MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_013959	CG	3	6	2423822	2423827	0 %	0 %	50 %	50 %	291614855
52003	NC_013959	TGC	2	6	2423894	2423899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614855
52004	NC_013959	TGA	2	6	2423928	2423933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614855
52005	NC_013959	GCC	2	6	2424028	2424033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614855
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52008	NC_013959	GCA	2	6	2424100	2424105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614855
52009	NC_013959	GC	3	6	2424135	2424140	0 %	0 %	50 %	50 %	291614855
52010	NC_013959	CTG	2	6	2424220	2424225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614855
52011	NC_013959	TGGC	2	8	2424354	2424361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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52014	NC_013959	CAG	2	6	2424484	2424489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614856
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52016	NC_013959	GTA	2	6	2424595	2424600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614856
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52117	NC_013959	CAC	2	6	2428863	2428868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614860
52118	NC_013959	GGAAT	2	10	2428873	2428882	40 %	20 %	40 %	0 %	291614860
52119	NC_013959	CCGGA	2	10	2428925	2428934	20 %	0 %	40 %	40 %	291614860
52120	NC_013959	CCG	2	6	2428982	2428987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614860
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52156	NC_013959	GCGCA	2	10	2430682	2430691	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52157	NC_013959	CAGC	2	8	2430744	2430751	25 %	0 %	25 %	50 %	291614864
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52208	NC_013959	CGT	2	6	2432987	2432992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614866
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52221	NC_013959	CGC	2	6	2433536	2433541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614866
52222	NC_013959	CTCC	2	8	2433626	2433633	0 %	25 %	0 %	75 %	291614866
52223	NC_013959	CG	3	6	2433643	2433648	0 %	0 %	50 %	50 %	291614866
52224	NC_013959	GCA	2	6	2433649	2433654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614866
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52229	NC_013959	GAA	2	6	2434019	2434024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614866
52230	NC_013959	CGG	2	6	2434144	2434149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614866
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52232	NC_013959	CG	3	6	2434248	2434253	0 %	0 %	50 %	50 %	291614866
52233	NC_013959	CCG	2	6	2434267	2434272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614866
52234	NC_013959	GC	3	6	2434284	2434289	0 %	0 %	50 %	50 %	291614866
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52236	NC_013959	CCGG	3	12	2434366	2434377	0 %	0 %	50 %	50 %	291614866
52237	NC_013959	CTG	2	6	2434383	2434388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614866
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52332	NC_013959	GC	3	6	2438472	2438477	0 %	0 %	50 %	50 %	291614870
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52337	NC_013959	CAGA	2	8	2438728	2438735	50 %	0 %	25 %	25 %	291614871
52338	NC_013959	CG	4	8	2438754	2438761	0 %	0 %	50 %	50 %	291614871
52339	NC_013959	CCA	2	6	2438784	2438789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614871
52340	NC_013959	TGA	2	6	2438835	2438840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614871
52341	NC_013959	TCT	2	6	2438862	2438867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52342	NC_013959	CCG	2	6	2438944	2438949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614872
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52345	NC_013959	GCA	2	6	2439126	2439131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614872
52346	NC_013959	CCTGC	2	10	2439142	2439151	0 %	20 %	20 %	60 %	291614872
52347	NC_013959	GAT	2	6	2439178	2439183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614872
52348	NC_013959	CTC	2	6	2439199	2439204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614872
52349	NC_013959	GAA	2	6	2439295	2439300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614872
52350	NC_013959	TGC	2	6	2439350	2439355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614872
52351	NC_013959	TGA	2	6	2439369	2439374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614872
52352	NC_013959	CCA	2	6	2439378	2439383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614872
52353	NC_013959	CG	3	6	2439387	2439392	0 %	0 %	50 %	50 %	291614872
52354	NC_013959	TCC	2	6	2439398	2439403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614872
52355	NC_013959	TGC	2	6	2439419	2439424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614872
52356	NC_013959	CGG	2	6	2439466	2439471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614872
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52359	NC_013959	CAC	2	6	2439744	2439749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614872
52360	NC_013959	GCA	2	6	2439820	2439825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614872
52361	NC_013959	GAT	2	6	2439832	2439837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614872
52362	NC_013959	CGT	2	6	2439948	2439953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614872
52363	NC_013959	GCGA	2	8	2439989	2439996	25 %	0 %	50 %	25 %	291614872
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52365	NC_013959	CTG	3	9	2440081	2440089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614872
52366	NC_013959	AAAC	2	8	2440183	2440190	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52367	NC_013959	GC	3	6	2440197	2440202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52368	NC_013959	CG	3	6	2440237	2440242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52369	NC_013959	GAT	2	6	2440249	2440254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52370	NC_013959	ACT	2	6	2440313	2440318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614873
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52388	NC_013959	CACC	2	8	2441000	2441007	25 %	0 %	0 %	75 %	291614873
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52420	NC_013959	GCA	2	6	2442057	2442062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614874
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52453	NC_013959	GCA	2	6	2443034	2443039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614875
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52460	NC_013959	CG	4	8	2443331	2443338	0 %	0 %	50 %	50 %	291614875
52461	NC_013959	TCGAC	2	10	2443349	2443358	20 %	20 %	20 %	40 %	291614875
52462	NC_013959	GTGGC	2	10	2443421	2443430	0 %	20 %	60 %	20 %	291614875
52463	NC_013959	CGT	2	6	2443445	2443450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614875
52464	NC_013959	GCG	2	6	2443502	2443507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614875
52465	NC_013959	CGC	2	6	2443548	2443553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614875
52466	NC_013959	GCA	2	6	2443556	2443561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614875
52467	NC_013959	CGT	2	6	2443568	2443573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614875
52468	NC_013959	TGA	2	6	2443622	2443627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614875
52469	NC_013959	TTCAT	2	10	2443720	2443729	20 %	60 %	0 %	20 %	291614875
52470	NC_013959	GAT	2	6	2443785	2443790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52471	NC_013959	CCA	2	6	2443815	2443820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52472	NC_013959	CAA	2	6	2443823	2443828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52473	NC_013959	CT	3	6	2443844	2443849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52474	NC_013959	T	6	6	2443875	2443880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52475	NC_013959	ATT	2	6	2443945	2443950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52476	NC_013959	AC	3	6	2443962	2443967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52477	NC_013959	TCA	2	6	2444003	2444008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52478	NC_013959	GCC	2	6	2444015	2444020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52479	NC_013959	CCA	2	6	2444033	2444038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52480	NC_013959	ACCG	2	8	2444092	2444099	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52481	NC_013959	CGG	2	6	2444132	2444137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52482	NC_013959	GCA	2	6	2444142	2444147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52483	NC_013959	CAG	2	6	2444155	2444160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52484	NC_013959	CGTC	2	8	2444169	2444176	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52485	NC_013959	ACCA	2	8	2444394	2444401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52486	NC_013959	GAC	2	6	2444460	2444465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614876
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52489	NC_013959	GC	3	6	2444650	2444655	0 %	0 %	50 %	50 %	291614876
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52492	NC_013959	CG	3	6	2444746	2444751	0 %	0 %	50 %	50 %	291614876
52493	NC_013959	CGT	2	6	2444791	2444796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614876
52494	NC_013959	ACC	2	6	2444859	2444864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614876
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52499	NC_013959	CGC	2	6	2444987	2444992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614876
52500	NC_013959	CTG	3	9	2445040	2445048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614876

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