MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54502	NC_013959	GGGC	2	8	2533491	2533498	0 %	0 %	75 %	25 %	291614958
54503	NC_013959	CCG	2	6	2533561	2533566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614958
54504	NC_013959	GCT	2	6	2533714	2533719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614958
54505	NC_013959	CTG	2	6	2533723	2533728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614958
54506	NC_013959	CAC	2	6	2533774	2533779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614958
54507	NC_013959	ACC	2	6	2533844	2533849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614958
54508	NC_013959	CGCC	2	8	2533897	2533904	0 %	0 %	25 %	75 %	291614958
54509	NC_013959	GCA	2	6	2533965	2533970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614958
54510	NC_013959	GC	3	6	2534016	2534021	0 %	0 %	50 %	50 %	291614959
54511	NC_013959	TTCA	2	8	2534058	2534065	25 %	50 %	0 %	25 %	291614959
54512	NC_013959	GATC	2	8	2534075	2534082	25 %	25 %	25 %	25 %	291614959
54513	NC_013959	CAT	2	6	2534096	2534101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614959
54514	NC_013959	GGCGCA	2	12	2534135	2534146	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291614959
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54517	NC_013959	GC	3	6	2534277	2534282	0 %	0 %	50 %	50 %	291614959
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54554	NC_013959	GGAT	2	8	2535862	2535869	25 %	25 %	50 %	0 %	291614959
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54558	NC_013959	CT	3	6	2536013	2536018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54559	NC_013959	AGA	2	6	2536024	2536029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54618	NC_013959	GGT	2	6	2538826	2538831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614962
54619	NC_013959	CTCG	2	8	2538850	2538857	0 %	25 %	25 %	50 %	291614962
54620	NC_013959	GCG	2	6	2538858	2538863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614962
54621	NC_013959	GCT	2	6	2538898	2538903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614962
54622	NC_013959	TCA	2	6	2538918	2538923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614962
54623	NC_013959	CAT	2	6	2538944	2538949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614962
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54625	NC_013959	GGAA	2	8	2538999	2539006	50 %	0 %	50 %	0 %	291614962
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54628	NC_013959	CTCG	2	8	2539102	2539109	0 %	25 %	25 %	50 %	291614962
54629	NC_013959	CCG	2	6	2539119	2539124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614962
54630	NC_013959	TCG	2	6	2539158	2539163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614962
54631	NC_013959	CCG	2	6	2539164	2539169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614962
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54644	NC_013959	GCA	2	6	2539577	2539582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614962
54645	NC_013959	TCG	2	6	2539677	2539682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614962
54646	NC_013959	CTT	2	6	2539756	2539761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614962
54647	NC_013959	ATGG	2	8	2539810	2539817	25 %	25 %	50 %	0 %	291614962
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54672	NC_013959	GCT	2	6	2540990	2540995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614964
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54703	NC_013959	CGT	2	6	2542229	2542234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614964
54704	NC_013959	TC	3	6	2542264	2542269	0 %	50 %	0 %	50 %	291614964
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54707	NC_013959	GAC	2	6	2542398	2542403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614965
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54709	NC_013959	CG	3	6	2542521	2542526	0 %	0 %	50 %	50 %	291614965
54710	NC_013959	TTGC	2	8	2542533	2542540	0 %	50 %	25 %	25 %	291614965
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54715	NC_013959	CTG	2	6	2542761	2542766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614965
54716	NC_013959	CAG	2	6	2542767	2542772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614965
54717	NC_013959	GGC	2	6	2542796	2542801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614965
54718	NC_013959	TCG	2	6	2542822	2542827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614965
54719	NC_013959	TTG	2	6	2542908	2542913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614965
54720	NC_013959	TCCA	2	8	2542917	2542924	25 %	25 %	0 %	50 %	291614965
54721	NC_013959	CG	3	6	2543002	2543007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54722	NC_013959	TCC	2	6	2543039	2543044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614966
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54725	NC_013959	CAGG	2	8	2543157	2543164	25 %	0 %	50 %	25 %	291614966
54726	NC_013959	GAAG	2	8	2543211	2543218	50 %	0 %	50 %	0 %	291614966
54727	NC_013959	CAA	2	6	2543229	2543234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614966
54728	NC_013959	CAG	2	6	2543272	2543277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614966
54729	NC_013959	AGGCCG	2	12	2543288	2543299	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291614966
54730	NC_013959	CGC	2	6	2543319	2543324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614966
