MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_013959	CAAAA	2	10	2465995	2466004	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53002	NC_013959	CA	3	6	2466028	2466033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53003	NC_013959	CCT	2	6	2466100	2466105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614893
53004	NC_013959	GTC	2	6	2466122	2466127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614893
53005	NC_013959	GTT	2	6	2466128	2466133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614893
53006	NC_013959	TGC	2	6	2466140	2466145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614893
53007	NC_013959	TCT	2	6	2466193	2466198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614893
53008	NC_013959	CAG	2	6	2466200	2466205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614893
53009	NC_013959	ATGC	2	8	2466251	2466258	25 %	25 %	25 %	25 %	291614893
53010	NC_013959	GTC	2	6	2466263	2466268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614893
53011	NC_013959	GAC	2	6	2466272	2466277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614893
53012	NC_013959	GCTG	2	8	2466392	2466399	0 %	25 %	50 %	25 %	291614893
53013	NC_013959	CTT	3	9	2466520	2466528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614893
53014	NC_013959	CAG	2	6	2466581	2466586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614893
53015	NC_013959	AGC	2	6	2466630	2466635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614893
53016	NC_013959	ATG	2	6	2466684	2466689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614894
53017	NC_013959	ACG	2	6	2466711	2466716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614894
53018	NC_013959	GAA	2	6	2466757	2466762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614894
53019	NC_013959	T	6	6	2466777	2466782	0 %	100 %	0 %	0 %	291614894
53020	NC_013959	GGC	2	6	2466787	2466792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614894
53021	NC_013959	GGC	2	6	2466812	2466817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614894
53022	NC_013959	GT	3	6	2466872	2466877	0 %	50 %	50 %	0 %	291614894
53023	NC_013959	TTC	2	6	2466886	2466891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614894
53024	NC_013959	GCA	3	9	2466897	2466905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614894
53025	NC_013959	CTG	2	6	2467018	2467023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614894
53026	NC_013959	CAG	2	6	2467066	2467071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614894
53027	NC_013959	T	6	6	2467109	2467114	0 %	100 %	0 %	0 %	291614894
53028	NC_013959	CAC	2	6	2467290	2467295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614894
53029	NC_013959	AAT	2	6	2467378	2467383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291614894
53030	NC_013959	GT	3	6	2467450	2467455	0 %	50 %	50 %	0 %	291614894
53031	NC_013959	TG	3	6	2467500	2467505	0 %	50 %	50 %	0 %	291614894
53032	NC_013959	CTT	2	6	2467528	2467533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614894
53033	NC_013959	GTA	2	6	2467601	2467606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614894
53034	NC_013959	GAC	2	6	2467673	2467678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614894
53035	NC_013959	AGT	2	6	2467754	2467759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614894
53036	NC_013959	ATC	2	6	2467821	2467826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53037	NC_013959	TGG	2	6	2467834	2467839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53038	NC_013959	CCA	2	6	2467990	2467995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53039	NC_013959	AC	3	6	2468083	2468088	50 %	0 %	0 %	50 %	291614895
53040	NC_013959	GGA	2	6	2468178	2468183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291614895
53041	NC_013959	CTGTT	2	10	2468198	2468207	0 %	60 %	20 %	20 %	291614895
53042	NC_013959	GTT	3	9	2468205	2468213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614895
53043	NC_013959	GTG	2	6	2468233	2468238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614895
53044	NC_013959	GC	3	6	2468288	2468293	0 %	0 %	50 %	50 %	291614895
53045	NC_013959	GGT	2	6	2468346	2468351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614895
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53047	NC_013959	T	6	6	2468421	2468426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53048	NC_013959	AGTG	2	8	2468484	2468491	25 %	25 %	50 %	0 %	291614896
53049	NC_013959	CGT	2	6	2468506	2468511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614896
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53052	NC_013959	TTG	2	6	2468628	2468633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614896
53053	NC_013959	GTG	2	6	2468660	2468665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614896
53054	NC_013959	TCA	2	6	2468670	2468675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614896
53055	NC_013959	TTG	2	6	2468691	2468696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614896
