NC_013959	GCT	2	6	2569751	2569756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614988
55333	NC_013959	CG	3	6	2569769	2569774	0 %	0 %	50 %	50 %	291614988
55334	NC_013959	CAA	2	6	2569802	2569807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614988
55335	NC_013959	AGG	2	6	2569850	2569855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291614988
55336	NC_013959	CGA	2	6	2569856	2569861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614988
55337	NC_013959	CG	3	6	2569909	2569914	0 %	0 %	50 %	50 %	291614988
55338	NC_013959	ACG	2	6	2569925	2569930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614988
55339	NC_013959	CAA	2	6	2569973	2569978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614988
55340	NC_013959	TGA	2	6	2570020	2570025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614988
55341	NC_013959	CCGAGG	2	12	2570059	2570070	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291614988
55342	NC_013959	CGCTG	2	10	2570138	2570147	0 %	20 %	40 %	40 %	291614988
55343	NC_013959	CAA	2	6	2570150	2570155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614988
55344	NC_013959	GGCGA	2	10	2570164	2570173	20 %	0 %	60 %	20 %	291614988
55345	NC_013959	CAG	2	6	2570241	2570246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614988
55346	NC_013959	AAGA	2	8	2570295	2570302	75 %	0 %	25 %	0 %	291614988
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55348	NC_013959	CTG	2	6	2570364	2570369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614988
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