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54732	NC_013959	GCA	3	9	2543385	2543393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614966
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54847	NC_013959	GGC	2	6	2547843	2547848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614970
54848	NC_013959	GCT	2	6	2547870	2547875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614970
54849	NC_013959	CTG	2	6	2547883	2547888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614970
54850	NC_013959	CTG	2	6	2547916	2547921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614970
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54864	NC_013959	ATGC	2	8	2548238	2548245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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54869	NC_013959	CGG	2	6	2548512	2548517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614971
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54952	NC_013959	CTG	2	6	2551851	2551856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614972
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54955	NC_013959	ATGCCG	2	12	2552029	2552040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291614972
54956	NC_013959	CAT	2	6	2552210	2552215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614972
54957	NC_013959	AGA	2	6	2552291	2552296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614972
54958	NC_013959	GAACTG	2	12	2552490	2552501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291614972
54959	NC_013959	GCA	2	6	2552519	2552524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614972
54960	NC_013959	TCA	2	6	2552536	2552541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614972
54961	NC_013959	TGC	2	6	2552545	2552550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614972
54962	NC_013959	CTG	2	6	2552553	2552558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614972
54963	NC_013959	CGA	2	6	2552585	2552590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614972
54964	NC_013959	TCG	2	6	2552665	2552670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614972
54965	NC_013959	CGC	2	6	2552705	2552710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614972
54966	NC_013959	CAT	2	6	2552714	2552719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614972
54967	NC_013959	AAC	2	6	2552776	2552781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614972
54968	NC_013959	CCG	2	6	2552835	2552840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614972
54969	NC_013959	CGG	2	6	2552845	2552850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614972
54970	NC_013959	GATC	2	8	2552908	2552915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54971	NC_013959	GCA	2	6	2552923	2552928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54972	NC_013959	TCG	2	6	2552957	2552962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54973	NC_013959	CAT	2	6	2553124	2553129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614973
54974	NC_013959	CGAT	2	8	2553238	2553245	25 %	25 %	25 %	25 %	291614973
54975	NC_013959	TGACC	2	10	2553248	2553257	20 %	20 %	20 %	40 %	291614973
54976	NC_013959	CAT	3	9	2553287	2553295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614973
54977	NC_013959	CGG	2	6	2553323	2553328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614973
54978	NC_013959	CCT	2	6	2553342	2553347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614973
54979	NC_013959	CG	3	6	2553418	2553423	0 %	0 %	50 %	50 %	291614973
54980	NC_013959	A	7	7	2553528	2553534	100 %	0 %	0 %	0 %	291614973
54981	NC_013959	ACCG	3	12	2553539	2553550	25 %	0 %	25 %	50 %	291614973
54982	NC_013959	GCT	2	6	2553551	2553556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614973
54983	NC_013959	GAC	2	6	2553569	2553574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614973
54984	NC_013959	CTG	2	6	2553612	2553617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614973
54985	NC_013959	TCG	2	6	2553636	2553641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614973
54986	NC_013959	GCA	2	6	2553656	2553661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614973
54987	NC_013959	TCG	3	9	2553670	2553678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614973
54988	NC_013959	CCA	2	6	2553752	2553757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614973
54989	NC_013959	ACC	2	6	2553789	2553794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614973
54990	NC_013959	GCA	2	6	2553970	2553975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614974
54991	NC_013959	CACGC	2	10	2553987	2553996	20 %	0 %	20 %	60 %	291614974
54992	NC_013959	CGA	2	6	2554018	2554023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614974
54993	NC_013959	CGTGT	2	10	2554076	2554085	0 %	40 %	40 %	20 %	291614974
54994	NC_013959	CGA	2	6	2554087	2554092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614974
54995	NC_013959	CA	3	6	2554210	2554215	50 %	0 %	0 %	50 %	291614974
54996	NC_013959	GTTT	2	8	2554227	2554234	0 %	75 %	25 %	0 %	291614974
54997	NC_013959	TCG	2	6	2554263	2554268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614974
54998	NC_013959	CGC	2	6	2554282	2554287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614974
54999	NC_013959	GC	4	8	2554292	2554299	0 %	0 %	50 %	50 %	291614974
55000	NC_013959	TGC	2	6	2554315	2554320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614974

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