53056	NC_013959	TGC	2	6	2468756	2468761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53057	NC_013959	GTT	2	6	2468820	2468825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53058	NC_013959	GCC	2	6	2468826	2468831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53059	NC_013959	CGG	2	6	2468859	2468864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53060	NC_013959	CAA	2	6	2468911	2468916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53061	NC_013959	GCC	2	6	2469000	2469005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614897
53062	NC_013959	GCC	2	6	2469021	2469026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614897
53063	NC_013959	TCA	2	6	2469061	2469066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614897
53064	NC_013959	TGG	2	6	2469076	2469081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614897
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53067	NC_013959	ACCCTA	2	12	2469201	2469212	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
53068	NC_013959	TA	3	6	2469218	2469223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53069	NC_013959	GTC	2	6	2469232	2469237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53070	NC_013959	TGT	2	6	2469277	2469282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53071	NC_013959	A	7	7	2469383	2469389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53072	NC_013959	TTGT	2	8	2469411	2469418	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53073	NC_013959	TGG	2	6	2469419	2469424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53074	NC_013959	CT	3	6	2469501	2469506	0 %	50 %	0 %	50 %	291614898
53075	NC_013959	TTTC	2	8	2469519	2469526	0 %	75 %	0 %	25 %	291614898
53076	NC_013959	CACC	2	8	2469594	2469601	25 %	0 %	0 %	75 %	291614898
53077	NC_013959	GCA	2	6	2469605	2469610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614898
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53079	NC_013959	GCC	2	6	2469659	2469664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614898
53080	NC_013959	TGC	2	6	2469735	2469740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614898
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53083	NC_013959	A	7	7	2469850	2469856	100 %	0 %	0 %	0 %	291614898
53084	NC_013959	AAT	2	6	2469917	2469922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291614898
53085	NC_013959	AAT	2	6	2469995	2470000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291614898
53086	NC_013959	CTG	2	6	2470012	2470017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614898
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53088	NC_013959	CAT	2	6	2470092	2470097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614898
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53091	NC_013959	CTG	2	6	2470546	2470551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614898
53092	NC_013959	TTC	2	6	2470574	2470579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614898
53093	NC_013959	TG	3	6	2470771	2470776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53094	NC_013959	TGG	2	6	2470778	2470783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53095	NC_013959	TCC	2	6	2470985	2470990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614899
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53105	NC_013959	TCT	3	9	2471679	2471687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614899
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53109	NC_013959	CA	3	6	2471833	2471838	50 %	0 %	0 %	50 %	291614899
53110	NC_013959	TGC	2	6	2471850	2471855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614899
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53112	NC_013959	CCA	2	6	2471877	2471882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614899
53113	NC_013959	CTTG	2	8	2471913	2471920	0 %	50 %	25 %	25 %	291614899
53114	NC_013959	TCG	2	6	2471945	2471950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614899
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53118	NC_013959	GGC	2	6	2472085	2472090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614899
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53468	NC_013959	TCG	2	6	2487996	2488001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614916
53469	NC_013959	TGC	2	6	2488073	2488078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614916
53470	NC_013959	GCA	2	6	2488123	2488128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614916
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53473	NC_013959	CG	4	8	2488190	2488197	0 %	0 %	50 %	50 %	291614916
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53479	NC_013959	CAG	2	6	2488502	2488507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614916
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53494	NC_013959	GC	3	6	2489299	2489304	0 %	0 %	50 %	50 %	291614917
53495	NC_013959	TGC	2	6	2489305	2489310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614917
53496	NC_013959	CGA	2	6	2489342	2489347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614917
53497	NC_013959	TCA	2	6	2489401	2489406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614917
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53499	NC_013959	CG	3	6	2489588	2489593	0 %	0 %	50 %	50 %	291614917
53500	NC_013959	CCG	2	6	2489607	2489612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614917

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